Synthesis of novel nonpeptidic thrombin inhibitors

Helvetica Chimica Acta

Volumn 83, Issue 5, 2000, Pages 855-909

  Obst, Ulrike ^a   Betschmann, Patrick ^a   Lerner, Christian ^a   Seiler, Paul ^a   Diederich, François ^a   Gramlich, Volker ^a   Weber, Lutz ^b   Banner, David W ^b   Schönholzer, Peter ^b  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b F HOFFMANN LA ROCHE LTD   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

THROMBIN INHIBITOR;

ARTICLE; BINDING AFFINITY; CHIRALITY; COMPLEX FORMATION; CRYSTAL STRUCTURE; DRUG SYNTHESIS; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME SUBSTRATE; MOLECULAR RECOGNITION; RECEPTOR OCCUPANCY; SITE DIRECTED MUTAGENESIS;

EID: 0034084514     PISSN: 0018019X     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1522-2675(20000510)83:5<855::AID-HLCA855>3.0.CO;2-9     Document Type: Article

References (78)

1. M. F. Scully in 'Essays in Biochemistry'. Ed. K. F. Tipton, Portland Press, London, 1992, pp. 17-36.
2. B. Furie, B. C. Furie, Cell 1988, 53, 505.
3. F. Markwardt, Hoppe-Seyler's Z. Physiol. Chem. 1957, 308, 147; S. R. Stone. J. Hofsteenge, Biochemistry 1986, 25, 4622.
4. F. Markwardt, Hoppe-Seyler's Z. Physiol. Chem. 1957, 308, 147; S. R. Stone. J. Hofsteenge, Biochemistry 1986, 25, 4622.
5. a) T. A. Lyle, Persp. Drug Discovery Des. 1993, 1, 453:
6. b) Bioorg. Med. Chem. 1995, 3, (8), devoted to 'Advances in the Design and Development of Thrombin Inhibitors'.
7. P. E. J. Sanderson, A. M. Naylor-Olsen, Curr. Med. Chem. 1998, 5, 289; V. Pavone, G. De Simone, F. Nastri, S. Galdiero, N. Staiano, A. Lombardi, C. Pedone, Biol. Chem. 1998, 379, 987: H. Kubinyi, Pharm. Unserer Zeit 1998, 27, 158; M. R. Wiley, M. J. Fisher, Exp. Opin. Ther. Patents 1997, 7, 1265.
8. P. E. J. Sanderson, A. M. Naylor-Olsen, Curr. Med. Chem. 1998, 5, 289; V. Pavone, G. De Simone, F. Nastri, S. Galdiero, N. Staiano, A. Lombardi, C. Pedone, Biol. Chem. 1998, 379, 987: H. Kubinyi, Pharm. Unserer Zeit 1998, 27, 158; M. R. Wiley, M. J. Fisher, Exp. Opin. Ther. Patents 1997, 7, 1265.
9. P. E. J. Sanderson, A. M. Naylor-Olsen, Curr. Med. Chem. 1998, 5, 289; V. Pavone, G. De Simone, F. Nastri, S. Galdiero, N. Staiano, A. Lombardi, C. Pedone, Biol. Chem. 1998, 379, 987: H. Kubinyi, Pharm. Unserer Zeit 1998, 27, 158; M. R. Wiley, M. J. Fisher, Exp. Opin. Ther. Patents 1997, 7, 1265.
10. P. E. J. Sanderson, A. M. Naylor-Olsen, Curr. Med. Chem. 1998, 5, 289; V. Pavone, G. De Simone, F. Nastri, S. Galdiero, N. Staiano, A. Lombardi, C. Pedone, Biol. Chem. 1998, 379, 987: H. Kubinyi, Pharm. Unserer Zeit 1998, 27, 158; M. R. Wiley, M. J. Fisher, Exp. Opin. Ther. Patents 1997, 7, 1265.
11. W. Bode, I. Mayr, U. Baumann, R. Huber, S. R. Stone, J. Hofsteenge, EMBO J. 1989, 8, 3467.
12. D. W. Banner, P. Hadváry, J. Biol. Chem. 1991, 266, 20085.
13. C. Tapparelli, R. Metternich, C. Ehrhardt, M. Zurini, G. Claeson, M. F. Scully, S. R Stone, J. Biol. Chem. 1993, 268, 4734.
14. J. Stürzebecher, H. Vieweg, P. Wikström, D. Turk, W. Bode, Biol. Chem. Hoppe-Seyler 1992, 373, 491.
15. S. Okamoto, A. Hijikata, R. Kikumoto, S. Tonomura, H. Hara, K. Ninomiya, A. Maruyama, M. Sugano, Y. Tamao, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1981, 101, 440.
16. K. Hilpert, J. Ackermann, D. W. Banner, A. Gast, K. Gubernator, P. Hadváry, L. Labler, K. Müller, G. Schmid, T. B. Tschopp, H. van de Waterbeemd, J. Med. Chem. 1994, 37, 3889.
17. S. F. Brady, K. J. Stauffer, W. C. Lumma, G. M. Smith, H. G. Ramjit, S. D. Lewis, B. J. Luas, S. J. Gardell, E. A. Lyle, S. D. Appleby, J. J. Cock, M. A. Holahan, M. T. Stranieri, J. J. Lynch, Jr., J. H. Lin, I. W. Chen, K. Vastag, A. M. Naylor-Olsen, J. P. Vacca, J. Med. Chem. 1998, 41, 401.
18. R. C. A. Isaacs, K. J. Cutrona, C. L. Newton, P. E. J. Sanderson, M. G. Solinsky, E. P. Baskin, I. W. Chen, C. M. Cooper, J. J. Cock, S. J. Gardell, S. D. Lewis, R. J. Lucas, E. A. Lyle, J. J. Lynch, A. M. Naylor-Olson, M. T. Stranieri, K. Vastag, J. P. Vacca, Bioorg. Med. Chem. Lett. 1998, 8, 1719.
19. W. von der Saal, R. Kucznierz, H. Leinert, R. A. Engh. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1997, 7, 1283.
20. M. Zhang, D. L. Bailey, J. A. Bastian, S. L. Briggs, N. Y. Chirgadze, D. K. Clawson, M. L. Denney, D. S. Gifford-Moore, R. W. Harper, L. M. Johnson, V. J. Klimkowski, T. J. Kohn, H. S. Lin, J. R. McCowan, M. E. Richett, D. J. Sall, A. J. Smith, G. F. Smith, D. W. Snyder, K. Takeuchi, B. G. Utterback, S.-C. B. Jan. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1999, 9, 775.
21. U. Obst, D. W. Banner, L. Weber, F. Diederich, Chem. Biol. 1997, 4, 287.
22. T. J. Tucker, W. C. Lumma, A. M. Mulichak, Z. G. Chen, A. M. Naylor-Olsen, S. D. Lewis, R. Lucas, R. M. Freidinger, L. C. Kuo, J. Med. Chem. 1997, 40, 830; T. J. Tucker, W. C. Lumma, S. D. Lewis, S. J. Gardell, B. J. Lucas, E. P. Baskin, R. Woltmann, J. J. Lynch, E. A. Lyle, S. D. Appleby, I.-W. Chen, K. B. Dancheck, J. P. Vacca. J. Med. Chem. 1997, 40, 1565: T. J. Tucker, W. C. Lumma, S. D. Lewis, S. J. Gardell, B. J. Lucas, J. T. Sisko, J. J. Lynch, E. A. Lyle, E. P. Baskin, R. F. Woltmann, S. D. Appleby, I.-W. Chen, K. B. Dancheck, A. M. Naylor-Olsen, J. A. Krueger, C. M. Cooper, J. P. Vacca, J. Med. Chem. 1997, 40, 3687.
23. T. J. Tucker, W. C. Lumma, A. M. Mulichak, Z. G. Chen, A. M. Naylor-Olsen, S. D. Lewis, R. Lucas, R. M. Freidinger, L. C. Kuo, J. Med. Chem. 1997, 40, 830; T. J. Tucker, W. C. Lumma, S. D. Lewis, S. J. Gardell, B. J. Lucas, E. P. Baskin, R. Woltmann, J. J. Lynch, E. A. Lyle, S. D. Appleby, I.-W. Chen, K. B. Dancheck, J. P. Vacca. J. Med. Chem. 1997, 40, 1565: T. J. Tucker, W. C. Lumma, S. D. Lewis, S. J. Gardell, B. J. Lucas, J. T. Sisko, J. J. Lynch, E. A. Lyle, E. P. Baskin, R. F. Woltmann, S. D. Appleby, I.-W. Chen, K. B. Dancheck, A. M. Naylor-Olsen, J. A. Krueger, C. M. Cooper, J. P. Vacca, J. Med. Chem. 1997, 40, 3687.
24. T. J. Tucker, W. C. Lumma, A. M. Mulichak, Z. G. Chen, A. M. Naylor-Olsen, S. D. Lewis, R. Lucas, R. M. Freidinger, L. C. Kuo, J. Med. Chem. 1997, 40, 830; T. J. Tucker, W. C. Lumma, S. D. Lewis, S. J. Gardell, B. J. Lucas, E. P. Baskin, R. Woltmann, J. J. Lynch, E. A. Lyle, S. D. Appleby, I.-W. Chen, K. B. Dancheck, J. P. Vacca. J. Med. Chem. 1997, 40, 1565: T. J. Tucker, W. C. Lumma, S. D. Lewis, S. J. Gardell, B. J. Lucas, J. T. Sisko, J. J. Lynch, E. A. Lyle, E. P. Baskin, R. F. Woltmann, S. D. Appleby, I.-W. Chen, K. B. Dancheck, A. M. Naylor-Olsen, J. A. Krueger, C. M. Cooper, J. P. Vacca, J. Med. Chem. 1997, 40, 3687.
25. R. Hirschmann, K. C. Nicolaou, S. Pietranico, E. M. Leahy, J. Salvino, B. Arison, M. A. Cichy, P. G. Spoors, W. C. Shakespeare, P. A. Sprengeler, P. Hamley, A. B. Smith III, T. Reisine, K. Raynor, L. Maechler, C. Donaldson, W. Vale, R. M. Freidinger, M. R. Caseieri, C. D. Strader. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12550.
26. R. Huisgen, J. Org. Chem. 1976, 41, 403.
27. R. Grigg, S. Thianpatanagul, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1984, 180: R. Grigg, S. Surendrakumar, S. Thianpatanagul, D. Vipond, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1987, 47: R. Grigg, J. Idle, P. McMeekin, D. Vipond, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1987, 49.
28. R. Grigg, S. Thianpatanagul, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1984, 180: R. Grigg, S. Surendrakumar, S. Thianpatanagul, D. Vipond, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1987, 47: R. Grigg, J. Idle, P. McMeekin, D. Vipond, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1987, 49.
29. R. Grigg, S. Thianpatanagul, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1984, 180: R. Grigg, S. Surendrakumar, S. Thianpatanagul, D. Vipond, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1987, 47: R. Grigg, J. Idle, P. McMeekin, D. Vipond, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1987, 49.
30. a) O. Tsuge, S. Kanemasa, M. Ohe, S. Takenaka, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1987, 60, 4079:
31. b) S. Kanemasa, K. Sakamoto, O. Tsuge, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1989, 62, 1960:
32. c) O. Tsuge, S. Kanemasa. Adv. Heterocycl. Chem. 1989, 45, 231.
33. U. Obst, V. Gramlich, F. Diederich, L. Weber, D. W. Banner, Angew. Chem. 1995, 107, 1874; Angew. Chem. Int. Ed. 1995, 34, 1739.
34. U. Obst, V. Gramlich, F. Diederich, L. Weber, D. W. Banner, Angew. Chem. 1995, 107, 1874; Angew. Chem. Int. Ed. 1995, 34, 1739.
35. Insight II, Version 2.3.0, San Diego, Biosym Technologies. 1993.
36. P. R. Gerber, K. Müller, J. Comput. Aided Mol. Design 1995, 9, 251.
37. M. Nishio, M. Hirota, Y. Umezawa, 'The CH/π Interaction: Evidence, Nature, and Consequences', Wiley-VCH, New York, 1998.
38. W. Eschweiler, Ber. Dtsch. Chem. Ges. 1905, 38, 880; H. T. Clarke, H. B. Gillespie, S. Z. Weisshaus, J. Am. Chem. Soc. 1933, 55, 4571.
39. W. Eschweiler, Ber. Dtsch. Chem. Ges. 1905, 38, 880; H. T. Clarke, H. B. Gillespie, S. Z. Weisshaus, J. Am. Chem. Soc. 1933, 55, 4571.
40. G. Wagner, I. Wunderlich, Pharmazie 1977, 32, 76.
41. J. March, 'Advanced Organic Chemistry', 4th edn., John Wiley and Sons, New York, 1992.
42. E. Kim, S. Paliwal, C. S. Wilcox, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11192.
43. K. A. Thomas, G. M. Smith, T. B. Thomas, R. J. Feldmann. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 4843.
44. M. Tintelnot, P. Andrews, J. Comput. Aided Mol. Design 1989, 3, 67.
45. I. K. McDonald, J. M. Thornton, J. Mol. Biol. 1994, 238, 777.
46. a) M. Van Parys, M. Vandewalle, Bull. Soc. Chim. Belg. 1981, 90, 757;
47. b) B. P. Wijnberg, W. N. Speckamp. A. R. C. Oostveen. Tetrahedron 1982, 38, 209.
48. J. M. Takacs, J. J. Weidner, J. Org. Chem. 1994, 59, 6480.
49. A. Basha, J. Orlando, S. M. Weinreb, Synth. Commun. 1977, 7, 549.
50. J. S. Drage, R. A. Earl, K. P. C. Vollhardt, J. Heterocycl. Chem. 1982, 19, 701.
51. M. Thaning, L.-G. Wistrand, J. Org. Chem. 1990, 55, 1406.
52. R. P. Polniaszek, S. E. Belmont, R. Alvarez, J. Org. Chem. 1990, 55, 215.
53. H. Hiemstra, W. N. Speckamp. Tetrahedron Lett. 1983, 24, 1407.
54. D. S. Brown, P. Charreau, T. Hansson, S. V. Ley, Tetrahedron 1991, 47, 1311.
55. A. R. Fersht, J.-P. Shi, J. Knill-Jones, D. M. Love, A. J. Wilkinson, D. M. Blow, P. Brick, P. Carter, M. M. Y. Wave, G. Winter. Nature (London) 1985, 314, 235.
56. M. Miyashita, A. Yoshikoshi, P. A. Grieco, J. Org. Chem. 1977, 42, 3772.
57. W. H. Pirkle, C. J. Welch, B. Lamm, J. Org. Chem. 1992, 57, 3854.
58. M. Reers, R. Koschinsky, G. Dickneite, D. Hoffman, J. Czech, W. Stüber, J. Enzyme Inhib. 1995, 9, 61: A. Bergner, M. Bauer, H. Brandstetter, J. Stürzebecker, W. Bode. J. Enzyme Inhib. 1995, 9, 101.
59. M. Reers, R. Koschinsky, G. Dickneite, D. Hoffman, J. Czech, W. Stüber, J. Enzyme Inhib. 1995, 9, 61: A. Bergner, M. Bauer, H. Brandstetter, J. Stürzebecker, W. Bode. J. Enzyme Inhib. 1995, 9, 101.
60. J. F. Hartwig. Acc. Chem. Res. 1998, 31, 852.
61. J. P. Wolfe, S. Wagaw, J.-F. Marcoux, S. L. Buchwald. Acc. Chem. Res. 1998, 31, 805.
62. T. Ishiyama, M. Murata, N. Miyaura, J. Org. Chem. 1995, 60, 7508.
63. M. Murata, S. Watanabe, Y. Masuda, J. Org. Chem. 1997, 62, 6458.
64. M. F. Hawthorne, J. Org. Chem. 1957, 22, 1001.
65. H. C. Brown, S. C. Kim, S. Krishnamurthy. J. Org. Chem. 1980, 45, 1.
66. J. P. Wolfe, J. Ahmann, J. P. Sadighi, R. A. Singer, S. L. Buchwald, Tetrahedron Lett. 1997, 38, 6367.
67. G. Mann, J. F. Hartwig, M. S. Driver, C. Fernandez-Rivas, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 827.
68. H. Kleinfeller, W. Frecks, J. Prakt. Chem. 1933, 138, 184.
69. N. Teno, K. Wanaka, Y. Okada, H. Taguchi, U. Okamoto, A. Hijikata-Okunomiya, S. Okamoto. Chem. Pharm. Bull. 1993, 41, 1079.
70. E. Ponnusamy, U. Fotadar, A. Spisni, D. Fiat. Synthesis 1986, 48.
71. D. L. Boger, D. Yohannes, J. Org. Chem. 1989, 54, 2498.
72. A. Dornow, G. Winter, Chem. Ber. 1951, 84, 307.
73. N. B. Metha, A. P. Phillips, F. Fu Lui, R. E. Brooks, J. Org. Chem. 1960, 25, 1012; J. E. T. Corrie. J. Chem. Soc., Perkin Trans I 1994, 2975.
74. N. B. Metha, A. P. Phillips, F. Fu Lui, R. E. Brooks, J. Org. Chem. 1960, 25, 1012; J. E. T. Corrie. J. Chem. Soc., Perkin Trans I 1994, 2975.
75. L. F. Tietze, T. Eicher, 'Reaktionen and Synthesen im organisch-chemischen Praktikum'. Thieme. Stuttgart, 1981, pp. 62-63.
76. K. E. Andersen, M. Begtrup, M. S. Chorghade, E. C. Lee, J. Lau, B. F. Lundi, H. Petersen, P. O. Sorensen, H. Thogersen. Tetrahedron 1994, 50, 8699.
77. M. Petrini, R. Ballini, E. Marcantoni, G. Rosini, Synth. Commun. 1988, 18, 847.
78. R. Lottenberg, J. A. Hall, J. W. Fenton, C. M. Jackson, Thromb. Res. 1982, 28, 313.