Whole genome expression profiling using DNA microarray for determining biocompatibility of polymeric surfaces

Molecular BioSystems

Volumn 2, Issue 9, 2006, Pages 421-428

  Stangegaard, Michael ^a   Wang, Z ^a   Kutter, J P ^a   Dufva, M ^a   Wolff, A ^a  

^a TECHNICAL UNIVERSITY OF DENMARK   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMATERIAL; ETHANOLAMINE; POLYMER; WATER;

ARTICLE; CELL DIVISION; CELL SHAPE; CHEMISTRY; DNA MICROARRAY; DRUG EFFECT; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE EXPRESSION REGULATION; GENETICS; GENOME; HELA CELL; HUMAN; HYDROPHOBICITY; KINETICS; METHODOLOGY; SURFACE PROPERTY;

BIOCOMPATIBLE MATERIALS; CELL DIVISION; CELL SHAPE; ETHANOLAMINE; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE EXPRESSION REGULATION; GENOME, HUMAN; HELA CELLS; HUMANS; HYDROPHOBICITY; KINETICS; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; POLYMERS; SURFACE PROPERTIES; WATER;

EID: 33747606725     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b608239d     Document Type: Article

References (56)

1. J. Charnley J. Bone Jt Surg. Br. 1960 42-B 28 30
2. G. S. Fiorini D. T. Chiu Biotechniques 2005 38 429 446
3. S. Petronis M. Stangegaard C. B. V. Christensen M. Dufva Biotechniques 2006 40 368 375
4. M. Stangegaard S. Petronis A. Jørgensen C. Christensen M. Dufva Lab Chip 2006 6 1045 1051
5. C. S. Chen X. Jiang G. M. Whitesides MRS Bull. 2005 30 194 201
6. C. J. Kirkpatrick F. Bittinger M. Wagner H. Kohler T. G. van Kooten C. L. Klein M. Otto Proc. Inst. Mech. Eng. Part H 1998 212 75 84
7. Y.-X. Wang J. L. Robertson W. B. Spillman R. O. Claus Pharm. Res. 2004 21 1362 1373
8. D. Williams Med. Device Technol. 2003 14 10 13
9. N. D. Gallant J. R. Capadona A. B. Frazier D. M. Collard A. J. García Langmuir 2002 18 5579 5584
10. A. Sin K. C. Chin M. F. Jamil Y. Kostov G. Rao M. L. Shuler Biotechnol. Prog. 2004 20 338 345
11. J. L. Charest L. E. Bryant A. J. Garcia W. P. King Biomaterials 2004 25 4767 4775
12. S. Bouaidat B. Winther-Jensen S. F. Christensen J. Jonsmann Sens. Actuators, A 2004 110 390 394
13. E. W. H. Jager C. Immerstrand K. H. Peterson K.-E. Magnusson I. Lundström O. Inganäs Biomed. Microdevices 2002 4 177 187
14. A. Dekker C. Panfil M. Valdor G. Pennartz H. Richter C. H. Mittermayer C. J. Kirkpatrick Cells Mater. (USA) 1994 4 101 112
15. C. J. Kirkpatrick A. Dekker Adv. Biomater. 1992 10 31
16. T. G. V. Kooten C. L. Klein H. Kohler C. J. Kirkpatrick D. F. Williams R. Eloy J. Mater. Sci.: Mater. Med. 1997 8 835 841
17. M. J. Dalby L. D. Silvio E. J. Harper W. Bonfield J. Mater. Sci.: Mater. Med. 2002 13 311 314
18. C. J. Kirkpatrick t. Otterbach d. Anderheiden j. Schiefer H. Richter H. Höcker C. H. Mittermayer A. Dekker Cells Mater. 1992 2 166 177
19. K. E. Geckeler R. Wacker W. K. Aicher Naturwissenschaften 2000 87 351 354
20. D. V. Nicolau T. Taguchi H. Tanigawa S. Yoshikawa Biosens. Bioelectron. 1996 11 1237 1252
21. D. Irimia J. O. M. Karlsson Biomed. Microdevices 2003 5 185 194
22. H. Lorenz M. Despont N. Fahrni N. LaBianca P. Renaud P. Vettiger J. Micromech. Microeng. 1997 7 121 124
23. K. B. Mogensen J. El-Ali A. Wolff J. P. Kutter Appl. Opt. 2003 42 4072 4079
24. Z. Wang J. El-Ali I. R. P. Nielsen K. B. Mogensen D. Snakenborg J. P. Kutter A. Wolff Lab Chip 2004 4 372 377
25. J. Hsieh C. J. Weng H. L. Yin H. H. Lin H. Y. Chou Microsyst. Technol. 2005 11 429 437
26. T. Mappes S. Achenbach A. Last J. Mohr R. Truckenmüller Microsyst. Technol. 2004 10 560 563
27. J. Zhang K. L. Tan H. Q. Gong Polym. Test. 2001 20 693 701
28. G. Kotzar M. Freas P. Abel A. Fleischman S. Roy C. Zorman J. M. Moran J. Melzak Biomaterials 2002 23 2737 2750
29. S. Bouaidat C. Berendsen P. Thomsen S. G. Petersen A. Wolff J. Jonsmann Lab Chip 2004 4 632 637
30. J. El-Ali I. R. Perch-Nielsen C. R. Poulsen D. D. Bang P. Telleman A. Wolff Sens. Actuators, A 2004 110 3 10
31. N. Zhang J. Xie M. Guers V. K. Varadan Smart Mater. Struct. 2003 12 260 263
32. Y. Song C. S. S. R. Kumar J. Hormes J. Micromech. Microeng. 2004 14 932 940
33. N. Iranpoor P. Salehi Tetrahedron 1995 51 909 912
34. M. Nordström R. Marie M. Calleja A. Boisen J. Micromech. Microeng. 2004 14 1614 1617
35. R. J. Cho M. J. Campbell E. A. Winzeler L. Steinmetz A. Conway L. Wodicka T. G. Wolfsberg A. E. Gabrielian D. Landsman D. J. Lockhart R. W. Davis Mol. Cell 1998 2 65 73
36. P. T. Spellman G. Sherlock M. Q. Zhang V. R. Iyer K. Anders M. B. Eisen P. O. Brown D. Botstein B. Futcher Mol. Biol. Cell 1998 9 3273 3297
37. V. R. Iyer M. B. Eisen D. T. Ross G. Schuler T. Moore J. C. Lee J. M. Trent L. M. Staudt J. Hudson, Jr. M. S. Boguski D. Lashkari D. Shalon D. Botstein P. O. Brown Science 1999 283 83 87
38. V. G. Tusher R. Tibshirani G. Chu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 5116 5121
39. S. M. Dhanasekaran T. R. Barrette D. Ghosh R. Shah S. Varambally K. Kurachi K. J. Pienta M. A. Rubin A. M. Chinnaiyan Nature 2001 412 822 826
40. S. A. Ahrendt S. Halachmi J. T. Chow L. Wu N. Halachmi S. C. Yang S. Wehage J. Jen D. Sidransky Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 7382 7387
41. A. A. Alizadeh M. B. Eisen R. E. Davis C. Ma I. S. Lossos A. Rosenwald J. C. Boldrick H. Sabet T. Tran X. Yu J. I. Powell L. Yang G. E. Marti T. Moore J. Hudson, Jr. L. Lu D. B. Lewis R. Tibshirani G. Sherlock W. C. Chan T. C. Greiner D. D. Weisenburger J. O. Armitage R. Warnke L. M. Staudt Nature 2000 403 503 511
42. T. R. Golub D. K. Slonim P. Tamayo C. Huard M. Gaasenbeek J. P. Mesirov H. Coller M. L. Loh J. R. Downing M. A. Caligiuri C. D. Bloomfield E. S. Lander Science 1999 286 531 537
43. L. T. Allen E. J. Fox I. Blute Z. D. Kelly Y. Rochev A. K. Keenan K. A. Dawson W. M. Gallagher Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 6331 6336
44. F. Carinci F. Pezzetti S. Volinia F. Francioso D. Arcelli E. Farina A. Piattelli Biomaterials 2004 25 215 228
45. C. R. Poulsen J. El-Ali I. R. Perch-Nielsen D. D. Bang P. Telleman A. Wolff J. Rapid Methods Autom. Microbiol. 2005 13 111 126
46. F. Fixe M. Dufva P. Telleman C. B. Christensen Lab Chip 2004 4 191 195
47. R. Marie S. Schmid A. Johansson L. Ejsing M. Nordström D. Häfliger C. Christensen A. Boisen M. Dufva Biosens. Bioelectron. 2006 21 1327 1332
48. L. A. Roberts H. Glenn C. S. Hahn B. S. Jacobson J. Cell Physiol. 2003 196 196 205
49. J. B. Weitzman L. Fiette K. Matsuo M. Yaniv Mol. Cell 2000 6 1109 1119
50. X. M. Zheng D. Black P. Chambon J. M. Egly Nature 1990 344 556 559
51. M. Dufva C. Christensen Expert Rev. Proteomics 2005 2 41 48
52. I. V. Yang E. Chen J. P. Hasseman W. Liang B. C. Frank S. Wang V. Sharov A. I. Saeed J. White J. Li N. H. Lee T. J. Yeatman J. Quackenbush Genome Biol. 2002 3 R62
53. C. Workman L. J. Jensen H. Jarmer R. Berka L. Gautier H. B. Nielser H. H. Saxild C. Nielsen S. Brunak S. Knudsen Genome Biol. 2002 3 R48
54. A. Irizarry Rafael Laurent Gautier Benjamin Milo Bolstad Crispin Miller M. Astrand Leslie M. Cope Robert Gentleman Jeff Gentry Conrad Halling Wolfgang Huber James MacDonald Benjamin I. P. Rubinstein C. Workman J. Zhang affy: Methods for Affymetrix Oligonucleotide Arrays. R package. 2005
55. R. C. Gentleman V. J. Carey D. M. Bates B. Bolstad M. Dettling S. Dudoit B. Ellis L. Gautier Y. Ge J. Gentry K. Hornik T. Hothorn W. Huber S. Iacus R. Irizarry F. Leisch C. Li M. Maechler A. J. Rossini G. Sawitzki C. Smith G. Smyth L. Tierney J. Y. Yang J. Zhang GenomeBiology 2004 5 R80
56. R_Development_Core_Team, R: A language and environment for statistical computing, R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria, 2005