Molecular dynamics study on liquid 1-octanol

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 80, Issue 4-5, 2000, Pages 999-1006

  De Oliveira, César Augusto Fernandes ^a   Guimarães, Cristiano Ruch Werneck ^a   De Alencastro, Ricardo Bicca ^a  

^a FEDERAL UNIVERSITY OF RIO DE JANEIRO   (Brazil)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTROSTATICS; FREE ENERGY; MOLECULAR DYNAMICS; PERTURBATION TECHNIQUES;

OCTANOL; PARTITION COEFFICIENTS; TIME AVERAGE PARTIAL CHARGES;

ALCOHOLS;

EID: 0343338181     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/1097-461x(2000)80:4/5<999::aid-qua48>3.0.co;2-k     Document Type: Article

References (23)

1. Kubinyi, H. In Burger's Medicinal Chemistry and Drug Discovery, Vol. 1, Principles and Practice; Wolff, M. E., Ed.; Wiley: New York, 1995; Chapter 14, pp. 497-571.
2. Essex, J. W.; Reynolds, C. A.; Richards, W. G. J Chem Soc Chem Commun 1989, 1152-1154.
3. Jorgensen, W. L.; Briggs, J. M.; Contreras, M. L. J Phys Chem 1990, 94, 1683-1686.
4. Dunn, III, W. J.; Nagy, P. I. J Comput Chem 1992, 13(4), 468-477.
5. DeBolt, S. E.; Kollman, P. A. J Am Chem Soc 1995, 117, 5316-5340.
6. Kimball, S. D. Curr Pharm Des 1995, 1, 441-468.
7. Tucker, T. J.; Lumma, W. C.; Lewis, S. D.; Gardell, S. J.; Lucas, B. J.; Sisko, J. T.; Lynch, J. J.; Lyle, E. A.; Baskin, E. P.; Woltmann, R. F.; Appleby, S. D.; Chen, I.-W.; Dancheck, K. B.; Naylor-Olsen, A. M.; Krueger, J. A.; Cooper, C. M.; Vacca, J. P. J Med Chem 1997, 40, 3687-3693.
8. Tucker, T. J.; Lumma, W. C.; Lewis, S. D.; Gardell, S. J.; Lucas, B. J.; Baskin, E. P.; Woltmann, R.; Lynch, J. J.; Lyle, E. A.; Appleby, S. D.; Chen, I.-W.; Dancheck, K. B.; Vacca, J. P J Med Chem 1997, 40, 1565-1569.
9. Sanderson, P. E. J.; Lyle, T. A.; Cutrona, K. J.; Dyer, D. L.; Dorsey, B. D.; McDonough, C. M.; Naylor-Olsen, A. M.; Chen, I.-W.; Chen, Z.; Cook, J. J.; Cooper, C. M.; Gardell, S. J.; Hare, T. R.; Krueger, J. A.; Lewis, S. D.; Lin, J. H.; Lucas, Jr., B. J.; Lyle, E. A.; Lynch, Jr., J. J.; Straineri, M. T.; Vastag, K.; Yan, Y.; Shafer, J. A.; Vacca, J. P. J Med Chem 1998, 41, 4466-4474.
10. Lee, K.; Hwang, S. Y.; Yun, M.; Kim, D. S. Bioorg Med Chem Lett 1998, 8, 1683-1686.
11. Tucker, T. J.; Brady, S. F.; Lumma, W. C.; Lewis, S. D.; Gardell, S. J.; Naylor-Olsen, A. M.; Yan, Y.; Sisko, J. T.; Stauffer, K. J.; Lucas, B. J.; Lynch, J. J.; Cook, J. J.; Stranieri, M. T.; Holahan, M. A.; Lyle, E. A.; Baskin, E. P.; Chen, I.-W.; Dancheck, K. B.; Krueger, J. A.; Cooper, C. M.; Vacca, J. P. J Med Chem 1998, 41, 3210-3219.
12. Guimarães, C. R. W.; Fraga, C. A. M.; Barreiro, E. J.; de Alencastro, R. B. Avaliação Teórica da Afinidade Relativa de Inhibidores de Trombina via Perturbação da Energia Livre; X Brazilian Symposium of Theoretical Chemistry, Caxambu, Brazil, 1999.
13. Jorgensen, W. L. J Phys Chem 1986, 90, 1276-1284.
14. Dauber-Osguthorpe, P.; Roberts, V. A.; Osguthorpe, D. J.; Wolff, J.; Genest, M.; Hagler, A. T. Proteins: Structure, Function Genetics 1988, 4, 31-47.
15. Verlet, L. Phys Rev 1993, 159, 98-103.
16. Woodock, L. V. Chem Phys Lett 1971, 10, 257-261.
17. Berendsen, H. C. J.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J Chem Phys 1984, 81, 3684-3690.
18. van Gunsteren, W. E.; Berendesen, H. J. C. Angew Chem Int Ed Engl 1990, 29, 992-1022.
19. Breneman, C. M.; Wiberg, K. B. J Comput Chem 1990, 11, 361-373.
20. Hehre, W. J.; Deppmeier, B. J.; Klunzinger, P. E. PC SPARTAN Pro; Wavefunction Inc.: Irvine, California, 1999.
21. Reynolds, C. A.; Essex, J. W.; Richards, W. G. J Am Chem Soc 1992, 114, 9075-9079.
22. Cautinho, K.; Canuto, S. Adv Quantum Chem 1997, 28, 89-98.
23. Connolly, M. L. Science 1983, 221, 709-713.