Ab Initio Determination of the Structure of the Active Site of a Metalloenzyme: Metal Substitution in Phosphotriesterase Using Density Functional Methods

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 75, Issue 3, 1999, Pages 289-299

  Kafafi, Sherif A ^a   Krauss, Morris ^a  

^a UNIVERSITY OF MARYLAND BIOTECHNOLOGY INSTITUTE   (United States)

Author keywords

Ab initio structure; Activated water nucleophile; Cadmium; Density functional; Metalloenzyme active site; Phosphotriesterase; Zinc

Indexed keywords

EID: 0001099193     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1097-461X(1999)75:3<289::AID-QUA18>3.0.CO;2-9     Document Type: Article

References (24)

1. Tuovinen, K.; Korhonen, E. K.; Raushel, F. M.; Hanninen, O. Fund Appl Toxicol 1994, 23, 578.
2. Tuovinen, K.; Korhonen, E. K.; Raushel, F. M.; Hanninen, O. Fund Appl Toxicol 1996, 31, 210.
3. Watkins, L. M.; Mahoney, H. J.; McCulloch, J. K.; Raushel, F. M. J Biol Chem 1997, 272, 25596-25601.
4. Kuo, J. M.; Chae, M. Y.; Raushel, F. M. Biochemistry 1997, 36, 1982-1988, and references cited therein.
5. Vanhooke, J. L.; Benning, M. M.; Raushel, F. M.; Holden, H. M. Biochemistry 1996, 35, 6020.
6. Benning, M. M.; Kuo, J. M.; Raushel, F. M.; Holden, H. M. Biochemistry 1995, 34, 7973.
7. Wilcox, D. E. Chem Rev 1996, 96, 2435.
8. Hong, S.; Raushel, F. M. Biochemistry 1996, 35, 10904.
9. Omburo, G. A.; Kuo, J. M.; Mullins, L. S.; Raushel, F. M. J Biol Chem 1992, 267, 13278.
10. Omburo, G. A.; Mullins, L. S.; Raushel, F. M. Biochemistry 1993, 32, 9148.
11. Ryde, U.; Olsson, M. H. M.; Pierloot, K.; Roos, B. O. J Mol Biol 1996, 261, 586.
12. Pierloot, K.; DeKerpel, J. O. A.; Ryde, U.; Roos, B. O. J Am Chem Soc 1997, 119, 218.
13. DeKerpel, J. O. A.; Pierloot, K.; Ryde, U.; Roos, B. O. J Phys Chem 1998, B102, 4638.
14. Garmer, D. R.; Krauss, M. J Am Chem Soc 1993, 115, 10247.
15. Gilson, H.; Krauss, M. J Am Chem Soc, submitted.
16. Alberts, I. A.; Nadassy, K.; Wodak, S. J. Protein Sci 1998, 7, 1700.
17. Kafafi, S. A.; El-Gharkawy, E. R. H. J Phys Chem 1998, A102, 3202.
18. Kafafi, S. A. J Phys Chem 1998, A102, 10404.
19. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T. A.; Peterson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; AlLahman, M. A.; Zakrewski, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; Head-Gordon, M.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 94, Revision B.3; Gaussian Inc.: Pittsburgh, 1995.
20. Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Redfern, P. C.; Pople, J. A. J Chem Phys 1997, 106, 1063.
21. Ziegler, T. Chem Rev 1991, 91, 651.
22. Adamo, C.; Barone, V. J Chem Phys 1998, 108, 664.
23. Buchbinder, J. J.; Stephenson, R. C.; Dresser, M. J.; Pitera, J. W.; Scanlan, T. S.; Fletterick, R. J. Biochemistry 1998, 37, 5096.
24. Cleland, W. W.; Andrews, T. J.; Gutteridge, S.; Hartman, F. C.; Lorimer, G. H. Chem Rev 1998, 98, 549.