-
2
-
-
0033534150
-
-
Kanaori, K.; Tamura, Y.; Wada, T.; Nishi, M.; Kanehara, H.; Morii, T.; Tajima, K.; Makino, K. Biochemistry 1999, 38, 16058-16066.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 16058-16066
-
-
Kanaori, K.1
Tamura, Y.2
Wada, T.3
Nishi, M.4
Kanehara, H.5
Morii, T.6
Tajima, K.7
Makino, K.8
-
4
-
-
0038683620
-
-
Prakash, P. T.; Kawasaki, A. M.; Lesnik, E. A.; Owens, S. R.; Manoharan, M. Org. Lett. 2003, 5, 403-406.
-
(2003)
Org. Lett.
, vol.5
, pp. 403-406
-
-
Prakash, P.T.1
Kawasaki, A.M.2
Lesnik, E.A.3
Owens, S.R.4
Manoharan, M.5
-
5
-
-
0034817168
-
-
Trempe, J. F.; Wilds, C. J.; Denisov, A. Y.; Pon, R. T.; Damha, M. J.; Gehring, K. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4896-4903.
-
(2001)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.123
, pp. 4896-4903
-
-
Trempe, J.F.1
Wilds, C.J.2
Denisov, A.Y.3
Pon, R.T.4
Damha, M.J.5
Gehring, K.6
-
6
-
-
0034644387
-
-
Wang, J.; Verbeure, B.; Luyten, I.; Lescrinier, E.; Froeyen, M.; Hendrix, C.; Rosemeyer, H.; Seela, F.; Van Aerschot, A.; Herdewijn, P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 8595-8602.
-
(2000)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.122
, pp. 8595-8602
-
-
Wang, J.1
Verbeure, B.2
Luyten, I.3
Lescrinier, E.4
Froeyen, M.5
Hendrix, C.6
Rosemeyer, H.7
Seela, F.8
Van Aerschot, A.9
Herdewijn, P.10
-
10
-
-
0038043309
-
-
Gyi, J. I.; Gao, D.; Conn, G. L.; Trent, J. O.; Brown, T.; Lane, A. N. Nucleic Acids Res. 2003, 31, 2683-2693.
-
(2003)
Nucleic Acids Res.
, vol.31
, pp. 2683-2693
-
-
Gyi, J.I.1
Gao, D.2
Conn, G.L.3
Trent, J.O.4
Brown, T.5
Lane, A.N.6
-
11
-
-
0030751943
-
-
Conte, M. R.; Conn, G. L.; Brown, T.; Lane, A. N. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 2627-2634.
-
(1997)
Nucleic Acids Res.
, vol.25
, pp. 2627-2634
-
-
Conte, M.R.1
Conn, G.L.2
Brown, T.3
Lane, A.N.4
-
15
-
-
0026524798
-
-
Kawai, G.; Yamamoto, Y.; Kamimura, T.; Masegi, T.; Sekine, M.; Hata, T.; Iimori, T.; Watanabe, T.; Miyazawa, T.; Yokoyama, S. Biochemistry 1992, 31, 1040-1046.
-
(1992)
Biochemistry
, vol.31
, pp. 1040-1046
-
-
Kawai, G.1
Yamamoto, Y.2
Kamimura, T.3
Masegi, T.4
Sekine, M.5
Hata, T.6
Iimori, T.7
Watanabe, T.8
Miyazawa, T.9
Yokoyama, S.10
-
16
-
-
0030779674
-
-
Popenda M.; Biala, E.; Milecki, J.; Adamiak, R. W. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 4589-4598.
-
(1997)
Nucleic Acids Res.
, vol.25
, pp. 4589-4598
-
-
Popenda, M.1
Biala, E.2
Milecki, J.3
Adamiak, R.W.4
-
17
-
-
0029956116
-
-
Egli, M.; Portmann, S.; Usman, N. Biochemistry 1996, 35, 8489-8494.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 8489-8494
-
-
Egli, M.1
Portmann, S.2
Usman, N.3
-
19
-
-
0034255357
-
-
Matveeva, O. V.; Tsodikov, A. D.; Giddings, M.; Freier, S. M.; Wyatt, J. R.; Spiridonov, A. N.; Shabalina, S. A.; Gesteland, R. F.; Atkins, J. F. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 2862-2865.
-
(2000)
Nucleic Acids Res.
, vol.28
, pp. 2862-2865
-
-
Matveeva, O.V.1
Tsodikov, A.D.2
Giddings, M.3
Freier, S.M.4
Wyatt, J.R.5
Spiridonov, A.N.6
Shabalina, S.A.7
Gesteland, R.F.8
Atkins, J.F.9
-
20
-
-
0027373178
-
-
(a) Lebreton, J.; De Mesmaeker, A.; Waldner, A.; Fritsch, V.; Wolf, R. M. Freier, S. M. Tetrahedron Lett. 1993, 34, 6383-6386.
-
(1993)
Tetrahedron Lett.
, vol.34
, pp. 6383-6386
-
-
Lebreton, J.1
De Mesmaeker, A.2
Waldner, A.3
Fritsch, V.4
Wolf, R.M.5
Freier, S.M.6
-
21
-
-
33748217097
-
-
(b) De Mesmaeker, A.; Waldner, A.; Lebreton, J.; Hoffmann, P.; Fritsch, V.; Wolf, R. M.; Freier, S. M. Angew. Chem. Ed. Engl. Engl. 1994, 34, 226-229.
-
(1994)
Angew. Chem. Ed. Engl. Engl.
, vol.34
, pp. 226-229
-
-
De Mesmaeker, A.1
Waldner, A.2
Lebreton, J.3
Hoffmann, P.4
Fritsch, V.5
Wolf, R.M.6
Freier, S.M.7
-
22
-
-
84988099601
-
-
(c) De Mesmaeker, A.; Waldner, A.; Fritsch, V.; Lebreton, J.; Wolf, R. M. Bull Soc. Chim. Belg. 1994, 103, 705-715.
-
(1994)
Bull Soc. Chim. Belg.
, vol.103
, pp. 705-715
-
-
De Mesmaeker, A.1
Waldner, A.2
Fritsch, V.3
Lebreton, J.4
Wolf, R.M.5
-
23
-
-
0030788142
-
-
(d) De Mesmaeker, A.; Wendeborn, S.; Jouanno, C.; Fritsch, V.; Wolf, R. M. Bioorg. Med. Chem. 1997, 7, 1869-1874.
-
(1997)
Bioorg. Med. Chem.
, vol.7
, pp. 1869-1874
-
-
De Mesmaeker, A.1
Wendeborn, S.2
Jouanno, C.3
Fritsch, V.4
Wolf, R.M.5
-
24
-
-
0031576820
-
-
(e) De Mesmaeker, A.; Jouanno, C.; Wolf, R. M.; Wendeborn, S. Bioorg. Med. Chem. 1997, 7, 447-452.
-
(1997)
Bioorg. Med. Chem.
, vol.7
, pp. 447-452
-
-
De Mesmaeker, A.1
Jouanno, C.2
Wolf, R.M.3
Wendeborn, S.4
-
25
-
-
2342476659
-
-
(f) De Mesmaeker, A., Lebreton, J.; Jouanno, C.; Fritsch, V.; Wolf, R. M.; Wendeborn, S. Synlett 1997, 11, 1287-1290.
-
(1997)
Synlett
, vol.11
, pp. 1287-1290
-
-
De Mesmaeker, A.1
Lebreton, J.2
Jouanno, C.3
Fritsch, V.4
Wolf, R.M.5
Wendeborn, S.6
-
26
-
-
0028969634
-
-
(a) Fritsch, V.; De Mesmaeker, A.; Waldner, A.; Lebreton, J.; Blommers, M. J. J.; Wolf, R. M. Bioorg. Med. Chem. 1995, 3, 321-335.
-
(1995)
Bioorg. Med. Chem.
, vol.3
, pp. 321-335
-
-
Fritsch, V.1
De Mesmaeker, A.2
Waldner, A.3
Lebreton, J.4
Blommers, M.J.J.5
Wolf, R.M.6
-
27
-
-
0001969369
-
-
(b) Wolf, R. M.; De Mesmaeker, A.; Waldner, A.; Wendeborn, S.; Fritsch, V.; Lebreton, J. New J. Chem. 1997, 21, 61-72.
-
(1997)
New J. Chem.
, vol.21
, pp. 61-72
-
-
Wolf, R.M.1
De Mesmaeker, A.2
Waldner, A.3
Wendeborn, S.4
Fritsch, V.5
Lebreton, J.6
-
28
-
-
0034839924
-
-
Wilds, C. J.; Minasov, G.; Natt, F.; Von Matt, P.; Altmann, K.-H.; Egli, M. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids, 2001, 20, 991-994.
-
(2001)
Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids
, vol.20
, pp. 991-994
-
-
Wilds, C.J.1
Minasov, G.2
Natt, F.3
Von Matt, P.4
Altmann, K.-H.5
Egli, M.6
-
29
-
-
0027971706
-
-
Blommers, M. J. J.; Pieles, U.; De Mesmaeker, A. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4187-4194.
-
(1994)
Nucleic Acids Res.
, vol.22
, pp. 4187-4194
-
-
Blommers, M.J.J.1
Pieles, U.2
De Mesmaeker, A.3
-
31
-
-
0033562547
-
-
Venkateswarlu, D.; Lind, K. E.; Mohan, V.; Manoharan, M.; Ferguson, D. M. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 2189-2195.
-
(1999)
Nucleic Acids Res.
, vol.27
, pp. 2189-2195
-
-
Venkateswarlu, D.1
Lind, K.E.2
Mohan, V.3
Manoharan, M.4
Ferguson, D.M.5
-
36
-
-
0034950462
-
-
Feig, M.; Zacharias, M.; Pettitt, B. M. Biophys. J. 2001, 81, 352-370.
-
(2001)
Biophys. J.
, vol.81
, pp. 352-370
-
-
Feig, M.1
Zacharias, M.2
Pettitt, B.M.3
-
37
-
-
0034836422
-
-
Spackova, N.; Berger, I.; Sponer, J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3295-3307.
-
(2001)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.123
, pp. 3295-3307
-
-
Spackova, N.1
Berger, I.2
Sponer, J.3
-
40
-
-
0034521981
-
-
Kollman, P. A.; Massova, I.; Reyes, C.; Kuhn, B.; Huo, S.; Chong, L.; Lee, M.; Lee, T.; Duan, Y.; Wang, W.; Donini, O.; Cieplak, P.; Srinivasan, J.; Case, D. A.; and Cheatham, III, T. E. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 889-897.
-
(2000)
Acc. Chem. Res.
, vol.33
, pp. 889-897
-
-
Kollman, P.A.1
Massova, I.2
Reyes, C.3
Kuhn, B.4
Huo, S.5
Chong, L.6
Lee, M.7
Lee, T.8
Duan, Y.9
Wang, W.10
Donini, O.11
Cieplak, P.12
Srinivasan, J.13
Case, D.A.14
Cheatham III, T.E.15
-
41
-
-
0030484689
-
-
De Mesmaeker, A.; Lesueur, C.; Bévierre, M.-O.; Waldner, A.; Fritsch, V.; Wolf, R. M. Angew. Chem. Ed. Engl. Engl. 1996, 35, 2790-2794.
-
(1996)
Angew. Chem. Ed. Engl. Engl.
, vol.35
, pp. 2790-2794
-
-
De Mesmaeker, A.1
Lesueur, C.2
Bévierre, M.-O.3
Waldner, A.4
Fritsch, V.5
Wolf, R.M.6
-
42
-
-
0002582138
-
-
For synthesis of nucleotides see ref 14 in De Mesmaeker A.; Lebreton, J.; Hoffmann, P.; Freier, S. M. Synlett. 1993, 9, 677-697.
-
(1993)
Synlett.
, vol.9
, pp. 677-697
-
-
De Mesmaeker, A.1
Lebreton, J.2
Hoffmann, P.3
Freier, S.M.4
-
45
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W.; Chandrasekar, J.; Madura, J.; Irnpey, R.; Kelin, M. J. Phys. Chem. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
Phys. Chem.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.1
Chandrasekar, J.2
Madura, J.3
Irnpey, R.4
Kelin, M.J.5
-
48
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A.-D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J., Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C., Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; W. E.-Reiher, III, Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stole, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586-3616
-
-
MacKerell, A.-D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-McCarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher III, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stole, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
49
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.5
-
50
-
-
0000951252
-
-
Feller, S. E.; Pastor, E. W.; Rojnuckarin, A.; Bogusz, S.; Brooks, B. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 17011-17020.
-
(1996)
J. Phys. Chem.
, vol.100
, pp. 17011-17020
-
-
Feller, S.E.1
Pastor, E.W.2
Rojnuckarin, A.3
Bogusz, S.4
Brooks, B.R.5
-
51
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, J. C. J. Comput. Chem. 1977, 23, 327-341.
-
(1977)
J. Comput. Chem.
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, J.C.3
-
53
-
-
0034825161
-
-
Hamprecht, Fred A.; Peter, Christine; Daura, Xavier; Thiel, Walter; van Gunsteren, Wilfred F. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2079-2089.
-
(2001)
J. Chem. Phys.
, vol.114
, pp. 2079-2089
-
-
Hamprecht Fred, A.1
Peter, C.2
Daura, X.3
Thiel, W.4
Van Gunsteren Wilfred, F.5
-
54
-
-
0032560959
-
-
Srinivasan, J., Cheatham, T. E., Cieplak, P., Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9401-9409.
-
(1998)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.120
, pp. 9401-9409
-
-
Srinivasan, J.1
Cheatham, T.E.2
Cieplak, P.3
Kollman, P.A.4
Case, D.A.5
-
55
-
-
0032556243
-
-
Jayaram, B.; Sprous, D.; Young, M. A.; Beveridge, D. L. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120: 10629-10633.
-
(1998)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.120
, pp. 10629-10633
-
-
Jayaram, B.1
Sprous, D.2
Young, M.A.3
Beveridge, D.L.4
-
56
-
-
0031788539
-
-
Cheatham, T. E., Srinivasan, J., Case, D. A.; Kollman, P. A. J. Biomol. Struct. Dyn. 1998, 16, 265-280.
-
(1998)
J. Biomol. Struct. Dyn.
, vol.16
, pp. 265-280
-
-
Cheatham, T.E.1
Srinivasan, J.2
Case, D.A.3
Kollman, P.A.4
-
62
-
-
0000671518
-
-
Sham, Y. Y.; Chu, Z. T. Warshel, A. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4458-4472.
-
(1997)
J. Phys. Chem. B
, vol.101
, pp. 4458-4472
-
-
Sham, Y.Y.1
Chu, Z.T.2
Warshel, A.3
-
64
-
-
33748640631
-
-
check
-
Sitkoff, D.; Ben-Tal, N.; Honig, B. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2744-2752.check
-
(1996)
Phys. Chem.
, vol.100
, pp. 2744-2752
-
-
Sitkoff, D.1
Ben-Tal, N.2
Honig, B.J.3
-
68
-
-
0033556120
-
-
Conn, G., Brown, T., Leonard, G. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 555-561.
-
(1999)
Nucleic Acids Res.
, vol.27
, pp. 555-561
-
-
Conn, G.1
Brown, T.2
Leonard, G.3
-
69
-
-
0032488608
-
-
Gyi, J. I.; Lane, A. N.; Conn, G. L.; Brown, T. Biochemistry 1998, 37, 73-80.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 73-80
-
-
Gyi, J.I.1
Lane, A.N.2
Conn, G.L.3
Brown, T.4
-
72
-
-
0028500180
-
-
Lubini, P.; Zurcher, W.; Egli, M. Chem. Biol. 1994, 1, 39-45.
-
(1994)
Chem. Biol.
, vol.1
, pp. 39-45
-
-
Lubini, P.1
Zurcher, W.2
Egli, M.3
-
76
-
-
0017820499
-
-
Record, M. T. Jr.; Anderson, C. F.; Lohman, T. M. Q. Rev. Biophys. 1978, 11, 103-178.
-
(1978)
Q. Rev. Biophys.
, vol.11
, pp. 103-178
-
-
Record Jr., M.T.1
Anderson, C.F.2
Lohman, T.M.3
|