Bio-inspired programmable self-assembly on DNA templates

Chemistry Letters

Volumn 35, Issue 7, 2006, Pages 694-699

  Tanaka, Kentaro ^a   Shionoya, Mitsuhiko ^a  

^a UNIVERSITY OF TOKYO   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33749346766     PISSN: 03667022     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1246/cl.2006.694     Document Type: Review

References (81)

1. a) N. C. Seeman, Nature 2003, 421, 427.
2. b) N. C. Seeman, Int. J. Nanotechnol. 2005, 2, 348.
3. c) N. C. Seeman, Methods Mol. Biol. 2005, 303, 143.
4. d) N. C. Seeman, P. S. Lukeman, Rep. Prog. Phys. 2005, 68, 237.
5. a) C. M. Niemeyer, Appl. Phys. A 1999, 68, 119.
6. b) C. M. Niemeyer, Curr. Opin. Chem. Biol. 2000, 4, 609.
7. c) C. M. Niemeyer, Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 4128.
8. d) C. M. Niemeyer, Trends. Biotechnol. 2002, 20, 395.
9. K. V. Gothelf, T. H. LaBean, Org. Biomol. Chem. 2005, 3, 4023.
10. J. Wangel, Org. Biomol. Chem. 2004, 2, 277.
11. J. J. Storhoff, C. A. Mirkin, Chem. Rev. 1999, 99, 1849.
12. Y. Sun, C.-H. Kiang, in Handbook of Nanostructured Biomaterials and Their Applications in Nanobiotechnology, ed. by H. S. Nalwa, American Scientific Publishers, Stevenson Ranch, 2005, Vol. 2, pp. 223-247.
13. Oligonucleotide Synthesis: A Practical Approach, ed. by M. J. Gait, IRL Press, New York, 1990.
14. N. C. Seeman, J. Theor. Biol. 1982, 99, 237.
15. a) C. M. Niemeyer, T. Sano, C. L. Smith, C. R. Cantor, Nucleic Acids Res. 1994, 22, 5530.
16. b) C. M. Niemeyer, W. Bürger, J. Peplies, Angew. Chem., Int. Ed. 1998, 37, 2265.
17. c) C. M. Niemeyer, M. Adler, B. Pignataro, S. Lenhert, S. Gao, L. Chi, H. Fuchs, D. Blohm, Nucleic Acids Res. 1999, 27, 4553.
18. d) C. M. Niemeyer, M. Adler, S. Gao, L. Chi, Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 3055.
19. e) C. M. Niemeyer, M. Adler, S. Lenhert, S. Gao, H. Fuchs, L. Chi, ChemBioChem 2001, 2, 260.
20. a) H. Yan, S.-H. Park, G. Finkelstein, J. H. Reif, T. H. LaBean, Science 2003, 301, 1882.
21. b) H. Li, S.-H. Park, J. H. Reif, T. H. LaBean, H. Yan, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 418.
22. c) S.-H. Park, P. Yin, Y. Liu, J. H. Reif, T. H. LaBean, H. Yan, Nano Lett. 2005, 5, 729.
23. d) S.-H. Park, C. Pistol, S.-J. Ahn, J. H. Reif, A. R. Lebeck, C. Dwyer, T. H. LaBean, Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 735.
24. C. A. Mirkin, R. L. Letsinger, R. C. Mucic, J. J. Storhoff, Nature 1996, 382, 607.
25. A. P. Alivisatos, K. P. Johnsson, X. Peng, T. E. Wilson, T. C. J. Loweth, M. P. Bruchez, P. G. Schultz, Nature 1996, 382, 609.
26. E. Katz, I. Willner, Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 6042.
27. N. L. Rosi, C. A. Mirkin, Chem. Rev. 2005, 105, 1547.
28. a) S. Kawahara, T. Uchimaru, S. Murata, Chem. Commun. 1999, 563.
29. b) Y. Ohya, K. Yabuki, M. Komatsu, S. Murata, Polym. Adv. Technol. 2000, 11, 845.
30. c) Y. Ohya, K. Yabuki, M. Hashimoto, A. Nakajima, T. Ouchi, Bioconjugate Chem. 2003, 14, 1057.
31. d) I. Horsey, W. S. Furey, J. G. Harrision, M. A. Osborne, S. Balasubramanian, Chem. Commun. 2000, 1043.
32. e) A. K. Tong, S. Jackusch, Z. Li, H.-R. Zhu, D. L. Akins, N. J. Turro, J. Ju, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12923.
33. f) J. Liu, Y. Lu, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 15208.
34. g) M. Heilemann, P. Tinnefeld, G. S. Mosteiro, M. G. Parajo, N. F. Van Hulst, M. Sauer, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6514.
35. P. D. Cook, in Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, ed. by S. L. Beaucage, D. E. Bergstrom, G. D. Glick, R. A. Jones, Wiley, New York, 2001, Unit 4.1.
36. D. E. Bergstrom, in Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, ed. by S. L. Beaucage, D. E. Bergstrom, G. D. Glick, R. A. Jones, Wiley, New York, 2001, Unit 1.4.
37. E. T. Kool, Acc. Chem. Res. 2002, 35, 936.
38. a) H. Asanuma, T. Ito, T. Yoshida, X. G. Liang, M. Komiyama, Angew. Chem., Int. Ed. 1999, 38, 2393.
39. b) H. Kashida, M. Tanaka, S. Baba, T. Sakamoto, G. Kawai, H. Asanuma, M. Komiyama, Chem. - Eur. J. 2006, 12, 777.
40. c) M. D. Sørensen, M. Petersen, J. Wengel, Chem. Commun. 2003, 2130.
41. d) M. Nakamura, Y. Ohtoshi, K. Yamana, Chem. Commun. 2005, 5163.
42. D. J. Hurley, Y. Tor, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 2194.
43. H. Morales-Rojas, E. T. Kool, Org. Lett. 2002, 4, 4377.
44. a) J. A. Piccirilli, T. Krauch, S. E. Moroney, S. A. Benner, Nature 1990, 343, 33.
45. b) J. J. Voegel, S. A. Benner, J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 6929.
46. c) J. D. Bain, A. R. Chamberlin, C. Y. Switzer, S. A. Benner, Nature 1992, 356, 537.
47. d) C. Y. Switzer, S. E. Moroney, S. A. Benner, Biochemistry 1993, 32, 10489.
48. e) J. Horlacher, M. Hottiger, V. N. Podust, U. Hübscher, S. A. Benner, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 6329.
49. a) B. A. Schweizer, E. T. Kool, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 1863.
50. b) R. X.-F. Ren, N. C. Chaudhuri, P. L. Paris, S. Rumney, IV, E. T. Kool, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7671.
51. c) S. Moran, R. X.-F. Ren, E. T. Kool, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 10506.
52. d) S. Moran, R. X.-F. Ren, S. I. Rumney, E. T. Kool, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2056.
53. e) E. T. Kool, Biopolymers 1998, 48, 3.
54. f) J. C. Morales, K. M. Guckian, C. Shails, E. T. Kool, J. Org. Chem. 1998, 63, 9652.
55. g) K. M. Guckian, E. T. Kool, Angew. Chem., Int. Ed. 1997, 36, 2825.
56. h) K. M. Guckian, T. R. Krugh, E. T. Kool, Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 954.
57. i) K. M. Guckian, T. R. Krugh, E. T. Kool, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6841.
58. j) B. M. O'Neill, J. E. Ratto, K. L. Good, D. Tahmassebi, S. A. Helquist, J. C. Morales, E. T. Kool, J. Org. Chem. 2002, 67, 5869.
59. a) D. L. McMinn, A. K. Ogawa, Y. Wu, J. Liu, P. G. Schultz, F. E. Romesberg, J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 11585.
60. b) M. Berger, A. K. Ogawa, D. L. McMinn, Y. Wu, P. G. Schultz, F. E. Romesberg, Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 2940.
61. c) A. K. Ogawa, Y. Wu, D. L. McMinn, J. Liu, P. G. Schultz, F. E. Romesberg, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3274.
62. d) Y. Wu, A. K. Ogawa, M. Berger, D. L. McMinn, P. G. Schultz, F. E. Romesberg, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 7621.
63. a) D. E. Bergstrom, P. Zhang, P. H. Toma, C. A. Andrews, R. Nichols, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 1201.
64. b) P. Zhang, W. T. Johnson, D. Klewer, N. Paul, G. Hoops, V. J. Davisson, Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2208.
65. K. Tanaka, M. Shionoya, J. Org. Chem. 1999, 64, 5002.
66. a) K. Tanaka, M. Tasaka, H. Cao, M. Shionoya, Eur. J. Pharm. Sci. 2001, 13, 77.
67. b) H. Cao, K. Tanaka, M. Shionoya, Chem. Pharm. Bull. 2000, 48, 1745.
68. a) M. Tasaka, K. Tanaka, M. Shiro, M. Shionoya, Supramol. Chem. 2001, 13, 671.
69. b) K. Tanaka, M. Tasaka, H. Cao, M. Shionoya, Supramol. Chem. 2002, 14, 255.
70. K. Tanaka, Y. Yamada, M. Shionoya, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 8802.
71. K. Tanaka, A. Tengeiji, T. Kato, N. Toyama, M. Shiro, M. Shionoya, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12494.
72. M. Shionoya, K. Tanaka, Bull. Chem. Soc. Jpn. 2000, 73, 1945.
73. a) E. Meggers, P. L. Holland, W. B. Tolman, F. E. Romesberg, P. G. Schultz, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 10714.
74. b) S. Atwell, E. Meggers, G. Spraggon, P. G. Schultz, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12364.
75. c) N. Zimmermann, E. Meggers, P. G. Schultz, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 13684.
76. a) H. Weizman, Y. Tor, Chem. Commun. 2001, 43.
77. b) H. Weizman, Y. Tor, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3375.
78. C. Switzer, S. Sinha, P. H. Kim, B. D. Heuberger, Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 1529.
79. G. H. Clever, K. Polborn, T. Carell, Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 7204.
80. K. Tanaka, A. Tengeiji, T. Kato, N. Toyama, M. Shionoya, Science 2003, 299, 1212.
81. M. Shionoya, K. Tanaka, Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 592.