Quantitative profiling of the detergent-resistant membrane proteome of Iota-b toxin induced Vero cells

Journal of Proteome Research

Volumn 4, Issue 2, 2005, Pages 523-531

  Blonder, Josip ^a   Hale, Martha L ^b   Chan, King C ^a   Yu, Li Rong ^a   Lucas, David A ^a   Conrads, Thomas P ^a   Zhou, Ming ^a   Popoff, Michel R ^c   Issaq, Haleem J ^a   Stiles, Bradley G ^b   Veenstra, Timothy D ^a  

^a SAIC FREDERICK INC   (United States)

^b UNITED STATES ARMY MEDICAL RESEARCH INSTITUTE OF INFECTIOUS DISEASES   (United States)

^c INSTITUT PASTEUR   (France)

Author keywords

18O 16O labeling; Iota b toxin; Membrane proteins; Quantitation

Indexed keywords

DETERGENT; METHANOL; OXYGEN; OXYGEN 18; PROTEOME; TOXIN;

ANIMAL CELL; AQUEOUS SOLUTION; ARTICLE; ATOM; CARBOXY TERMINAL SEQUENCE; CATION EXCHANGE; CONTROLLED STUDY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN BINDING; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN EXPRESSION; REVERSED PHASE HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; SOLUBILIZATION; TANDEM MASS SPECTROMETRY; VERO CELL;

ADP RIBOSE TRANSFERASES; AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; BACTERIAL TOXINS; CERCOPITHECUS AETHIOPS; DETERGENTS; MEMBRANE PROTEINS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEOME; VERO CELLS;

LOTA;

EID: 20244374564     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr049790s     Document Type: Article

References (48)

1. Simons, K.; Toomre, D. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2000, 1, 31-39.
2. Rappsilber, J.; Mann, M. Genome Biol. 2002, 3, 2008.1-2008.5.
3. Griffin, T. J.; Han, D. K. M.; Gygi, S. P.; Rist, B.; Lee, H.; Aebersold, R.; Parker, K. C. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2001, 12, 1238-1246.
4. Blonder, J.; Goshe, M. B.; Moore, R. J.; Pasa-Tolic, L.; Masselon, C. D.; Lipton, M. S.; Smith, R. D. J. Proteome Res. 2002, 1, 351-360.
5. Blonder, J.; Conrads, T. P.; Yu, L. R.; Terunuma, A.; Janini, G. M.; Issaq, H. J.; Vogel, J.; Veenstra, T. D. Proteomics 2004, 4, 31-45.
6. Blonder, J.; Hale, M. L.; Lucas, D. A.; Schaefer, C. F.; Yu, L. R.; Conrads, T. P.; Issaq, H. J.; Stiles, B. G.; Veenstra, T. D. Electrophoresis 2004, 25, 1307-1318.
7. Blonder, J.; Goshe, M. B.; Xiao, W.; Camp, D. G., 2nd; Wingerd, M.; Davis, R. W.; Smith, R. D.; Hale, M. L.; Lucas, D. A.; Schaefer, C. F.; Yu, L. R.; Conrads, T. P.; Issaq, H. J.; Stiles, B. G.; Veenstra, T. D. J. Proteome Res. 2004, 3, 434-444.
8. Blonder, J.; Rodriguez-Galan, M. C.; Chan, K. C.; Lucas, D. A.; Yu, L. R.; Conrads, T. P.; Issaq, H. J.; Young, H. A.; Veenstra, T. D. J. Proteome Res. 2004, 3, 862-870.
9. Blonder, J.; Terunuma, A.; Conrads, T. P.; Chan, K. D.; Yee, C.; Lucas, D. A.; Issaq, H. J.; Schaefer, C. F.; Buetow, K. H.; Veenstra, T. D.; Vogel, J. C. J. Invest. Dermatol. 2004, 133, 691-699.
10. Wu, C. C.; MacCoss, M. J.; Howell, K. E.; Yates, J. R., 3rd Nat. Biotechnol. 2003, 21, 532-538.
11. Pedersen, S. K.; Harry, J. L.; Sebastian, L.; Baker, J.; Traini, M. D.; McCarthy, J. T.; Manoharan, A.; Wilkins, M. R.; Gooley, A. A.; Righetti, P. G.; Packer, N. H.; Williams, K. L.; Herbert, B. R. J. Proteome Res. 2003, 2, 303-311.
12. Bouchai, P.; Kucera, I. J. Basic Microbiol. 2004, 44, 17-22.
13. Wu, C. C.; MacCoss, M. J.; Mardones, G.; Finnigan, C.; Mogelsvang, S.; Yates, J. R., 3rd; Howell, K. E. Mol. Biol. Cell 2004, 15, 2907-2919.
14. Simons, K.; Ikonen, E. Nature 1997, 387, 569-572.
15. Santoni, V.; Molloy, M.; Rabilloud, T. Electrophoresis 2000, 21, 1054-1070.
16. Wu, C. C.; Yates, J. R., 3rd Nat. Biotechnol. 2003, 21, 262-267.
17. Han, D. K.; Eng, J.; Zhou, H.; Aebersold, R. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 946-951.
18. Foster, L. J.; de Hoog, C. L.; Mann, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 5813-5818.
19. Zang, L.; Toy, D. P.; Hancock, W. S.; Sgroi, D. C.; Karger, B. L. J. Proteome Res. 2004, 3, 604-612.
20. Brown, K. J.; Fenselau, C. J. Proteome Res. 2004, 3, 455-462.
21. Yao, X.; Freas, A.; Ramirez, J.; Demirev, P. A.; Fenselau, C. Anal. Chem. 2004, 76, 2675.
22. Marvaud, J. C.; Smith, T.; Hale, M. L.; Popoff, M. R.; Smith, L. A.; Stiles, B. G. Infect. Immun. 2001, 69, 2435-2441.
23. Hale, M. L.; Marvaud, J. C.; Popoff, M. R.; Stiles, B. G. Infect. Immun. 2004, 72, 2186-2193.
24. Schnolzer, M.; Jedrzejewski, P.; Lehmann, W. D. Electrophoresis 1996, 17, 945-953.
25. Stiles, B. G.; Hale, M. L.; Marvaud, J. C.; Popoff, M. R. 2000 Infect. Immun. 2000, 68, 3475-3484.
26. Aman, M. J.; Ravichandran, K. S. Curr. Biol. 2000, 10, 393-396.
27. Jayanthi, L. D.; Samuvel, D. J.; Ramamoorthy, S. J. Biol. Chem. 2004, 279, 19315-19326.
28. Stewart, I. I.; Thomson, T.; Figeys, D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15, 2456-2465.
29. Heller, M.; Mattou, H.; Menzel, C.; Yao, X. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003, 14, 704-718.
30. Conrads, K. A.; Yu, L. R.; Lucas, D. A.; Zhou, M.; Chan, K. C.; Simpson, K. A.; Schaefer, C. F.; Issaq, H. J.; Veenstra, T. D.; Beck, G. R., Jr.; Conrads, T. P. Electrophoresis 2004, 25, 1342-1352.
31. Jakobsson, P. J.; Mancini, J. A.; Riendeau, D.; Ford-Hutchinson, A. W. J. Biol. Chem. 1997, 272, 22934-22939.
32. Hocking, D. C.; Kowalski, K. J. Cell Biol. 2002, 158, 175-184.
33. Krogh, A.; Larsson, B.; von Heijne, G.; Sonnhammer, E. L. L. J. Mol. Biol. 2001, 305, 567-580.
34. Rothberg, K. G.; Heuser, J. E.; Donzell, W. C.; Ying, Y. S.; Glenney, J. R.; Anderson, R. G. Cell 1992, 68, 673-682.
35. Slaughter, N.; Laux, I.; Tu, X.; Whitelegge, J.; Zhu, X.; Effros, R.; Bickel, P.; Nel, A. Clin. Immunol. 2003, 108, 138-151.
36. Nichols, B. J.; Kenworthy, A. K.; Polishchuk, R. S.; Lodge, R.; Roberts, T. H.; Hirschberg, K.; Phair, R. D.; Lippincott-Schwartz, J. J. Cell. Biol. 2001, 153, 529-541.
37. Stiles, B. G.; Wilkins, T. D. Infect. Immun. 1986, 54, 683-688.
38. Stiles, B. G.; Wilkins, T. D. Toxicon. 1986, 24, 767-773.
39. Perelle, S.; Domenighini, M.; Popoff, M. R. FEBS Lett. 1996, 395, 191-194.
40. Vandekerckhove, J.; Schering, B.; Barmann, M.; Aktories, K. FEBS Lett. 1987, 225, 48-52.
41. Oliferenko, S.; Paiha, K.; Harder, T.; Gerke, V.; Schwarzler, C.; Schwarz, H.; Beug, H.; Gunthert, U.; Huber, L. A. J. Cell Biol. 1999, 146, 843-854.
42. Cywes, C.; Wessels, M. R. Nature 2001, 414, 648-652.
43. Lafont, F.; Tran Van Nhieu, G.; Hanada, K.; Sansonetti, P.; van der Goot, F. G. EMBO J. 2002, 21, 4449-4457.
44. Mirazimi, A.; Nilsson, M.; Svensson, L. J. Virol. 1998, 72, 8705-8709.
45. Schue, V.; Green, G. A.; Girardot, R.; Monteil, H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1994, 203, 22-28.
46. Malyguine, A. M.; Scott, J. E.; Dawson, J. R. Immunol. Lett. 1998, 61, 67-71.
47. Murtagh, J. J., Jr.; Moss, J.; Vaughan, M. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 842-849.
48. Luetje, C. W.; Nathanson, N. M. J. Neurochem. 1988, 50, 1775-1782.