Effects of oligoDNA template length and sequence on binary self-assembly of a nucleotide bolaamphiphile

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 5, Issue 21, 2007, Pages 3450-3455

  Iwaura, Rika ^a   Kikkawa, Yoshihiro ^b   Ohnishi Kameyama, Mayumi ^a   Shimizu, Toshimi ^b,c  

^a NATIONAL FOOD RESEARCH INSTITUTE   (Japan)

^b NATIONAL INSTITUTE OF ADVANCED INDUSTRIAL SCIENCE AND TECHNOLOGY AIST   (Japan)

^c JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACIDS; NANOFIBERS; NANOSTRUCTURES; NUCLEOTIDES;

BINARY SELF ASSEMBLY; BOLAAMPHIPHILES; DOUBLE STRANDED NANOFIBERS; NANOFIBER STRUCTURES;

DNA;

DNA; DRUG DERIVATIVE; OLIGODEOXYRIBONUCLEOTIDE; THYMIDINE;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; MOLECULAR GENETICS; NUCLEOTIDE SEQUENCE;

BASE SEQUENCE; DNA; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; MOLECULAR SEQUENCE DATA; MOLECULAR STRUCTURE; OLIGODEOXYRIBONUCLEOTIDES; THYMIDINE;

EID: 35348814379     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b711687j     Document Type: Article

References (54)

1. T. Park S. C. Zimmerman J. Am. Chem. Soc. 2006 128 14236 14237
2. T. Park S. C. Zimmerman J. Am. Chem. Soc. 2006 128 11582 11590
3. O. A. Scherman G. Ligthart R. P. Sijbesma E. W. Meijer Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 2072 2076
4. Y. Kamikawa M. Nishii T. Kato Chem.-Eur. J. 2004 10 5942 5951
5. T. Kato N. Mizoshita K. Kishimoto Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 38 68
6. E. Kolomiets E. Buhler S. J. Candau J. M. Lehn Macromolecules 2006 39 1173 1181
7. T. Sugimoto T. Suzuki S. Shinkai K. Sada J. Am. Chem. Soc. 2007 129 270 271
8. T. Shimizu Macromol. Rapid Commun. 2002 23 311 331
9. T. Shimizu M. Masuda H. Minamikawa Chem. Rev. 2005 105 1401 1444
10. M. C. T. Fyfe J. F. Stoddart Acc. Chem. Res. 1997 30 393 401
11. J.-M. Lehn, Supramolecular Chemistry, VCH, Weinheim, 1995
12. S. Sivakova S. J. Rowan Chem. Soc. Rev. 2005 34 9 21
13. S. Sivakova J. Wu C. J. Campo P. T. Mather S. J. Rowan Chem.-Eur. J. 2006 12 446 456
14. F. Zeng S. C. Zimmerman Chem. Rev. 1997 97 1681 1712
15. H.-J. Kim W.-C. Zin M. Lee J. Am. Chem. Soc. 2004 126 7009 7014
16. L. Brunsveld J. Vekemans J. Hirschberg R. P. Sijbesma E. W. Meijer Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 4977 4982
17. S. J. George A. Ajayaghosh P. Jonkheijm A. Schenning E. W. Meijer Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 3422 3425
18. T. Kawasaki M. Tokuhiro N. Kimizuka T. Kunitake J. Am. Chem. Soc. 2001 123 6792 6800
19. I. Koltover T. Salditt J. O. Radler C. R. Safinya Science 1998 281 78 81
20. J. O. Radler I. Koltover T. Salditt C. R. Safinya Science 1997 275 810 814
21. E. Braun Y. Eichen U. Sivan G. Ben-Yoseph Nature 1998 391 775 778
22. S. H. Park P. Yin Y. Liu J. H. Reif T. H. LaBean H. Yan Nano Lett. 2005 5 729 733
23. H. Yan S. H. Park G. Finkelstein J. H. Reif T. H. LaBean Science 2003 301 1882 1884
24. K. Tanaka A. Tengeiji T. Kato N. Toyama M. Shionoya Science 2003 299 1212 1213
25. C. A. Mirkin R. L. Letsinger R. C. Mucic J. J. Storhoff Nature 1996 382 607 609
26. J. L. Czlapinski T. L. Sheppard J. Am. Chem. Soc. 2001 123 8618 8619
27. J. L. Czlapinski T. L. Sheppard Bioconjugate Chem. 2005 16 169 177
28. S. Vogel K. Rohr O. Dahl J. Wengel Chem. Commun. 2003 1006 1007
29. K. V. Gothelf R. S. Brown Chem.-Eur. J. 2005 11 1062 1069
30. K. V. Gothelf A. Thomsen M. Nielsen E. Clo R. S. Brown J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1044 1046
31. K. Sugiyasu M. Numata N. Fujita S. M. Park Y. J. Yun B. H. Kim S. Shinkai Chem. Commun. 2004 1996 1997
32. M. Numata S. Shinkai Chem. Lett. 2003 32 308 309
33. P. G. A. Janssen J. Vandenbergh J. L. J. vanDongen E. W. Meijer A. P. H. J. Schenning J. Am. Chem. Soc. 2007 129 6078 6079
34. R. Iwaura F. J. M. Hoeben M. Masuda A. Schenning E. W. Meijer T. Shimizu J. Am. Chem. Soc. 2006 128 13298 13304
35. R. Iwaura K. Yoshida M. Masuda M. Ohnishi-Kameyama M. Yoshida T. Shimizu Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 1009 1012
36. R. Iwaura M. Ohnishi-Kameyama M. Yoshida T. Shimizu Chem. Commun. 2002 2658 2659
37. R. Iwaura K. Yoshida M. Masuda K. Yase T. Shimizu Chem. Mater. 2002 14 3047 3053
38. T. Itahara Bull. Chem. Soc. Jpn. 1997 70 2239 2247
39. D. T. Browne J. Esinger N. J. Leonard J. Am. Chem. Soc. 1968 90 7302 7323
40. S. Aoyagi Y. Inoue J. Biol. Chem. 1968 243 514 520
41. M. M. Warshaw I. Tinoco J. Mol. Biol. 1966 20 29 38
42. D. M. Gray K. H. Johnson M. R. Vaughan P. A. Morris J. C. Sutherland R. L. Ratliff Biopolymers 1990 29 317 323
43. S. Brahms J. G. Brahms Nucleic Acids Res. 1990 18 1559 1564
44. S. R. Gudibande S. D. Jayasena M. J. Behe Biopolymers 1988 27 1905 1915
45. A. L. Williams C. Cheong I. Tinoco L. B. Clark Nucleic Acids Res. 1986 14 6649 6659
46. L. E. Ulanovsky E. N. Trifonov Nature 1987 326 720 722
47. H. S. Koo H. M. Wu D. M. Crothers Nature 1986 320 501 506
48. P. J. Hagerman Nature 1986 321 449 450
49. I. Tinoco J. Am. Chem. Soc. 1964 86 297 298
50. S. Nonin J. L. Leroy M. Gueron Biochemistry 1995 34 10652 10659
51. J. L. Leroy M. Kochoyan T. Huynhdinh M. Gueron J. Mol. Biol. 1988 200 223 238
52. S. R. Holbrook S. H. Kim J. Mol. Biol. 1984 173 361 388
53. D. Andreatta S. Sen J. L. PerezLustres S. A. Kovalenko N. P. Ernsting C. J. Murphy R. S. Coleman M. A. Berg J. Am. Chem. Soc. 2006 128 6885 6892
54. C. M. Hillary H. C. M. Nelson J. T. Finch B. F. Luisi A. Klug Nature 1987 330 221 226