Characterization of surface topology and binding area in complexes of the elongation factor proteins EF-Ts and EF-Tu·GDP from Thermus thermophilus: A study by protein chemical modification and mass spectrometry

Chemistry - A European Journal

Volumn 4, Issue 4, 1998, Pages 707-715

  Glocker, Michael O ^a   Nock, Steffen ^b   Sprinzl, Mathias ^b   Przybylski, Michael ^a  

^a UNIVERSITY OF KONSTANZ   (Germany)

^b UNIVERSITY OF BAYREUTH   (Germany)

Author keywords

Acylations; Mass spectrometry; Peptides; Protein protein interactions; Supramolecular complexes

Indexed keywords

EID: 0031861066     PISSN: 09476539     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1521-3765(19980416)4:4<707::AID-CHEM707>3.0.CO;2-C     Document Type: Article

References (60)

1. D. L. Miller, H. Weissbach, in Molecular Mechanisms of Protein Biosynthesis (Eds.: H. Weissbach, S. Prestka), Academic Press, New York, 1977, pp. 323-373.
2. M. Sprinzl, Trends Biochem. Sci. 1994, 19, 245-250.
3. A. Wagner, I. Simon, M. Sprinzl, R. S. Goody, Biochemistry 1995, 34, 12535-12542.
4. M. Kjeldgaard, J. Nyborg, J. Mol. Biol. 1992, 223, 721-742.
5. G. Polekhina, S. Thirup, M. Kjeldgaard, P. Nissen, C. Lippmann, J. Nyborg, Structure 1996, 4, 1141-1151.
6. K. Abel, M. D. Yoder, R. Hilgenfeld, F. Jurnak, Structure 1996, 4, 1153-1159.
7. a) H. Berchtold, L. S. Reshetnikova, C. O. A. Reiser, N. K. Schirmer, M. Sprinzl, R. Hilgenfeld, Nature 1993, 365, 126-132;
8. b) M. Kjeldgard, P. Nissen, S. Thirup, J. Nyborg, Structure 1993, 1, 35-50.
9. B. F. C. Clark, J. Nyborg, Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 110-116.
10. K. I. Arai, Y. Ota, N. Arai, S. Nakamura, C. Henneke, T. Oshima, Y. Kaziro, Eur. J. Biochem. 1978, 92, 509-519.
11. J. Blank, S. Nock, R. Kreutzer, M. Sprinzl, Eur. J. Biochem. 1996, 236, 222-227.
12. Y. Jiang, S. Nock, M. Nesper, M. Sprinzl, P. B. Sigler, Biochemistry 1996, 35, 10269-10278.
13. T. Kawashima, C. Berthet-Colominas, M. Wulff, S. Cusack, R. Leberman, Nature 1996, 379, 511-518.
14. D. Suckau, M. Mák, M. Przybylski, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 5630-5634.
15. M. O. Glocker, C. Borchers, W. Fiedler, D. Suckau, M. Przybylski, Bioconjugate Chem. 1994, 5, 583-590.
16. T. Krell, A. R. Pitt, J. R. Coggins, FEBS Lett. 1995 360, 93-96.
17. J. W. Boots, W. D. van Dongen, H. M. Verheij, G. H. de Haas, J. Haverkamp, A. J. Slotboom, Biochim. Biophys. Acta 1995, 1248, 27-34.
18. G. B. Hegy, C. H. L. Shackleton, M. Carlquist, T. Bonn, O. Engström, P. Sjöholm, H. E. Witkowska, Steroids 1996, 61, 367-373.
19. F. Zappacosta, P. Ingallinella, A. Scaloni, A. Pessi, E. Bianchi, M. Sollazzo, A. Tramontan, G. Marino, P. Pucci, Protein Sci. 1997, 6, 1901-1909.
20. D. Delforge, B. Devreese, M. Dieu, E. Delaive, J. Van Beeumen, J. Remacle, J. Biol. Chem. 1997, 272, 2276-2284.
21. S. Akashi, M. Shirouzu, T. Terada, Y. Ito, S. Yokoyama, K. Takio, Anal. Biochem. 1997, 248, 15-25.
22. M. O. Glocker, M. Kalkum, R. Yamamoto, J. Schreurs, Biochemistry 1996, 35, 14625-14633.
23. M. Przybylski, C. Borchers, D. Suckau, M. Mák, M. Jetschke, in Peptides 1992 (Proc. 22nd Eur. Peptide Sympos.) (Eds.: C. H. Schneider, A. N. Eberle), Escom Science, Amsterdam, 1993, pp. 83-84.
24. M. Przybylski, Adv. Mass Spectrom. 1995, 13, 257-283.
25. M. Kussmann, M. Przybylski, Methods Enzymol. 1995, 251, 430-435.
26. M. Przybylski, M. O. Glocker, U. Nestel, V. Schnaible, M. Blüggel, K. Diederichs, J. Weckesser, M. Schad, A. Schmid, W. Welte, R. Benz, Protein Sci. 1996, 5, 1477-1489.
27. L. Seidler, M. Peter, F. Meissner, M. Sprinzl, Nucl. Acids Res. 1987, 15, 9263-9277.
28. M. Przybylski, J. Kast, M. O. Glocker, E. Dürr, H. R. Bosshard, S. Nock, M. Sprinzl, Toxicol. Lett. 1995, 82/83, 567-575; M. Sotoh, T. Tanaka, A. Kushiro, T. Hakoshima, K. I. Tomita, FEBS Lett. 1991, 288, 98-100.
29. M. Przybylski, J. Kast, M. O. Glocker, E. Dürr, H. R. Bosshard, S. Nock, M. Sprinzl, Toxicol. Lett. 1995, 82/83, 567-575; M. Sotoh, T. Tanaka, A. Kushiro, T. Hakoshima, K. I. Tomita, FEBS Lett. 1991, 288, 98-100.
30. M. Przybylski, M. O. Glocker, Angew. Chem. 1996, 106, 878-889; Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1996, 35, 806-826.
31. M. Przybylski, M. O. Glocker, Angew. Chem. 1996, 106, 878-889; Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1996, 35, 806-826.
32. D. S. Wagner, R. J. Anderegg, Anal. Chem. 1994, 66, 706-711.
33. J. A. Loo, R. R. Loo, H. R. Udseth, C. G. Edmonds, R. D. Smith, Rapid Commun. Mass Spectrom. 1991, 5, 101-105.
34. F. Wang, X. Tang, Biochemistry 1996, 35, 4069-4078.
35. L. Konermann, B. A. Collings, D. J. Douglas, Biochemistry 1997, 36, 5554-5559.
36. X. M. Pan, X. R. Sheng, S. M. Yang, J. M. Zhou, FEBS Lett. 1997, 402, 25-27.
37. J. A. Kraunsoe, R. T. Aplin, B. Green, G. Lowe, FEBS Lett. 1996, 28, 108-112.
38. H. E. Witkowska, B. N. Green, M. Carlquist, C. H. Shackleton, Steroids 1996, 61, 433-438.
39. N. Potier, P. Barth, D. Tritsch, J. F. Biellmann, A. Van Dorsselaer, Eur. J. Biochem. 1997, 243, 274-282.
40. R. S. Annan, K. Biemann, J. Am. Soc. Mass. Spectrom. 1993, 4, 87-96.
41. J. Ozols, P. Strittmatter, J. Biol. Chem. 1966, 241, 4793-4797.
42. D. Suckau, Y. Shi, S. C. Beu, M. W. Senko, J. P. Quinn, F. M. Wampler, III, F. W. McLafferty, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 790-793.
43. S. J. Valentine, D. E. Clemmer, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3558-3566.
44. S. J. Valentine, J. G. Anderson, A. D. Ellington, D. E. Clemmer, J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3891-3900.
45. T. D. Wood, R. A. Chorush, F. M. Wampler, III, D. P. Little, P. B. O'Connor, F. W. McLafferty, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 2451-2454.
46. a) M. O. Glocker, M. Bantscheff, M. Kalkum, S. Nock, M. Sprinzl, M. Przybylski, Proc. 45th Conf. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997, 976;
47. b) M. O. Glocker, S. Nock, M. Sprinzl, M. Przybylski, Proc. 43rd Conf. Am. Soc. Mass Spectrom. 1995, 1330.
48. H. R. Bosshard, in Methods of Biochemical Analysis, Vol. 25 (Ed.: D. Click), Interscience, Wiley, New York, 1979, pp. 273-301.
49. S. Nock, Dissertation, University Bayreuth, 1996.
50. T. Higuchi, L. Eberson, J. D. McRae, J. Am. Chem. Soc. 1967, 89, 3001-3004.
51. W. B. Melchior, Jr., D. Fahrney, Biochemistry 1970, 9, 251-258.
52. A. Bunton, N. A. Fuller, S. G. Perry, V. J. Shiner, J. Chem. Soc. 1963, 2918-2926.
53. Y. Wang, Y. Jiang, M. Meyering-Voss, M. Sprinzl, P. B. Sigler, Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 650-656.
54. N. K. Schirmer, C. O. A. Reiser, M. Sprinzl, Eur. J. Biochem. 1991, 200, 295-300.
55. M. G. Bubunenko, M. L. Kireeva, A. T. Gudkov, Biochimie 1992, 74, 419-425.
56. R. W. Castenholz, Bacteriol. Rev. 1969, 33, 476-504.
57. S. Limmer, C. O. A. Reiser, N. K. Schirmer, N. W. Grillenbeck, M. Sprinzl, Biochemistry 1992, 31, 2970-2977.
58. J. Blank, N. W. Grillenbeck, R. Kreutzer, M. Sprinzl, Protein Expression Purif. 1995, 6, 637-645.
59. K. I. Arai, M. Kawakita, Y. Kaziro, J. Biol. Chem. 1972, 247, 7029-7037.
60. R. Koradi, M. Billeter, K. Wüthrich, J. Mol. Graphics 1996, 14, 51-55.