Mechanism of rubisco: The carbamate as general base

Chemical Reviews

Volumn 98, Issue 2, 1998, Pages 549-561

  Cleland, W Wallace ^a   Andrews, T John ^b   Gutteridge, Steven ^c   Hartman, Fred C ^d   Lorimer, George H ^c,e  

^a UNIVERSITY OF WISCONSIN   (United States)

^b AUSTRALIAN NATIONAL UNIVERSITY   (Australia)

^c DUPONT COMPANY   (United States)

^d OAK RIDGE NATIONAL LABORATORY   (United States)

^e Bldg 142   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000672797     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr970010r     Document Type: Article

References (101)

1. Andrews, T. J.; Lorimer, G. H. In The Biochemistry of Plants; Hatch, M. D., Boardman, N. K., Eds.; Academic Press: New York, 1987; Vol. 10, pp 131-218.
2. Hartman, F. C.; Harpel, M. R. Adv. Enzymol. 1993, 67, 1.
3. Hartman, F. C.; Harpel, M. R. Annu. Rev. Biochem. 1994, 63, 197.
4. Gutteridge, S.; Gatenby, A. A. Plant Cell 1995, 7, 809.
5. Lorimer, G. H.; Badger, M. R.; Andrews, T. J. Biochemistry 1976, 15, 529.
6. Lorimer, G. H.; Miziorko, H. M. Biochemistry 1980, 19, 5321.
7. Lorimer, G. H. Biochemistry 1981, 20, 1236.
8. Lorimer, G. H. Trends in Biochem. Sci. 1983, 3, 65.
9. Miziorko, H. M.; Sealy, R. C. Biochemistry 1980, 19, 1167.
10. Pierce, J.; Reddy, G. S. Arch. Biochem. Biophys. 1986, 245, 483.
11. Donnelly, M. I.; Stringer, C. D.; Hartman, F. C. Biochemistry 1983, 22, 2, 4346.
12. Miziorko, H. M. J. Biol. Chem. 1979, 254, 270.
13. Lorimer, G. H. J. Biol. Chem. 1979, 254, 5599.
14. Faurholt, C. J. Chim. Phys. 1925, 22, 1.
15. Edsall, J. T.; Wyman, J. Biophysical Chemistry; Academic Press: New York, 1958; Vol. 1, pp 571-578.
16. Ewing, S. P.; Lockshon, D.; Jencks, W. P. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 3072.
17. Gurd, F. R. N.; Matthew, J. B.; Wittebort, R. J.; Morrow, J. S.; Friend, S. H. In Biophysics and Physiology of Carbon Dioxide; Bauer, C., Gross, G., Bartels, H., Eds.; Springer Verlag: Berlin, 1980; pp 89-101.
18. Roughton, F. J. W. Biochem. J. 1970, 117, 801.
19. Kilmartin, J. V.; Rossi-Bernardi, L. Physiol. Rev. 1973, 53, 836.
20. Davis, A. J.; O'Brien, P. O.; Nunn, P. B. Bioorg. Chem. 1993, 21, 309.
21. Arnone, A.; Rogers, P. H.; Briley, P. D. In Biophysics and Physiology of Carbon Dioxide; Bauer, C., Gross, G., Bartels, H., Eds.; Springer-Verlag: Berlin, 1980; pp 67-74.
22. Lundqvist, T.; Schneider, G. Biochemistry 1991, 30, 904.
23. Taylor, T. C.; Andersson, I. Nature Struct. Biol. 1996, 3, 95.
24. Jabri, E.; Carr, M. B.; Hausinger, R. P.; Karplus, P. A. Science 1995, 268, 998.
25. Park, I.-S.; Hausinger, R. Science 1995, 267, 1156.
26. Benning, M. M.; Kuo, J. M.; Raushel, F. M.; Holden, H. M. Biochemistry 1995, 34, 7973.
27. Hong, S.-B.; Kuo, J. M.; Mullins, L. S.; Raushel, F. M. J. Am. Chem Soc. 1995, 117, 7580.
28. Andersson, I. J. Mol. Biol. 1996, 259, 160.
29. Lorimer, G. H.; Gutteridge, S.; Reddy, G. S. J. Biol. Chem. 1989, 264, 9873.
30. Taylor, T. C.; Andersson, I. J. Mol. Biol. 1997, 265, 432.
31. Gutteridge, S.; Parry, M.; Schmidt, C. N. G.; Feeney, J. FEBS Lett. 1984, 170, 355.
32. Pierce, J.; Andrews, T. J.; Lorimer, G. H. J. Biol. Chem. 1986, 261, 10248.
33. Van Dyk, D. E.; Schloss, J. V. Biochemistry 1986, 25, 5145.
34. Schloss, J. V.; Lorimer, G. H. J. Biol. Chem. 1982, 257, 4691.
35. Andersson, I.; Knight, S.; Schneider, G.; Lindqvist, Y.; Lundqvist, T.; Branden, C.-I.; Lorimer, G. H. Nature 1989, 337, 229.
36. Knight, S.; Andersson, I.; Brändén, C.-I. J. Mol. Biol. 1990, 215, 113.
37. Newman, J.; Gutteridge, S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 25876.
38. Schreuder, H. A.; Knight, S.; Curmi, P. M. G.; Andersson, I.; Cascio, D.; Sweet, R. M.; Brändén, C.-I.; Eisenberg, D. Protein Sci. 1993, 2, 1136.
39. Calvin, M. Fed. Proc. 1954, 13, 697.
40. Saver, B. G.; Knowles, J. M. Biochemistry 1982, 21, 5398.
41. Sue, J. M.; Knowles, J. Biochemistry 1982, 21, 5404.
42. Fiedler, F.; Müllhofer, G.; Trebst, A.; Rose, I. A. Eur. J. Biochem. 1967, 1, 395.
43. Pierce, J.; Lorimer, G. H.; Reddy, G. S. Biochemistry 1986, 25, 1635.
44. Hartman, F. C.; Milanez, S.; Lee, E. H. J. Biol. Chem. 1985, 260, 13968.
45. Hartman, F. C.; Soper, T. S.; Niyogi, S. K.; Mural, R. J.; Foote, R. S.; Mitra, S.; Lee, E.H.; Machanoff, R.; Larimer, F. W. J. Biol. Chem. 1987, 262, 3496.
46. Lorimer, G. H.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1988, 263, 6468.
47. Smith, H. B.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1988, 263, 4921.
48. Lundqvist, T.; Schneider, G.J. Biol. Chem. 1991, 266, 12604.
49. Hartman, F. C.; Lee, E. H. J. Biol. Chem. 1989, 264, 11784.
50. Mural, R. J.; Soper, T. S.; Larimer, F. W.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1990, 265, 6501.
51. Harpel, M. R.; Larimer, F. W.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1991, 266, 24734.
52. Harpel, M. R.; Hartman, F. C. Biochemistry 1996, 35, 13865.
53. Soper, T. S.; Larimer, F. W.; Mural, R. J.; Lee, E. H.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1992, 267, 8452.
54. Davenport, R. C.; Bash, P. A.; Seaton, B. A.; Karplus, M.; Petsko, G. A.; Ringe, D. Biochemistry 1991, 30, 5821.
55. Gandour, R. D. Bioorg. Chem. 1981, 10, 169.
56. Rebek, J. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1990, 29, 245.
57. Kresge, A. J. Pure Appl. Chem. 1991, 63, 213.
58. Gerlt, J. A.; Gassman, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 11552.
59. Corey, E. J.; Sheen, R. A. J. Am. Chem. Soc. 1956, 78, 6269.
60. Knowles, J. R. Philos. Trans. R. Soc. B 1991, 332, 115.
61. Mullhofer, G.; Rose, I. A. J. Biol. Chem. 1965, 240, 1341.
62. Zheng, Y. J.; Merz, K. M.; Farber, G. K. Protein Eng. 1993, 6, 479.
63. Nickbarg, E. B.; Davenport, R. C.; Petsko, G. A.; Knowles, J. R. Biochemistry 1988, 27, 5948.
64. Jaworowski, A.; Rose, I. A. J. Biol. Chem. 1985, 260, 944.
65. Jaworowski, A.; Hartman, F. C.; Rose, I. A. J. Biol. Chem. 1984, 259, 6783.
66. Lorimer, G. H.; Andrews, T. J.; Pierce, J.; Schloss, J. V. Philos. Trans. R. Soc. London B 1986, 313, 397.
67. Cleland, W. W. Biochemistry 1990, 29, 3194.
68. Pierce, J.; Tolbert, N. E.; Barker, R. Biochemistry 1980, 19, 934.
69. Deslongchamps, P. Stereoelectronic Effects in Organic Chemistry; Pergamon Press: Oxford, 1983.
70. Kirby, A. J. The Anomeric Effect and Related Stereoelectronic Effects on Oxygen; Springer-Verlag: Berlin, 1983.
71. Andrews, T. J.; Kane, H. J. J. Biol. Chem. 1991, 266, 9447.
72. Bowes, G.; Ogren, W. L.; Hageman, R. H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1971, 45, 716.
73. Lorimer, G. H.; Andrews, T. J.; Tolbert, N. E. Biochemistry 1973, 12, 2, 18.
74. Andres, J.; Safont, V. S.; Tapia, O. J. Phys. Chem. 1993, 97, 7888.
75. Tapia, O.; Andres, J. Mol. Eng. 1992, 2, 37.
76. Chen, Y.-R.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1995, 270, 11741.
77. Harpel, M. R.; Serpersu, E. H.; Lamerdin, J. A.; Huang, Z.-H.; Gage, D, A.; Hartman, F. C. Biochemistry 1995, 34, 11296.
78. Harpel, M. R.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1992, 267, 6475.
79. Parry, M. A. J.; Madgwick, P.; Parmar, S.; Cornelius, M. J.; Keys, A. J. Planta 1992, 187, 109.
80. Gutteridge, S.; Rhoades, D. F.; Herrmann, C. J. Biol. Chem. 1993, 268, 7818.
81. Chen, Z.; Spreitzer, R. J. Planta 1991, 183, 597.
82. Richard, J. P. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 4926.
83. Paech, C.; McCurry, S. D.; Pierce, J.; Tolbert, N. E. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1978, 83, 1084.
84. Rose, I. A. Philos. Trans. R. Soc. London B 1981, 293, 131.
85. Pompliano, D. L.; Peyman, A.; Knowles, J. R. Biochemistry 1990, 29, 3186.
86. Richard, J. P. Biochemistry 1991, 30, 4581.
87. Morell, M. K.; Paul, K.; O'Shea, N. J.; Kane, H. J.; Andrews, T. J. J. Biol. Chem. 1994, 269, 8091.
88. Larimer, F. W.; Harpel, M. R.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1994, 269, 11114.
89. Taylor, T. C.; Andersson, I. Biochemistry 1997, 36, 4041.
90. Curmi, P.; Cascio, D.; Sweet, R. M.; Eisenberg, D.; Schreuder, H. J. Biol. Chem. 1992, 267, 16980.
91. Hanson, K. R.; Rose, I. A. Acc. Chem. Res. 1975, 8, 1.
92. Schneider, G.; Lindqvist, T.; Lundqvist, T. J. Mol. Biol 1990, 211, 989.
93. Lundqvist, T.; Schneider, G. J. Biol. Chem. 1988, 263, 3643.
94. Lundqvist, T.; Schneider, G. J. Biol. Chem. 1989, 264, 7078.
95. Newman, J.; Gutteridge, S. Structure 1994, 2, 495.
96. Taylor, T. C.; Fothergill, M. D.; Andersson, I. J. Biol. Chem. 1996, 271, 32894.
97. Zhang, K. Y. J.; Cascio, D.; Eisenberg, D. Protein Sci. 1994, 3, 64.
98. Smith, H. B.; Hartman, F. C. Biochemistry 1991, 30, 5172.
99. Lorimer, G. H.; Chen, Y.-R.; Hartman, F. C. Biochemistry 1993, 32, 2, 9018.
100. Larson, E. M.; Larimer, F. W.; Hartman, F. C. Biochemistry 1995, 34, 4531.
101. Larimer, F. W.; Lee, E. H.; Mural, R. J.; Soper, T. S.; Hartman, F. C. J. Biol. Chem. 1987, 262, 15327.