Structural insights into NMDA ionotropic glutamate receptors via molecular modelling

Journal of Molecular Modeling

Volumn 6, Issue 1, 2000, Pages 16-25

  Chohan, Kamaldeep K ^a   Wo, Z Galen ^b   Oswald, Robert E ^b   Sutcliffe, Michael J ^a  

^a UNIVERSITY OF LEICESTER   (United Kingdom)

^b Department of Population Medicine and Diagnostic Sciences   (United States)

Author keywords

Agonist binding; Cation channel; Selectivity

Indexed keywords

EID: 0008151665     PISSN: 16102940     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/pl00010721     Document Type: Article

References (58)

1. Paas, Y. Trends Neurosci. 1998, 21, 117-125.
2. Monaghan, D. T.; Bridges, R. J.; Cotman, C. W. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 1989, 29, 365-402.
3. Dingledine, R.; Borges, K.; Bowie, D.; Traynelis, S. Pharmacol. Rev. 1999, 51, 7-61.
4. Wo, Z. G.; Oswald, R. E. Trends Neurosciences 1995, 18, 161-168.
5. Nakanishi, N.; Schneider, N. A.; Axel, R Neuron 1990, 5, 569-581.
6. O'Hara, P. J.; Sheppard, P. O.; Thøgersen, H.; Venezia, D.; Haldeman, B. A.; McGrane, V.; Houamed, K. M.; Thomsen, C.; Gilbert, T. L.; Mulvihill, E. R. Neuron 1993, 11, 41-52.
7. Wo, Z. G.; Oswald, R. E. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 7154-7158.
8. Hollmann, M.; Heinemann, S. Annu. Rev. Neurosci. 1994, 17, 31-108.
9. Bennett, J. A.; Dingledine, R. Neuron 1995, 14, 373-384.
10. Wo, Z. G.; Oswald, R. E. J. Biol. Chem. 1995, 270, 2000-2009.
11. Wood, M. W.; van Dongen, H. M. A.; van Dongen, A. M. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 4882-4886.
12. Sprengel, R.; Suchanek, B.; Amico, C.; Brusa, R.; Burnashev, N.; Rozov, A.; Hvalby, O.; Jensen, V.; Paulsen, O.; Andersen, P.; Kim, J. J.; Thompson, R. F.; Sun, W.; Webster, L. C.; Grant, S. G.; Eilers, J.; Konnerth, A.; Li, J.; McNamara, J. O.; Seeburg, P. H. Cell 1998, 92, 279-289.
13. Kennedy, M. B. Trends Neurosci 1997, 20, 264-268.
14. Leonard, A. S.; Hell, J. W. J. Biol. Chem. 1997, 272, 12107-12115.
15. Moriyoshi, K.; Masu, M.; Ishii, T.; Shigemoto, R.; Mizuno, N.; Nakanishi, S. Nature 1991, 354, 31-37.
16. Soloviev, M. M.; Barnard, E. A. J. Mol. Biol. 1997, 273, 14-18.
17. McBain, C. J.; Mayer, M. L. Physiol. Rev. 1994, 74, 723-760.
18. Hirai, H.; Kirsch, J.; Laube, B.; Betz, H.; Kuhse, J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 6031-6036.
19. Honer, M.; Benke, D.; Laube, B.; Kuhse, J.; Heckendorn, R.; Allgeier, H.; Angst, C.; Monyer, H.; Seeburg, P. H.; Betz, H.; Mohler, H. J. Biol. Chem. 1998, 273, 11158-11163.
20. Laube, B.; Hirai, H.; Sturgess, M.; Betz, H.; Kuhse, J. Neuron 1997, 18, 493-503.
21. Sutcliffe, M. J.; Smeeton, A. H.; Wo, Z. G.; Oswald, R. E. J. Chem. Soc., Far. Disc. 1998, 111, 259-272.
22. Armstrong, N.; Sun, Y.; Chen, G. Q.; Gouaux, E. Science 1998, 395, 913-917.
23. Doyle, D. A.; Cabral, J. M.; Pfuetzner, R. A.; Kuo, A. L.; Gulbis, J. M.; Cohen, S. L.; Chait, B. T.; MacKinnon, R. Science 1998, 280, 69-77.
24. Sutcliffe, M. J.; Smeeton, A. H.; Wo, Z. G.; Oswald, R. E. Method. Enzymol. 1998, 293, 589-620.
25. Sutcliffe, M. J.; Smeeton, A. H.; Wo, Z. G.; Oswald, R. E. Biochem. Soc. Trans. 1998, 26, 450-458.
26. Thompson, J. D.; Higgins, D. G.; Gibson, T. J. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4673-4680.
27. Bernstein, F. C.; Koetzle, T. F.; Williams, G. J. B.; Meyer, E. F.; Brice, M. D.; Rodgers, J. R.; Kennard, O.; Shimanovichi, T.; Tasumi, M. J. Mol. Biol. 1977, 112, 535-542.
28. Cuff, J. A.; Clamp, M.; Siddiqui, A. S.; Finaly, M.; Barton, G. J. Bioinformatics 1998, 14, 892-893.
29. Sali, A.; Blundell, T. L. J. Mol. Biol. 1993, 234, 779-815.
30. Kuner, T.; Wollmuth, L. P.; Karlin, A.; Seeburg, P. H.; Sakmann, B. Neuron 1996, 17, 343-352.
31. Rosenmund, C.; Stern-Bach, Y.; Stevens, C. F. Science 1998, 280, 1596-1599.
32. Mano, I.; Teichberg, V. I. Neuroreport 1998, 9, 327-331.
33. Laube, B.; Kuhse, J.; Betz, H. J. Neurosci. 1998, 18, 2954-2961.
34. Premkumar, L. S.; Auerbach, A. J. Gen. Physiol. 1997, 110, 485-502.
35. Williams, K.; Pahk, A. J.; Kashiwagi, K.; Masuko, T.; Nguyen, N. D.; Igarashi, K. Mol. Pharmacol. 1998, 53, 933-941.
36. Kashiwagi, K.; Pahk, A. J.; Masuko, T.; Igarashi, K.; Williams, K. Mol. Pharmacol. 1997, 52, 701-713.
37. Chao, J.; Seiler, N.; Renault, J.; Kashiwagi, K.; Masuko, T.; Igarashi, K.; Williams, K. Mol. Pharmacol. 1997, 51, 861-871.
38. Nicholls, A.; Honig, B. J. Comput. Chem. 1991, 12, 435-445.
39. Nicholls, A.; Sharp, K.; Honig, B. Proteins 1991, 11, 281-296.
40. Smart, O. S.; Goodfellow, J. M.; Wallace, B. A. Biophys. J. 1993, 65, 2455-2460.
41. Williams, K. Neurosci. Lett. 1996, 215, 9-12.
42. Anson, L. C.; Chen, P. E.; Wyllie, D. J. A.; Colquhoun, D.; Schoepfer, R. J. Neurosci. 1998, 18, 581-589.
43. Zarei, M. M.; Dani, J. A. J. Neurosci. 1995, 15, 1446-1454.
44. Villarroel, A.; Burnashev, N.; Sakmann, B. Biophys. J. 1995, 68, 866-875.
45. Wollmuth, L. P.; Kuner, T.; Seeburg, P. H.; Sakmann, B. J. Physiol., (London) 1996, 491, 779-797.
46. Chothia, C.; Lesk, A. M. Embo J. 1986, 5, 823-826.
47. Beck, C.; Wollmuth, L. P.; Seeburg, P. H.; Sakmann, B.; Kuner, T. Neuron 1999, 22, 559-570.
48. Krupp, J. J.; Vissel, B.; Heinemann, S. F.; Westbrook, G. L. Neuron 1998, 20, 317-327.
49. Eisenberg, R. S. J. Membr. Biol. 1996, 150, 1-25.
50. Roux, B.; MacKinnon, R. Science 1999, 285, 100-102.
51. Wo, Z. G.; Chohan, K. K.; Chen, H.; Sutcliffe, M. J.; Oswald, R. E. J. Biol. Chem. 1999, 274, 37210-37218.
52. Paas, Y.; Eisenstein, M.; Medevielle, F.; Teichberg, V. I.; Devillers-Thiery, A. Neuron 1996, 17, 979-990.
53. Kashiwagi, K.; Fukuchi, J. I.; Chao, J.; Igarashi, K.; Williams, I. Mol. Pharmacol. 1996, 49, 1131-1141.
54. Villarroel, A.; Regalado, M. P.; Lerm, J. Neuron 1998, 20, 329-339.
55. Laskowski, R. A.; MacArthur, M. W.; Moss, D. S.; Thornton, J. M. J. Appl. Cryst. 1993, 26, 283-291.
56. Barton, G. J. Protein Eng. 1993, 6, 37-40.
57. Wallace, A. C.; Laskowski, R. A.; Thornton, J. M. Protein Eng. 1995, 8, 127-134.
58. Kraulis, P. J. J. Appl. Crystallogr. 1991, 24, 946-950.