Model of fluorescence intermittency in single enzymes

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 9, 2007, Pages 2377-2384

  Chaudhury, Srabanti ^a   Kou, S C ^b   Cherayil, Binny J ^a  

^a INDIAN INSTITUTE OF SCIENCE   (India)

^b HARVARD UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CORRELATION METHODS; ENZYMES; FLUORESCENCE; GAUSSIAN NOISE (ELECTRONIC); MATHEMATICAL MODELS; RANDOM PROCESSES;

FLUORESCENCE INTERMITTENCY; INTENSITY FLUCTUATIONS; NANOSCALE SYSTEMS; SIGNAL INTENSITY;

LIGHT EMISSION;

EID: 33947514883     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp065737a     Document Type: Article

References (56)

1. Lippitz, M.; Kulzer, F.; Orrit, M. ChemPhysChem 2005, 6, 770.
2. (a) Verberk, R.; van Oijen, A. M.; Orrit, M. Phys. Rev. B 2002, 66, 233202.
3. (b) Verberk, R.; Orrit, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2214.
4. Kuno, M.; Fromm, D. P.; Johnson, S. T.; Gallagher, A.; Nesbitt, D. J. Phys. Rev. B 2003, 67, 125304.
5. (a) Lu, H. P.; Xun, L.; Xie, X. S. Science 1998, 282, 1877.
6. (b) Schenter, G. K.; Lu, H. P.; Xie, X. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10477.
7. (a) Velonia, K.; Flomenbom, O.; Loos, D.; Masuo, S.; Cotlet, M.; Engelborghs, Y.; Hofkens, J.; Rowan, A. E.; Klafter, J.; Nolle, R. J. M.; de Schryver, F. C. Angew. Chem.. Int. Ed. 2005, 44, 560.
8. (b) Flomenbom, O.; Velonia, K.; Loos, D.; Masuo, S.; Cotlet, M.; Engelborghs, Y.; Hofkens, J.; Rowan, A. E.; Nolte, R. J. M.; Van der Auweraer, M.; de Schryver, F. C.; Klafter, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 2368.
9. Zwanzig, R. Acc. Chem. Res. 1990, 23, 148;
10. J. Chem. Phys. 1992, 97, 3587.
11. Wang, J.; Wolynes, P. Chem. Phys. Lett. 1993, 2/2, 427;
12. Chem. Phys. 1994, 180, 141;
13. J. Chem. Phys. 1999, 110, 4812.
14. Pechukas, P.; Hanggi, P. Phys. Rev. Lett. 1994, 73, 2772.
15. Debnath, A.; Chakrabarti, R.; Sebastian, K. L. J. Chem. Phys. 2006, 124, 204111.
16. Garcia-Viloca, M.; Gao, J.; Karplus, M.; Truhlar, D. G. Science 2004, 303, 186.
17. Xie, X. S. Single Mol. 2001, 4, 229.
18. Yang, S.; Cao, J. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10996.
19. Min, W.; English, B. P.; Luo, G.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Acc. Chem. Res. 2005, 38, 923.
20. Min, W.; Xie, X. S. Phys. Rev. E 2006, 73, 010902(R).
21. (a) Kou, S. C.; Xie, X. S. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 180603.
22. (b) Min, W.; Luo, G.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 198302.
23. Mandelbrot, B.; van Ness, J. SIAM Rev. 1968, 10, 422.
24. Lim, S. C.; Muniandy, S. V. Phys. Rev. E 2002, 66, 021114.
25. Fa, K. S.; Lenzi, E. K. Phys. Rev. E 2005, 71, 012101.
26. English, B. P.; Min, W.; van Oijen, A. M.; Lee, K. T.; Luo, G.; Sun, H.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 87.
27. Chaudhury, S.; Cherayil, B. J. J. Chem. Phys. 2006, 125, 024904, 114106.
28. Tang, J.; Marcus, R. A. Phys. Rev. Lett. 2005, 95, 107401;
29. J. Chem. Phys. 2005, 123, 054704, 204511;
30. Phys. Rev. E 2006, 73, 022102.
31. Okuyama, S.; Oxtoby, D. J. Chem. Phys. 1986, 84, 5824, 5830.
32. Hänggi, P. In Stochastic Processes Applied to Physics; Pasquera, L., Rodriguez, M., Eds.; World Scientific: Philadelphia, PA, 1985; pp 69-95.
33. Hänggi, P. In Noise in Nonlinear Dynamical Systems; Moss, F., McClintock, P. V. E., Eds.; Cambridge University Press: New York, 1989; Vol. 1, Chapter 9, pp 307-328.
34. San Miguel, M.; Sancho, M. J. Stat. Phys. 1980, 22, 605.
35. Hernández-Machado, A.; Sancho, J. M.; San Miguel, M.; Pesquera, L. Z. Phys. B 1983, 52, 335.
36. Fox, R. F. Phys. Rev. A 1986, 33, 467.
37. Morita, A.; Bagchi, B. J. Chem. Phys. 1999, 110, 8643.
38. Hynes, J. T. J. Phys. Chem. 1986, 90, 3701.
39. Yang, H.; Luo, G.; Karnchanaphanurach, P.; Louie, T.-M.; Rech, I.; Cova, S.: Xun, L.; Xie, X. S. Science 2003, 302, 262.
40. Vinales, A. D.; Despósito, M. A. Phys. Rev. E 2006, 73, 016111.
41. Erdélyi, A.; Magnus, W.; Oberhettinger, F.; Tricomi, F. G. Higher Transcendental Functions; McGraw-Hill: New York, 1953; Vol. 3.
42. Hanggi, P.; Mojtabai, F. Phys. Rev. A 1982, 26, 1168.
43. Hanggi, P. J. Stat. Phys. 1986, 42, 105; 44, 1003;
44. Z. Phys. B 1978, 31, 407.
45. Hanggi, P.; Thomas, H.; Grabert, H.; Talkner, P. J. Stat. Phys. 1978, 18, 155.
46. Adelman, S. A. J. Chem. Phys. 1976, 64, 124.
47. Hanggi, P.; Thomas, H. Z. Phys. B 1977, 26, 85.
48. Hanggi, P. Z. Phys. B 1978, 31, 407.
49. Kohen, D.; Tannor, D. J. J. Chem. Phys. 1995, 103, 6013.
50. Barkai, E.; Jung, Y.; Silbey, R. Annu. Reu. Phys. Chem. 2004, 55, 457.
51. He, Y.; Barkai, E. J. Chem Phys. 2005, 122, 184703.
52. Kneller, G. R. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2641. Debnath, P.; Min, W.; Xie, X. S.;
53. Cherayil, B. J. J. Chem. Phys. 2005, 123, 204903.
54. Luo, G.; Andricioaei, I.; Xie, X. S.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 9363.
55. Tang, J.; Marcus, R. A. Phys. Rev. E 2006, 73, 022102.
56. Tang, J.; Lin, S.-H. Phys. Rev E 2006, 73, 061108.