An 'all pigment' model of excitation quenching in LHCII

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 17, Issue 24, 2015, Pages 15857-15867

  Chmeliov, Jevgenij ^a,b   Bricker, William P ^c   Lo, Cynthia ^c   Jouin, Elodie ^d   Valkunas, Leonas ^a,b   Ruban, Alexander V ^d   Duffy, Christopher D P ^d  

^a VILNIUS UNIVERSITY   (Lithuania)

^b CENTER FOR PHYSICAL SCIENCES AND TECHNOLOGY   (Lithuania)

^c WASHINGTON UNIVERSITY IN ST LOUIS   (United States)

^d QUEEN MARY UNIVERSITY OF LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PHOTOSYSTEM II;

CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ENERGY TRANSFER; METABOLISM; PHOTOSYSTEM II; QUANTUM THEORY;

ENERGY TRANSFER; MODELS, MOLECULAR; PHOTOSYSTEM II PROTEIN COMPLEX; QUANTUM THEORY;

EID: 84935919687     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5cp01905b     Document Type: Article

References (62)

1. R. E. Blankenship, Molecular Mechanisms of Photosynthesis, Blackwell Science, Oxford, 2002, p. 321
2. H. van Amerongen, L. Valkunas and R. van Grondelle, Photosynthetic Excitons, World Scientific, Singapore, 2000, p. 590
3. R. Croce H. van Amerongen J. Photochem. Photobiol., B 2011 104 142 153
4. G. D. Scholes G. R. Fleming A. Olaya-Castro R. van Grondelle Nat. Chem. 2011 3 763 774
5. R. Croce H. van Amerongen Photosynth. Res. 2013 116 153 166
6. H. van Amerongen R. Croce Photosynth. Res. 2013 116 251 263
7. C. D. P. Duffy L. Valkunas A. V. Ruban Phys. Chem. Chem. Phys. 2013 15 18752 18770
8. R. Croce H. van Amerongen Nat. Chem. Biol. 2014 10 492 501
9. A. V. Ruban M. P. Johnson C. D. P. Duffy Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2012 1817 167 181
10. A. O. Goushcha V. N. Kharkyanen G. W. Scott A. R. Holzwarth Biophys. J. 2000 79 1237 1252
11. A. O. Goushcha A. J. Manzo G. W. Scott L. N. Christophorov P. P. Knox Y. M. Barabash M. T. Kapoustina N. M. Berezetska V. N. Kharkyanen Biophys. J. 2003 84 1146 1160
12. E. Wientjes H. van Amerongen R. Croce J. Phys. Chem. B 2013 117 11200 11208
13. E. Wientjes H. van Amerongen R. Croce Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2013 1827 420 426
14. E. Belgio E. Kapitonova J. Chmeliov C. D. P. Duffy P. Ungerer L. Valkunas A. V. Ruban Nat. Commun. 2014 5 4433
15. N. E. Holt D. Zigmantas L. Valkunas X. P. Li K. K. Niyogi G. R. Fleming Science 2005 307 433 436
16. A. A. Pascal Z. F. Liu K. Broess B. van Oort H. van Amerongen C. Wang P. Horton B. Robert W. R. Chang A. Ruban Nature 2005 436 134 137
17. A. V. Ruban R. Berera C. Ilioaia I. H. M. van Stokkum J. T. M. Kennis A. A. Pascal H. van Amerongen B. Robert P. Horton R. van Grondelle Nature 2007 450 575 578
18. T. K. Ahn T. J. Avenson M. Ballottari Y. C. Cheng K. K. Niyogi R. Bassi G. R. Fleming Science 2008 320 794 797
19. M. G. Müller P. Lambrev M. Reus E. Wientjes R. Croce A. R. Holzwarth ChemPhysChem 2010 11 1289 1296
20. P. Jahns D. Latowski K. Strzalka Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2009 1787 3 14
21. H. A. Frank A. Cua V. Chynwat A. Young D. Gosztola M. R. Wasielewski Photosynth. Res. 1994 41 389 395
22. Y.-Z. Ma N. E. Holt X.-P. Li K. K. Niyogi G. R. Fleming Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 4377 4382
23. S. Bode C. C. Quentmeier P.-N. Liao N. Hafi T. Barros L. Wilk F. Bittner P. J. Walla Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 12311 12316
24. H. Staleva J. Komenda M. K. Shukla V. Šlouf R. Kaňa T. Polívka R. Sobotka Nat. Chem. Biol. 2015 11 287 291
25. Z. F. Liu H. C. Yan K. B. Wang T. Y. Kuang J. P. Zhang L. L. Gui X. M. An W. R. Chang Nature 2004 428 287 292
26. X. Pan M. Li T. Wan L. Wang C. Jia Z. Hou X. Zhao J. Zhang W. Chang Nat. Struct. Mol. Biol. 2011 18 309 315
27. Y. Umena K. Kawakami J.-R. Shen N. Kamiya Nature 2011 473 55 60
28. V. I. Novoderezhkin M. A. Palacios H. van Amerongen R. van Grondelle J. Phys. Chem. B 2005 109 10493 10504
29. V. Novoderezhkin A. Marin R. van Grondelle Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 17093 17103
30. F. Müh M. E.-A. Madjet T. Renger J. Phys. Chem. B 2010 114 13517 13535
31. F. Müh M. E.-A. Madjet T. Renger Photosynth. Res. 2012 111 87 101
32. C. D. P. Duffy J. Chmeliov M. Macernis J. Sulskus L. Valkunas A. V. Ruban J. Phys. Chem. B 2013 117 10974 10986
33. A. Dreuw P. H. P. Harbach J. M. Mewes M. Wormit Theor. Chem. Acc. 2010 125 419 426
34. T. Yanai D. P. Tew N. C. Handy Chem. Phys. Lett. 2004 393 51 57
35. P. C. Hariharan J. A. Pople Theor. Chim. Acta 1973 28 213 222
36. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski and D. J. Fox, Gaussian 09, Revision D.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009
37. M. J. S. Dewar W. Thiel J. Am. Chem. Soc. 1977 99 4899 4907
38. J. J. P. Stewart, MOPAC2006, 2008
39. M. Macernis J. Sulskus C. D. P. Duffy A. V. Ruban L. Valkunas J. Phys. Chem. A 2012 116 9843 9853
40. T. Förster Ann. Phys. 1948 437 55 75
41. T. Förster Discuss. Faraday Soc. 1959 27 7 17
42. M. Sener J. Strümpfer J. Hsin D. Chandler S. Scheuring C. N. Hunter K. Schulten ChemPhysChem 2011 12 518 531
43. B. P. Krueger G. D. Scholes G. R. Fleming J. Phys. Chem. B 1998 102 5378 5386
44. W. P. Bricker C. S. Lo J. Phys. Chem. B 2014 118 9141 9154
45. A. Ishizaki T. R. Calhoun G. S. Schlau-Cohen G. R. Fleming Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 7319 7337
46. L. Valkunas S. Kudzmauskas G. Juzeliunas Sov. Phys.-Coll. 1985 25 41 47
47. G. D. Scholes X. J. Jordanides G. R. Fleming J. Phys. Chem. B 2001 105 1640 1651
48. P. J. Walla P. A. Linden K. Ohta G. R. Fleming J. Phys. Chem. A 2002 106 1909 1916
49. T. Renger R. Marcus J. Chem. Phys. 2002 116 9997 10019
50. D. I. G. Bennett K. Amarnath G. R. Fleming J. Am. Chem. Soc. 2013 135 9164 9173
51. M. Yang G. R. Fleming J. Chem. Phys. 2003 119 5614 5622
52. G. Raszewski T. Renger J. Am. Chem. Soc. 2008 130 4431 4446
53. F. Müh T. Renger A. Zouni Plant Physiol. Biochem. 2008 46 238 264
54. R. S. Knox B. Q. Spring Photochem. Photobiol. 2003 77 497 501
55. T. Polívka J. L. Herek D. Zigmantas H. E. Akerlund V. Sundström Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 4914 4917
56. H. C. Yan P. F. Zhang C. Wang Z. F. Liu W. R. Chang Biochem. Biophys. Res. Commun. 2007 355 457 463
57. E. J. Peterman C. C. Gradinaru F. Calkoen J. C. Borst R. van Grondelle H. van Amerongen Biochemistry 1997 36 12208 12215
58. S. Caffarri R. Croce J. Breton R. Bassi J. Biol. Chem. 2001 276 35924 35933
59. C. D. P. Duffy L. Valkunas A. V. Ruban J. Phys. Chem. B 2013 117 7605 7614
60. M. Wahadoszamen R. Berera A. M. Ara E. Romero R. van Grondelle Phys. Chem. Chem. Phys. 2012 14 759 766
61. P.-N. Liao C.-P. Holleboom L. Wilk W. Kühlbrandt P. J. Walla J. Phys. Chem. B 2010 114 15650 15655
62. G. S. Schlau-Cohen H.-Y. Yang T. P. J. Krüger P. Xu M. Gwizdala R. van Grondelle R. Croce W. E. Moerner J. Phys. Chem. Lett. 2015 6 860 867