Determination of DNA adenine methylation in genomes of mammals and plants by liquid chromatography/mass spectrometry

RSC Advances

Volumn 5, Issue 79, 2015, Pages 64046-64054

  Huang, Wei ^a   Xiong, Jun ^a   Yang, Ying ^b   Liu, Song Mei ^b   Yuan, Bi Feng ^a   Feng, Yu Qi ^a  

^a WUHAN UNIVERSITY   (China)

^b ZHONGNAN HOSPITAL OF WUHAN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALKYLATION; DNA; GENES; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MAMMALS; MASS SPECTROMETRY; METHYLATION; SPECTROMETRY; TRANSCRIPTION;

BIOLOGICAL PROCESS; CONTROL SUBJECT; DNA REPLICATIONS; GENE TRANSCRIPTIONS; HIGH RESOLUTION MASS SPECTROMETRY; LIQUID CHROMATOGRAPHY/MASS SPECTROMETRY; RESTRICTION-MODIFICATION SYSTEMS; TYPE 2 DIABETES MELLITUS;

NUCLEIC ACIDS;

EID: 84938578708     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5ra05307b     Document Type: Article

References (43)

1. D. Ratel J. L. Ravanat F. Berger D. Wion BioEssays 2006 28 309 315
2. G. Bertani J. J. Weigle J. Bacteriol. 1953 65 113 121
3. S. E. Luria M. L. Human J. Bacteriol. 1952 64 557 569
4. T. Oshima C. Wada Y. Kawagoe T. Ara M. Maeda Y. Masuda S. Hiraga H. Mori Mol. Microbiol. 2002 45 673 695
5. F. Barras M. G. Marinus Trends Genet. 1989 5 139 143
6. E. Boye A. Lobner-Olesen Cell 1990 62 981 989
7. D. W. Russell N. D. Zinder Cell 1987 50 1071 1079
8. M. G. Marinus A. Poteete J. A. Arraj Gene 1984 28 123 125
9. S. Hattman C. Kenny L. Berger K. Pratt J. Bacteriol. 1978 135 1156 1157
10. E. E. Capowski J. M. Wells G. S. Harrison K. M. Karrer Mol. Cell. Biol. 1989 9 2598 2605
11. S. Hattman Biochemistry 2005 70 550 558
12. C. W. Achwal C. A. Iyer H. S. Chandra FEBS Lett. 1983 158 353 358
13. Y. Fu G. Z. Luo K. Chen X. Deng M. Yu D. Han Z. Hao J. Liu X. Lu L. C. Dore X. Weng Q. Ji L. Mets C. He Cell 2015 161 879 892
14. G. Zhang H. Huang D. Liu Y. Cheng X. Liu W. Zhang R. Yin D. Zhang P. Zhang J. Liu C. Li B. Liu Y. Luo Y. Zhu N. Zhang S. He C. He H. Wang D. Chen Cell 2015 161 893 906
15. E. L. Greer M. A. Blanco L. Gu E. Sendinc J. Liu D. Aristizabal-Corrales C. H. Hsu L. Aravind C. He Y. Shi Cell 2015 161 868 878
16. G. Egger G. Liang A. Aparicio P. A. Jones Nature 2004 429 457 463
17. B. F. Yuan Adv. Clin. Chem. 2014 67 151 187
18. Y. Tang X. D. Gao Y. Wang B. F. Yuan Y. Q. Feng Anal. Chem. 2012 84 7249 7255
19. B. F. Yuan Y. Q. Feng TrAC, Trends Anal. Chem. 2014 54 24 35
20. A. Rottach H. Leonhardt F. Spada J. Cell. Biochem. 2009 108 43 51
21. P. D. Lawley A. R. Crathorn S. A. Shah B. A. Smith Biochem. J. 1972 128 133 138
22. B. F. Vanyushin S. G. Tkacheva A. N. Belozersky Nature 1970 225 948 949
23. A. M. Krais M. G. Cornelius H. H. Schmeiser Electrophoresis 2010 31 3548 3551
24. M. Munzel D. Globisch T. Carell Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2011 50 6460 6468
25. M. R. Branco G. Ficz W. Reik Nat. Rev. Genet. 2012 13 7 13
26. G. Jia Y. Fu C. He Trends Genet. 2013 29 108 115
27. C. M. Wei A. Gershowitz B. Moss Cell 1975 4 379 386
28. R. Desrosiers K. Friderici F. Rottman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1974 71 3971 3975
29. K. D. Meyer Y. Saletore P. Zumbo O. Elemento C. E. Mason S. R. Jaffrey Cell 2012 149 1635 1646
30. D. Dominissini S. Moshitch-Moshkovitz S. Schwartz M. Salmon-Divon L. Ungar S. Osenberg K. Cesarkas J. Jacob-Hirsch N. Amariglio M. Kupiec R. Sorek G. Rechavi Nature 2012 485 201 206
31. J. M. Fustin M. Doi Y. Yamaguchi H. Hida S. Nishimura M. Yoshida T. Isagawa M. S. Morioka H. Kakeya I. Manabe H. Okamura Cell 2013 155 793 806
32. S. Schwartz S. D. Agarwala M. R. Mumbach M. Jovanovic P. Mertins A. Shishkin Y. Tabach T. S. Mikkelsen R. Satija G. Ruvkun S. A. Carr E. S. Lander G. R. Fink A. Regev Cell 2013 155 1409 1421
33. Y. Fu D. Dominissini G. Rechavi C. He Nat. Rev. Genet. 2014 15 293 306
34. X. Wang Z. Lu A. Gomez G. C. Hon Y. Yue D. Han Y. Fu M. Parisien Q. Dai G. Jia B. Ren T. Pan C. He Nature 2014 505 117 120
35. F. Shen W. Huang J. T. Huang J. Xiong Y. Yang K. Wu G. F. Jia J. Chen Y. Q. Feng B. F. Yuan S. M. Liu J. Clin. Endocrinol. Metab. 2015 100 E148 E154
36. Y. Tang J. M. Chu W. Huang J. Xiong X. W. Xing X. Zhou Y. Q. Feng B. F. Yuan Anal. Chem. 2013 85 6129 6135
37. X. W. Xing Y. L. Liu M. Vargas Y. Wang Y. Q. Feng X. Zhou B. F. Yuan PLoS One 2013 8 e72993
38. Y. Tang J. Xiong H. P. Jiang S. J. Zheng Y. Q. Feng B. F. Yuan Anal. Chem. 2014 86 7764 7772
39. G. Jia Y. Fu X. Zhao Q. Dai G. Zheng Y. Yang C. Yi T. Lindahl T. Pan Y. G. Yang C. He Nat. Chem. Biol. 2011 7 885 887
40. M. L. Chen F. Shen W. Huang J. H. Qi Y. Wang Y. Q. Feng S. M. Liu B. F. Yuan Clin. Chem. 2013 59 824 832
41. X. T. Peng, B. F. Yuan and Y. Q. Feng, J. Sep. Sci., 2011, 34, 3123 3130
42. P. Liu X.-H. Yang Q. Wang J. Huang J.-B. Liu Y. Zhu L.-L. He K.-M. Wang Chin. Chem. Lett. 2014 25 1047 1051
43. X. W. Xing F. Tang J. Wu J. M. Chu Y. Q. Feng X. Zhou B. F. Yuan Anal. Chem. 2014 86 11269 11274