An effective hamiltonian for hole transfer along B-DNA double strands

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 4, Issue 24, 2002, Pages 6072-6079

  Brunaud, Guillaume ^a   Castet, Frédéric ^a   Fritsch, Alain ^a   Ducasse, Laurent ^a  

^a UNIVERSITÉ DE BORDEAUX   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0038293658     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b208655g     Document Type: Article

References (67)

1. J. Ladik, Acta Phys. Acad. Sci. Hung., 1960, 11, 239.
2. F. D. Lewis, Y. Wu, Y. Zhang, R. L. Letsinger, S. R. Greenfield and M. R. Wasielewski, Science, 2000, 277, 673.
3. D. Lewis, T. Wu, X. Liu, R. L. Letsinger, S. R. Greenfield, S. E. Miller and M. R. Wasielewski, J. Am. Chem. Soc., 2000, 122, 2889.
4. A. Harriman, Angew. Chem. Int. Ed., 1999, 38, 945.
5. M. Brun and A. Harriman, J. Am. Chem. Soc., 1992, 114, 3656.
6. M. Brun and A. Harriman, J. Am. Chem. Soc., 1994, 116, 10383.
7. K. Fukui and K. Tanaka, Angew. Chem. Int. Ed., 1998, 37, 158.
8. M. E. Nunez, K. T. Noyes, D. A. Gianolio, L. W. McLaughlin and J. K. Barton, Biochemistry, 2000, 39, 6190.
9. S. O. Kelley and J. K. Barton, Science, 1999, 283, 375.
10. B. Giese, S. Wersely, M. Spormann, U. Lindemann, E. Meggers and M. E. Michel-Beyerle, Angew. Chem. Int. Ed., 1999, 38, 996.
11. P. T. Henderson, D. Jones, G. Hampikian, Y. Kan and G. Schuster, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1999, 96, 8353.
12. D. Ly, L. Sanii and G. J. Schuster, J. Am. Chem. Soc., 1999, 121, 9400.
13. J. Ladik, F. Bogar and V. V. Doren, Adv. Quantum Chem., 2001, 39, 19.
14. J. Ladik and Y.-J. Ye, Int. J. Quantum Chem., 2002, 90, 838.
15. Y.-J. Ye, R.-S. Chen, A. Martinez, P. Otto and J. Ladik, Physica B, 2000, 279, 246.
16. J. Ladik, THEOCHEM, 2001, 544, 1.
17. A. A. Voityuk, J. Jortner, M. Bixon and N. J. Rösch, Chem. Phys., 2001, 114, 5614.
18. A. A. Voityuk, N. Rösch, M. Bixon and J. Jortner, J. Phys. Chem. B, 2000, 104, 9740.
19. M. Bixon and J. Jortner, J. Phys. Chem. B, 2000, 104, 3906.
20. M. Bixon, B. Giese, S. Wessely, T. Langenbacher, M. E. Michel-Beyerle and J. Jortner, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1999, 96, 11713.
21. M. Bixon and J. Jortner, Chem. Phys., 2002, 281, 393.
22. A. Troisi and G. Orlandi, Chem. Phys. Lett., 2001, 344, 509.
23. I. Saito, M. Takayama and S. Kawanishi, J. Am. Chem. Soc., 1995, 117, 5590.
24. H. Sugiyama and I. Saito, J. Am. Chem. Soc., 1996, 118, 7063.
25. Y. Yoshioka, Y. Kitagawa, Y. Tukano, K. Yamagushi, T. Nakamura and I. Saito, J. Am. Chem. Soc., 1999, 121, 8712.
26. I. Saito, T. Nakamura and K. Nakatani, J. Am. Chem. Soc., 2000, 122, 3001.
27. A. A. Voityuk, J. Jortner, M. Bixon and N. Rösch, Chem. Phys. Lett., 2000, 324, 430.
28. A. A. Voityuk, M. E. Michel-Beyerle and N. Rösh, Chem. Phys. Lett., 2001, 342, 231.
29. M. J. S. Dewar, E. G. Zoebisch, E. F. Healy and J. J. P. Stewart, J. Am. Chem. Soc., 1985, 107, 3902.
30. F. C. Grozema, Y. A. Berlin and L. D. A. Siebbeles, Int. J. Quantum Chem., 1999, 75, 1009.
31. F. C. Grozema, Y. A. Berlin and L. D. A. Siebbeles, J. Am. Chem. Soc., 2000, 122, 10903.
32. P. O'Neill, A. W. Parker, M. A. Plumb and L. D. A. Siebbeles, J. Phys. Chem. B, 2001, 105, 5283.
33. R. Pariser and R. G. Parr, J. Chem. Phys., 1953, 21, 466;
34. J. Chem. Phys., 1953, 21, 767;
35. J. A. Pople, Trans. Faraday Soc., 1953, 49, 1375.
36. J. Hubbard, Proc. R., Soc. London, Ser. A, 1963, 276, 238;
37. J. Hubbard, Proc. R., Soc. London. Ser. A, 1964, 277, 237;
38. J. Hubbard, Proc. R., Soc. London, Ser. A, 1964, 281, 401;
39. J. Hubbard, Proc. R., Soc. London, Ser. A, 1965, 285, 542.
40. F. Castet, A. Fritsch and L. Ducasse, J. Phys. I (France), 1996, 6, 583.
41. G. Brunaud, F. Castet, A. Fritsch, M. Kreissler and L. Ducasse, J. Phys. Chem. B, 2001, 105, 12665.
42. The coulombic parameters are unpublished.
43. G. S. M. Tong, I. V. Kurnikov and D. N. Beratan, J. Phys. Chem. B, 2002, 106, 2381.
44. Geometries used in this work are generated using the Macromodel package: MacroModel V6.5, Schrödinger, New York. F. Mohamadi, N. G. J. Richards, W. C. Guida, R. Liskamp, M. Lipton, C. Caulfield, G. Chang, T. Hendrickson and W. C. Still, J. Comput. Chem., 1990, 11, 440.
45. S. Ramasesha and Z. G. Soos, Int. J. Quantum Chem., 1984, 25, 1003.
46. N. S. Hush and A. S. Cheung, Chem. Phys. Lett., 1975, 34, 11.
47. A.-O. Colson, B. Besler, D. M. Colse and M. D. Sevilla, J. Phys. Chem., 1992, 96, 661.
48. S. O. Kelley, N. M. Jackson, M. G. Hill and J. K. Barton, Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1999, 38, 941.
49. K. E. Erkilla, D. T. Oldom and J. K. Barton, Chem. Rev., 1999, 99, 2777.
50. E. Meggers, E. Michel-Beyerle and B. Giese, J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 12950.
51. V. M. Orlov, A. N. Smirnov and Y. M. Varshavsky, Tetrahedron Lett., 1976, 48, 4377.
52. A.-O. Colson, B. Besler and M. D. Sevilla, J. Phys. Chem., 1992, 96, 9787.
53. M. Hutter and T. Clark, J. Am. Chem. Soc., 1996, 118, 7574.
54. N. Russo, M. Toscano and A. Grand, J. Comput. Chem., 2000, 21, 1243.
55. F. Prat, K. N. Houk and C. S. Foote, J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 845.
56. D. Beveridge and R. Lavery, Theoretical Biochemistry and Molecular Biophysics, Adenine Press, Schenectady, NY, 1991.
57. I. V. Kurnikov, G. S. M. Tong, M. Madrid and D. N. Beratan, J. Phys. Chem. B, 2002, 106, 7.
58. T. Melvin, M. A. Plumb, S. W. Botchway, P. O'Neill and A. W. Parker, Photochem. Photobiol., 1995, 61, 584.
59. I. Saito, T. Nakamura, K. Nakatani, Y. Yoshioka, K. Yamagushi and H. Sugiyama, J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 12686.
60. Y. Kan and G. Shuster, J. Am. Chem. Soc., 1999, 121, 10857.
61. A. Y. Kasumov, M. Kodak, S. Guéron, B. Reulet, V. T. Volkov, D. V. Klinov and H. Bouchiat, Science, 2001, 291, 281.
62. F. Castet, L. Ducasse and A. Fritsch, J. Chem. Phys., 2000, 112, 10625.
63. V. Sartor, E. Boone and G. B. Schuster, J. Phys. Chem. B, 2001, 105, 11057.
64. F. C. Grozema, L. D. A. Siebbeles, Y. A. Berlin and M. A. Ratner, Chem. Phys. Chem., 2002, 6, 536.
65. P. Hobza and J. Sponer, Chem. Phys. Lett., 1998, 288, 7.
66. C. R. Treadway, M. G. Hill and J. K. Barton, Chem. Phys., 2002, 281, 409.
67. A. A. Voityuk, K. Siriwong and N. Rösh, Phys. Chem. Chem. Phys., 2001, 3, 5421.