Protein profiling of human pancreatic islets by two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry

Journal of Proteome Research

Volumn 4, Issue 3, 2005, Pages 931-940

  Ahmed, Meftun ^a,b,c   Forsberg, Jens ^a   Bergsten, Peter ^a  

^a UPPSALA UNIVERSITY   (Sweden)

^b Ibrahim Medical College   (Bangladesh)

^c CHURCHILL HOSPITAL   (United Kingdom)

Author keywords

Diabetes; Human; Islets; Proteomics; Two dimensional gel electrophoresis

Indexed keywords

CALRETICULIN; CARRIER PROTEIN; CHAPERONE; CYCLOPHILIN B; CYTOKERATIN 18; CYTOKERATIN 19; CYTOKERATIN 7; ELONGATION FACTOR 1ALPHA; ENZYME; GLUCOSE REGULATED PROTEIN; GLUCOSE REGULATED PROTEIN 78; HEAT SHOCK PROTEIN 27; HEAT SHOCK PROTEIN 90; HISTONE H2B; LIPOCORTIN 2; PEROXIREDOXIN; PHOSPHATIDYLINOSITOL; PROTEIN GLUCOSE REGULATED PROTEIN 94; UNCLASSIFIED DRUG;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CELL STRUCTURE; CONTROLLED STUDY; HUMAN; HUMAN CELL; MASS SPECTROMETRY; PANCREAS ISLET; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN FUNCTION; PROTEOMICS; SIGNAL TRANSDUCTION; TWO DIMENSIONAL GEL ELECTROPHORESIS;

ADULT; CELL SEPARATION; CELLS, CULTURED; DIABETES MELLITUS; ELECTROPHORESIS, GEL, TWO-DIMENSIONAL; HUMANS; ISLETS OF LANGERHANS; MASS SPECTROMETRY; MIDDLE AGED; PROTEINS; PROTEOMICS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SUBCELLULAR FRACTIONS;

EID: 20844435281     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr050024a     Document Type: Article

References (37)

1. Wild, S.; Roglic, G.; Green, A.; Sicree, R.; King, H. Diabetes Care 2004, 27 (5), 1047-53.
2. Homo-Delarche, F. Diabetes Metab. 1997, 23 (6), 473-505.
3. Donath, M. Y.; Halban, P. A. Diabetologia 2004, 47 (3), 581-9.
4. Lander, E. S.; Linton, L. M.; Birren, B.; Nusbaum, C.; Zody, M. C.; Baldwin, J.; Devon, K.; Dewar, K.; Doyle, M.; FitzHugh, W.; Funke, R.; Gage, D.; Harris, K.; Heaford, A.; Rowland, J.; Kann, L.; Lehoczky, J.; LeVine, R.; McEwan, P.; McKernan, K.; Meldrim, J.; Mesirov, J. P.; Miranda, C.; Morris, W.; Naylor, J.; Raymond, C.; Rosetti, M.; Santos, R.; Sheridan, A.; Sougnez, C.; Stange-Thomann, N.; Stojanovic, N.; Subramanian, A.; Wyman, D.; Rogers, J.; Sulston, J.; Ainscough, R.; Beck, S.; Bentley, D.; Burton, J.; Clee, C.; Carter, N.; Coulson, A.; Deadman, R.; Deloukas, P.; Dunham, A.; Dunham, I.; Durbin, R.; French, L.; Grafham, D.; Gregory, S.; Hubbard, T.; Humphray, S.; Hunt, A.; Jones, M.; Lloyd, C.; McMurray, A.; Matthews, L.; Mercer, S.; Milne, S.; Mullikin, J. C.; Mungall, A.; Plumb, R.; Ross, M.; Shownkeen, R.; Sims, S.; Waterston, R. H.; Wilson, R. K.; Hillier, L. W.; McPherson, J. D.; Marra, M. A.; Mardis, E. R.; Fulton, L. A.; Chinwalla, A. T.; Pepin, K. H.; Gish, W. R.; Chissoe, S. L.; Wendl, M. C.; Delehaunty, K. D.; Miner, T. L.; Delehaunty, A.; Kramer, J. B.; Cook, L. L.; Fulton, R. S.; Johnson, D. L.; Minx, P. J.; Clifton, S. W.; Hawkins, T.; Branscomb, E.; Predki, P.; Richardson, P.; Wenning, S.; Slezak, T.; Doggett, N.; Cheng, J. F.; Olsen, A.; Lucas, S.; Elkin, C.; Uberbacher, E.; Frazier, M.; Gibbs, R. A.; Muzny, D. M.; Scherer, S. E.; Bouck, J. B.; Sodergren, E. J.; Worley, K. C.; Rives, C. M.; Gorrell, J. H.; Metzker, M. L.; Naylor, S. L.; Kucherlapati, R. S.; Nelson, D. L.; Weinstock, G. M.; Sakaki, Y.; Fujiyama, A.; Hattori, M.; Yada, T.; Toyoda, A.; Itoh, T.; Kawagoe, C.; Watanabe, H.; Totoki, Y.; Taylor, T.; Weissenbach, J.; Heilig, R.; Saurin, W.; Artiguenave, F.; Brottier, P.; Bruls, T.; Pelletier, E.; Robert, C.; Wincker, P.; Smith, D. R.; Doucette-Stamm, L.; Rubenfield, M.; Weinstock, K.; Lee, H. M.; Dubois, J.; Rosenthal, A.; Platzer, M.; Nyakatura, G.; Taudien, S.; Rump, A.; Yang, H.; Yu, J.; Wang, J.; Huang, G.; Gu, J.; Hood, L.; Rowen, L.; Madan, A.; Qin, S.; Davis, R. W.; Federspiel, N. A.; Abola, A. P.; Proctor, M. J.; Myers, R. M.; Schmutz, J.; Dickson, M.; Grimwood, J.; Cox, D. R.; Olson, M. V.; Kaul, R.; Shimizu, N.; Kawasaki, K.; Minoshima, S.; Evans, G. A.; Athanasiou, M.; Schultz, R.; Roe, B. A.; Chen, F.; Pan, H.; Ramser, J.; Lehrach, H.; Reinhardt, R.; McCombie, W. R.; de la Bastide, M.; Dedhia, N.; Blocker, H.; Hornischer, K.; Nordsiek, G.; Agarwala, R.; Aravind, L.; Bailey, J. A.; Bateman, A.; Batzoglou, S.; Birney, E.; Bork, P.; Brown, D. G.; Burge, C. B.; Cerutti, L.; Chen, H. C.; Church, D.; Clamp, M.; Copley, R. R.; Doerks, T.; Eddy, S. R.; Eichler, E. E.; Furey, T. S.; Galagan, J.; Gilbert, J. G.; Harmon, C.; Hayashizaki, Y.; Haussler, D.; Hermjakob, H.; Hokamp, K.; Jang, W.; Johnson, L. S.; Jones, T. A.; Kasif, S.; Kaspryzk, A.; Kennedy, S.; Kent, W. J.; Kitts, P.; Koonin, E. V.; Korf, I.; Kulp, D.; Lancet, D.; Lowe, T. M.; McLysaght, A.; Mikkelsen, T.; Moran, J. V.; Mulder, N.; Pollara, V. J.; Ponting, C. P.; Schuler, G.; Schultz, J.; Slater, G.; Smit, A. F.; Stupka, E.; Szustakowski, J.; Thierry-Mieg, D.; Thierry-Mieg, J.; Wagner, L.; Wallis, J.; Wheeler, R.; Williams, A.; Wolf, Y. I.; Wolfe, K. H.; Yang, S. P.; Yeh, R. F.; Collins, F.; Guyer, M. S.; Peterson, J.; Felsenfeld, A.; Wetterstrand, K. A.; Patrinos, A.; Morgan, M. J.; Szustakowki, J.; de Jong, P.; Catanese, J. J.; Osoegawa, K.; Shizuya, H.; Choi, S.; Chen, Y. J. Nature 2001, 409, (6822), 860-921.
5. Kaestner, K. H.; Lee, C. S.; Scearce, L. M.; Brestelli, J. E.; Arsenlis, A.; Le, P. P.; Lantz, K. A.; Crabtree, J.; Pizarro, A.; Mazzarelli, J.; Pinney, D.; Fischer, S.; Manduchi, E.; Stoeckert, C. J., Jr.; Gradwohl, G.; Clifton, S. W.; Brown, J. R.; Inoue, H.; Cras-Meneur, C.; Permutt, M. A. Diabetes 2003, 52 (7), 1604-1610.
6. Almind, K.; Doria, A.; Kahn, C. R. Nat. Med. 2001, 7 (3), 277-279.
7. Shalev, A.; Pise-Masison, C. A.; Radonovich, M.; Hoffmann, S. C.; Hirshberg, B.; Brady, J. N.; Harlan, D. M. Endocrinology 2002, 143 (9), 3695-3698.
8. Gygi, S. P.; Rochon, Y.; Franza, B. R.; Aebersold, R. Mol. Cell. Biol. 1999, 19 (3), 1720-1730.
9. Herber, S.; Grus, F. H.; Sabuncuo, P.; Augustin, A. J. Electrophoresis 2001, 22 (9), 1838-1844.
10. Nakanishi, T.; Koyama, R.; Ikeda, T.; Shimizu, A. J. Chromatogr. B Analyt. Technol. Biomed. Life Sci. 2002, 776 (1), 89-100.
11. Jiang, M.; Jia, L.; Jiang, W.; Hu, X.; Zhou, H.; Gao, X.; Lu, Z.; Zhang, Z. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2003, 309 (1), 196-200.
12. Hojlund, K.; Wrzesinski, K.; Larsen, P. M.; Fey, S. J.; Roepstorff, P.; Handberg, A.; Dela, F.; Vinten, J.; McCormack, J. G.; Reynet, C.; Beck-Nielsen, H. J. Biol. Chem. 2003, 278 (12), 10436-10442.
13. Baekkeskov, S.; Warnock, G.; Christie, M.; Rajotte, R. V.; Larsen, P. M.; Fey, S. Diabetes 1989, 38 (9), 1133-1141.
14. Ricordi, C.; Lacy, P. E.; Finke, E. H.; Olack, B. J.; Scharp, D. W. Diabetes 1988, 37 (4), 413-420.
15. Brandhorst, H.; Brandhorst, D.; Brendel, M. D.; Hering, B. J.; Bretzel, R. G. Cell. Transplant 1998, 7 (5), 489-495.
16. Shevchenko, A.; Wilm, M.; Vorm, O.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68 (5), 850-858.
17. Perkins, D. N.; Pappin, D. J.; Creasy, D. M.; Cottrell, J. S. Electrophoresis 1999, 20 (18), 3551-3567.
18. Sanchez, J. C.; Chiappe, D.; Converset, V.; Hoogland, C.; Binz, P. A.; Paesano, S.; Appel, R. D.; Wang, S.; Sennitt, M.; Nolan, A.; Cawthorne, M. A.; Hochstrasser, D. F. Proteomics 2001, 1 (1), 136-163.
19. Nicolls, M. R.; D'Antonio, J. M.; Hutton, J. C.; Gill, R. G.; Czwornog, J. L.; Duncan, M. W. J. Proteome Res. 2003, 2 (2), 199-205.
20. Gras-Meneur, C.; Inoue, H.; Zhou, Y.; Ohsugi, M.; Bernal-Mizrachi, E.; Pape, D.; Clifton, S. W.; Permutt, M. A. Diabetologia 2004, 47 (2), 284-299.
21. Sitia, R.; Braakman, I. Nature 2003, 426 (6968), 891-894.
22. Nozaki, J.; Kubota, H.; Yoshida, H.; Naitoh, M.; Goji, J.; Yoshinaga, T.; Mori, K.; Koizumi, A.; Nagata, K. Genes Cells 2004, 9 (3), 261-270.
23. Lan, H.; Rabaglia, M. E.; Schueler, K. L.; Mata, C.; Yandell, B. S.; Attie, A. D. Diabetes 2004, 53(1), 240-244.
24. Oyadomari, S.; Takeda, K.; Takiguchi, M.; Gotoh, T.; Matsumoto, M.; Wada, I.; Akira, S.; Araki, E.; Mori, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98 (19), 10845-10850.
25. Srivastava, M.; Eidelman, O.; Leighton, X.; Glasman, M.; Goping, G.; Pollard, H. B. Mol. Med. 2002, 8 (12), 781-797.
26. Thurmond, D. C.; Gonelle-Gispert, C.; Furukawa, M.; Halban, P. A.; Pessin, J. E. Mol Endocrinol 2003, 17 (4), 732-742.
27. Kasper, M.; von Dorsche, H.; Stosiek, P. Histochemistry 1991, 96 (3), 271-277.
28. Blessing, M.; Ruther, U.; Franke, W. W. J. Cell. Biol. 1993, 120 (3), 743-755.
29. Webb, G. C.; Akbar, M. S.; Zhao, C.; Steiner, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000, 97 (11), 5773-5778.
30. Howell, S. L.; Tyhurst, M. Diabetologia 1982, 22 (5), 301-308.
31. Sanchez, J. C.; Converset, V.; Nolan, A.; Schmid, G.; Wang, S.; Heller, M.; Sennitt, M. V.; Hochstrasser, D. F.; Cawthorne, M. A. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1 (7), 509-516.
32. Hao, W.; Palmer, J. P. J. Interferon Cytokine Res. 1995, 15 (12), 1075-1081.
33. Kaneto, H.; Kajimoto, Y.; Miyagawa, J.; Matsuoka, T.; Fujitani, Y.; Umayahara, Y.; Hanafusa, T.; Matsuzawa, Y.; Yamasaki, Y.; Hori, M. Diabetes 1999, 48 (12), 2398-2406.
34. Kovacs, P.; Yang, X.; Permana, P. A.; Bogardus, C.; Baier, L. J. Diabetes 2002, 51 (5), 1618-1621.
35. Yedovitzky, M.; Mochly-Rosen, D.; Johnson, J. A.; Gray, M. O.; Ron, D.; Abramovitch, E.; Cerasi, E.; Nesher, R. J. Biol. Chem. 1997, 272 (3), 1417-1420.
36. Yan, L.; Nairn, A. C.; Palfrey, H. C.; Brady, M. J. J. Biol. Chem. 2003, 278 (20), 18177-18183.
37. Kessler, L.; Jesser, C.; Belcourt, A.; Pinget, M. Transplantation 1997, 63 (10), 1537-1540.