Infrared imaging of MDA-MB-231 breast cancer cell line phenotypes in 2D and 3D cultures

Analyst

Volumn 140, Issue 7, 2015, Pages 2336-2343

  Smolina, Margarita ^a   Goormaghtigh, Erik ^a  

^a UNIVERSITÉ LIBRE DE BRUXELLES   (Belgium)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BREAST TUMOR; CELL PROLIFERATION; FLUORESCENCE IMAGING; HUMAN; INFRARED RADIATION; PATHOLOGY; PHENOTYPE; TUMOR CELL LINE;

BREAST NEOPLASMS; CELL LINE, TUMOR; CELL PROLIFERATION; HUMANS; INFRARED RAYS; OPTICAL IMAGING; PHENOTYPE;

EID: 84925336715     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4an01833h     Document Type: Article

References (61)

1. T. Sorlie R. Tibshirani J. Parker T. Hastie J. S. Marron A. Nobel S. Deng H. Johnsen R. Pesich S. Geisler J. Demeter C. M. Perou P. E. Lonning P. O. Brown A. L. Borresen-Dale D. Botstein Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 8418 8423
2. C. Sotiriou S. Y. Neo L. M. McShane E. L. Korn P. M. Long A. Jazaeri P. Martiat S. B. Fox A. L. Harris E. T. Liu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 10393 10398
3. L. M. Shi G. Campbell W. D. Jones F. Campagne Z. N. Wen S. J. Walker Z. Q. Su T. M. Chu F. M. Goodsaid L. Pusztai J. D. Shaughnessy A. Oberthuer R. S. Thomas R. S. Paules M. Fielden B. Barlogie W. J. Chen P. Du M. Fischer C. Furlanello B. D. Gallas X. J. Ge D. B. Megherbi W. F. Symmans M. D. Wang J. L. Zhang H. Bitter B. Brors P. R. Bushel M. Bylesjo M. J. Chen J. Cheng J. Chou T. S. Davison M. Delorenzi Y. P. Deng V. Devanarayan D. J. Dix J. Dopazo K. C. Dorff F. Elloumi J. Q. Fan S. C. Fan X. H. Fan H. Fang N. Gonzaludo K. R. Hess H. X. Hong J. Huan R. A. Irizarry R. Judson D. Juraeva S. Lababidi C. G. Lambert L. Li Y. E. Li Z. G. Li S. M. Lin G. Z. Liu E. K. Lobenhofer J. Luo W. Luo M. N. Mccall Y. Nikolsky G. A. Pennello R. G. Perkins R. Philip V. Popovici N. D. Price F. Qian A. Scherer T. L. Shi W. W. Shi J. Y. Sung D. Thierry-Mieg J. Thierry-Mieg V. Thodima J. Trygg L. Vishnuvajjala S. J. Wang J. P. Wu Y. C. Wu Q. A. Xie W. A. Yousef L. A. Zhang X. G. Zhang S. Zhong Y. M. Zhou S. Zhu D. Arasappan W. J. Bao A. B. Lucas F. Berthold R. J. Brennan A. Buness J. G. Catalano C. Chang R. Chen Y. Y. Cheng J. A. Cui W. Czika F. Demichelis X. T. Deng D. Dosymbekov R. Eils Y. Feng J. Fostel S. Fulmer-Smentek J. C. Fuscoe L. Gatto W. G. Ge D. R. Goldstein L. Guo D. N. Halbert J. Han S. C. Harris C. Hatzis D. Herman J. P. Huang R. V. Jensen R. Jiang C. D. Johnson G. Jurman Y. Kahlert S. A. Khuder M. Kohl J. Y. Li M. L. Li Q. Z. Li S. Li J. Liu Y. Liu Z. C. Liu L. Meng M. Madera F. Martinez-Murillo I. Medina J. Meehan K. Miclaus R. A. Moffitt D. Montaner P. Mukherjee G. J. Mulligan P. Neville T. Nikolskaya B. T. Ning G. P. Page J. Parker R. M. Parry X. J. Peng R. L. Peterson J. H. Phan B. Quanz Y. Ren S. Riccadonna A. H. Roter F. W. Samuelson M. M. Schumacher J. D. Shambaugh Q. A. Shi R. Shippy S. Z. Si A. Smalter C. Sotiriou M. Soukup F. Staedtler G. Steiner T. H. Stokes Q. L. Sun P. Y. Tan R. Tang Z. Tezak B. Thorn M. Tsyganova Y. Turpaz S. C. Vega R. Visintainer J. von Frese C. Wang E. Wang J. W. Wang W. Wang F. Westermann J. C. Willey M. Woods S. J. Wu N. Q. Xiao J. Xu L. Xu L. Yang X. A. Zeng M. Zhang C. Zhao R. K. Puri U. Scherf W. D. Tong R. D. Wolfinger Nat. Biotechnol. 2010 28 S5 S16
4. P. K. Tan T. J. Downey E. L. Spitznagel P. Xu D. Fu D. S. Dimitrov R. A. Lempicki B. M. Raaka M. C. Cam Nucleic Acids Res. 2003 31 5676 5684
5. J. E. Larkin B. C. Frank H. Gavras R. Sultana J. Quackenbush Nat. Methods 2005 2 337 343
6. P. L. Bedard M. Ignatiadis B. Haibe-Kains S. Loi C. Criscitiello C. Desmedt G. Bontempi M. J. Piccart C. Sotiriou Cancer Res. 2009 69 507S 507S
7. P. L. Bedard C. Sotiriou EMBO Mol. Med. 2010 2 3 5
8. A. Derenne, T. Claessens, C. Conus and E. Goormaghtigh, in Encyclopedia of Biophysics, 2013, pp. 1074-1081
9. A. Derenne O. Vandersleyen E. Goormaghtigh Biochim. Biophys. Acta 2014 1841 1200 1209
10. M. Diem L. Chiriboga P. Lasch A. Pacifico Biopolymers 2002 67 349 353
11. A. Pevsner M. Diem Appl. Spectrosc. 2001 55 1502 1505
12. S. Boydston-White T. Chernenko A. Regina M. Miljkovic C. Matthaus M. Diem Vib. Spectrosc. 2005 38 169 177
13. E. Kleiren J. M. Ruysschaert E. Goormaghtigh V. Raussens Spectrosc. Int. J. 2010 24 61 66
14. H. H. de Jongh E. Goormaghtigh J. M. Ruysschaert H. H. de-Jongh Biochemistry 1997 36 13603 13610
15. E. Goormaghtigh V. Cabiaux J. M. Ruysschaert Subcell. Biochem. 1994 23 405 450
16. E. Goormaghtigh R. Gasper A. Benard A. Goldsztein V. Raussens Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2009 1794 1332 1343
17. E. Goormaghtigh J. M. Ruysschaert V. Raussens Biophys. J. 2006 90 2946 2957
18. G. Bellisola C. Sorio Am. J. Cancer Res. 2012 2 1 21
19. R. Bhargava Anal. Bioanal. Chem. 2007 389 1155 1169
20. P. Lasch M. Diem W. Hänsch D. Naumann J. Chemom. 2007 20 209 220
21. P. Lasch L. Chiriboga H. Yee M. Diem Technol. Cancer Res. Treat. 2002 1 1 7
22. G. J. Ooi J. Fox K. Siu R. Lewis K. R. Bambery D. McNaughton B. R. Wood Med. Phys. 2008 35 2151 2161
23. B. Bird M. Romeo N. Laver M. Diem J. Biophotonics 2009 2 37 46
24. M. J. Walsh A. Kajdacsy-Balla S. E. Holton R. Bhargava Vib. Spectrosc. 2012 60 23 28
25. A. Benard C. Desmedt M. Smolina P. Szternfeld M. Verdonck G. Rouas N. Kheddoumi F. Rothé D. Larsimont C. Sotiriou E. Goormaghtigh Analyst 2014 139 1044 1056
26. N. Navin J. Kendall J. Troge P. Andrews L. Rodgers J. McIndoo K. Cook A. Stepansky D. Levy D. Esposito L. Muthuswamy A. Krasnitz W. R. McCombie J. Hicks M. Wigler Nature 2011 472 90 94
27. C. Giesen H. A. O. Wang D. Schapiro N. Zivanovic A. Jacobs B. Hattendorf P. J. Schüffler D. Grolimund J. M. Buhmann S. Brandt Z. Varga P. J. Wild D. Günther B. Bodenmiller Nat. Methods 2014 11 417 422
28. R. M. Neve K. Chin J. Fridlyand J. Yeh F. L. Baehner T. Fevr L. Clark N. Bayani J.-P. Coppe F. Tong T. Speed P. T. Spellman S. DeVries A. Lapuk N. J. Wang W.-L. Kuo J. L. Stilwell D. Pinkel D. G. Albertson F. M. Waldman F. McCormick R. B. Dickson M. D. Johnson M. Lippman S. Ethier A. Gazdar J. W. Gray Cancer Cell 2006 10 515 527
29. D. L. Holliday V. Speirs Breast Cancer Res. 2011 13 215
30. T. Vargo-Gogola J. M. Rosen Nat. Rev. Cancer 2007 7 659 672
31. M. J. Bissell D. C. Radisky A. Rizki V. M. Weaver O. W. Petersen Differentiation 2002 70 537 546
32. M. J. Bissell P. A. Kenny D. C. Radisky Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 2005 70 343 356
33. G. Y. Lee P. A. Kenny E. H. Lee M. J. Bissell Nat. Methods 2007 4 359 365
34. J. Han H. Chang O. Giricz G. Y. Lee F. L. Baehner J. W. Gray M. J. Bissell P. A. Kenny B. Parvin PLoS Comput. Biol. 2010 6
35. P. A. Kenny G. Y. Lee C. A. Myers R. M. Neve J. R. Semeiks P. T. Spellman K. Lorenz E. H. Lee M. H. Barcellos-Hoff O. W. Petersen J. W. Gray M. J. Bissell Mol. Oncol. 2007 1 84 96
36. K. J. Martin D. R. Patrick M. J. Bissell M. V. Fournier PLoS One 2008 3
37. H. K. Kleinman G. R. Martin Semin. Cancer Biol. 2005 15 378 386
38. E. Goormaghtigh J. M. Ruysschaert Spectrochim. Acta, Part A 1994 50 2137 2144
39. E. Goormaghtigh, in Adv. Biomed. Spectrosc. (Biological and Biomedical Infrared Spectroscopy), ed., A. Barth, and, P. I. Haris, IOS Press, 2009, pp. 104-128
40. P. Bassan A. Kohler H. Martens J. Lee E. Jackson N. Lockyer P. Dumas M. Brown N. Clarke P. Gardner J. Biophotonics 2010 3 609 620
41. P. Bassan A. Sachdeva A. Kohler C. Hughes A. Henderson J. Boyle J. H. Shanks M. Brown N. W. Clarke P. Gardner Analyst 2012 137 1370 1377
42. B. Bird M. Miljković M. Diem J. Biophotonics 2010 3 597 608
43. K. R. Bambery B. R. Wood D. McNaughton Analyst 2012 137 126 132
44. A. Dazzi A. Deniset-Besseau P. Lasch Analyst 2013 138 4191 4201
45. A. Gaigneaux J. M. Ruysschaert E. Goormaghtigh Appl. Spectrosc. 2006 60 1022 1028
46. M. Verdonck, N. Wald, J. Janssis, P. Yan, C. Meyer, A. Legat, D. E. Speiser, C. Desmedt, D. Larsimont, C. Sotiriou and E. Goormaghtigh, Breast cancer and melanoma cell line identification by FTIR imaging after formalin-fixation and paraffin-embedding, 2013, vol. 138
47. R. Katz-Brull D. Seger D. Rivenson-Segal E. Rushkin H. Degani Cancer Res. 2002 62 1966 1970
48. H. Yamaguchi T. Oikawa Oncotarget 2010 1 320 328
49. R. Gasper E. Goormaghtigh Analyst 2010 135 3048 3051
50. A. Derenne A. Mignolet E. Goormaghtigh Analyst 2013 138 3998 4005
51. P. Lasch D. Naumann Biochim. Biophys. Acta 2006 1758 814 829
52. E. C. Mattson M. J. Nasse M. Rak K. M. Gough C. J. Hirschmugl Anal. Chem. 2012 84 6173 6180
53. J. M. Nam Y. Onodera M. J. Bissell C. C. Park Cancer Res. 2010 70 5238 5248
54. N. Garamszegi S. P. Garamszegi L. A. Shehadeh S. P. Scully Mol. Cancer Res. 2009 7 319 329
55. S. E. Holton A. Bergamaschi B. S. Katzenellenbogen R. Bhargava PLoS One 2014 9 e96878
56. Z. I. Khamis Z. J. Sahab Q.-X. A. Sang Int. J. Breast Cancer 2012 2012 574025
57. S. E. Holton M. J. Walsh A. Kajdacsy-Balla R. Bhargava Biophys. J. 2011 101 1513 1521
58. M. H. Barcellos-Hoff D. Medina Breast Cancer Res. 2005 7 33 36
59. N. A. Bhowmick E. G. Neilson H. L. Moses Nature 2004 432 332 337
60. W. H. Fridman J. Galon F. Pagès E. Tartour C. Sautès-Fridman G. Kroemer Cancer Res. 2011 71 5601 5605
61. D. Liao Y. Luo D. Markowitz R. Xiang R. A. Reisfeld PLoS One 2009 4 e7965