The global chloromethane cycle: Biosynthesis, biodegradation and metabolic role

Natural Product Reports

Volumn 17, Issue 4, 2000, Pages 337-348

  Harper, David B ^a  

^a QUEEN'S UNIVERSITY BELFAST   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIODEGRADATION; BIOSYNTHESIS; CHLOROMETHANE CYCLE;

BIODEGRADATION, ENVIRONMENTAL; METHYL CHLORIDE;

EID: 0033859207     PISSN: 02650568     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/a809400d     Document Type: Article

References (105)

1. 1 G. W. Gribble, Acc. Chem. Res., 1998, 31, 141.
2. 2 G. W. Gribble, in Progress in the Chemistry of Organic Natural Products 68, ed. W. Herz, G. W. Kirby, R. E. Moore, W. Steglich and Ch. Tamm, Springer-Verlag, New York, 1996, p. 1.
3. 3 J. C. J. Barna and D. H. Williams, Ann. Rev. Microbiol., 1984, 38, 339.
4. 4 H. R. Morris, G. W. Taylor, M. S. Masento, K. A. Jermyn and R. R. King, Nature (London), 1987, 328, 811.
5. 5 K. C. Engvild, in Naturally-Produced Organohalogens, ed. A. Grimvall and E. W. B. de Leer, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, 1995, p. 227.
6. 6 E. De Jong and J. A. Field, Ann. Rev. Microbiol., 1997, 51, 375.
7. 7 M. Sakuma and H. Fukami, Tetrahedron Lett., 1993, 34, 6059.
8. 8 R. S. Berger, Science, 1972, 177, 704.
9. 9 K. C. Engvild, Phytochemistry, 1985, 25, 781.
10. 10 M. A. K. Khalil and R. A. Rasmussen, Atmos. Environ., 1999, 33, 1305.
11. 11 W. C. Keene, M. A. K. Khalil, D. J. Erikson, A. McCulloch, T. E. Graedel, J. M. Lobert, M. L. Aucott, S. L. Gong, D. B. Harper, G. Kleiman, P. Midgley, R. M. Moore, C. Seuzaret, W. T. Sturges, C. M. Benkovitz, V. Koropalov, L. A. Barrie and Y. F. Li, J. Geophys. Res., 1999, 104, 8429.
12. 12 S. Fetzner, Appl. Microbiol. Biotechnol., 1998, 50, 633.
13. 13 M. J. Prather and R. T. Watson, Nature (London), 1990, 344, 729.
14. 14 S. A. Montzka, J. H. Butler, R. C. Myers, T. M. Thompson, T. H. Swanson, A. D. Clarke, L. T. Lock and J. W. Elkins, Science, 1996, 272, 1318.
15. 15 Y. Yokouchi, Y. Noijiri, L. A. Barrie, D. Toom-Sauntry, T. Machida, Y. Inuzuka, H. Akimoto, H.-J. Li, Y. Fujinuma and S. Aoki, Nature (London), 2000, 403, 295.
16. 16 H. J. Li, Y. Yokouchi and A. Akimoto, Atmos. Environ., 1999, 33, 1881.
17. 17 J. H. Butler, M. Battle, M. L. Bender, S. A. Montzka, A. D. Clarke, E. S. Saltzman, C. M. Sucher, J. P. Severinghaus and J. W. Elkins, Nature (London), 1999, 399, 749.
18. 18 R. Koppmann, F. J. Johnen, C. Plas-Dülmer and J. Rudolph, J. Geophys. Res., 1993, 98, 20517.
19. 19 M. A. K. Khalil, R. M. Moore, D. B. Harper, J. M. Lobert, D. J. Erikson, V. Koropalov, W. T. Sturges and W. C. Keene, J. Geophys. Res., 1999, 104, 8333.
20. 20 J. M. Lobert, W. C. Keene, J. A. Logan and R. Yevich, J. Geophys. Res., 1999, 104, 8373.
21. 21 R. Watling and D. B. Harper, Mycol. Res., 1998, 102, 769.
22. 22 R. C. Rhew, B. R. Miller and R. F. Weiss, Nature (London), 2000, 403, 292.
23. 23 R. K. Varner, P. M. Crill and R. W. Talbot, Geophys. Res. Lett., 1999, 26, 2433.
24. 24 C. H. Dimmer, P. G. Simmonds, G. Nickless and M. R. Bassford, Atmos. Environ., 2000, in press.
25. 25 J. M. Lobert, J. H. Butler, S. A. Montzka, L. S. Geller, R. C. Myers and J. W. Elkins, Science, 1995, 267, 1002.
26. 26 M. A. K. Khalil, R. A. Rasmussen and R. Gunawardena, J. Geophys. Res., 1993, 98, 2887.
27. 27 R. M. Moore and M. Webb, Geophys. Res. Lett., 1996, 23, 2951.
28. 28 J. M. Baker, C. E. Reeves, P. D. Nightingale, S. A. Penkett, S. W. Gibb and A. D. Hatton, Mar. Chem., 1999, 64, 267.
29. 29 S. A. Yvon-Lewis and J. H. Butler, Geophys. Res. Lett., 1997, 24, 1227.
30. 30 J. H. Butler, Atmos. Environ., 1996, 30, i.
31. 31 J. H. Butler and J. M. Rodriquez, in The Methyl Bromide Issue, ed. C. H. Bell, N. Price and B. Chakrabarti, John Wiley and Sons, Chichester, 1996, p. 27.
32. 32 M. O. Andreae, E. Atlas, G. W. Harris, G. Helas, A. de Kock, R. Koppmann, W. Maenhaut, S. Manø, W. H. Pollock, J. Rudolph, D. Scharffe, G. Schebeske and M. Welling, J. Geophys. Res., 1996, 101, 23 603.
33. 33 M. Miller, in The Methyl Bromide Issue, ed. C. H. Bell, N. Price and B. Chakrabarti, John Wiley and Sons, Chichester, 1996, p. 91.
34. 34 J. M. Baker, C. E. Reeves, S. A. Penkett, L. M. Cardenas and P. D. Nightingale, Geophys. Res. Lett., 1998, 25, 2405.
35. 35 J. Gan, S. R. Yates, H. D. Ohr and J. J. Sims, Geophys. Res. Lett., 1998, 25, 3595.
36. 36 J. M. Lee Taylor and E. A. Holland, J. Geophys. Res., 2000, in press.
37. 37 W. Reifenhauser and K. G. Heumann, Atmos. Environ., 1992, 26A, 2905.
38. 38 W. L. Chameides and D. D. Davis, J. Geophys. Res., 1980, 85, 7383.
39. 39 S. Solomon, R. R. Garcia and A. A. Ravishankara, J. Geophys. Res., 1994, 99, 20 491.
40. 40 H. B. Singh, L. J. Salas and R. E. Stiles, J. Geophys. Res., 1983, 88, 3684.
41. 41 R. A. Rasmussen, M. A. K. Khalil, R. Gunawardena and S. D. Hoyt, J. Geophys. Res., 1982, 87, 3086.
42. 42 M. L. A. M. Campos, P. D. Nightingale and T. D. Jickells, Tellus, 1996, 48B, 106.
43. 43 K. R. Redeker, N. Y. Wang, J. Low, A. Gotoh and R. Cicerone, Eos, 1999, 80, S64.
44. 44 Y. Lu and M. A. K. Khalil, Chemosphere, 1991, 23, 397.
45. 45 O. C. Zafiriou, J. Mar. Res., 1975, 33, 75.
46. 46 J. E. Lovelock, Nature (London), 1975, 256, 193.
47. 47 R. H. White, J. Mar. Res., 1982, 40, 529.
48. 48 Z. Hu and R. M. Moore, Mar. Chem., 1996, 52, 147.
49. 49 V. K. Tait, R. M. Moore and R. Tokarczyk, J. Geophys. Res., 1994, 99, 7821.
50. 50 R. M. Moore, W. Groszko and S. J. Niven, J. Geophys. Res., 1996, 101, 28 529.
51. 51 F. Keppler, R. Eiden, V. Niedan, J. Pracht and H. F. Schöler, Nature (London), 2000, 403, 298.
52. 52 D. B. Harper, Nature (London), 1985, 315, 55.
53. 53 D. B. Harper and J. T. Kennedy, J. Gen. Microbiol., 1986, 132, 1231.
54. 54 D. B. Harper, J. T. Kennedy and J. T. G. Hamilton, Phytochemistry, 1988, 27, 3147.
55. 55 S. L. Manley and M. N. Dastoor, Limnol. Oceanogr., 1987, 32, 709.
56. 56 A. M. Wuosmaa and L. P. Hager, Science, 1990, 249, 160.
57. 57 R. M. Moore, R. Tokarczyk, V. K. Tait, M. Paulin and C. Geen, in Naturally-Produced Organohalogens, ed. A. Grimvall and E. W. B. de Leer, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, 1995, p. 283.
58. 58 V. K. Tait and R. M. Moore, Limnol. Oceanogr., 1995, 40, 189.
59. 59 M. G. Scarratt and R. M. Moore, Mar. Chem., 1996, 54, 263.
60. 60 J. L. Varns, Am. Potato J., 1982, 59, 593.
61. 61 D. B. Harper, B. M. R. Harvey, M. R. Jeffers and J. T. Kennedy, New Phytol., 1999, 142, 5.
62. 62 V. A. Isodorov, Organic Chemistry of the Earth's Atmosphere, Springer Verlag, Berlin, 1990, p. 78.
63. 63 H. S. Saini, J. M. Attieh and A. D. Hanson, Plant, Cell Environ., 1995, 18, 1027.
64. 64 J. M. Attieh, A. D. Hanson and H. S. Saini, J. Biol. Chem., 1995, 270, 9250.
65. 65 J. Williams, N.-Y. Wang, R. J. Cicerone, K. Yagi, M. Kurihara and F. Terada, Global Biogeochem. Cycles, 1999, 13, 485.
66. 66 J. H. Shorter, C. E. Kolb, P. M. Crill, R. A. Kerwin, R. W. Talbot, M. E. Hines and R. C. Harriss, Nature (London), 1995, 377, 717.
67. 67 M. E. Hines, P. M. Crill, R. K. Varner, R. W. Talbot, J. H. Shorter, C. E. Kolb and R. C. Harriss, Appl. Environ. Microbiol., 1998, 64, 1864.
68. 68 M. A. K. Khalil and R. A. Rasmussen, Report 05-98, Department of Physics, Portland State University, Portland, OR, 1998.
69. 69 D. I. Stirling and H. Dalton, FEMS Microbiol. Lett., 1979, 5, 315.
70. 70 S. Keuning, D. B. Janssen and B. Witholt, J. Bacteriol., 1985, 163, 635.
71. 71 M. E. Rasche, E. R. Hicks, M. R. Hyman and D. J. Arp, J. Bacteriol., 1990, 172, 5368.
72. 72 J. Traunecker, A. Preuß and G. Diekert, Arch. Microbiol., 1991, 156, 416.
73. 73 S. Hartmans, A. Schmuckle, A. M. Cook and T. Leisinger, J. Gen. Microbiol., 1986, 132, 1139.
74. 74 N. V. Doronina, A. P. Sokolov and Y. A. Trotsenko, FEMS Microbiol. Lett., 1996, 142, 179.
75. 75 N. V. Doronina and Y. A. Trotsenko, Mikrobiologiya, 1997, 66, 70.
76. 76 T. Vannelli, A. Studer, M. Kertesz and T. Leisinger, Appl. Environ. Microbiol., 1998, 64, 1933.
77. 77 T. L. Connell Hancock, A. M. Costello, M. E. Lidstrom and R. S. Oremland, Appl. Environ. Microbiol., 1998, 64, 2899.
78. 78 C. Coulter, J. T. G. Hamilton, W. C. McRoberts, L. Kulakov, M. J. Larkin and D. B. Harper, Appl. Environ. Microbiol., 1999, 65, 4301.
79. 79 R. H White, Arch. Microbiol., 1982, 132, 100.
80. 80 D. B. Harper and J. T. G. Hamilton, J. Gen. Microbiol., 1988, 134, 2831.
81. 81 D. B. Harper, J. T. G. Hamilton, J. T. Kennedy and K. J. McNally, Appl. Environ. Microbiol., 1989, 55, 1981.
82. 82 K. J. McNally, J. T. G. Hamilton and D. B. Harper, J. Gen. Microbiol., 1990, 136, 1509.
83. 83 D. Saxena, S. Aouad, J. Attieh and H. Saini, Appl. Environ. Microbiol., 1998, 64, 2831.
84. 84 K. J. McNally and D. B. Harper, J. Gen. Microbiol., 1991, 137, 1029.
85. 85 L. Agius and H. S. A. Sherratt, Channelling in Intermediary Metabolism, Portland Press, London, 1997.
86. 86 X. Ni and L. P. Hager, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1998, 95, 12 866.
87. 87 X. Ni and L. P. Hager, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1999, 96, 3611.
88. 88 D. B. Harper, J. A. Buswell, J. T. Kennedy and J. T. G. Hamilton, Appl. Environ. Microbiol., 1990, 56, 3450.
89. 89 D. B. Harper, J. A. Buswell and J. T. Kennedy, J. Gen. Microbiol., 1991, 137, 2867.
90. 90 D. B. Harper, W. C. McRoberts and J. T. Kennedy, Appl. Environ. Microbiol., 1996, 62, 3366.
91. 91 C. Coulter, J. T. Kennedy, W. C. McRoberts and D. B. Harper, Appl. Environ. Microbiol., 1993, 59, 706.
92. 92 M. R. Jeffers, W. C. McRoberts and D. B. Harper, Microbiology, 1997, 143, 1975.
93. 93 C. Coulter, J. T. G. Hamilton and D. B. Harper, Appl. Environ. Microbiol., 1993, 59, 1461.
94. 94 S. L. Neidleman, Crit. Rev. Microbiol., 1975, 5, 333.
95. 95 S. L. Neidleman and J. Geigert, Biohalogenation: Principles, Basic Roles and Applications, Ellis Horwood Ltd, Chichester, 1986.
96. 96 P. E. Kolattukudy, Annu. Rev. Plant Physiol., 1981, 32, 539.
97. 97 P. E. Kolattukudy and B. B. Dean, Plant Physiol., 1974, 54, 116.
98. 98 M. Meßmer, G. Wohlfarth and G. Diekert, Arch. Microbiol., 1992, 160, 383.
99. 99 M. Meßmer, S. Reinhardt, G. Wohlfarth and G. Diekert, Arch. Microbiol., 1996, 165, 18.
100. 100 G. Wohlfarth and G. Diekert, Curr. Opin. Biotechnol., 1997, 8, 290.
101. 101 F. Kaufmann, G. Wohlfarth and G. Diekert, Arch. Microbiol., 1997, 168, 136.
102. 102 T. Vannelli, M. Meßmer, A. Studer, S. Vuilleumier and T. Leisinger, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1999, 96, 4615.
103. 103 A. Studer, S. Vuilleumier and T. Leisinger, Eur. J. Biochem., 1999, 264, 242.
104. 104 L. Chistoserdova, J. A. Vorholt, R. K. Thauer and M. E. Lidstrom, Science, 1998, 281, 99.
105. 105 D. B. Harper, R. M. Kalin, M. J. Larkin, J. T. G. Hamilton and C. Coulter, Environ. Sci. Technol., 2000, in press.