Theoretical study of the electronic spectrum of plastocyanin

Journal of the American Chemical Society

Volumn 119, Issue 1, 1997, Pages 218-226

  Pierloot, Kristine ^a   De Kerpel, Jan O A ^a   Ryde, Ulf ^b   Roos, Björn O ^b  

^a UNIVERSITY OF LEUVEN   (Belgium)

^b LUND UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PLASTOCYANIN;

ARTICLE; COMPUTER SIMULATION; ELECTRON SPIN RESONANCE; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN STRUCTURE; THEORY;

EID: 0031042264     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja962381f     Document Type: Article

References (39)

1. Sykes, A. G. Adv. Inorg. Chem. 1990, 36, 377-408.
2. Adman, E. T. Adv. Protein Chem. 1991, 42, 145-197.
3. Colman, P. M.; Freeman, H. C.; Guss, J. M.; Murata, M.; Noms, V. A.; Ramshaw, J. A. M.; Venkatappa, M. P. Nature 1978, 272, 319-324.
4. Guss, J. M.; Freeman, H. C. J. Mol. Biol. 1983, 169, 521-563.
5. Guss, J. M.; Bartunik, H. D.; Freeman, H. C. Acta Crystallogr. 1992, B48, 790-807.
6. Solomon, E. I.; Hare, J. W.; Dooley, D. M.; Dawson, J. H.; Stephens, P. J.: Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 168.
7. Penfield, K. W.; Gay, R. R.; Himmelwright, R. S.; Eickman, N. C.; Norrs, V. A.; Freeman, H. C.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 4382.
8. Gewirth, A. A.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 3811.
9. Liu, M.-Y.; Liu, M.-C.; Payne, W. J.; Legall, J. J. Bacteriol. 1986, 166, 604-608.
10. Penfield, K. W.; Gewirth, A. A.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 4519.
11. Larsson, S.; Broo, A.; Sjölin, L. J. Phys. Chem. 1995, 99, 4860.
12. Andersson, K.; Malmqvist, P.-Å.; Roos, B. O. J. Chem. Phys. 1992, 96, 1218.
13. Roos, B. O.; Andersson, K.; Fülscher, M. P.; Malmqvist, P.-Å.; Serrano-Andrés, L.; Pierloot, K.; Merchán, M. In Advances in Chemical Physics: New Methods in Computational Quantum Mechanics; Prigogine, I., Rice, S. A., Eds.; John Wiley & Sons, New York, 1996; Vol. XCIII: 219.
14. Rice, J. E.; Horn, H.; Lengsfiels, B. H.; McLean, A. D.; Carter, J. T,; Replogle, E. S.; Barnes, L. A.; Maluendes, S. A.; Lie, G. C.; Gutwski, M.; Rude, W. E.; Sauer, S. P. A.; Lindh, R.; Andersson, K.; Chevalier, T. S.; Widmark, P.-O.; Bouzida, D.; Pacansky, G.; Singh, K.; Gillan, C. J.; Carnevali, P.; Swope, W. C.; Liu, B. Mulliken™ Version 2.25b, internal release; IBM Corporation: Almaden, CA, 1995,
15. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, M. A.; Zakrzewski, V. G.; Ortjz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; Head-Gordon, M.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 94, Revision D.I; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1995.
16. Vosko, S. H.; Wilk, L.; Nusair, M. J. Chem. Phys. 1980, 58. 1200-1211.
17. Ricca, A.; Bauschlicher, C. W. J. Phys. Chem. 1994, 98, 12899-12903.
18. Ricca, A.; Bauschlicher, C. W. Theor. Chim. Acta 1995, 92, 123-131.
19. Holthausen, M. C.; Mohr, M.; Koch, W. Chem. Phys. Lett. 1995, 240, 245-252.
20. Schäfer, A.; Horn, H.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2571-2577.
21. Hehre, W. J.; Radom, L.; Schleyer, P. v. R.; Pople, J. A. Ab initio molecular orbital theory; Wiley-Interscience: New York, 1986.
22. Ryde, U.; Olsson, M, H.; Pierloot, K.; Roos, B. O. J. Mol, Biol. 1996, 261, 586-596.
23. Andersson, K.; Malmqvist, P.-Å.; Roos, B. O.; Sadlej, A. J.; Wolinski, K. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5483.
24. Andersson, K.; Roos, B. O. In Modern electron structure theory; Yarkony, R., Ed.; Advanced Series in Physical Chemistry; World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd.: Singapore, 1995; Vol. 2, Part I:55.
25. Roos, B. O.; Andersson, K. Chem. Phys. Lett. 1995, 245, 215.
26. Roos, B. O.; Andersson, K.; Fülscher, M. P.; Serrano-Andrés, L.; Pierloot, K.; Merchán, M.; Molina, V. J. Mol. Struct. (Theochem) 1996, in press.
27. Pierloot, K.; Dumez, B.; Widmark, P.-O.; Roos, B. O. Theor. Chim. Acta 1995, 90, 87.
28. Malmqvist, P. Å.; Roos, B. O. Chem. Phys. Lett. 1989, 155, 189.
29. Andersson, K.; Fülscher, M. P.; Karlström, G.; Lindh, R.; Malmqvist, P.-Å.; Olsen, J.; Roos, B. O.; Sadlej, A. J.; Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M.; Kellö, V.; Noga, J.; Urban, M.; Widmark, P.-O. MOLCAS Version 3: Dept. of Theor. Chem., Chem. Center, Univ. of Lund, P.O.B. 124, S-221 00 Lund, Sweden, Lund, 1994.
30. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.
31. Pearlman, D. A.; Case, D. A.; Caldwell, J. W.; Ross, W. S.; Cheatham, T. E.; Ferguson, D. M.; Seibel, G. L.; Singh, U. C.; Weiner, P. K.; Kollman, P. A. Amber Version 4.1; University of California: San Francisco, CA, 1995.
32. Stavrev, K. K.; Zerner, M. C. Int. J. Quantum Chem.: Quantum Biol., Symp. 1995, 22, 155-159.
33. Andrew, C. R.; Yeom, H.; Valentine, J. S.; Karlsson, B. G.; Bonander, N.; van Pouderoyen, G.; Canters, G. W.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11489-11498.
34. Fields, B. A.; Bartsch, H. H.; Bartunik, H. D.; Cordes, F.; Guss, J. M.; Freeman, H. C. Acta Crystallogr. 1994, D50, 709-730,
35. Malmström, B. G. Eur. J. Biochem. 1994, 223, 207-216.
36. Williams, R. J. P. Eur. J. Biochem. 1995, 234, 363-381.
37. Han, J.; Loehr, T. M.; Lu, Y.; Valentine, J. S.; Averill, B. A.; Sanders-Loehr, J. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4256-4263.
38. Adman, E. T.; Godden, J. W.; Turley, S. J. Biol. Chem. 1995, 270, 27458-27474.
39. Pierloot, K.; De Kerpel, J. O. A.; Olsson, M. H. M.; Ryde, U.; Eriksson, L.; Roos, B. O. Degeneracy in blue copper proteins - a theoretical investigation of the structure, spectrum and EPR parameters of nitrite reductase. To be published, 1997.