Theoretical study of the effect of water in the process of proton transfer of glycinamide

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 109, Issue 12, 2005, Pages 5919-5926

  Sun, Yong ^a   Li, Haoran ^a   Liang, Wanchun ^a   Han, Shijun ^a  

^a ZHEJIANG UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CELLULAR COMPONENTS; GLYCINAMIDE; PROTON TRANSFER; TAUTOMERIZATION PROCESS;

AMMONIA; CATALYSIS; MUTAGENESIS; NUCLEIC ACIDS; OPTIMIZATION; POLYPEPTIDES; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; PROTEINS; PROTONS; SOLVENTS; WATER;

AMINO ACIDS;

DRUG DERIVATIVE; GLYCINAMIDE; GLYCINE; PROTON; WATER;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; CONFORMATION; METABOLISM; THEORETICAL MODEL;

COMPUTER SIMULATION; GLYCINE; MODELS, MOLECULAR; MODELS, THEORETICAL; MOLECULAR CONFORMATION; PROTONS; WATER;

EID: 17144418458     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0451243     Document Type: Article

References (39)

1. Li, P.; Bu, Y.; Ai, H. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 1200.
2. Oie, T.; Loew, G. H.; Burt, S. K.; MacElroy, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 8007.
3. Jensen, J. H.; Baldridge, K. K.; Gordon, M. S. J. Phys. Chem. 1992, 96, 8340.
4. Remko, M.; Rode, B. M. Chem. Phys. Lett. 2000, 316, 489.
5. Remko, M.; Rode, B. M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 4667.
6. Klassen, J. S.; Kebarle, P. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6552.
7. Kinser, R. D.; Ridge, D. P.; Hvistendahl, G.; Rasmussen, B.; Uggerud, E. Chem. - Eur. J. 1996, 2, 1143.
8. Sulzbach, H. M.; Schleyer, P. V. R.; Schaefer, H. F., III. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3967.
9. Ramek, M.; Cheng, V. K. W. Int. J. Quantum Chem., Quantum Biol. Symp. 1992, 19, 15.
10. Li, P.; Bu, Y.; Ai, H. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 6419.
11. Li, P.; Bu, Y.; Ai, H. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 1405.
12. Li, P.; Bu, Y.; Ai, H.; Cao, Z. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4069.
13. Fu, A.-P.; Li, H.; Du, D.; Zhou, Z. Chem. Phys. Lett. 2003, 382, 332.
14. Kim, K.; Lim, S.; Kim, H. J.; Kim, Y. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 617.
15. Wang, X. C.; Nichols, J.; Feyereisen, M.; Gutowski, M.; Boatz, J.; Haymet, A. D. J.; Simons, J. J. Phys. Chem. 1991, 95, 10419.
16. Wang, X. C.; Facelli, J. C.; Simons, J. Int. J. Quantum Chem. 1993, 45, 123.
17. Hu, X.; Li, H.; Ding, J.; Han, S. Biochemistry 2004, 43, 6361.
18. Hu, X.; Li, H.; Liang, W.; Han, S. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 12999.
19. Liang, W.; Li, H.; Hu, X.; Han, H. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10219.
20. Chen, H.; Li, S.; Jiang, Y. J. Phys. Chem. A. 2003, 107, 4652.
21. Li, J.; Brill, T. B. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5993.
22. Ai, H.; Bu, Y.; Li, P.; Sun, L. J. Phys. Chem. A. 2004, 108, 4156.
23. Yan, S.; Bu, Y.; Cao, Z.; Li, P. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7038.
24. Stepanian, S. G.; Reva, I. D.; Radchenko, E. D.; Rosado, M. T. S.; Duarte, M. L. T. S.; Fausto, R.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1041.
25. Rodríguez-Santiago, L.; Sodupe, M.; Oliva, A.; Bertran, J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 1256.
26. Császár, A. G. J. Phys. Chem. 1996, 100, 3541.
27. Stepanian, S. G.; Reva, I. D.; Radchenko, E. D.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4623.
28. Barone, V.; Adamo, C.; Lelj, F. J. Chem. Phys. 1995, 102, 364.
29. Malick, D. K.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A. J. Chem. Phys. 1998, 108, 5704.
30. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553.
31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, revision A.3; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
32. Lavrich, R. J.; Tubergen, W. J. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 2938.
33. Jasien, P. G.; Stevens, W. J. J. Chem. Phys. 1986, 84, 3271.
34. Lovas, F. J.; Suenram, R. D.; Fraser, G. T.; Gillies, C. W.; Zozom, J. J. Chem. Phys. 1988, 88, 722.
35. Florian, J.; Leszczynski, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3010.
36. Guallar, V.; Douhal, A.; Moreno, M.; Lluch, J. M. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 6251.
37. Gaigeot, M. P.; Ghomi, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 5007.
38. Smets, J.; Smith, D. M. A.; Elkadi, Y.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 9152.
39. Remko, M.; Rode, B. M. Struct. Chem. 2004, 15, 223.