Peptide binding and antigen presentation by class II histocompatibility glycoproteins

Biopolymers

Volumn 43, Issue 4, 1997, Pages 303-322

  Jensen, Peter E ^a  

^a EMORY UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

Antigen presentation; Class II histocompatibility glycoproteins; Peptide binding

Indexed keywords

ANTIGENS; BIOCOMPATIBILITY; CELLS; CHEMICAL BONDS; IMMUNOLOGY; PROTEINS;

GLYCOPROTEINS; HISTOCOMPATIBILITY; PEPTIDES;

AMINO ACIDS;

CD4 ANTIGEN; GLYCOPROTEIN; MAJOR HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN CLASS 2; PEPTIDE;

AMINO ACID SEQUENCE; ANTIGEN PRESENTATION; ANTIGEN PRESENTING CELL; CRYSTALLOGRAPHY; HELPER CELL; HYDROGEN BOND; IMMUNE RESPONSE; IMMUNE SYSTEM; INTERNALIZATION; PROTEIN BINDING; REVIEW;

ANTIGEN PRESENTATION; CD4-POSITIVE T-LYMPHOCYTES; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; HISTOCOMPATIBILITY ANTIGENS CLASS II; HUMANS; HYDROGEN-ION CONCENTRATION; KINETICS; PEPTIDES; PROTEIN BINDING;

EID: 0030821945     PISSN: 00063525     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(sici)1097-0282(1997)43:4<303::aid-bip4>3.0.co;2-z     Document Type: Article

References (160)

1. Ziegler, K. & Unanue, E. R. (1981) J. Immunol. 127, 1869-1875.
2. Ziegler, H. K. & Unanue, E. R. (1982) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79, 175-178.
3. Rosenthal, A. S. & Shevach, E. M. (1973) J. Exp. Med. 138, 1194-1212.
4. Unanue, E. R. (1981) Adv. Immunol. 31, 1-136.
5. Ishizaka, K., Okudaira, H. & King, T. P. (1975) J. Immunol. 114, 110-115.
6. Chesnut, R. W., Endres, R. O. & Grey, H. M. (1980) Clin. Immunol. Immunopathol. 15, 397-408.
7. Thomas, D. W., Schauster, J. L. & Wilner, G. D. (1981) Cell Immunol. 58, 238-245.
8. Maizels, R. M., Clarke, J. A., Harvey, M. A., Miller, A. & Sercarz, E. E. (1980) Eur. J. Immunol. 10, 509-515.
9. Shimonkevitz, R., Kappler, J., Marrack, P. & Grey, H. (1983) J. Exp. Med. 158, 303-316.
10. Allen, P. M. & Unanue, E. R. (1984) J. Immunol. 132, 1077-1079.
11. Streicher, H. Z., Berkower, I. J., Busch, M., Gurd, F. R. N. & Berzofsky, J. A. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 6831-6835.
12. Thomas, J. W., Danho, W., Bullesbach, E., Fohles, J. & Rosenthal, A. S. (1981) J. Immunol. 126, 1095-1100.
13. Katz, M. E., Maizels, R. M., Wicker, L., Miller, A. & Sercarz, E. E. (1982) Eur. J. Immunol. 12, 535-540.
14. Hansburg, D., Fairwell, T., Schwartz, R. H. & Appella, E. (1983) J. Immunol. 131, 319-324.
15. Corradin, G., Juillerat, M. A., Vita, C. & Engers, H. D. (1983) Mol. Immunol. 20, 763-768.
16. Hackett, C. J., Dietzschold, B., Gerhard, W., Christ, B., Knorr, R., Gillessen, D. & Melchers, F. (1983) J. Exp. Med. 158, 294-302.
17. Allen, P. M., Strydom, D. J. & Unanue, E. R. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 2489-2493.
18. Shimonkevitz, R., Colon, S., Kappler, J. W., Marrack, P. & Grey, H. M. (1984) J. Immunol. 133, 2067-2074.
19. Allen, P. M., Matsueda, G. R., Haber, E. & Unanue, E. R. (1985) J. Immunol. 135, 368-373.
20. Allen, P. M., Matsueda, G. R., Evans, R. J., Dunbar, J. B., Jr., Marshall, G. R. & Unanue, E. R. (1987) Nature 327, 713-715.
21. Seite, A., Buus, S., Colon, S., Smith, J. A., Miles, C. & Grey, H. M. (1987) Nature 328, 395-399.
22. DeLisi, C. & Berzofsky, J. A. (1985) Proc. Natl. Acad. Sci USA 82, 7048-7052.
23. Rothbard, J. B. & Taylor, W. R. (1988) EMBO J. 7, 93-100.
24. Townsend, A. R., Rothbard. J., Gotch, F. M., Bahadur, G., Wraith, D. & McMichael, A. J. (1986) Cell 44, 959-968.
25. Thomas, D. W., Meltz, S. K. & Wilner, G. D. (1979) J. Immunol. 123, 759-764.
26. Werdelin, O. (1982) J. Immunol. 129, 1883-1891.
27. Rock, K. L. & Benacerraf, B. (1984) J. Exp. Med. 160, 1864-1879.
28. Kappler, J. W., Skidmore, B., White, J. & Marrack, P. (1981) J. Exp. Med. 153, 1198-1214.
29. Patten, P., Yokota, T., Rothbard, J., Chien, Y., Arai, K. & Davis, M. M. (1984) Nature 312, 40-46.
30. Chien, Y., Becker, D. M., Lindsten, T., Okamura, M., Cohen, D. I. & Davis, M. M. (1984) Nature 312, 31-35.
31. Watts, T. H., Brian, A. A., Kappler, J. W., Marrack, P. & McConnell, H. M. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 7564-7568.
32. Babbitt, B. P., Allen, P. M., Matsueda, G., Haber, E. & Unanue, E. R. (1985) Nature 317, 359-361.
33. Buus, S., Sette, A., Colon, S. M., Jenis, D. M. & Grey, H. M. (1986) Cell 47, 1071-1077.
34. Buus, S., Sette, A., Colon, S. M., Miles, C. & Grey, H. M. (1987) Science 235, 1353-1358.
35. Guillet, J.-G., Lai, M.-Z., Briner, T. J., Buus, S., Sette, A., Grey, H. M., Smith, J. A. & Gefter, M. L. (1987) Science 235, 865-844.
36. Sette, A., Buus, S., Colon, S., Miles, C. & Grey, H. M. (1988) J. Immunol. 141, 45-48.
37. Schaeffer, E. B., Sette, A., Johnson, D. L., Bekoff, M. C., Smith, J. A., Grey, H. M. & Buus, S. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 4649-4653.
38. Babbitt, B. P., Matsueda, G., Haber, E., Unanue, E. R. & Allen, P. M. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 4509-4513.
39. Brown, J. H., Jardestzky, T. S., Gorga, J. C., Stern, L. J., Urban, R. G., Strominger, J. L. & Wiley, D. C. (1993) Nature 364, 33-39.
40. Stern, L. J., Brown, J. H., Jardetzky, T. S., Gorga, J. C., Urban, R. G., Strominger, J. L. & Wiley, D. C. (1994) Nature 368, 215-221.
41. Jardetzky, T. S., Brown, J. H., Gorga, J. C., Stern, L. J., Urban, R. G., Chi, Y. I., Stauffacher, C., Strominger, J. L. & Wiley, D. C. (1994) Nature 368, 711-718.
42. Kim, J., Urban, R. G., Strominger, J. L. & Wiley, D. C. (1994) Science 266, 1870-1874.
43. Ghosh, P., Amaya, M., Mellins, E. & Wiley, D. C. (1995) Nature 378, 457-462.
44. Jardetzky, T. S., Brown, J. H., Gorga, J. C., Stern, L. J., Urban, R. G., Strominger, J. L. & Wiley, D. C. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 734-738.
45. Fremont, D. H., Hendrickson, W. A., Marrack, P. & Kappler, J. (1996) Science 272, 1001-1004.
46. Bjorkman, P. J., Saper, M. A., Samraoui, B., Bennett, W. S., Strominger, J. L. & Wiley, D. C. (1987) Nature 329, 506-512.
47. Sette, A., Adorini, L., Colon, S. M., Buus, S. & Grey, H. M. (1989) J. Immunol. 143, 1265-1267.
48. Jensen, P. E. (1993) J. Immunol. 150, 3347-3356.
49. Falk, K., Rotzschke, O., Stevanovic, S., Jung, G. & Rammensee, H.-G. (1991) Nature 531, 290-296.
50. Rammensee, H. G., Friede, T. & Stevanoviic, S. (1995) Immunogenetics 41, 178-228.
51. Falk, K., Rotzschke, O., Stevanovic, S., Jung, G. & Rammensee, H. G. (1994) Immunogenetics 39, 230-242.
52. Rudensky, A. Y., Preston-Hurlburt, P., Hong, S., Barlow, A. & Janeway, C. A., Jr. (1991) Nature 353, 622-627.
53. Rudensky, A. Y., Preston-Hurlburt, P., Al-Ramadi, B. K., Rothbard, J. & Janeway, C. A. (1992) Nature 359, 429-431.
54. Chicz, R. M., Urban, R. G., Lane, W. S., Gorga, J. C., Stern, L. J., Vignali, D. A. & Strominger, J. L. (1992) Nature 358, 764-768.
55. Hunt, D. F., Michel, H., Dickinson, T. A., Shabanowitz, J., Cox, A. L., Sakaguchi, K., Appella, E., Grey, H. M. & Sette, A. (1992) Science 256, 1817-1820.
56. Marrack, P., Ignatowicz, L., Kappler, J. W., Boymel, J. & Freed, J. H. (1993) J. Exp. Med. 178, 2173-2183.
57. Chicz, R. M., Urban, R. G., Gorga, J. C., Vignali, D. A., Lane, W. S. & Strominger, J. L. (1993) J. Exp. Med. 178, 27-47.
58. Newcomb, J. R. & Cresswell, P. (1993) J. Immunol. 150, 499-507.
59. Demotz, S., Grey, H. M., Appella, E. & Sette, A. (1989) Nature 342, 682-684.
60. Nelson, C. A., Roof, R. W., McCourt, D. W. & Unanue, E. R. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 7380-7383.
61. Kropshofer, H., Max, H., Halder, T., Kaibus, M., Muller, C. A. & Kalbacher, H. (1993) J. Immunol. 151, 4732-4742.
62. Jensen, P. E. (1995) Semin. Immunol. 7, 347-353.
63. Sette, A., Adorini, L., Appella, E., Colon, S. M., Miles, C., Tanaka, S., Ehrhardt, C., Doria, G., Nagy, Z. A., Buus, S. & Grey, H. M. (1989) J. Immunol. 143, 3289-3294.
64. Reay, P. A., Kantor, R. M. & Davis, M. M. (1994) J. Immunol. 152, 3946-3957.
65. Hammer, J., Valsasnini, P., Tolba, K., Bolin, D., Higelin, J., Takacs, B. & Sinigaglia, F. (1993) Cell 74, 197-203.
66. Jardetzky, T. S., Gorga, J. C., Busch, R., Rothbard, J., Strominger, J. L. & Wiley, D. C. (1990) EMBO J. 9, 1797-1803.
67. Kosco Vilbois, M. H., Gray, D., Scheidegger, D. & Julius, M. (1993) J. Exp. Med. 178, 2055-2066.
68. Geluk, A., van Meijgaarden, K. E., Southwood, S., Oseroff, C., Drij fhout, J. W., de Vries, R. R., Ottenhoff, T. H. & Sette, A. (1994) J. Immunol. 152, 5742-5748.
69. Ortmann, B., Martin, S., von Bonin, A., Schiltz, E., Hoschutzky, H. & Weltzien, H. U. (1992) J. Immunol. 148, 1445-1450.
70. Hording, C. V., Kihlberg, J., Elofsson, M., Magnusson, G. & Unanue, E. R. (1993) J. Immunol. 151, 2419-2425.
71. Deck, B., Elofsson, M., Kihlberg, J. & Unanue, E. R. (1995) J. Immunol. 155, 1074-1078.
72. Kersh, G. J. & Allen, P. M. (1996) Nature 380, 495-498.
73. Hill, C. M., Liu, A., Marshall, K. W., Mayer, J., Jorgensen, B., Yuan, B., Cubbon, R. M., Nichols, E, A., Wicker, L. S. & Rothbard, J. B. (1994) J. Immunol. 152, 2890-2898.
74. Guichard, G., Calbo, S., Muller, S., Kourilsky, P., Briand, J. P. & Abastado. J. P. (1995) J. Biol. Chem. 270, 26057-26059,
75. Jensen, P. E. (1989) J. Immunol. 143, 420-425.
76. Roosneck, E., Demotz, S., Corradin, G. & Lanzavecchia, A. (1988) J. Immunol. 140, 4079-4070.
77. Watts, T. H. & McConnell, H. M. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 9660-9664.
78. Harding, C. V. & Unanue, E. R. (1990) Nature 346, 574-576.
79. Demotz, S., Grey, H. M. & Sette, A. (1990) Science 249, 1028-1030.
80. Germain, R. N. & Hendrix, L. R. (1991) Nature 353, 134-139.
81. Sadegh-Nasseri, S. & McConnell, H. M. (1989) Nature 337, 274-276.
82. Falo, L. D., Benacerraf, B., Jr. & Rock, K. L. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 6994-6997.
83. Lakey, E. K., Margoliash, E. & Pierce, S. K, (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 1659-1663.
84. Jensen, P. E. (1988) J. Immunol. 141, 2545-2550.
85. Harding, C. V. & Unanue, E. R. (1989) J. Immunol. 142, 12-19.
86. Davidson, H. W., Reid, P. A., Lanzavecchia, A. & Watts, C. (1991) Cell 67, 105-116.
87. Pinet, V., Vergelli, M., Martin, R., Bakke, O. & Long, E. O. (1995) Nature 375, 603-606.
88. Nelson, C. A., Petzold, S. J. & Unanue, E. R. (1994) Nature 371, 250-252.
89. Jensen, P. E. (1990) J. Exp. Med. 171, 1779-1789.
90. Jensen, P. E. (1991) J. Exp. Med. 174, 1111-1120.
91. Tompkins, S. M., Rota, P. A., Moore, J. C. & Jensen, P. E. (1993) J. Immunol. Methods 163, 209-216.
92. Sherman, M. A., Runnels, H. A., Moore, J. C., Stern, L. J. & Jensen, P.E. (1994) J. Exp. Med. 179, 229-234.
93. Lee, J. M. & Watts, T. H. (1990) J. Immunol. 144, 1829-1834.
94. Reay, P. A., Wettstein, D. A. & Davis, M. M. (1992) EMBO J. 11, 2829-2839.
95. Witt, S. N. & McConnell, H. M. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 8164-8168.
96. Tampe, R. & McConnell, H. M. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 4661-4665.
97. Harding, C. V., Roof, R. W., Allen, P. M. & Un-anue, E. R. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 2740-2744.
98. Mouritsen, S., Hansen, A. S., Petersen, B. L. & Bims, S. (1992) J. Immunol. 148, 1438-1444.
99. Sette, A., Southwood, S., O'Sullivan, D., Gaeta, F. C. A., Sidney, J. & Grey, H. M. (1992) J. Immunol. 148, 844-851.
100. Sadegh-Nasseri, S. & Germain, R. N. (1991) Nature 353, 167-170.
101. Jensen, P. E. (1992) J. Exp. Med. 176, 793-798.
102. Boniface, J. J., Allbritton, N. L., Reay, P. A., Kantor, R. M., Stryer, L. & Davis, M. M. (1993) Biochemistry 32, 11761-l1768.
103. Lee, J. M., Kay, C. M. & Watts, T. H. (1992) Int. Immunol. 4, 889-897.
104. Runnels, H. A., Moore, J. C. & Jensen, P. E. (1996) J. Exp. Med. 183, 127-136.
105. Boniface, J. J., Lyons, D, S., Wettstein, D. A., Allbritton, N. L. & Davis, M. M. (1995) J. Exp. Med. submitted.
106. Sadegh-Nasseri, S., Stern, L. J., Wiley, D. C. & Germain, R. N. (1994) Nature 370, 647-650.
107. Tampe, R., Clark, B. R. & McConnell, H. M. (1991) Science 254, 87-89.
108. de Kroon, A. I. & McConnell, H. M. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 8797-8801.
109. de Kroon, A. I. & McConnell, H. M. (1994) J. Immunol. 152, 609-619.
110. Beeson, C. & McConnell, H. M. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 8842-8845.
111. Stern, L. J. & Wiley, D. C. (1992) Cell 68, 465-477.
112. Roche, P. A. & Cresswell, P. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 3150-3154.
113. Andersen, M. S., Swier, K., Arneson, L. & Miller, J. (1993) J. Exp. Med. 178, 1959-1969.
114. Sherman, M. A., Weber, D. A. & Jensen, P. E. (1995) Immunity 3, 197-205.
115. Mellins, E., Smith, L., Arp, B., Cotner, T., Celis, E. & Pious, D. (1990) Nature 343, 71-74.
116. Mellins, E., Kempin, S., Smith, L., Monji, T. & Pious, D. (1991) J. Exp. Med. 174, 1607-1615.
117. Riberdy, J. M., Newcomb, J. R., Surman, M. J., Barbosa, J. A. & Cresswell, P. (1992) Nature 360, 474-477.
118. Sette, A., Ceman, S., Kubo, R. T., Sakaguchi, K., Appella, E., Hunt, D. F., Davis, T. A., Michel, H., Shabanowitz, J., Rudersdorf, R., et al. (1992) Science 258, 1801-1804.
119. Morris, P., Shaman, J., Attaya, M., Amaya, M., Goodman, S., Bergman, C., Monaco, J. J. & Mellins, E. (1994) Nature 368, 551-554.
120. Fling, S. P., Arp, B. & Pious, D. (1994) Nature 368, 554-558.
121. Cho, S. G., Attaya, M. & Monaco, J. J. (1991) Nature 353, 573-576.
122. Kelly, A. P., Monaco, J. J., Cho, S. G. & Trowsdale, J. (1991) Nature 353, 571-573.
123. Sloan, V. S., Cameron, P., Porter, G., Gammon, M., Amaya, M., Mellins, E. & Zaller, D. M. (1995) Nature 375, 802-806.
124. Denzin, L. K. & Cresswell, P. (1995) Cell 82, 155-165.
125. Peleraux, A., Karlsson, L., Chambers, J. & Peterson, P. A. (1996) Immunogenetics 43, 204-214.
126. Mellins, E., Cameron, P., Amaya, M., Goodman, S., Pious, D., Smith, L. & Arp, B. (1994) J. Exp. Med. 179, 541-549.
127. Avva, R. R. & Cresswell, P. (1994) Immunity 1, 763-774.
128. Morkowski, S., Goldrath, A. W., Eastman, S., Ramachandra, L., Freed, D. C., Whiteley, P. & Rudensky, A. Y. (1995) J. Exp. Med, 182, 1403-1413.
129. Urban, R. G., Chicz, R. M. & Strominger, J. L. (1994) J. Exp. Med. 180, 751-755.
130. Sette, A., Southwood, S., Miller, J. & Appella, E. (1995) J. Exp. Med. 181, 677-683.
131. Malcherek, G., Gnau, V., Jung, G., Rammensee, H.-G. & Melms, A. (1995) J. Exp. Med. 181, 527-536.
132. Sinigaglia, F. & Hammer, J. (1995) J. Exp. Med. 181, 449-451.
133. Bangia, N. & Watts, T. H. (1995) Int. Immunol. 7, 1585-1591.
134. Gautam, A. M., Pearson, C., Quinn, V., McDevitt, H. O. & Milburn, P. J. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 335-339.
135. Geluk, A., van Meijgaarden, K. E., Wouter Drijfhout, J. & Ottenhoff, T. H. M. (1995) Mol. Immunol 32, 975-981.
136. Freisewinkel, I. M., Schenck, K. & Koch, N. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 9703-9706.
137. Bijlmakers, M. J., Benaroch, P. & Ploegh, H. L. (1994) J. Exp. Med. 180, 623-629.
138. Romagnoli, P. & Germain, R. N. (1994) J. Exp. Med. 180, 1107-1113.
139. Jasanoff, A., Park, S. J. & Wiley, D. C. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 9900-9904.
140. Park, S. J., Sadegh-Nasseri, S. & Wiley, D. C. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 11289-11293.
141. Cresswell, P. (1996) Cell 84, 505-507.
142. Blum, J. S. & Cresswell, P. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 3975-3979.
143. Newcomb, J. R. & Cresswell, P. (1993) J. Immunol. 151, 4153-4163.
144. Marie, M. A., Taylor, M. D. & Blum, J. S. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 2171-2175.
145. Riese, R. J., Wolf, P. R., Bromme, D., Natkin, L. R., Villadandos, J. A., Ploegh, H. L. & Chapman, H. A. (1996) Immunity 4, 357-366.
146. Weber, D. A., Evavold, B. D. & Jensen, P. E. (1996) Science 274, 618-620.
147. Kropshofer, H., Vogt, A. B., Stern, L. J. & Hammerling, G. J. (1995) Science 270, 1357-1359.
148. Beeson, C. & McConnell, H. M. (1995) J. Am. Chem. Soc. 117, 10429-10433.
149. Vogt, A. B., Kropshofer, H., Moldenhauer, G. & Hammerling, G. J. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 9724-9729.
150. Mellins, E., Arp, B., Ochs, B., Erlich. H. & Pious, D. (1988) J. Exp. Med. 168, 1531-1537.
151. Sanderson, F., Thomas, C., Neefjes, J. & Trowsdale, J. (1996) Immunity 4, 87-96.
152. Wolf, P. R. & Ploegh, H. L. (1995) Nature 376, 464-465.
153. Denzin, L. K., Hammond, C. & Cresswell, P. (1996) J. Exp. Med. 184, 2153-2165.
154. Anderson, M.S. & Miller, J. (1992) Proc. Natl. Acad. Sei. USA 89, 2282-2286.
155. Gellman, S. H. (1991) Biochemistry 30, 6633-6636.
156. Martin, W. D., Hicks, G. G., Mendiratta, S. K., Leva, H. I., Ruley, H. E. & Van Kaer, L. (1996) Cell 84, 543-550.
157. Miyazaki, T., Wolf, P., Tourne, S., Waltzinger, C., Dierich, A., Barois, N., Ploegh, H., Benoist, C. & Mathis, D. (1996) Cell 84, 531-541.
158. Fung-Leung, W. P., Surh, C. D., Liljedahl, M., Pang, J., Leturcq, D., Peterson, P. A., Webb, S. R. & Karlsson, L. (1996) Science 271, 1278-1281.
159. Ramachandra, L., Kovats, S., Eastman, S. & Rudensky, A. Y. (1996) J. Immunol. 156, 2196-2204.
160. Katz, J. F., Stebbins, C., Appella, E. & Sant, A. J. (1996) J. Exp. Med. 184, 1747-1753.