Single-molecule nanosecond anisotropy dynamics of tethered protein motions

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 2, 2003, Pages 618-626

  Hu, Dehong ^a   Lu, H Peter ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MOLECULAR INTERACTIONS; SURFACE INTERACTIONS; TETHERED PROTEIN; TIME RESOLVED FLUORESCENCE ANISOTROPY;

ANISOTROPY; CONFORMATIONS; FLUORESCENCE; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULES; NANOSTRUCTURED MATERIALS; SURFACE PROPERTIES;

PROTEINS;

EID: 0037448482     PISSN: 10895647     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0213654     Document Type: Article

References (48)

1. Xie, X. S.; Trautman, J. K. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 441.
2. Lu, H. P.; Xun, L. Y.; Xie, X. S. Science 1998, 282, 1877.
3. Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11.
4. Onuchic, J. N.; Lutheyschulten, Z.; Wolynes, P. G. Annu. Rev. Phys. Chem. 1997, 48, 545.
5. Chen, Y.; Hu, D.; Vorpagel, E. R.; Lu, H. P., submitted.
6. Zhuang, X.; Ha, T.; Kim, H. D.; Centner, T.; Labeit, S.; Chu, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 14241.
7. Edman, L.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8266.
8. Jia, Y. W.; Sytnik, A.; Li L. Q.; Vladimirov, S.; Cooperman, B. S.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 7932.
9. Ha, T.; Ting, A. Y.; Liang, J.; Caldwell, W. B.; Deniz, A. A.; Chemla, D. S.; Schultz, P. G.; Weiss, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 893.
10. Weiss, S. Science 1999, 283, 1676.
11. Zhuang, X. W.; Bartley, L. E.; Babcock, H. P.; Russell, R.; Ha, T. J.; Herschlag, D.; Chu, S. Science 2000, 288, 2048.
12. Moerner, W. E. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 910.
13. Moerner, W. E.; Orrit, M. Science 1999, 283, 1670.
14. Tamarat, P.; Maali, A.; Lounis, B.; Orrit, M. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 1.
15. Schenter, G. K.; Lu, H. P.; Xie, X. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10477.
16. Xie, X. S.; Lu, H. P. J. Biol. Chem. 1999, 274, 15967.
17. Lu, H. P.; Iakoucheva, L. M.; Ackerman, E. J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9184.
18. Ha, T.; Glass, J.; Enderle, T.; Chemla, D. S.; Weiss, S. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 2093.
19. Harms, G. S.; Sonnleitner, M.; Schütz, G. J.; Gruber, H. J.; Schmidt, T. Biophys. J. 1999, 77, 2864.
20. Schutz, G. J.; Schindler, H.; Schmidt, T. Opt. Lett. 1997, 22, 651.
21. Xie, X. S.; Dunn, R. C. Science 1994, 265, 361.
22. Ha, T.; Enderle, T.; Chemla, D. S.; Selvin, P. R.; Weiss, S. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3979.
23. Weston, K. D.; Goldner, L. S. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 3453.
24. Dickson, R. M.; Norris, D. J.; Moerner, W. E. Phys. Rev. Lett. 1998, 81, 5322.
25. Ruiter, A. G. T.; Veerman, J. A.; Garciaparajo, M. F.; Van Hulst, N. F. J. Phys. Chem. 1997, 101, 7318.
26. Peterman, E. J. G.; Sosa, H.; Goldstein, L. S. B.; Moerner, W. E. Biophys. J. 2001, 81, 2851.
27. Sase, I.; Miyata, H.; Ishiwata, S. I.; Kinosita, K., Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 5646.
28. Hu, D.; Yu, J.; Wong, K.; Bagchi, B.; Rossky, P. J.; Barbara, P. F. Nature 2000, 405, 1030.
29. Deschenes, L. A.; Vanden Bout, D. A. Science 2001, 292, 255.
30. Ha, T.; Laurence, T. A.; Chemla, D. S.; Weiss, S. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 6839.
31. Warshaw, D. M.; Hayes, E.; Gaffney, D.; Lauzon, A.-M.; Wu J.; Kennedy, G.; Trybus, K.; Lowey, S.; Berger, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 8034.
32. Hollars, C. W.; Dunn, R. C. J. Chem. Phys. 2000, 112, 7822.
33. Bopp, M. A.; Sytnik, A.; Howard, T. D.; Cogdell, R. J.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 11271.
34. Sosa, H.; Peterman, E. J. G.; Moerner, W. E.; Goldstein, L. S. B. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 540.
35. Adachi, K.; Yasuda, R.; Noji, H.; Itoh, H.; Harada, Y.; Yoshida, M.; Kinosita, K., Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 7243.
36. Mei, E.; Higgins, D. A. J. Chem. Phys. 2000, 112, 7839.
37. Bartko, A. P.; Dickson, R. M. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 11237.
38. Schaffer, J.; Volkmer, A.; Eggeling, C.; Subramaniam, V.; Striker, G.; Seidel, C. A. M. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 331.
39. Bohmer, M.; Pampaloni, F.; Wahl, M.; Rahn, H.; Erdmann, R.; Enderlein, J. Rev. Sci. Instrum. 2001, 72, 4145.
40. Fries, J. R.; Brand, L.; Eggeling, C.; Kollner, M.; Seidel, C. A. M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 6601.
41. Zhang, X. J.; Wozniak, J. A.; Matthews, B. W. J. Mol. Biol. 1995, 250, 527.
42. Cross, A. J.; Waldeck, D. H.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1983, 78, 6455.
43. Cross, A. J.; Fleming, G. R. Biophys. J. 1984, 46, 45.
44. Lakowicz, J. R. Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2nd ed.; Kluwer Academic/Plenum Publishers: New York, 1999.
45. Enderlein, J.; Erdmann, R. Opt. Commun. 1997, 134, 371.
46. Lu, H. P.; Xie, X. S. Nature 1997, 385, 143.
47. Cross, A. J.; Fleming, G. R. Biophys. J. 1986, 50, 507.
48. Forkey, J. N.; Quinlan, M. E.; Goldman, Y. E. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2000, 74, 1.