Principal factors that determine the extension of detection range in molecular beacon aptamer/conjugated polyelectrolyte bioassays

Chemical Science

Volumn 6, Issue 3, 2015, Pages 1887-1894

  Jeong, Ji Eun ^a   Kim, Boram ^a   Woo, Shinjae ^a   Hwang, Sungu ^a   Bazan, Guillermo C ^b   Woo, Han Young ^a  

^a Pusan National University   (South Korea)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENOSINETRIPHOSPHATE; BINDING ENERGY; BIOASSAY; ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE; FLUOROPHORES; HYDROPHOBICITY; POLYELECTROLYTES;

APTAMER SEQUENCES; CHEMICAL AND BIOLOGICALS; CONJUGATED POLYELECTROLYTES; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; HYDROPHOBIC INTERACTIONS; LIMIT OF DETECTION; NANOMOLAR CONCENTRATION; PRINCIPAL FACTORS;

SIGNAL DETECTION;

EID: 84923207018     PISSN: 20416520     EISSN: 20416539     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4sc03258f     Document Type: Article

References (53)

1. A. Herland O. Inganäs Macromol. Rapid Commun. 2007 28 11
2. S. W. Thomas III G. D. Joly T. M. Swager Chem. Rev. 2007 107 48
3. J. Liang K. Li B. Liu Chem. Sci. 2013 4 18
4. A. Duarte K.-Y. Pu B. Liu G. C. Bazan Chem. Mater. 2011 23 15
5. H. Jiang P. Taranekar J. R. Reynolds K. S. Schanze Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 17
6. F. Feng L. Liu S. Wang Nat. Protoc. 2010 5 10
7. D. T. McQuade A. E. Pullen T. M. Swager Chem. Rev. 2000 100 38
8. B. S. Gaylord M. R. Massie S. C. Feinstein G. C. Bazan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 6
9. B. S. Gaylord A. J. Heeger G. C. Bazan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 4
10. K. Lee L. K. Povlich J. Kim Adv. Funct. Mater. 2007 17 8
11. C. A. Traina R. C. Bakus II G. C. Bazan J. Am. Chem. Soc. 2011 133 8
12. K. Lee J. Lee E. J. Jeong A. Kronk K. S. J. Elenitoba-Johnson M. S. Lim J. Kim Adv. Mater. 2012 24 2479
13. F. Wang Z. Liu B. Wang L. Feng L. Liu F. Lv Y. Wang S. Wang Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 1
14. X. Feng F. Lv L. Liu Q. Yang S. Wang G. C. Bazan Adv. Mater. 2012 24 5428
15. Y. C. Shin J. H. Lee J.-E. Jeong B. Kim E. J. Lee O. S. Jin T. G. Jung J. J. Lee H. Y. Woo D.-W. Han Biotechnol. Appl. Biochem. 2013 60 580
16. V. S. Le B. Kim W. Lee J.-E. Jeong R. Yang H. Y. Woo Macromol. Rapid Commun. 2013 34 772
17. B. L. Nguyen J.-E. Jeong I. H. Jung B. Kim V. S. Le I. Kim K. Kyhm H. Y. Woo Adv. Funct. Mater. 2014 24 1748
18. Q. Zhou T. M. Swager J. Am. Chem. Soc. 1995 117 2
19. T. M. Swager Acc. Chem. Res. 1998 31 201
20. A. Tsourkas M. A. Behlke S. D. Rose G. Bao Nucleic Acids Res. 2003 31 1319
21. A. Vallée-Bélisle F. Ricci K. W. Plaxco Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 13802
22. A. Vallée-Bélisle F. Ricci K. W. Plaxco J. Am. Chem. Soc. 2012 134 2876
23. D. Kang A. Vallée-Bélisle A. Porchetta K. W. Plaxco F. Rici Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 6717
24. B. Kim I. H. Jung M. Kang H.-K. Shim H. Y. Woo J. Am. Chem. Soc. 2012 134 3133
25. F. He Y. Tang M. Yu F. Feng L. An H. Sun S. Wang Y. Li D. Zhu G. C. Bazan J. Am. Chem. Soc. 2006 128 6764
26. Y. Y. Wang B. Liu Langmuir 2009 25 12787
27. B. Li C. Qin T. Li L. Wang S. Dong Anal. Chem. 2009 81 3544
28. T. Hermann D. J. Patel Science 2000 287 820
29. A. D. Ellington J. W. Szostak Nature 1990 346 818
30. J. T. Davis Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 668
31. V. Esposito A. Galeone L. Mayol G. Oliviero A. Virgilio L. Randazzo Nucleosides, Nucleotides Nucleic Acids 2007 1155
32. H. Yaku T. Fujimoto T. Murashima D. Miyoshi N. Sugimoto Chem. Commun. 2012 48 6203
33. S. Tyagi F. R. Kramer Nat. Biotechnol. 1996 14 303
34. F. Xia X. Zuo R. Yang Y. Xiao D. Kang A. Vallée-Bélisle X. Gong A. J. Heeger K. W. Plaxco J. Am. Chem. Soc. 2010 132 1252
35. D. E. Huizenga J. W. Szostak Biochemistry 1995 34 656
36. Y. Wang Z. Li D. Hu C.-T. Lin J. Li Y. Lin J. Am. Chem. Soc. 2010 132 9274
37. C.-L. Zhu C.-H. Lu X.-Y. Song H.-H. Yang X.-R. Wang J. Am. Chem. Soc. 2011 133 1278
38. J. Liu Y. Lu Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 90
39. X. He Y. Zhao D. He K. Wang F. Xu J. Tang Langmuir 2012 28 12909
40. J. J. Li Z. Fang W. Tan Biochem. Biophys. Res. Commun. 2002 292 31
41. V. Bagalkot O. C. Farokhzad R. Langer S. Jon Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 1
42. J.-H. Lee M. D. Canny A. D. Erkenez D. Krilleke Y.-S. Ng D. T. Shima A. Pardi F. Jucker Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 18902
43. J. C. Cox A. D. Ellington Bioorg. Med. Chem. 2001 9 2525
44. C. H. Lin D. J. Patel Chem. Biol. 1997 4 817
45. A. V. Hill J. Physiol. 1910 40 IV
46. A. Porchetta A. Vallée-Bélisle K. W. Plaxco F. Ricci J. Am. Chem. Soc. 2012 134 20601
47. The UNAFold Web Server, http://mfold.rna.albany.edu, accessed 1995
48. M. Zuker Nucleic Acids Res. 2003 31 3406
49. I. Beis E. A. Newsholme Biochem. J. 1975 152 23
50. M. W. Gorman E. O. Feigl C. W. Buffington Clin. Chem. 2007 53 318
51. F. Ricci A. Vallée-Bélisle A. Porchetta K. W. Plaxco J. Am. Chem. Soc. 2012 134 15177
52. J.-H. Lee D.-H. Hwang Chem. Commun. 2003 2836
53. B. H. Lee I. H. Jung H. Y. Woo H.-K. Shim G. Kim K. Lee Adv. Funct. Mater. 2014 24 1100