Erratum: The importance of hydration and DNA conformation in interpreting infrared spectra of cells and tissues (Chemical Society Reviews (2015) DOI: 10.1039/c5cs00511f);The importance of hydration and DNA conformation in interpreting infrared spectra of cells and tissues

Chemical Society Reviews

Volumn 45, Issue 7, 2016, Pages 1980-1998

  Wood, Bayden R ^a  

^a MONASH UNIVERSITY   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; WATER;

CELLS; CHEMISTRY; CONFORMATION; CYTOLOGY; HUMAN; INFRARED SPECTROSCOPY; PROCEDURES;

CELLS; DNA; HUMANS; NUCLEIC ACID CONFORMATION; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED; WATER;

EID: 84962106285     PISSN: 03060012     EISSN: 14604744     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5cs90121a     Document Type: Erratum

References (153)

1. D. W. Urserry, Encyclopedia of life sciences, John Wiley & Sons Ltd, Chichester, 2002
2. V. N. Potaman and R. R. Sinden, Madame Curie Bioscience Database [Internet], Landes Bioscience, Austin (TX), 2000
3. E. Taillandier J. Liquier Methods Enzymol. 1992 211 307 335
4. R. E. Franklin R. G. Gosling Acta Crystallogr. 1953 6 673 677
5. P. J. Cooper L. D. Hamilton J. Mol. Biol. 1966 16 562 563
6. J. Brahms J. Pilet T. T. Phuong Lan L. R. Hill Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1973 70 3352 3355
7. A. Bacolla R. D. Wells Mol. Carcinog. 2009 48 273 285
8. R. R. Sinden, in DNA Structure and Function, ed., R. R. Sinden, Academic Press, San Diego, 1994, pp. 1-57
9. G. Burckhardt C. Zimmer G. Luck FEBS Lett. 1973 30 35 39
10. E. M. Bradbury W. C. Price M. H. F. Wilkinson J. Mol. Biol. 1961 3 301 317
11. A. Rich Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1960 46 1044 1053
12. G. Milman R. Langridge M. J. Chamberlin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1967 57 1804 1810
13. A. Rich J. Biol. Chem. 2006 281 7693 7696
14. L. Fairall S. Martin D. Rhodes EMBO J. 1989 8 1809 1817
15. L. Nekludova C. O. Pabo Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 6948 6952
16. Y. Timsit J. Biomol. Struct. Dyn. 2000 17 suppl 1 169 176
17. D. Flatters M. Young D. L. Beveridge R. Lavery J. Biomol. Struct. Dyn. 1997 14 757 765
18. G. Guzikevich-Guerstein Z. Shakked Nat. Struct. Biol. 1996 3 32 37
19. A. Jacobo-Molina J. Ding R. G. Nanni A. D. Clark, Jr. X. Lu C. Tantillo R. L. Williams G. Kamer A. L. Ferris P. Clark et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1993 90 6320 6324
20. S. C. Mohr N. V. H. A. Sokolov C. He P. Setlow Proc. Natl. Acad. Sci. 1991 88 77 81
21. F. DiMaio X. Yu E. Rensen M. Krupovic D. Prangishvili E. H. Egelman Science 2015 348 914 917
22. D. R. Whelan T. J. Hiscox J. I. Rood K. R. Bambery D. McNaughton B. R. Wood J. R. Soc., Interface 2014 11 20140454
23. F. M. Pohl T. M. Jovin J. Mol. Biol. 1972 67 375 396
24. T. J. Thamann R. C. Lord A. H. Wang A. Rich Nucleic Acids Res. 1981 9 5443 5457
25. A. Rich S. Zhang Nat. Rev. Genet. 2003 4 566 572
26. E. M. Lafer R. P. Valle A. Moller A. Nordheim P. H. Schur A. Rich B. D. Stollar J. Clin. Invest. 1983 71 314 321
27. P. Vasudevaraju G. R. M. Bharathia K. Sambamurti K. S. J. Rao Brain Res. Rev. 2008 8 136 148
28. R. Treffer R. Bohme T. Deckert-Gaudig K. Lau S. Tiede X. Lin V. Deckert Biochem. Soc. Trans. 2012 40 609 614
29. A. Centrone Annu. Rev. Anal. Chem. 2015 8 101 126
30. R. Treffer X. Lin E. Bailo T. Deckert-Gaudig V. Deckert Beilstein J. Nanotechnol. 2011 2 628 637
31. E. Lipiec R. Sekine J. Bielecki W. M. Kwiatek B. R. Wood Angew. Chem. 2014 53 169 172
32. L. V. Yakushevich, Nonlinear Physics of DNA, Wiley-VCH Verlag GmbH & Co, Weinheim, 2004
33. S. Arnott Trends Biochem. Sci. 2006 31 349 354
34. R. R. Sinden, DNA Structure and Function, Elsevier Inc., 1994
35. R. E. Dickerson Sci. Am. 1983 249 94 110
36. D. Rhodes A. Klug Nature 1980 286 573 578
37. T. A. Early D. R. Kearns Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1979 76 4165 4169
38. M. Levitt Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1983 47 pt 1 251 262
39. M. D. Barkley B. H. Zimm J. Chem. Phys. 1979 70 2991 3007
40. Z.-J. Tan S.-J. Chen Biophys. J. 2006 90 1175 1190
41. J. D. Watson F. H. Crick Nature 1953 171 737 738
42. J. D. Watson F. H. Crick Nature 1953 171 964 967
43. R. O. Herzog and W. Jancke, in Verwendung von Röntgenstrahlen zur Untersuchung metamikroskopischer biologischer Strukturen, ed., C. Neuberg, Springer Berlin Heidelberg, Berlin, 1921, pp. 118-120
44. K. H. Meyer H. Mark Ber. Dtsch. chem. Ges. 1928 61 1932 1936
45. K. H. Meyer Biochem. Z. 1928 214 253
46. K. H. Meyer H. Mark Nature 1951 167 736
47. M. L. Huggins Chem. Rev. 1943 32 195 218
48. L. Pauling R. B. Corey J. Am. Chem. Soc. 1950 72 5349
49. C. H. Bamford W. E. Hanby F. Happey Proc. R. Soc. London, Ser. A 1951 205 30 47
50. L. Pauling R. B. Corey H. R. Branson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1951 37 205 211
51. M. F. Perutz Nature 1951 167 1053 1054
52. L. Pauling R. B. Corey Nature 1951 168 550 551
53. L. Pauling R. B. Corey Nature 1953 171 59 61
54. F. H. Crick Nature 1952 170 882 883
55. F. H. Crick Acta Crystallogr. 1953 6 689 697
56. J. Liu Q. Zheng Y. Deng C.-S. Cheng N. R. Kallenbach M. Lu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 15457 15462
57. W. T. Astbury F. O. Bell Nature 1938 140 747 748
58. W. T. Astbury Nature 1937 140 968 969
59. S. Furberg, An X-ray study of some nucleosides and nucleotides, Birkbeck College, 1949
60. M. H. F. Wilkins R. G. Gosling W. E. Seeds Nature 1951 167 759 760
61. R. E. Franklin R. G. Gosling Nature 1953 171 740 741
62. C. A. Dekker A. M. Michelson A. R. Todd J. Chem. Soc. 1953 947 951
63. E. Chargaff S. Zamenhof C. Green Nature 1950 165 756 757
64. J. M. Gulland Symp. Soc. Exp. Biol. 1947 1 14
65. J. Kypr M. Vorlickova Gen. Physiol. Biophys. 1986 5 415 421
66. J. Kypr I. Kejnovska D. Renciuk M. Vorlickova Nucleic Acids Res. 2009 37 1713 1725
67. V. I. Ivanov E. E. Minyat Nucleic Acids Res. 1981 9 4783 4798
68. D. G. Gorenstein Methods Enzymol. 1992 211 254 286
69. D. G. Gorenstein S. A. Schroeder J. M. Fu J. T. Metz V. Roongta C. R. Jones Biochemistry 1988 27 7223 7237
70. G. B. B. M. Sutherland M. Tsuboi Proc. R. Soc. London, Ser. A 1957 239 446 463
71. D. R. Whelan K. R. Bambery P. Heraud M. J. Tobin M. Diem D. McNaughton B. R. Wood Nucleic Acids Res. 2011 39 5439 5448
72. M. J. Tobin L. Puskar R. L. Barber E. C. Harvey P. Heraud B. R. Wood K. R. Bambery C. T. Dillon K. L. Munro Vib. Spectrosc. 2010 53 34 38
73. G. P. Zhizhina E. F. Oleinik Russ. Chem. Rev. 1972 41 258 280
74. M. Tsuboi Appl. Spectrosc. Rev. 1969 3 45 90
75. E. R. Blout M. Fields Science 1948 107 252
76. E. R. Blout M. Fields J. Biol. Chem. 1949 178 335 343
77. E. R. Blout H. Lenormant Biochim. Biophys. Acta 1954 15 303
78. M. J. Fraser R. D. B. Fraser Nature 1951 167 761 762
79. M. Tsuboi J. Am. Chem. Soc. 1957 79 1351 1354
80. M. Feughelman R. Langridge W. E. Seeds A. R. Stokes H. R. Wilson C. W. Hooper M. H. Wilkins R. K. Barclay L. D. Hamilton Nature 1955 175 834 838
81. D. A. Marvin M. Spencer M. H. Wilkins L. D. Hamilton Nature 1958 182 387 388
82. D. A. Marvin M. Spencer M. H. Wilkins L. D. Hamilton J. Mol. Biol. 1961 3 547 565
83. E. M. Bradbury W. C. Price G. R. Wilkinson J. Mol. Biol. 1962 4 39 49
84. E. M. Bradbury W. C. Price G. R. Wilkinson G. Zubay J. Mol. Biol. 1962 4 50 60
85. F. S. Parker, Applications of infrared spectroscopy in biochemistry, biology and medicine, Plenum Press, New York, 1971
86. M. Tsuboi Prog. Theor. Phys. 1961 Supp. 17 99
87. M. Falk K. A. Hartman R. C. Lord J. Am. Chem. Soc. 1963 85 387 391
88. Y. Kyogoku M. Tsuboi T. Shimanouchi I. Watanabe J. Mol. Biol. 1961 3 741 745
89. J. Pilet J. Brahms Biopolymers 1973 12 387 403
90. J. Pilet J. Brahms Nature, New Biol. 1972 236 99 100
91. S. Brahms J. Brahms J. Pilet Isr. J. Chem. 1974 12 153 163
92. W. Pohle H. Fritzsche Nucleic Acids Res. 1980 8 2527 2535
93. E. B. Brown W. L. Peticolas Biopolymers 1975 14 1259 1271
94. K. C. Lu E. W. Prohofsky L. L. Van Zandt Biopolymers 1977 16 2491 2506
95. J. Liquier J. Taboury E. Taillandier J. Brahms Biochemistry 1977 16 3262 3266
96. R. Langridge H. R. Wilson C. W. Hooper M. H. Wilkins J. Mol. Biol. 1960 2 19 37
97. A. Mignolet A. Derenne M. Smolina B. R. Wood E. Goormaghtigh Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2015 10.1016/j.bbapap.2015.08.010
98. F. Abassi Joozdani F. Yari P. Abassi Joozdani S. Nafisi PLoS One 2015 10 e0127541
99. S. Agarwal D. K. Jangir R. Mehrotra J. Photochem. Photobiol., B 2013 120 177 182
100. S. Nafisi M. Adelzadeh Z. Norouzi M. N. Sarbolouki DNA Cell Biol. 2009 28 201 208
101. S. Agarwal D. K. Jangir P. Singh R. Mehrotra J. Photochem. Photobiol., B 2014 130 281 286
102. D. K. Jangir G. Tyagi R. Mehrotra S. Kundu J. Mol. Struct. 2010 969 126 129
103. E. Lipiec K. R. Bambery P. Heraud W. M. Kwiatek D. McNaughton M. J. Tobin C. Vogel B. R. Wood Analyst 2014 139 4200 4209
104. D. Pozzi P. Grimaldi S. Gaudenzi L. Di Giambattista I. Silvestri S. Morrone A. Congiu Castellano Radiat. Res. 2007 168 698 705
105. L. Di Giambattista P. Grimaldi S. Gaudenzi D. Pozzi M. Grandi S. Morrone I. Silvestri A. Congiu Castellano Eur. Biophys. J. 2010 39 929 934
106. S. M. Ali F. Bonnier K. Ptasinski H. Lambkin K. Flynn F. M. Lyng H. J. Byrne Analyst 2013 138 3946 3956
107. E. Lipiec K. R. Bambery P. Heraud C. Hirschmugl J. Lekki W. M. Kwiatek M. J. Tobin C. Vogel D. Whelan B. R. Wood J. Mol. Struct. 2014 1073 134 141
108. E. Lipiec K. R. Bambery J. Lekki M. J. Tobin C. Vogel D. R. Whelan B. R. Wood W. M. Kwiatek Radiat. Res. 2015 184 73 82
109. N. Gault J. L. Poncy J. L. Lefaix Can. J. Physiol. Pharmacol. 2004 82 38 49
110. N. Gault J. L. Lefaix Radiat. Res. 2003 160 238 250
111. N. Gault O. Rigaud J. L. Poncy J. L. Lefaix Int. J. Radiat. Biol. 2005 81 767 779
112. N. Gault O. Rigaud J.-L. Poncy J.-L. Lefaix Radiat. Res. 2007 167 551 562
113. E. Benedetti E. Bramanti F. Papineschi I. Rossi E. Benedetti Appl. Spectrosc. 1997 51 792 797
114. H. Susi J. C. Ard Spectrochim. Acta 1971 276 1549 1582
115. T. Sato Y. Kyogoku S. Higuchi Y. Mitsui Y. Iitaka M. Tsuboi K. I. Miura J. Mol. Biol. 1966 16 180 190
116. M. Tsuboi K. Matsuo T. Shimanouchi Y. Kyogoku Spectrochim. Acta 1963 19 1617 1618
117. A. Pevsner M. Diem Biopolymers 2003 72 282 289
118. B. R. Wood B. Tait D. McNaughton Appl. Spectrosc. 2000 54 353 359
119. B. R. Wood B. Tait D. McNaughton Hum. Immunol. 2000 61 1307 1314
120. H. H. Mantsch M. Jackson J. Mol. Struct. 1995 347 187 206
121. G. Bellisola C. Sorio Am. J. Cancer Res. 2012 2 1 21
122. K. Malek, B. R. Wood and K. R. Bambery, in Optical Spectroscopy and Computational Methods in Biology and Medicine, ed., M. Baranska, Springer, 2014, pp. 419-473
123. D. McNaughton and B. R. Wood, in New Approaches in Biomedical Spectroscopy, ed., H. Kneipp, and, E. Wentrup-Byrne, ACS Books, USA, 2007, pp. 14-29
124. E. Benedetti F. Papineschi P. Vergamini R. Consolini G. Spremolla Leuk. Res. 1984 8 483 489
125. E. Benedetti M. P. Palatresi P. Vergamini F. Papineschi M. C. Andreucci G. Spremolla Appl. Spectrosc. 1986 40 39 43
126. P. T. Wong E. D. Papavassiliou B. Rigas Appl. Spectrosc. 1991 45 1563 1567
127. B. R. Wood M. A. Quinn B. Tait M. Ashdown T. Hislop M. Romeo D. McNaughton Biospectroscopy 1998 4 75 91
128. M. J. Romeo B. R. Wood M. A. Quinn D. McNaughton Biopolymers 2003 72 69 76
129. L. Chiriboga P. Xie H. Yee V. Vigorita D. Zarou D. Zakim M. Diem Biospectroscopy 1998 4 47 53
130. M. J. Romeo B. R. Wood D. McNaughton Vib. Spectrosc. 2002 28 167 175
131. B. R. Wood M. A. Quinn F. R. Burden D. McNaughton Biospectroscopy 1996 2 143 153
132. B. R. Wood L. Chiriboga H. Yee M. A. Quinn D. McNaughton M. Diem Gynecol. Oncol. 2004 93 59 68
133. M. Jackson L. P. Choo P. H. Watson W. C. Halliday H. H. Mantsch Biochim. Biophys. Acta 1995 1270 1 6
134. M. Diem S. Boydston-White L. Chiriboga Appl. Spectrosc. 1999 53 148A 161A
135. M. Diem M. Romeo S. Boydston-White M. Miljkovic C. Matthaus Analyst 2004 129 880 885
136. B. Mohlenhoff M. Romeo M. Diem B. R. Wood Biophys. J. 2005 88 3635 3640
137. C. Lengauer K. W. Kinzler B. Vogelstein Nature 1998 396 643 649
138. B. R. Wood, K. R. Bambery, P. Heraud and D. McNaughton, in FT-IR Spectroscopy in Microbiological and Medical Diagnostics, ed., D. Naumann, and, P. Lasch, Robert Koch Institute, Berlin, 2009
139. D. R. Whelan K. R. Bambery L. Puskar D. McNaughton B. R. Wood Analyst 2013 138 3891 3899
140. D. R. Whelan K. R. Bambery L. Puskar D. McNaughton B. R. Wood J. Biophotonics 2013 6 775 784
141. H. Zentgraf D. Duemling W. W. Franke Exp. Cell Res. 1969 56 333 340
142. Z. Nie F. Cui Y. K. Tzeng H. C. Chang M. Chu H. C. Lin C. H. Chen H. H. Lin A. L. Yu Anal. Chem. 2007 79 7401 7407
143. C. Hughes M. D. Brown F. J. Ball G. Monjardez N. W. Clarke K. R. Flower P. Gardner Analyst 2012 137 5736 5742
144. D. E. Bedolla S. Kenig E. Mitri P. Ferraris A. Marcello G. Grenci L. Vaccari Analyst 2013 138 4015 4021
145. S. Boydston-White T. Gopen S. Houser J. Bargonetti M. Diem Biospectroscopy 1999 5 219 227
146. A. Derenne A. Mignolet E. Goormaghtigh Analyst 2013 138 3998 4005
147. H. Y. Holman M. C. Martin E. A. Blakely K. Bjornstad W. R. McKinney Biopolymers 2000 57 329 335
148. M. Jimenez-Hernandez M. D. Brown C. Hughes N. W. Clarke P. Gardner Analyst 2015 140 4453 4464
149. M. Jimenez-Hernandez C. Hughes P. Bassan F. Ball M. D. Brown N. W. Clarke P. Gardner Analyst 2013 138 3957 3966
150. F. Q. Zhang J. Qi Z. G. Yang Guangpuxue Yu Guangpu Fenxi 2011 31 2076 2080
151. S. Boydston-White M. Romeo T. Chernenko A. Regina M. Miljkovic M. Diem Biochim. Biophys. Acta 2006 1758 908 914
152. P. L. Fale A. Altharawi K. L. Chan Biochim. Biophys. Acta 2015 1853 2640 2648
153. P. Bassan A. Sachdeva A. Kohler C. Hughes A. Henderson J. Boyle J. H. Shanks M. Brown N. W. Clarke P. Gardner Analyst 2012 137 1370 1377