Solving large RNA structures by X-ray crystallography

Methods in Enzymology

Volumn 317, Issue , 2000, Pages 169-180

  Cate, Jamie H ^a   Doudna, Jennifer A ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

RNA;

ARTICLE; CRYSTAL STRUCTURE; MOLECULAR DYNAMICS; PRIORITY JOURNAL; RNA CONFORMATION; RNA SEQUENCE; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

EID: 0034101184     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/s0076-6879(00)17014-4     Document Type: Article

References (35)

1. B. L. Golden, A. R. Gooding, E. R. Podell, and T. R. Cech, Science 282, 259 (1989).
2. F. L. Suddath, G. J. Quigley, A. McPherson, D. Sneden, J. J. Kim, S. H. Kim, and A. Rich, Nature 248, 20 (1974).
3. J. D. Robertus, J. E. Ladner, J. T. Finch, D. Rhodes, R. S. Brown, B. F. Clark, and A. Klug, Nature 250, 546 (1974).
4. J. H. Cate, A. R. Gooding, E. Podell, K. Zhou, B. L. Golden, C. E. Kundrot, T. R. Cech, and J. A. Doudna, Science 273, 1678 (1996).
5. H. W. Pley, K. M. Flaherty, and D. B. McKay, Nature (Lond.) 372, 68 (1994).
6. W. G. Scott, J. T. Finch, and A. Klug, Cell 81, 991 (1995).
7. C. C. Correll, B. Freeborn, P. B. Moore, and T. A. Steitz, Cell 91, 705 (1997).
8. A. R. Ferre-D'Amare, K. Zhou, and J. A. Doudna, J. Mol. Biol. 279, 621 (1998).
9. K. Nagai, C. Oubridge, T. H. Jessen, J. Li, and P. R. Evans, Nature 348, 515 (1990).
10. C. Oubridge, N. Ito, P. R. Evans, C. H. Teo, and K. Nagai, Nature 372, 432 (1994).
11. A. R. Ferre-D'Amare, K. Zhou, and J. A. Doudna, Nature (Lond.) 395, 567 (1998).
12. D. W. Celander and T. R. Cech, Biochemistry 29, 1355 (1990).
13. D. W. Celander and T. R. Cech, Science 251, 401 (1991).
14. S. Stern, D. Moazed, and H. F. Noller, Methods Enzymol. 164, 481 (1988).
15. A. R. Ferre-d'Amare and J. A. Doudna, Methods Mol. Biol. 74, 371 (1997).
16. J. R. Luft and G. T. DeTitta, Methods Enzymol. 276, 110 (1997).
17. A. McPherson, Methods Enzymol. 114, 112 (1985).
18. D. W. Rodgers, Methods Enzymol. 276, 183 (1997).
19. S. Doublie, Methods Enzymol. 276, 523 (1997).
20. W. G. Scott, J. T. Finch, R. Grenfell, J. Fogg, T. Smith, M. J. Gait, and A. Klug, J. Mol. Biol. 250, 327 (1995).
21. C. C. Correll, B. Freeborn, P. B. Moore, and T. A. Steitz, J. Biomol. Struct. Dyn. 15, 165 (1997).
22. W. A. Hendrickson, and C. M. Ogata, Methods Enzymol. 276, 494 (1997).
23. A. R. Ferre-D'Amare and J. A. Doudna, Curr. Protocols Nucleic Acid Chem., in press (1999).
24. J. H. Cate, and J. A. Doudna, Structure 4, 1221 (1996).
25. T. C. Terwilliger, Methods Enzymol. 276, 530 (1997).
26. W. Saenger, "Principles of Nucleic Acid Structure." Springer-Verlag, New York, 1984.
27. T. A. Jones, J. Y. Zou, S. W. Cowan, and Kjeldgaard, Acta Crystallogr. A, 47, 110 (1991).
28. A. M. Pyle, Science, 261, 709 (1993).
29. S. R. Holbrook, J. L. Sussman, R. W. Warrant, and S. H. Kim, J. Mol. Biol. 123, 631 (1978).
30. S. R. Holbrook, J. L. Sussman, R. W. Warrant, G. M. Church, and S. H. Kim, Nucleic Acids Res. 4, 2811 (1977).
31. J. L. Sussman, S. R. Holbrook, R. W. Warrant, G. M. Church, and S. H. Kim, J. Mol. Biol. 123, 607 (1978).
32. V. Luzzati, Acta Crystallogr. 5, 802 (1952).
33. C. A. Grosshans and T. R. Cech, Biochemistry 28, 6888 (1989).
34. B. Hille, J. Gen. Physiol. 61, 669 (1973).
35. Acta Crystallogr. D, 50, 760 (1994).