Hydrogen atom and hydride anion addition to adenine: Structures and energetics

ChemPhysChem

Volumn 7, Issue 7, 2006, Pages 1471-1480

  Evangelista, Francesco A ^a   Schaefer III, Henry F ^a  

^a UNIVERSITY OF GEORGIA   (United States)

Author keywords

Adenine; Density functional calculations; DNA damage; Hydrogen; Radicals

Indexed keywords

CARBON; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ELECTRON AFFINITY; ELECTRONS; HYDRIDES; HYDROGEN; HYDROGEN BONDS; NEGATIVE IONS;

ADENINE; ADIABATIC ELECTRON AFFINITY; DNA DAMAGES; ELECTRON DETACHMENTS; OPTIMIZED GEOMETRIES; RADICALS; VERTICAL DETACHMENT ENERGIES; VERTICAL ELECTRON AFFINITIES;

ATOMS;

EID: 33745968432     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.200600049     Document Type: Article

References (59)

1. J. E. Cleaver, DNA Repair 2002, 1, 977-979.
2. D. M. Close, Radiat. Res. 1993, 135, 1-15.
3. S. Steenken, L. Goldbergerova, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 3928-3934.
4. T. Douki, D. Angelov, J. Cadet, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11 360-11 366.
5. D. Douki, J. L. Ravanat, D. Angelov, J. R. Wagner, J. Cadet, Top. Curr. Chem. 2004, 236, 1-25.
6. S. Steenken, Chem. Rev. 1989, 89, 503-520.
7. A. J. S. C. Vieira, S. Steenken, J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 6986-6994.
8. W. K. Pogozelski, T. D. Tullius, Chem. Rev. 1998, 98, 1089-1107.
9. C. Chatgilialoglu, M. Guerra, Q. G. Mulazzani, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3839-3848.
10. L. E. Ramirez-Arizmendi, J. L. Heidbrink, L. P. Guler, H. I. Kenttamaa, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 2272-2281.
11. M. A. Huels, I. Hahndorf, E. Illenberger, L. Sanche, J. Chem. Phys. 1998, 108, 1309-1312.
12. H. Abdoul-Carime, P. Cloutier, L. Sanche, Radiat. Res. 2001, 155, 625-633.
13. H. Abdoul-Carime, L. Sanche, Int. J. Radiat. Biol. 2002, 78, 89-99.
14. M. A. Huels, B. Boudaiffa, P. Cloutier, D. Hunting, L. Sanche, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4467-4477.
15. H. Abdoul-Carime, S. Gohlke, E. Illenberger, Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 168 103.
16. H. Abdoul-Carime, S. Gohlke, E. Fischbach, J. Scheike, E. Illenberger, Chem. Phys. Lett. 2004, 387, 267-270.
17. A. Pullman, Biopolym. Symp. 1964, 47-65.
18. B. Pullman, Biopolym. Symp. 1964, 141-159.
19. B. Pullman, A. Pullman, T. Nash, A. C. Allison, Nature 1963, 199, 467-471.
20. A. C. Allison, T. Nash, Nature 1963, 197, 758-763.
21. M. B. C. Leão, A. C. Pavão, V. A. A. Espinoza, C. A. Taft, E. P. Bulnes, J. Mol. Struct. 2005, 719, 129-135.
22. C. Desfrançois, H. Abdoul-Carime, J. P. Schermann, J. Chem. Phys. 1996, 104, 7792-7794.
23. J. R. Wiley, J. M. Robinson, S. Ehdaie, E. C. M. Chen, E. S. D. Chen, W. E. Wentworth, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1991, 180, 841-845.
24. J. Schiedt, R. Weinkauf, D. M. Neumark, E. W. Schlag, Chem. Phys. 1998, 239, 511-524.
25. V. Periquet, A. Moreau, S. Carles, J. P. Schermann, C. Desfrançois, J. Electron Spectrosc. Relat. Phenom. 2000, 106, 141-151.
26. S. Gohlke, H. Abdoul-Carime, E. Illenberger, Chem. Phys. Lett. 2003, 380, 595-599.
27. S. S. Wesolowski, M. L. Leininger, P. N. Pentchev, H. F. Schaefer, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4023-4028.
28. N. A. Richardson, S. S. Wesolowski, H. F. Schaefer, J. Phys. Chem. B 2003, 107, 848-853.
29. L. T. M. Profeta, J. D. Larkin, H. F. Schaefer, Mol. Phys. 2003, 101, 3277-3284.
30. F. A. Evangelista, A. Paul, H. F. Schaefer, J. Phys. Chem. A 2004, 108, 3565-3571.
31. Q. Luo, J. Li, Q. S. Li, S. Kim, S. E. Wheeler, Y. M. Xie, H. F. Schaefer, Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 861-865.
32. Q. Luo, Q. S. Li, Y. M. Xie, H. F. Schaefer, Collect. Czech. Chem. Commun. 2005, 70, 826-836.
33. J. J. Lichter, W. Gordy, Proc Natl. Acad. Sci. USA 1968, 60, 450-455.
34. W. H. Nelson, E. Sagstuen, E. O. Hole, D. M. Close, Radiat. Res. 1992, 131, 272-284.
35. D. M. Close, W. H. Nelson, E. Sagstuen, E. O. Hole, Radiat. Res. 1994, 137, 300-309.
36. J. Schmidt, D. C. Borg, Radiat. Res. 1971, 46, 36-51.
37. H. Zehner, E. Westhof, W. Flossmann, A. Muller, Z. Naturforsch. C Biosci. 1977, 32, 1-10.
38. K. Sieber, J. Huttermann, Int. J. Radiat. Biol. 1989, 55, 331-345.
39. X. H. Chen, E. A. Syrstad, M. T. Nguyen, P. Gerbaux, F. Turecek, J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8121-8132.
40. A. O. Colson, D. Becker, I. Eliezer, M. D. Sevilla, J. Phys. Chem. A 1997, 101, 8935-8941.
41. A. O. Colson, M. D. Sevilla, J. Phys. Chem. 1995, 99, 13 033-13 037.
42. S. D. Wetmore, R. J. Boyd, L. A. Eriksson, J. Phys. Chem. B 1998, 102, 10 602-10 614.
43. J. Reynisson, S. Steenken, Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 659-665.
44. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652.
45. C. T. Lee, W. T. Yang, R. G. Parr, Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
46. S. Huzinaga, J. Chem. Phys. 1965, 42, 1293-1302.
47. T. H. Dunning, J. Chem. Phys. 1970, 53, 2823-2833.
48. T. J. Lee, H. F. Schaefer, J. Chem. Phys. 1985, 83, 1784-1794.
49. J. C. Rienstra-Kiracofe, G. S. Tschumper, H. F. Schaefer, S. Nandi, G. B. Ellison, Chem. Rev. 2002, 102, 231-282.
50. Gaussian 94, Revision E.2, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, M. A. Robb,, J. R. Cheeseman, T. Keith, G. A. Petersson, J. A. Montgomery, K. Raghavachari, M. A. Al-Laham, V. G. Zakrzewski, J. V. Ortiz, J. B. Foresman, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, A. Nanayakkara, M. Challacombe, C. Y. Peng, P. Y. Ayala, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, E. S. Replogle, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, J. S. Binkley, D. J.; Defrees, J. Baker, J. P. Stewart, M. Head-Gordon, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 1995.
51. A. E. Reed, R. B. Weinstock, F. Weinhold, J. Chem. Phys. 1985, 83, 735-746.
52. A. E. Reed, F. Weinhold, J. Chem. Phys. 1985, 83, 1736-1740.
53. A. E. Reed, L. A. Curtiss, F. Weinhold, Chem. Rev. 1988, 88, 899-926.
54. A. E. Reed, P. R. Schleyer, J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 1434-1445.
55. P. Hobza, J. Sponer, Chem. Rev. 1999, 99, 3247-3276.
56. J. Sponer, J. Leszczynski, P. Hobza, Biopolymers 2001, 61, 3-31.
57. F. Dong, R. E. Miller, Science 2002, 298, 1227-1230.
58. S. Wang, H. F. Schaefer, J. Chem. Phys. 2006, 124, 044 303.
59. A. O. Colson, M. D. Sevilla, J. Phys. Chem. 1996, 100, 4420-4423.