Assessment of approximate density functional methods for the study of the interactions of AI(III) with aromatic amino acids

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 3, Issue 5, 2007, Pages 1830-1836

  Rezabal, E ^a   Marino, T ^b   Mercero, J M ^a   Russo, N ^b   Ugalde, J M ^a  

^a UNIVERSITY OF THE BASQUE COUNTRY UPV EHU   (Spain)

^b UNIVERSITY OF CALABRIA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 35948945741     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct700027n     Document Type: Article

References (70)

1. Perdew, J. P.; Ruzsinszky, A.; Tao, J.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E.; Csonka, G. I. J. Chem. Phys. 2005, 123, 062201.
2. Riley, K. E.; Holt, B. T. O.; Merz, K. M., Jr. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 407.
3. Zhao, Y.; Schultz, N. E.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 364.
4. Antony, J.; Grimme, S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 5287.
5. Dudev, T.; Lim, C. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 3692.
6. Johnson, E. R.; Becke, A. D. Chem. Phys. Lett. 2006, 432, 600.
7. Williams, R. Coord. Chem. Rev. 2002, 228, 93.
8. Yokel, R. Neurotoxicology 2000, 21, 813.
9. Exley, C.; Esiri, M. M. J. Neurol. Neurosurg. Psychiatry 2006, 77, 877.
10. Exley, C.; Begum, A.; Woolley, M. P.; Bloor, R. N. Am. J. Med. 2006, 119, 276.
11. Exley, C. J. Inorg. Biochem. 2005, 99, 1747.
12. Ruan, C.; Yang, Z.; Hallowita, N.; Rodgers, M. T. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 11539.
13. Gapeev, A.; Dunbar, R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 8360.
14. Gapeev, A.; Dunbar, R. Int. J. Mass Spectrom. 2003, 227, 825.
15. Kish, M. M.; Ohanessian, G.; Wesdemiotis, C. Int. J. Mass Spectrom. 2003, 227, 509.
16. Ruan, C.; Rodgers, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 14600.
17. Cerda, B.; Wesdemiotis, C. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9734.
18. Hoyau, S.; Ohanessian, G. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2016.
19. Gatlin, C. L.; Turecek, F.; Vaisar, T. J. Mass Spectrom. 1995, 30, 1605.
20. Gatlin, C. L.; Turecek, F.; Vaisar, T. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 3637.
21. Wen, D.; Yalcin, R.; Harrison, A. G. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1997, 8, 749.
22. Lei, Q.; Amster, I. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1996, 7, 722.
23. Yalcin, T.; Wang, J.; Wen, D.; Harrison, A. G. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997, 8, 749.
24. Lavanant, H.; Hoppilliard, Y. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 1037.
25. Lavanant, H.; Hecquet, E.; Hoppilliard, Y. Int. J. Mass Spectrom. 1999, 185/186/187, 11.
26. Talaty, E. R.; Perera, B. A.; Gallardo, A. L.; Barr, J. M.; Stipdonk, M. J. V. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 8059.
27. Shoeib, T.; Cunje, A.; Hopkinson, A.; Siu, K. J. Am. Soc. Mass Spectrom 2002, 13, 408.
28. Shoeib, T.; Siu, K. M.; Hopkinson, A. C. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 6121.
29. Polfer, N. C.; Oomens, J.; Moore, D. T.; Helden, G.; Meijer, G.; Dunbar, R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 517.
30. Polfer, N.; Oomens, J.; Dunbar, R. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 2744.
31. Meadows, E.; De Wall, S.; Barbour, L. J.; Gokel, G. W. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3092.
32. Gallivan, J.; Dougherty, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9459.
33. Minoux, H.; Chipot, C. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 10366.
34. De Wall, S. L.; Meadows, E. S.; Barbour, L. J.; Gokel, G. W. Proc. Natl. Acad. Sci. 2000, 97, 6271.
35. Ma, J.; Dougherty, D. Chem. Rev. 1997, 97, 1303.
36. Gokel, G. W.; DeWall, S. L.; Meadows, E. S. Eur. J. Org. Chem. 2000, 2967.
37. Rimola, A.; Rodríguez-Santiago, L.; Sodupe, M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 24189.
38. Mecozzi, S.; West, A.; Dougherty, D. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 10566.
39. Dougherty, D. A. Science 1996, 271, 163.
40. Cubero, E.; Luque, F. J.; Orozco, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 5976.
41. Garau, C.; Frontera, A.; Quinonero, D.; Ballester, P.; Costa, A.; Deya, P. M. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9423.
42. Garau, C.; Frontera, A.; Quinonero, D.; Ballester, P.; Costa, A.; Deya, P. M. Chem. Phys. Lett. 2004, 392, 85.
43. Garau, C.; Frontera, A.; Quinonero, D.; Ballester, P.; Costa, A.; Deya, P. M. Chem. Phys. Lett. 2004, 399, 220.
44. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623.
45. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
46. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
47. Mercero, J. M.; Matxain, J. M.; Lopez, X.; York, D. M.; Largo, A.; Eriksson, L. A.; Ugalde, J. M. Int. J. Mass Spectrom. 2005, 240, 37.
48. Reddy, A. S.; Sastry, G. N. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8893.
49. Zhang, S.; Liu, L.; Fu, Y.; Guo, Q. J. Mol. Struct. 2005, 757, 37.
50. Ryzhov, V.; Dunbar, R. C.; Cerda, B.; Wesdemiotis, C. Am. Soc. Mass Spectrom. 2000, 11, 1037.
51. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1998, 108, 664.
52. Dunbar, R. C. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 7328.
53. Oliveira, G.; Martin, J.; Proft, F.; Geerlings, P. Phys. Rev. A 1999, 60, 1034.
54. Tao, J.; Perdew, J. P.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 146401.
55. Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E.; Tao, J.; Perdew, J. P. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12129.
56. Zhao, Y.; Tishchenko, O.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 19046.
57. Zhao, Y.; Thrular, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6908.
58. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2701.
59. Gerber, R. B.; Chaban, G. M.; Gregurick, S. K.; Brauer, B. Biopolymers 2003, 68, 370.
60. Frisch, M. J.; Tracks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
61. Stevens, W. J.; Krauss, M.; Basch, H.; Jasien, P. G. Can. J. Chem. 1992, 70, 612.
62. Garmer, D. R.; Gresh, N. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3556.
63. Gresh, N.; Stevens, W. J.; Krauss, M. J. Comput. Chem. 1995, 16, 843.
64. Gresh, N.; Garmer, D. R. J. Comput. Chem. 1996, 17, 1481.
65. San Sebastian, E.; Mercero, J. M.; Roland H. Stote, A. D.; Cossío, F. P.; Lopez, X. J. Am. Chem. Soc. 2005.
66. Mercero, J. M.; Fowler, J. E.; Ugalde, J. M. J. Phys. Chem. A 1998, 102 (35), 7006.
67. Mercero, J. M.; Matxain, J. M.; Rezabal, E.; Lopez, X.; Ugalde, J. M. Int. J. Quantum Chem. 2004, 98, 409.
68. Mercero, J. M.; Fowler, J. E.; Ugalde, J. M. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 7053.
69. Rulised, L.; Vondrasek, J. J. Inorg. Biochem. 1998, 71, 115.
70. Mercero, J. M.; Mujika, J. I.; Matxain, J. M.; Lopez, X.; Ugalde, J. M. Chem. Phys. 2003, 295, 175.