Molecular dynamics study on liquid 1-octanol. Part 2. Water-saturated 1-octanol solution

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 90, Issue 2, 2002, Pages 786-791

  Datta, Sambhu N ^a   Misra, Anirban ^a  

^a INDIAN INSTITUTE OF TECHNOLOGY BOMBAY   (India)

Author keywords

Molecular dynamics; Physicochemical properties; Water saturated 1 octanol solution

Indexed keywords

ALCOHOLS; FREE ENERGY; MOLECULES; PERTURBATION TECHNIQUES; SATURATION (MATERIALS COMPOSITION); SOLUTIONS;

CONSISTENT-VALENCE FORCE FIELD; OCTANOL; PARTITION COEFFICIENTS; PHYSICOCHEMICAL PROPERTIES;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 0037108073     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.992     Document Type: Article

References (43)

1. Michael, P; Williams, A. Organic and Bio-Organic Mechanisms; Longman: Essex, UK, 1997; pp. 261-266.
2. DeBolt, S. E.; Kollman, P. A. J Am Chem Soc 1995, 117, 5316-5340.
3. Hansch, C.; Leo, A. Exploring QSAR Fundamentals and Applications in Chemistry and Biology; American Chemical Society: Washington, DC, 1995.
4. Richards, W. G. Methods Princ Med Chem 1996, 4, 173-180.
5. Carrupt, P.; Testa, B.; Gaillard, P. In Reviews in Computational Chemistry; Lipkowitz, K. B.; Boyd, D., Eds.; Wiley-VCH: New York, 1997; Vol. 11, pp. 241-345.
6. Ghose, A. K.; Crippen, G. M. J Comput Chem 1986, 7, 565-577.
7. Leo, A. Chem Rev 1993, 30, 1283-1306.
8. Klopman, G.; Shaomeng, J. L.; Dimayuga, M. J. Chem Inf Comput Sci 1994, 34, 752-781.
9. Kamlet, M. J.; Doherty, R. M.; Abraham, M. H.; Marcus, Y.; Taft, R. W. J Phys Chem 1988, 92, 5244-5255.
10. Abraham, M. H.; Chadha, H. S.; Whiting, G. S.; Mitchell, R. C. J Pharm Sci 1994, 83, 1085-1100.
11. Duffy, E. M.; Jorgensen, W. L. J Am Chem Soc 2000, 122, 2878-2888.
12. Jorgensen, W. L.; Duffy, E. M. Bioorg Med Chem Lett 2000, 10, 1155-1158.
13. Beveridge, D. L.; DiCapua, F. M. Annu Rev Biophys Biophys Biochem 1989, 18, 431-492.
14. Jorgensen, W. L. Acc Chem Res 1989, 22, 184-189.
15. Kollman, P. A. Chem Rev 1993, 93, 2395-2417.
16. Essex, J. W.; Reynolds, C. A.; Richards, W. G. J Chem Soc Chem Commun 1989, 1152-1154.
17. Jorgensen, W. L.; Briggs, J. M.; Contreras, M. L. J Phys Chem 1990, 94, 1683-1686.
18. Dunn, III W. J.; Nagy, P. I. J Comput Chem 1992, 13(4), 468-477.
19. Best, S. A.; Merz, Jr., K. M.; Reynolds, C. H. J Phys Chem B 1999, 103, 714-726.
20. Kimball, S. D. Curr Pharm Des 1995, 1, 441-468.
21. Tucker, T. J.; Lumma, W. C.; Lewis, S. D.; Gardell, S. J.; Lucas, B. J.; Sisko, J. T.; Lynch, J. J.; Lyle, E. A.; Baskin, E. P.; Woltmann, R. F.; Appleby, S. D.; Chen, I.-W.; Dancheck, K. B.; Naylor-Olsen, A. M.; Krueger, J. A.; Cooper, C. M.; Vacca, J. P. J Med Chem 1997, 40, 3687-3693.
22. Feng, D.-M.; Gardell, S. J.; Lewis, S. D.; Bock, M. G.; Chen, Z.; Freidinger, R. M.; Naylor-Olsen, A. M.; Ramjit, H. G.; Woltmann, R.; Baskin, E. P.; Lynch, J. J.; Lucas, R.; Shafer, J. A.; Dancheck, K. B.; Chen, I.-W.; Mao, S.-S.; Krueger, J. A.; Hare, T. R.; Mulichak, A. M.; Vacca, J. P. J Med Chem 1997, 40, 3726-3733.
23. Tucker, T. J.; Brady, S. F.; Lumma, W. C.; Lewis, S. D.; Gardell, S. J.; Naylor-Olsen, A. M.; Van, Y.; Sisko, J. T.; Stauffer, K. J.; Lucas, B. J.; Lynch, J. J.; Cook, J. J.; Stranieri, M. T.; Holahan, M. A.; Lyle, E. A.; Baskin, E. P.; Chen, I.-W.; Dancheck, K. B.; Krueger, J. A.; Cooper, C. M.; Vacca, J. P. J Med Chem 1998, 41, 3210-3219.
24. Bone, R.; Lu, T.; Illig, C. R.; Soil, R. M.; Spurlino, J. C. J Med Chem 1998, 41, 2068-2075.
25. Lumma, Jr., W. C.; Witherup, K. M.; Tucker, T. J.; Brady, S. F.; Sisko, J. T.; Naylor-Olsen, A. M.; Lewis, S. D.; Lucas, B. J.; Vacca, J. P. J Med Chem 1998, 41, 1011-1013.
26. Isaacs, R. C. A.; Cutrona, K. J.; Newton, C. L.; Sanderson, P. E. J.; Solinsky, M. G.; Baskin, E. P.; Chen, I.-W.; Cooper, C. M.; Cook, J. J.; Gardell, S. J.; Lewis, S. D.; Lucas, Jr., R. J.; Lyle, E. A.; Lynch, Jr., J. J.; Naylor-Olsen, A. M.; Stranieri, M. T.; Vastag, K.; Vacca, J. P. Bioorg Med Chem Lett 1998, 8, 1719-1724.
27. Sanderson, P. E. J.; Lyle, T. A.; Cutrona, K. J.; Dyer, D. L.; Dorsey, B. D.; McDonough, C. M.; Naylor-Olsen, A. M.; Chen, I.-W.; Chen, Z.; Cook, J.J.; Cooper, C.M.; Gardell, S. J.; Hare, T. R.; Krueger, J. A.; Lewis, S. D.; Lin, J. H.; Lucas, Jr., B. J.; Lyle, E. A.; Lynch, Jr., J. J.; Stranieri, M. T.; Vastag, K.; Yan, Y.; Shafer, J, A.; Vacca, J. P. J Med Chem 1998, 41, 4466-4474.
28. Lee, K.; Hwang, S. Y.; Hong, S.; Hong, C. Y.; Lee, C.-S.; Shin, Y.; Kirn, S.; Yun, M.; Yoo, Y. J.; Kang, M.; Oh, Y. S. Bioorg Med Chem Lett 1998, 6, 869-876.
29. Sugano, K.; Yoshida, S.; Takaku, M.; Haramura, M.; Saitoh, R.; Nabuchi, Y.; Ushio, H. Bioorg Med Chem Lett 2000, 10, 1939-1942.
30. Tucker, T. J.; Lumma, W. C.; Lewis, S. D.; Gardell, S. J.; Lucas, B. J.; Baskin, E. P.; Woltmann, R.; Lynch, J. J.; Lyle, E. A.; Appleby, S. D.; Chen, J. W.; Dancheck, K. B.; Vacca, J. P. J Med Chem 1997, 40, 1565-1569.
31. Guimarães, C. R. W.; Bicca de Alencastro, R. Int J Quantum Chem 2001, to appear..
32. Guimarães, C. R. W.; Bicca de Alencastro, R. J Phys Chem B, submitted.
33. Dauber-Osguthorpe, P.; Roberts, V. A.; Osguthorpe, D. J.; Wolff, J.; Genest, M.; Hagler, A. T. Proteins: Struct Funct Genet 1988, 4, 31-47.
34. Oliveira, C. A. F.; Guimarães, C. R. W.; Bicca de Alencastro, R. Inv J Quantum Chem 2001, 80, 999-1006.
35. Lau, K. F.; Alper, H. E.; Thacher, T. S.; Stouch, T. R. J Phys Chem 1994, 98, 8785-8792.
36. Molecular Simulations Inc., 9685 Scranton Road, San Diego, California 92121-3752.
37. Hockney, R. W. Meth Comp Phys 1970, 9, 136-211.
38. Berendsen, H. C. J.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J Chem Phys 1984, 81, 3684-3690.
39. Jorgensen, W. L.; Tirado-Rives, J. J Am Chem Soc 1988, 110, 1657-1666.
40. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J Chem Phys 1983, 79, 926-935.
41. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gubsteren, W.; Hermans, J. In Intermolecular Forces; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dodrecht, The Netherlands, 1981; pp. 331-342.
42. Alien, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Clarenden: Oxford, UK, 1987; p. 204.
43. Iwahashi, M.; Hayashi, Y.; Hachiya, N.; Matsuzawa, H.; Kabayashi, A. J Chem Soc Faraday Trans 1993, 89, 707-712.