Tools in metabonomics: An integrated validation approach for LC-MS metabolic profiling of mercapturic acids in human urine

Analytical Chemistry

Volumn 79, Issue 7, 2007, Pages 2918-2926

  Wagner, Silvia ^a   Scholz, Karoline ^a   Sieber, Maximilian ^a   Kellert, Marco ^a   Voelkel, Wolfgang ^a,b  

^a UNIVERSITY OF WÜRZBURG   (Germany)

^b Bavarian Health and Food Safety Authority   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANIMALS; BIOMARKERS; BODY FLUIDS; DATA PROCESSING; DISEASES; STANDARDS; TOXICITY;

MERCAPTURATE PATTERN; MERCAPTURIC ACIDS; METABONOMICS;

METABOLISM;

ACETYLCYSTEINE;

ADULT; AMINO ACID ANALYSIS; ARTICLE; CONFOUNDING VARIABLE; FEASIBILITY STUDY; FEMALE; HUMAN; HUMAN EXPERIMENT; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MALE; MASS SPECTROMETRY; NORMAL HUMAN; SEX DIFFERENCE; TIME; URINALYSIS; VALIDATION PROCESS;

ACETYLCYSTEINE; ADULT; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; DATABASES; FEMALE; HUMANS; MALE; MASS SPECTROMETRY; MIDDLE AGED; MULTIVARIATE ANALYSIS; REFERENCE VALUES; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; TIME FACTORS;

EID: 34247115128     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac062153w     Document Type: Article

References (42)

1. Nicholson, J. K.; Lindon, J. C.; Holmes, E. Xenobiotica 1999, 29, 1181-1189.
2. Rochfort, S. J. Nat. Prod. 2005, 68, 1813-1820.
3. Lindon, J. C.; Keun, H. C.; Ebbels, T. M.; Pearce, J., M.; Holmes, E.; Nicholson, J. K. Pharmacogenomics 2005, 6, 691-699.
4. Fiehn, O.; Kristal, B.; Van Ommen, B.; Sumner, L. W.; Sansone, S.-A.; Taylor, C.; Hardy, N.; Kaddurah-Daouk, R. OMICS 2006, 10, 158-163.
5. Van der Greet, J.; Smilde, A. K. J. Chemom. 2006, 19, 376-386.
6. Kochhar, S.; Jacobs, D. M.; Ramadan, Z.; Berruex, F.; Fuerholz, A.; Fay, L. B. Anal. Biochem. 2006, 352, 274-281.
7. Stella, C.; Beckwith-Hall, B.; Cloarec, O.; Holmes, E.; Lindon, J. C.; Powell, J.; van der Ouderaa, F.; Bingham, S.; Cross, A. J.; Nicholson, J. K. J. Proteome Res. 2006, 5, 2780-2788.
8. Clayton, T. A.; Lindon, J. C.; Cloarec, O.; Antti, H.; Charuel, C.; Hanton, G.; Provost, J.-P.; Le Net, J.-L.; Baker, D.; Walley, R. J.; Everett, J. R.; Nicholson, J. K. Nature 2006, 440, 1073-1077.
9. 't Hart, B. A.; Vogels, J. T. W. E.; Spijksma, G.; Brok, H. P. M.; Polman, C.; van der Greet, J. J. Neurol. Sci. 2003, 212, 21-30.
10. Rubingh, C. M.; Bijlsma, S.; Derks, E. P. P. A.; Bobeldijk, I.; Verheij, E. R.; Kochhar, S.; Smilde, A. K. Metabolomics 2006, 2, 53-61.
11. Lenz, E. M.; Bright, J.; Wilson, I. D.; Morgan, S. R.; Nash, A. F. J. Pharm. Biomed. Anal. 2003, 33, 1103-1115.
12. Solanky, K. S.; Bailey, N. J.; Beckwith-Hall, B. M.; Bingham, S.; Davis, A.; Holmes, E.; Nicholson, J. K.; Cassidy, A. J. Nutr. Biochem. 2005, 16, 236-244.
13. Brindle, J. T.; Antti, H.; Holmes, E.; Tranter, G.; Nicholson, J. K.; Bethell, H. W.; Clarke, S.; Schofield, P. M.; McKilligin, E.; Mosedale, D. E.; Grainger, D. J. Nat. Med. 2002, 8, 1439-1444.
14. Wilson, I. D.; Nicholson, J. K.; Castro-Perez, J.; Granger, J. H.; Johnson, K. A.; Smith, B. W.; Plumb, R. S. J. Proteome Res. 2005, 4, 591-598.
15. Lu, G.; Wang, J.; Zhao, X.; Kong, H.; Xu, G. Chin. J. Chromatogr. 2006, 24, 109-113.
16. Lutz, U.; Lutz, R. W.; Lutz, W. K. Anal. Chem. 2006, 78, 4564-4571.
17. Dieterle, F.; Ross, A.; Schlotterbeck, G.; Senn, H. Anal. Chem. 2006, 78, 4281-4290.
18. Craig, A.; Cloarec, O.; Holmes, E.; Nicholson, J. K.; Lindon, J. C. Anal. Chem. 2006, 78, 2262-2267.
19. Yang, J.; Xu, G.; Zheng, Y.; Kong, H.; Pang, T; Lv, S.; Yang, Q. J. Chromatogr. B 2004, 813, 59-65.
20. Wang, C.; Kong, H.; Guan, Y.; Yang, J.; Gu, J.; Yang, S.; Xu, G. Anal. Chem. 2005, 77, 4108-4116.
21. Idborg, H.; Zamani, L.; Edlund, P. O.; Schuppe-Koistinen, I.; Jacobsson, S. P. J. Chromatogr. B 2005, 828, 9-13.
22. Nordstroem, A.; O'Maille, G.; Qin, C.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 3289-3295.
23. Zell, M.; Husser, C.; Erdin, R.; Hopfgartner, G. J. Chromatogr. B 1997, 694, 135-143.
24. Bijlsma, S.; Bobeldijk, I.; Verheij, E. R.; Ramaker, R.; Kochhar, S.; Macdonald, I. A.; van Ommen, B.; Smilde, A. K. Anal. Chem. 2006, 78, 567-574.
25. Smith, C. A.; Want, E. J.; O'Maille, G.; Abagyan, R.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 779-787.
26. Teahan, O.; Gamble, S.; Holmes, E.; Waxman, J.; Nicholson, J. K.; Bevan, C.; Keun, H. C. Anal. Chem. 2006, 78, 4307-4318.
27. Tate, A. R.; Damment, S. J.; Lindon, J. C. Anal. Biochem. 2001, 291, 17-26.
28. Sangster, T.; Major, H.; Plumb, R.; Wilson, A. J.; Wilson, I. D. Analyst 2006, 131, 1075-1078.
29. Scholz, K.; Dekant, W.; Völkel, W.; Pahler, A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 1976-1984.
30. Wagner, S.; Scholz, K.; Donegan, M.; Burton, L.; Wingate, J.; Voelkel, W. Anal. Chem. 2006, 78, 1296-1305.
31. Kellert, M.; Scholz, K.; Wagner, S.; Dekant, W.; Volkel, W. J. Chromatogr. A 2006, 1131, 58-66.
32. Dekant, W.; Metzler, M.; Henschler, D. J. Biochem. Toxicol. 1986, 1, 57-72.
33. Junge, W.; Wilke, B.; Halabi, A.; Klein, G. Clin. Chim. Acta 2004, 344, 137-148.
34. Fennell, T. R.; Sumner, S. C.; Snyder, R. W.; Burgess, J.; Friedman, M. A. Toxicol. Sci. 2006, 93, 256-267.
35. Liao, P. C.; Li, C. M.; Lin, L. C.; Hung, C. W.; Shih, T. S. J. Anal. Toxicol. 2002, 26, 205-210.
36. Brink, A.; Lutz, U.; Voelkel, W.; Lutz, W. K. J. Chromatogr. B 2006, 830, 255-261.
37. Eriksson, L.; Johansson, E.; Kettaneh-Wold, N.; Wold, S. Multi- and Megavariate Data Analysis: Principles and Applications; Umetrics Academy: Umeå, Sweden, 2001.
38. Jonsson, P.; Bruce, S. J.; Moritz, T.; Trygg, J.; Sjoestroem, M.; Plumb, R.; Granger, J.; Maibaum, E.; Nicholson, J. K.; Holmes, E.; Antti, H. Analyst 2005, 130, 701-707.
39. Lenz, E. M.; Bright, J.; Wilson, I. D.; Hughes, A.; Morrisson, J.; Lindberg, H.; Lockton, A. J. Pharm. Biomed. Anal. 2004, 36, 841-849.
40. Bollard, M. E.; Holmes, E.; Lindon, J. C.; Mitchell, S. C.; Branstetter, D.; Zhang, W.; Nicholson, J. K. Anal. Biochem. 2001, 295, 194-202.
41. Andrews, R. S.; Bond, C. C.; Burnett, J.; Saunders, A.; Watson, K. J. Int. Med. Res. 1976, 4, 34-39.
42. Trygg, J.; Wold, S. J. Chemom. 2002, 16, 119-128.