On studying protein phosphorylation patterns using bottom-up LC-MS/MS: The case of human α-casein

Analyst

Volumn 132, Issue 8, 2007, Pages 768-776

  Kjeldsen, Frank ^a   Savitski, Mikhail M ^a   Nielsen, Michael L ^a   Shi, Lei ^b   Zubarev, Roman A ^a  

^a UPPSALA UNIVERSITY   (Sweden)

^b JILIN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALCIUM PHOSPHATE; CASEIN; CASEIN KINASE; SERINE;

ARTICLE; BREAST MILK; CAUCASIAN; CONTROLLED STUDY; ENZYME DEGRADATION; FEMALE; HUMAN; IONIZATION; LACTATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MAMMARY GLAND; MASS SPECTROMETRY; MICELLIZATION; PROTEIN FUNCTION; PROTEIN PHOSPHORYLATION; SENSITIVITY ANALYSIS;

EID: 34547115699     PISSN: 00032654     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b701902e     Document Type: Article

References (33)

1. T. Hunter Cell 1987 50 823 829
2. B. Duclos S. Marcandier A. J. Cozzone Methods Enzymol. 1991 201 10 21
3. M. Karin T. Hunter Curr. Biol. 1995 5 747 757
4. L. N. Johnson D. Barford J. Biol. Chem. 1990 265 2409 2412
5. I. Joung T. U. Kim L. A. Stolz G. Payne D. G. Winkler C. T. Walsh J. L. Strominger J. Shin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995 92 5778 5782
6. J. D. Watts M. J. Welham L. Kalt J. W. Schrader R. Aebersold J. Immunol. 1993 151 6862 6871
7. R. Aebersold D. R. Goodlett Chem. Rev. 2001 101 269 295
8. L. Andersson J. Porath Anal. Biochem. 1986 154 250 254
9. S. B. Ficarro M. L. McCleland P. T. Stukenberg D. J. Burke M. M. Ross J. Shabanowitz D. F. Hunt F. M. White Nat. Biotechnol. 2002 20 301 305
10. Y. Ikeguchi H. Nakamura Anal. Sci. 1997 13 479 483
11. S. A. Beausoleil M. Jedrychowski D. Schwartz J. E. Elias J. Villen J. X. Li M. A. Cohn L. C. Cantley S. P. Gygi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 12130 12135
12. M. Gronborg T. Z. Kristiansen A. Stensballe J. S. Andersen O. Ohara M. Mann O. N. Jensen A. Pandey Mol. Cell. Proteomics 2002 1 517 527
13. A. Gruhler J. V. Olsen S. Mohammed P. Mortensen N. J. Faergeman M. Mann O. N. Jensen Mol. Cell. Proteomics 2005 4 310 327
14. T. Kocher M. M. Savitski M. L. Nielsen R. A. Zubarev J. Proteome Res. 2006 5 659 668
15. A. J. Link J. Eng D. M. Schieltz E. Carmack G. J. Mize D. R. Morris B. M. Garvik J. R. Yates Nat. Biotechnol. 1999 17 676 682
16. E. Lasonder Y. Ishihama J. S. Andersen A. M. W. Vermunt A. Pain R. W. Sauerwein W. M. C. Eling N. Hall A. P. Waters H. G. Stunnenberg M. Mann Nature 2002 419 537 542
17. P. R. Liu C. L. Feasley F. E. Regnier J. Chromatogr., A 2004 1047 221 227
18. M. Palmblad M. Ramstrom K. E. Markides P. Hakansson J. Bergquist Anal. Chem. 2002 74 5826 5830
19. N. J. Morris M. Bushfield B. E. Lavan M. D. Houslay Biochem. J. 1994 301 693 702
20. A. Stensballe S. Andersen O. N. Jensen Proteomics 2001 1 207 222
21. R. Jenness D. E. Sloan Dairy Sci. Abstr. 1970 32 599 610
22. R. J. Carroll J. J. Basch Food Microstruct. 1985 4 323 331
23. L. K. Rasmussen H. A. Due T. E. Petersen Comp. Biochem. Physiol., B: Biochem. Mol. Biol. 1995 111 75 81
24. H. M. Farrell E. L. Malin E. M. Brown P. X. Qi Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2006 11 135 147
25. S. M. Sood P. J. Herbert C. W. Slattery J. Dairy Sci. 1998 81 3149 3153
26. S. M. Sood G. Erickson C. W. Slattery Protein J. 2005 24 227 232
27. E. S. Sorensen L. Moller M. Vinther T. E. Petersen L. K. Rasmussen Eur. J. Biochem. 2003 270 3651 3655
28. M. Wilm A. Shevchenko T. Houthaeve S. Breit L. Schweigerer T. Fotsis M. Mann Nature 1996 379 466 469
29. M. L. Nielsen M. M. Savitski R. A. Zubarev Mol. Cell. Proteomics 2005 4 835 845
30. D. N. Perkins D. J. C. Pappin D. M. Creasy J. S. Cottrell Electrophoresis 1999 20 3551 3567
31. H. Steen J. A. Jebanathirajah M. Springer M. W. Kirschner Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 3948 3953
32. M. M. Savitski M. L. Nielsen R. A. Zubarev Mol. Cell. Proteomics 2006 5 935 948
33. D. Tsur S. Tanner E. Zandi V. Bafna P. A. Pevzner Nat. Biotechnol. 2005 23 1562 1567