Ultrafast 2D-IR spectroscopy of transient species

ChemPhysChem

Volumn 8, Issue 12, 2007, Pages 1747-1756

  Bredenbeck, Jens ^a   Helbing, Jan ^a   Kolano, Christoph ^a   Hamm, Peter ^a  

^a UNIVERSITY OF ZURICH   (Switzerland)

Author keywords

Femtochemistry; IR spectroscopy; Molecular dynamics; Vibrational spectroscopy

Indexed keywords

INFRARED SPECTROSCOPY; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR STRUCTURE; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; VIBRATIONAL SPECTROSCOPY;

FEMTOCHEMISTRY; FEMTOSECOND TIME RESOLUTION; HIGH-TIME RESOLUTION; MEASURING COUPLING; NON-EQUILIBRIUM PROCESS; STRUCTURE AND DYNAMICS; TRANSIENT SPECIES; TWODIMENSIONAL INFRARED SPECTROSCOPY (2D-IR);

SPACECRAFT INSTRUMENTS;

EID: 34548448111     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.200700148     Document Type: Short Survey

References (74)

1. R. R. Ernst, G. Bodenhausen, A. Wokaun, Principles of Nuclear Magnetic Resonance in One and Two Dimensions, Vol. 14, International Series of Monographs on Chemistry, Oxford University Press, Oxford, 1987.
2. W. P. Aue, E. Bartholdi, R. R. Ernst, J. Chem. Phys. 1976, 64, 2229-2246.
3. P. Hamm, M. Lim, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123-6138.
4. J. D. Hybl, A. W. Albrecht, S. M. Gallagher Faeder, D. M. Jonas, Chem. Phys. Lett. 1998, 297, 307-313.
5. M. C. Asplund, M. T. Zanni, R. M. Hochstrasser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 8219-8224.
6. a) V. Cervetto, J. Helbing, J. Bredenbeck, P. Hamm, J. Chem. Phys. 2004, 121, 5935-5942;
7. b) H. S. Chung, Z. Ganim, K. C. Jones, A. Tokmakoff, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, DOI: 10.1073/pnas.0700959104.
8. P. Hamm, R. A. Kaindl, J. Stenger, Opt. Lett. 2000, 25, 1798-1800.
9. M. Khalil, N. Demirdöven, A. Tokmakoff, J. Chem. Phys. 2004, 121, 362-373.
10. O. Golonzka, M. Khalil, N. Demirdöven, A. Tokmakoff, J. Chem. Phys. 2001, 115, 10814-10828.
11. S. Woutersen, P. Hamm, J. Phys. Condens. Matter 2002, 14, R1035-R1062.
12. P. Hamm, R. M. Hochstrasser in Ultrafast Infrared and Raman Spectroscopy (Ed.: M. D. Fayer), Marcel Dekker, New York, 2001.
13. M. T. Zanni, S. Gnanakaran, J. Stenger, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6520-6535.
14. J. Bredenbeck, P. Hamm, J. Chem. Phys. 2003, 119, 1569-1578.
15. J. Wang, J. Cheng, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 7545-7555.
16. M. Khalil, N. Demirdöven, A. Tokmakoff, J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5258-5279.
17. O. F. A. Larsen, P. Bodis, W. J. Buma, J. S. Hannam, D. A. Leigh, S. Woutersen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 13378-13382.
18. S. Woutersen, Y. Mu, G. Stock, P. Hamm, Chem. Phys. 2001, 266, 137-147.
19. T. Steinel, J. B. Asbury, S. A. Corcelli, C. P. Lawrence, J. L. Skinner, M. D. Fayer, Chem. Phys. Lett. 2004, 386, 295-300.
20. J. Zheng, K. Kwak, J. Asbury, X. Chen, I. R. Oiletic, M. D. Fayer, Science 2005, 309, 1338-1343.
21. S. Woutersen, Y. Mu, G. Stock, Peter Hamm, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 11254-11258.
22. P. Mukherjee, I. Kass, I. Arkin, M. T. Zanni, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 3528-3533.
23. F. Ding, E. C. Fulmer, M. T. Zanni, J. Chem. Phys. 2005, 123, 094502.
24. I. V. Rubtsov, J. Wang, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3384-3396.
25. C. Scheurer, S. Mukamel, J. Chem. Phys. 2002, 116, 6803-6816.
26. NMR in Structural Biology (Ed.: K. Wüthrich), World Scientific, Singapore, 1995.
27. Protein NMR for the Millennium (Biological Magnetic Resonance) (Eds.: N. R. Krishna, L. J. Berliner), Kluwer, Dordrecht, 2003.
28. M. Zeeb, J. Balbach, Methods 2004, 34, 65-74.
29. P. Wenter, B. Fürtig, A. Hainard, H. Schwalbe, S. Pitsch, Angew. Chem. 2005, 117, 2656-2659;
30. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 2600-2603.
31. D. J. Stufkens, A. Vlček Jr. , Coord. Chem. Rev. 1998, 177, 127-179.
32. D. M. Dattelbaum, K. M. Omberg, J. R. Schoonover, R. L. Martin, T. J. Meyer, Inorg. Chem. 2002, 41, 6071-6079.
33. S. Záliš, I. R. Farrell, A. Vlček, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4580-4592.
34. J. B. Asbury, Y. Wang, T. Lian, Bull. Chem. Soc. Jpn. 2002, 75, 973-983.
35. K. Koike, N. Okoshi, H. Hori, K. Takeuchi, O. Ishitani, H. Tsubaki, I. P. Clark, M. W. George, F. P. A. Johnson, J. J. Turner, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11448-11455.
36. I. R. Farrell, P. Matousek, M. Towrie, A. W. Parker, D. C. Grills, M. W. George, A. Vlček Jr. , Inorg. Chem. 2002, 41, 4318-4323.
37. M. Pizzotti, R. Ugo, D. Roberto, S. Bruni, Organometallics 2002, 21, 5830-5840.
38. K. K.-W. Lo, W.-K. Hui, D. C.-M. Ng, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9344-9345.
39. J. Bredenbeck, J. Helbing, P. Hamm, Phys. Rev. Lett. 2005, 95, 083201.
40. C. Chudoba, E. T. J. Nibbering, T. Elsaesser, Phys. Rev. Lett. 1998, 81, 3010-3013.
41. S. Mukamel, Principles of Nonlinear Optical Spectroscopy, Vol. 6, Oxford Series in Optical and Imaging Sciences, Oxford University Press, Oxford, 1995.
42. J. Bredenbeck, J. Helbing, R. Behrendt, C. Renner, L. Moroder, P. Hamm, J. Phys. Chem. B 2003, 107, 8654-8660.
43. J. Bredenbeck, J. Helbing, P. Hamm, J. Chem. Phys. 2004, 121, 5943-5957.
44. J. Bredenbeck, J. Helbing, A. Sieg, T. Schrader, W. Zinth, C. Renner, R. Behrendt, L. Moroder, J. Wachtveitl, P. Hamm, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 6452-6457.
45. J. Helbing, H. Bregy, J. Bredenbeck, R. Pfister, P. Hamm, R. Hubert, J. Wachtveitl, L. De Vico, M. Olivucci, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 823-8834.
46. J. Bredenbeck, J. Helbing, J. R. Kumita, G. A. Woolley, P. Hamm, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 2379-2384.
47. C. Kolano, J. Helbing, M. Kozinski, W. Sander, P. Hamm, Nature 2006, 444, 469-472.
48. C. Kolano, K. Gomann, W. Sander, Eur. J. Org. Chem. 2004, 4167-4176.
49. H. S. M. Lu, M. Volk, Y. Kholodenko, E. Gooding, R. M. Hochstrasser, W. F. DeGrado, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7173-7180.
50. M. Volk, Y. Kholodenko, H. S. M. Lu, E. A. Gooding, W. F. DeGrado, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. B 1997, 101, 8607-8616.
51. S. Woutersen, P. Hamm, J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11316-11320.
52. R. A. G. D. Silva, J. Kubelka, P. Bour, S. M. Decatur, T. A. Keiderling, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 8318-8323.
53. C. Fang, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. B 2005, 109, 18652-18663.
54. A. T. Krummel, P. Mukherjee, M. T. Zanni, J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9165-9169.
55. C. Fang, J. Wang, Y. S. Kim, A. K. Charnley, W. Barber-Armstrong, A. B. Smith III, S. M. Decatur, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10415-10427.
56. S. Bagchi, Y. S. Kim, A. K Charnley, A. B. Smith III, R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. B 2007, 111, 3010-3018.
57. A. W. Smith, A. Tokmakoff, J. Chem. Phys. 2007, 126, 045109.
58. E. C. Fulmer, F. Ding, M. T. Zanni, J. Chem. Phys. 2005, 122, 034302,.
59. P. Hamm, J. Chem. Phys. 2006, 124, 1244506.
60. B. H. Meier, R. R. Ernst, J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 6441-6442.
61. R. Kubo, AIP Conf. Proc. 1969, 14, 101-127.
62. Y. Sam Kim, R. M. Hochstrasser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 11185-11190.
63. T. Steinel, J. B. Asbury, J. Zheng, M. D. Fayer, J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10957-10964.
64. J. Bredenbeck, J. Helbing, P. Hamm, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 990-991.
65. J. Bredenbeck, J. Helbing, K. Nienhaus, G. U. Nienhaus, P. Hamm, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, DOI: 10.1073/pnas.0607758104.
66. J. B. Johnson, D. C. Lamb, H. Frauenfelder, J. D. Müller, B. McMahon, G. U. Nienhaus, R. D. Young, Biophys. J. 1996, 71, 1563-1573.
67. J. Vojtěchovský, K. Chu, J. Berendzen, R. M. Sweet, I. Schlichting, Biophys. J. 1999, 77, 2153-2174.
68. K. Nienhaus, P. Deng, J. S. Olson, J. J. Warren, G. U. Nienhaus, J. Biol. Chem. 2003, 278, 42532-42544.
69. H. Frauenfelder, B. H. McMahon, P. W. Fenimore, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 8615-8617.
70. M. Lim, T. A. Jackson, P. A. Anfinrud, J. Chem. Phys. 1995, 102, 4355-4366.
71. M. Lim, T. A. Jackson, P. A. Anfinrud, Science 1995, 269, 962-966.
72. K. Nienhaus, J. S. Olson, S. Franzen, G. U. Nienhaus, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 40-41.
73. M. Lim, T. A. Jackson, P. A. Anfinrud, Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 209-214.
74. D. R. Nutt, M. Meuwly, Biophys. J. 2003, 85, 3612-3622.