Detection of intensity change points in time-resolved single-molecule measurements

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 109, Issue 1, 2005, Pages 617-628

  Watkins, Lucas P ^a   Yang, Haw ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYMATIC REACTION; INTENSITY CHANGE POINTS; ORIENTATIONAL TRANSITIONS; THRESHOLDING;

ELECTRONIC STRUCTURE; ENZYMES; MATHEMATICAL MODELS; MOLECULAR STRUCTURE; PHOTONS; ROBUSTNESS (CONTROL SYSTEMS); SPURIOUS SIGNAL NOISE;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 12344282980     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0467548     Document Type: Article

References (54)

1. Moerner, W.; Orrit, M. Science 1999, 283, 1670-1676.
2. Mandel, L.; Wolf, E. Optical Coherence and Quantum Optics; Cambridge University Press: New York, 1995.
3. Nirmal, M.; Dabbousi, B. O.; Bawendi, M. G.; Macklin, J. J.; Trautman, J. K.; Harris, T. D.; Brus, L. E. Nature 1996, 383, 802-1106.
4. Neuhauser, R. G.; Shimizu, K. T.; Woo, W. K.; Empedocles, S. A.; Bawendi, M. G. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 3301-3304.
5. Kuno, M.; Fromm, D.; Hamann, H.; Gallgher, A.; Nesbitt, D. J. Chem. Phys. 2001, 115, 1028-1040.
6. Krauss, T. D.; O'Brian, S.; Brus, L. E. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 1725-1733.
7. Dickson, R. M.; Cubitt, A. B.; Tsien, R. Y.; Moerner, W. E. Nature 1997, 388, 355-358.
8. Lu, H. P.; Xun, L.-Y.; Xie, X. S. Science 1998, 282, 1877-1882.
9. Zhuang, X. W.; Bartley, L. E.; Babcock, H. P.; Russell, R.; Ha, T. J.; Herschlag, D.; Chu, S. Science 2000, 288, 2048-2051.
10. Tan, E.; Wilson, T. J.; Nahas, M. K.; Clegg, R. M.; Lilley, D. M. J.; Ha, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 9308-9313.
11. Yasuda, R.; Masaike, T.; Adachi, K.; Noji, H.; Itoh, H.; Kinosita, K., Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9314-9318.
12. Yildiz, A.; Forkey, J. N.; McKinney, S. A.; Ha, T.; Goldman, Y. E.; Selvin, P. R. Science 2003, 300, 2061-2065.
13. Diez, M.; Zimmermann, B.; Börsch, M.; König, M.; Schweinberger, E.; Steigmiller, S.; Reuter, R.; Felekyan, S.; Kudryavtsev, V.; Seidel, C.; Gräber, P. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 135-141.
14. Ha, T.; Glass, J.; Enderle. T.; Chemla, D. S.; Weiss, S. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 2093-2096.
15. Tinnefeld, P.; Herten, D. P.; Sauer, M. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 7989-8003.
16. Mei, E.; Vinogradow, S.; Hochstrasser, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13199-13204.
17. Biju, V.; Micic, M.; Hu, D.; Lu, H. P. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 9374-9381.
18. van den Bout, D.; Yip, W.; Fu, D.; Swager, T.; Barbara, P. Science 1997, 277, 1074-1077.
19. Bartko, A. P.; Dickson, R. M. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3053-3056.
20. Weston, K. D.; Goldner, L. S. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 3453-3462.
21. Bartko, A. P.; Xu, K.; Dickson, R. M. Phys. Rev. Lett. 2002, 89, 026101-1-026101-4.
22. Stevens, B. C.; Ha, T. J. Chem. Phys. 2004, 120, 3030-3039.
23. Lippitz, M.; Hübner, C. G.; Christ, T.; Eichner, H.; Bordat, P.; Herrmann, A.; Müllen, K.; Basché, T. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 103001-1-103001-4.
24. Moerncr, W.; Fromm, D. Rev. Sci. Instrum. 2003, 74, 3597-3619.
25. Kulzer, F.; Orrit, M. Annu. Rev. Phys. Chem. 2004, 55, 585-611.
26. Andrec, M.; Levy, R. M.; Talaga, D. S. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 7454-7464.
27. Watkins, L. P.; Yang, H. Biophys. J. 2004, 86, 4015-4029.
28. Fisher, R. A. Proc. Cam. Philos. Soc. 1925, 22, 700-725.
29. Fréchet, M. Metron 1930, 8, 3.
30. Cramér, H. Mathematical Methods of Statistics; Princeton University Press: Princeton, NJ, 1946.
31. Rao, C. R. Proc. Cambridge Philos. Soc. 1949, 45, 213-218.
32. Chen, J.; Gupta, A. K. Commun. Statist.-Simula. 2001, 30, 665-697.
33. Worsley, K. J. Biometrika 1983, 70, 455-464.
34. Worsley, K. J. Biometrika 1986, 73, 91-104.
35. Boudjellaba, H.; MacGibbon, B.; Sawyer, P. Commun. Statist.-Theory Methods 2001, 30, 407-434.
36. Noé, M. Ann. Math. Stat. 1972, 43, 58-64.
37. Worsley, K. J. Biometrics 1988, 44, 259-263.
38. Henderson, R. Biometrika 1990, 77, 835-43.
39. Fraley, C.; Raftery, A. E. Comput. J. 1998, 41, 578-588.
40. Ward, J. H., Jr. J. Am. Statist. Assoc. 1963, 58, 234-244.
41. Fraley, C.; Raftery, A. E. J. Am. Statist. Assoc. 2002, 97, 611-631.
42. Scott, A. J.; Symons, M. J. Biometrics 1971, 27, 387-397.
43. Farley, C. SIAM J. Sci. Comput. 1998, 20, 270-281.
44. Dempster, A. P.; Laird, N. M.; Rubin, D. B. J. R. Stat. Soc. B 1977, 39, 1-38.
45. Lanterman, A. D. Int. Slat. Rev. 2001, 69, 185-212.
46. Leroux, B. G. Ann. Stat. 1992, 20, 1350-1360.
47. Schwarz, G. Ann. Stat. 1978, 6, 461-464.
48. Wang, J.; Wolynes, P. Phys. Rev. Lett. 1995, 74, 4317-4320.
49. Yang, H.; Xie, X. S. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10965-10979.
50. Barsegov, V.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J Chem. Phys. 2002, 116, 4240-4251.
51. Owen, A. B. J. Am. Statist. Assoc. 1995, 90, 516-521.
52. Press: W. H.; Teukolsky, S. A.; Vetterling, W. T.; Flannery, B. P. Numerical Recipes in C; Cambridge University Press: New York, 1988.
53. Gombay, E.; Horvath, L. J. Multivariate Anal. 1996, 50, 120-152.
54. Vostrikova, L. Y. Theory Probab. Appl. 1981, 26, 356-362.