Structural investigations of poly(amido amine) dendrimers in methanol using molecular dynamics

Journal of Polymer Science, Part B: Polymer Physics

Volumn 44, Issue 21, 2006, Pages 3062-3077

  Opitz, Armin W ^a   Wagner, Norman J ^a  

^a UNIVERSITY OF DELAWARE   (United States)

Author keywords

Backfolding; Dendrimers; Molecular dynamics; Pair correlation function; Radius of gyration; Simulations; Structure; X ray

Indexed keywords

BACKFOLDING; CORRELATION FUNCTION; PROTONATION; RADIUS OF GYRATION;

COMPUTER SIMULATION; DENDRIMERS; MOLECULAR DYNAMICS; PH EFFECTS; POLYAMIDEIMIDES; SOLVENTS; X RAY SCATTERING;

METHANOL;

EID: 33750541715     PISSN: 08876266     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/polb.20949     Document Type: Article

References (44)

1. Tomalia, D. A.; Baker, H.; Dewald, J.; Hall, M.; Kallos, G.; Martin, S.; Roeck, J.; Ryder, J.; Smith, P. Polym J 1985, 17, 117-132.
2. Newkome, G. R.; Moorefield, C. N.; Vogtle, F. Dendrimers, 2nd ed.; Wiley: Chichester, England, 2001.
3. Liu, Y. L.; Zhao, M. Q.; Bergbreiter, D. E.; Crooks, R. M. J Am Chem Soc 1997, 119, 8720-8721.
4. Mak, C. C.; Chow, H. F. Macromolecules 1997, 30, 1228-1230.
5. Gu, Y. L.; Xie, H.; Gao, J. X.; Liu, D. X.; Williams, C. T.; Murphy, C. J.; Ploehn, H. J. Langmuir 2005, 21, 3122-3131.
6. Chen, C. Z. S.; Cooper, S. L. Biomaterials 2002, 23, 3359-3368.
7. Hanus, L. H.; Sooklal, K.; Murphy, C. J.; Ploehn, H. J. Langmuir 2000, 16, 2621-2626.
8. Crooks, R. M.; Zhao, M. Q.; Sun, L.; Chechik, V.; Yeung, L. K. Ace Chem Res 2001, 34, 181-190.
9. Scott, R. W. J.; Wilson, O. M.; Crooks, R. M. J Phys Chem B 2005, 109, 692-704.
10. Mackay, M. E.; Hong, Y.; Jeong, M.; Tande, B. M.; Wagner, N. J.; Hong, S.; Gido, S. P.; Vestberg, R.; Hawker, C. J. Macromolecules 2002, 35, 8391-8399.
11. Tande, B. M.; Wagner, N. J.; Mackay, M. E.; Hawker, C. J.; Jeong, M. Macromolecules 2001, 34, 8580-8585.
12. Bodnar, I.; Silva, A. S.; Kim, Y. H.; Wagner, N. J. J Polym Sci Part B: Polym Phys 2000, 38, 874-882.
13. Bodnar, I.; Silva, A. S.; Deitcher, R. W.; Weisman, N. E.; Kim, Y. H.; Wagner, N. J. J Polym Sci Part B: Polym Phys 2000, 38, 857-873.
14. Kobayashi, H.; Kawamoto, S.; Saga, T.; Sato, N.; Hiraga, A.; Konishi, J.; Togashi, K.; Brechbiel, M. W. J Magn Res Imaging 2001, 14, 705-713.
15. Bielinska, A.; Kukowska Latallo, J. F.; Johnson, J.; Tomalia, D. A.; Baker, J. R. Nucl Acids Res 1996, 24, 2176-2182.
16. Barth, R. F.; Adams, D. M.; Soloway, A. H.; Alam, F.; Darby, M. V. Bioconjugate Chem 1994, 5, 58-66.
17. Tande, B. M.; Deitcher, R. W.; Sandier, S. I.; Wagner, N. J. J Chem Eng Data 2002, 47, 376-377.
18. Lieu, J. G.; Liu, M. J.; Frechet, J. M. J.; Prausnitz, J. M. J Chem Eng Data 1999, 44, 613-620.
19. Ballauff, M.; Likos, C. N. Angew Chem Int Ed 2004, 43, 2998-3020.
20. Degennes, P. G.; Hervet, H. J Phys Lett 1983, 44, 351-360.
21. Lescanec, R. L.; Muthukumar, M. Macromolecules 1990, 23, 2280-2288.
22. Rosenfeldt, S.; Dingenouts, N.; Ballauff, M.; Lindner, P.; Likos, C. N.; Werner, N.; Vogtle, F. Macromol Chem Phys 2002, 203, 1995-2004.
23. Ramzi, A.; Scherrenberg, R.; Brackman, J.; Joosten, J.; Mortensen, K. Macromolecules 1998, 31, 1621-1626.
24. Scherrenberg, R.; Coussens, B.; van Vliet, P.; Edouard, G.; Brackman, J.; de Brabander, E.; Mortensen, K. Macromolecules 1998, 31, 456-461.
25. Maiti, P. K.; Cagin, T.; Wang, G. F.; Goddard, W. A. Macromolecules 2004, 37, 6236-6254.
26. Prosa, T. J.; Bauer, B. J.; Amis, E. J.; Tomalia, D. A.; Scherrenberg, R. J Polym Sci Part B: Polym Phys 1997, 35, 2913-2924.
27. Tande, B. M.; Wagner, N. J.; Kim, Y. H. Macromolecules 2003, 36, 4619-4623.
28. Chen, W.; Tomalia, D. A.; Thomas, J. L. Macromolecules 2000, 33, 9169-9172.
29. Murat, M.; Grest, G. S. Macromolecules 1996, 29, 1278-1285.
30. Terao, T.; Nakayama, T. Macromolecules 2004, 37, 4686-4694.
31. Harreis, H. M.; Likos, C. N.; Ballauff, M. J Chem Phys 2003, 118, 1979-1988.
32. Mansfield, M. L. Macromolecules 2000, 33, 8043-8049.
33. Lee, I.; Athey, B. D.; Wetzel, A. W.; Meixner, W.; Baker, J. R. Macromolecules 2002, 35, 4510-4520.
34. Cagin, T.; Wang, G. F.; Martin, R.; Breen, N.; Goddard, W. A. Nanotechnology 2000, 11, 77-84.
35. Canetta, E.; Maino, G. Nucl Instrum Methods Phys Res Sect B 2004, 213, 71-74.
36. Rathgeber, S.; Pakula, T.; Urban, V. J Chem Phys 2004, 121, 3840-3853.
37. Han, M.; Chen, P. Q.; Yang, X. Z. Polymer 2005, 46, 3481-3488.
38. Maiti, P. K.; Cagin, T.; Lin, S. T.; Goddard, W. A. Macromolecules 2005, 38, 979-991.
39. Lin, S. T.; Maiti, P. K.; Goddard, W. A. J Phys Chem B 2005, 109, 8663-8672.
40. Case, D. A.; Pearlman, D. A.; Caldwell, J. W.; Cheatham, T. E., III; Wang, J.; Ross, W. S.; Simmerling, C. L.; Darden, T. A.; Merz, K. M.; Stanton, R. V.; Cheng, A. L.; Vincent, J. J.; Crowley, M.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Radmer, R. J.; Duan, Y.; Pitera, J.; Massova, I.; Seibel, G. L.; Singh, U. C.; Weiner, P. K.; Kollman, P. A. Amber 7, University of California: San Francisco, 2002. http://amber.scripps.edu/
41. Likos, C. N.; Rosenfeldt, S.; Dingenouts, N.; Ballauff, M.; Lindner, P.; Werner, N.; Vogtle, F. J Chem Phys 2002, 117, 1869-1877.
42. Wang, J. M.; Cieplak, P.; Kollman, P. A. J Comput Chem 2000, 21, 1049-1074.
43. Tsui, V.; Case, D. A. Biopolymers 2000, 56, 275-291.
44. Tildesley, D. J.; Allen, M. P. Computer Simulation of Liquids; Oxford University Press: New York, 1987.