Phase determination from multiwavelength anomalous diffraction measurements

Methods in Enzymology

Volumn 276, Issue , 1997, Pages 494-523

  Hendrickson, Wayne A ^a   Ogata, Craig M ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANISOTROPY; ATOMIC ABSORPTION SPECTROMETRY; CRYSTAL STRUCTURE; FOURIER TRANSFORMATION; MACROMOLECULE; PHYSICAL PHASE; PRIORITY JOURNAL; REVIEW; STRUCTURE ANALYSIS; X RAY CRYSTALLOGRAPHY; X RAY DIFFRACTION; X RAY FLUORESCENCE;

EID: 0031058883     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(97)76074-9     Document Type: Article

References (88)

1. J. M. Bijvoet, Proc. Acad. Sci. Amst. B52, 313 (1949).
2. J. R. Herriott, L. C. Sieker, L. H. Jensen, and W. Lovenberg, J. Mol. Biol. 50, 391 (1970).
3. W. A. Hendrickson and M. M. Teeter, Nature 290, 107 (1981).
4. Y. Okaya and R. Pepinsky, Phys. Rev. 103, 1645 (1956).
5. S. Ramaseshan, Current Science 65, 644 (1993).
6. W. A. Hendrickson, Trans. Am. Cryst. Assoc. 21, 11 (1985).
7. R. Kahn, R. Fourme, R. Bosshard, M. Chiadmi, J. L. Risler, O. Dideberg, and J. P. Wery, FEBS Lett. 179, 133 (1985).
8. R. Fourme and W. A. Hendrickson, in "Synchrotron Radiation and Biophysics" (E. S. S. Hasnain, Ed.), pp. 156-175. Horwood, Chichester, 1990.
9. J. L. Smith, Curr. Opin. Struct. Biol. 1, 1002 (1991).
10. W. A. Hendrickson, Science 254, 51 (1991).
11. W. A. Hendrickson, in "Resonant Anomalous X-Ray Scattering: Theory and Applications" (G. Materlik, K. Fischer, C. J. Sparks, eds.), pp. 159-173. Elsevier, Amsterdam, 1994.
12. E. Fanchon and W. A. Hendrickson, Acta Cryst. A46, 809 (1990).
13. J. Karle, Int. J. Quantum Chem. Symp. 7, 357 (1980).
14. R. W. James, "The Optical Principles of the Diffraction of X-Rays," p. 135. Bell, London, 1948.
15. D. T. Cromer and D. Liberman, J. Chem. Phys. 53, 1891 (1970).
16. D. H. Templeton and L. K. Templeton, Acta Cryst. A38, 62 (1982).
17. W. I. Weis, R. Kahn, R. Fourme, K. Drickamer, and W. A. Hendrickson, Science 254, 1608 (1991).
18. W. A. Hendrickson, J. R. Horton, and D. M. LeMaster, EMBO J. 9, 1665 (1990).
19. S. Doublié, Methods in Enzymology 276 [29] 1997 (this volume).
20. C. M. Ogata, W. A. Hendrickson, X. Gao, and D. J. Patel, Abstr. Am. Cryst. Assoc. Mtg., Ser. 2 17, 53 (1989).
21. M. Schiltz, R. Fourme, I. Broutin, and T. Prange, Structure 3, 309 (1995).
22. J. O. Boles, K. Lewinski, M. Kunkle, J. D. Odom, R. B. Dunlap, L. Lebioda, and M. Hatada, Nature Struct. Biol. 1, 283 (1994).
23. S.-E. Ryu, P. D. Kwong, A. Truneh, T. G. Porter, J. Arthos, M. Rosenberg, X. Dai, N.-H. Xuong, R. Axel, R. W. Sweet, and W. A. Hendrickson, Nature 348, 419 (1990).
24. M. Lemonnier, R. Fourme, F. Rousseaux, and R. Kahn, Nucl. Instrum. Methods. 152, 173 (1978).
25. A. Nakagawa, Y. Higuchi, N. Yasuoka, Y. Katsube, and T. Yagi, J. Biochem. 108, 701 (1990).
26. U. W. Arndt, T. J. Greenhough, J. R. Helliwell, J. A. K. Howard, S. A. Rule, and A. W. Thompson, Nature 298, 835 (1982).
27. P. L. Lee and C. M. Ogata, J. Appl. Cryst. 28, 661 (1995).
28. Z. Otwinowski, in "Proceedings of the CCP4 Study Weekend: Data Collection and Processing" (I. Sawyer L., N. and Bailey S., eds.), pp. 56-62. SERC Daresbury Laboratory, Warrington, U.K., 1993.
29. CCP4, SERC Collaborative Computing Project No. 4, Daresbury Laboratory, Warrington, U.K., 1979.
30. B. W. Matthews and E. W. Czerwinski, Acta Cryst. A31, 480 (1975).
31. W. A. Hendrickson, in "Computational Crystallography 4: Techniques and New Technologies" (E. N. W. Isaacs and M. R. Taylor, eds.), pp. 97-108. Oxford University Press, Oxford, 1988.
32. A. M. Friedman, T. O. Fischmann, and T. A. Steitz, Science 268, 1721 (1995).
33. V. Ramakrishnan, J. T. Finch, V. Graziano, P. L. Lee, and R. M. Sweet, Nature 362, 219 (1993).
34. D. T. Cromer, J. Appl. Cryst. 16, 437 (1983).
35. W. A. Hendrickson, J. L. Smith, R. P. Phizackerley, and E. A. Merritt, Proteins 4, 77 (1988).
36. T. C. Terwilliger, Acta Cryst D50, 11 (1994).
37. T. C. Terwilliger, Methods Enzymol. 276, [30], 1997 (this volume).
38. A. Pähler, J. L. Smith, and W. A. Hendrickson, Acta Cryst. A46, 537 (1990).
39. W. A. Hendrickson and E. A. Lattman, Acta Cryst. B26, 136 (1970).
40. E. de La Fortelle and G. Bricogne, Methods Enzymol 276, [27], 1997 (this volume).
41. J. C. Phillips and K. O. Hodgson, Acta Cryst. A36, 856 (1980).
42. Z. Otwinowski, in "Isomorphous Replacement and Anomalous Scattering," pp. 80-86. SERC Daresbury Laboratory, Warrington, U.K., 1991.
43. V. Ramakrishnan and V. Biou, Methods Enzymol. 276, [31], 1997 (this volume).
44. T. C. Terwilliger, Acta Cryst. D50, 17 (1994).
45. W. Furey and S. Swaminathan, Am. Cryst. Assoc. Mtg. Abstr. 18, 73 (1990).
46. F. T. Burling, W. I. Weis, K. M. Flaherty, and A. T. Brünger, Science 271, 72 (1996).
47. G. Bujacz, M. Jaskolski, J. Alexandratos, A. Wlodawer, G. Merkel, R. A. Katz, and A. M. Skalka, J. Mol. Biol. 253, 333 (1995).
48. R. L. Walter, D. J. Thiel, S. L. Barna, M. W. Tate, M. E. Wall, E. F. Eikenberry, S. M. Grunner, and S. E. Ealick, Structure 3, 835 (1995).
49. H. M. K. Murthy, W. A. Hendrickson, W. H. Orme-Johnson, E. A. Merritt, and R. P. Phizackerley, J. Biol. Chem. 263, 18430 (1988).
50. J. M. Guss, E. A. Merritt, R. P. Phizackerley, B. Hedman, M. Murata, K. O. Hodgson, and H. C. Freeman, Science 241, 806 (1988).
51. W. A. Hendrickson, A. Pähler, J. L. Smith, Y. Satow, E. A. Merritt, and R. P. Phizackerley, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 2190 (1989).
52. P. R. Kolatkar, S. R. Ernst, M. L. Hackert, C. M. Ogata, W. A. Hendrickson, E. A. Merritt, and R. P. Phizackerley, Acta Cryst. B48, 191 (1992).
53. M. M. Skinner, H. Zhang, D. H. Leschnitzer, Y. Guan, H. Bellamy, R. M. Sweet, C. W. Gray, R. N. H. Konings, A. J.-J. Wang, and T. C. Terwilliger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 2071 (1994).
54. B. R. Crane, L. M. Siegel, and E. D. Getzoff, Science 270, 59 (1995).
55. J. L. Martin, J. C. A. Bardwell, and J. Kuriyan, Nature 365, 464 (1994).
56. H. Wu, J. W. Lustbader, Y. Liu, R. E. Canfield, and W. A. Hendrickson, Structure 2, 545 (1994).
57. T. S. R. Krishna, X.-P. Kong, S. Gary, P. M. Burgers, and J. Kuriyan, Cell 79, 1233 (1994).
58. S. R. Hubbard, L. Wei, L. Ellis, and W. A. Hendrickson, Nature 372, 746 (1994).
59. F. Dyda, A. B. Hickman, T. M. Jenkins, A. Engelman, R. Craigie, and D. R. Davies, Science 266, 1981 (1994).
60. C. E. Stebbins, S. Borukhov, M. Oriova, A. Polyakov, A. Goldfard, and S. A. Dahrst, Nature 373, 636 (1995).
61. L. Shapiro, A. M. Fannon, P. D. Kwong, A. Thompson, M. S. Lehmann, G. Grubel, J.-F. Legrand, J. Als-Nielsen, D. R. Colman, and W. A. Hendrickson, Nature 374, 327 (1995).
62. N. Q. McDonald, N. Panayotatos, and W. A. Hendrickson, EMBO J. 14, 2689 (1995).
63. G. Zhang, M. G. Kazanietz, P. M. Blumberg, and J. H. Hurley, Cell 81, (1995).
64. T. E. Benson, D. J. Filman, C. T. Walsh, and J. M. Hogle, Nature Struct. Biol. 2, 644 (1995).
65. J. Goldberg, H.-B. Huang, Y.-G. Kwon, P. Greengard, A. C. Nairn, and J. Kuriyan, Nature 376, 745 (1995).
66. M. M. Georgiadis, S. M. Jessen, C. M. Ogata, A. Telesnitsky, S. P. Goff, and W. A. Hendrickson, Structure 3, 879 (1995).
67. A. Qu and D. J. Leahy, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 10277 (1995).
68. T. M. T. Hall, J. A. Porter, P. A. Beachy, and D. J. Leahy, Nature 378, 212 (1995).
69. F. A. Athappilly and W. A. Hendrickson, Structure 3, 1407 (1995).
70. J.-O. Lee, P. Tieu, M. A. Arnaout, and R. Liddington, Cell 80, 831 (1995).
71. V. Biou, F. Shu, and V. Ramakrishnan, EMBO J. 14, 4056 (1995).
72. C. W. Muller, F. A. Rey, M. Sodeoka, G. L. Verdine, and S. C. Harrison, Nature 373, 311 (1995).
73. D. J. Leahy, W. A. Hendrickson, I. Aukhil, and H. P. Erickson, Science 258, 987 (1992).
74. M. Newman, T. Strzelecka, L. F. Dordner, I. Schildraut, and A. K. Aggarwall, Nature 368, 660 (1994).
75. Y. Shamoo, A. M. Friedman, M. R. Parsons, W. H. Konigsberg, and T. A. Steitz, Nature 376, 362 (1995).
76. W. Yang, W. A. Hendrickson, R. J. Crouch, and Y. Satow, Science 249, 1398 (1990).
77. J. L. Smith, E. J. Zaluzec, J.-P. Wery, L. Niu, R. L. Switzer, H. Zalkin, and Y. Satow, Science 264, 1427 (1994).
78. S. Harada, M. Yasui, K. Murakawa, N. Kasai, and Y. Satow, J. Appl. Cryst. 19, 448 (1986).
79. B. J. Graves, M. H. Hatada, W. A. Hendrickson, J. K. Miller, V. S. Madison, and Y. Satow, Biochemistry 29, 2679 (1990).
80. J. R. Tame, G. N. Murshudov, E. J. Dodson, T. K. Neil, G. G. Dodson, F. C. Higgins, and A. J. Wilkinson, Science 264, 1427 (1994).
81. M.-P. Egloff, P. T. W. Cohen, P. Reinemer, and D. Barford, J. Mol. Biol. 254, 942 (1995).
82. R. W. Alkire, M. Sagurton, F. D. Michaud, W. J. Trela, R. J. Bartlett, and R. Rothe, Nucl. Instrum. Methods A352, 535 (1995).
83. N. Watanabe, A. Nakagawa, S. Asachi, and N. Sakabe, Rev. Sci. Instrum. 66, 1824 (1995).
84. A. Deacon, J. Habash, S. J. Harrop, J. R. Helliwell, W. N. Hunter, G. A. Leonard, M. Peterson, A. Hadener, A. J. Kalb(Gilboa), N. M. Allinson, C. Castelli, K. Moon, S. McSweeney, A. Gonzolez, A. W. Thompson, S. Ealick, D. M. Szebenyi, and R. Walter, Rev. Sci. Instrum. 66, 1287 (1995).
85. J. P. Simon, E. Geissler, A. M. Hecht, F. Bley, F. Livet, M. Roth, J. L. Ferrer, E. Fanchon, C. Cohen-Addad, and J. C. Thierry, Rev. Sci. Instrum. 63, 1051 (1995).
86. S. Bernstorff, E. Busetto, C. Gramaccioni, A. Lausi, L. Olivi, F. Zanini, A. Savoia, M. Colapietro, G. Portalone, M. Camalli, A. Pifferi, R. Spagna, L. Barba, and A. Cassetta, Rev. Sci. Instrum. 66, 1661 (1995).
87. M. Newman, T. Strzelecka, L. F. Forner, I. Schildkraut, and A. K. Aggarwal, Structure 2, 439 (1994).
88. Y. Liu, C. M. Ogata, and W. A. Hendrickson, in preparation.