Reactivity of inorganic sulfide species toward a heme protein model

Inorganic Chemistry

Volumn 54, Issue 2, 2015, Pages 527-533

  Bieza, Silvina A ^a   Boubeta, Fernando ^a   Feis, Alessandro ^c   Smulevich, Giulietta ^c   Estrin, Darío A ^a   Boechi, Leonardo ^b   Bari, Sara E ^a  

^a UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES   (Argentina)

^b INSTITUTO DE CÁLCULO   (Argentina)

^c UNIVERSITY OF FLORENCE   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HEMOPROTEIN; HYDROGEN SULFIDE; OLIGOPEPTIDE; PEROXIDASE; PROTEIN BINDING; SODIUM SULFIDE; SULFIDE;

CHEMISTRY; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN CONFORMATION;

HEMEPROTEINS; HYDROGEN SULFIDE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; OLIGOPEPTIDES; PEROXIDASES; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; SULFIDES;

EID: 84921486295     PISSN: 00201669     EISSN: 1520510X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic502294z     Document Type: Article

References (64)

1. Stipanuk, M. H.; Beck, P. W. Biochem. J. 1982, 206, 267-277
2. Abe, K.; Kimura, H. J. Neurosci. 1996, 16, 1066-1071
3. Hosoki, R.; Matsiki, N.; Kimura, H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997, 237, 527-531
4. Beauchamp, R. O.; Bus, J. S.; Popp, J. A.; Boreiko, C. J.; Andjelkhovich, D. A. Crit. Rev. Toxicol. 1984, 13, 25-97
5. Polhemus, D. J.; Lefer, D. J. Circ. Res. 2014, 114, 730-737
6. Kamoun, P.; Belardinelli, M.; Chabli, A.; Lallouchi, K.; Chadefaux-Vekemans, B. Am. J. Med. Genet., Part A 2003, 116, 310-1
7. Ottani, A.; Zaffe, D.; Galantucci, M.; Strinati, F.; Lodi, R.; Guarini, S. Neurobiol. Learn. Mem. 2013, 104, 82-91
8. Filipovic, M. R.; Miljkovic, J.; Allgäuer, A.; Chaurio, R.; Shubina, T.; Herrmann, M.; Ivanovic-Burmazovic, I. Biochem. J. 2012, 441, 609-21
9. Lu, M.; Hu, L. F.; Hu, G.; Bian, J. S. Free Radical Biol. Med. 2008, 45, 1705-13
10. Collman, J. P.; Ghosh, S.; Dey, A.; Decréau, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 22090-22095
11. Ida, T.; Sawa, T.; Ihara, H.; Tsuchiya, Y.; Watanabe, Y.; Jamagai, Y.; Suematsu, M.; Motohashi, H.; Fujii, S.; Matsunaga, T.; Yamamoto, M.; Ono, K.; Devarie-Baez, N. O.; Xian, M.; Fukuto, J. M.; Akaike, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014, 111, 7606-11
12. Wang, R. FASEB J. 2002, 16, 1793-98
13. Mani, S.; Cao, W.; Wu, L.; Wang, R. Nitric Oxide 2014, 41, 62-71
14. Kimura, H. Nitric Oxide 2014, 41, 4-10
15. Kolluru, G. K.; Shen, X.; Bir, S. C.; Kevil, C. G. Nitric Oxide 2013, 35, 5-20
16. Mustafa, A. K.; Gadalla, M. M.; Sen, N.; Kim, S.; Mu, W.; Gazi, S. K.; Barrow, R. K.; Yang, G.; Wang, R.; Snyder, S. H. Sci. Signaling 2009, 2, ra72
17. Wang, R. Trends Biochem. Sci. 2014, 39, 227-232
18. Kimura, H. Neurochem. Int. 2013, 63, 492-497
19. Nguyen, B. D.; Zhao, X.; Vyas, K.; La Mar, G. N.; Lile, R. A.; Brucker, E. A.; Phillips, G. N., Jr.; Olson, J. S.; Wittenberg, J. B. J. Biol. Chem. 1998, 273, 9517-9526
20. Boffi, A.; Rizzi, M.; Monacelli, F.; Ascenzi, P. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1523, 206-208
21. Brittain, T.; Yosaatmadja, Y.; Henty, K. IUBMB Life 2008, 60, 135-138
22. Nishimori, I.; Vullo, D.; Minakuchi, T.; Scozzafava, A.; Osman, S.; AlOthman, Z.; Capasso, C.; Supuran, C. T. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2014, 24, 1127-1132
23. Li, Q.; Lancaster, J. R., Jr. Nitric Oxide 2013, 35, 21-34
24. Wedmann, R.; Bertlein, S.; Macinkovic, I.; Böltz, S.; Milikovic, J. L.; Muñoz, L. E.; Herrman, M.; Filipovic, M. R. Nitric Oxide 2014, 41, 85-96
25. Nagy, P.; Pálinkás, Z.; Nagy, A.; Budai, B.; Tóth, I.; Vasas, A. Biochem. Biophys. Acta. 2014, 1840, 876-91
26. Hughes, M. N.; Centelles, M. N.; Moore, K. P. Free Radical Biol. Med. 2009, 47, 1346-1353
27. Greiner, R.; Pálinkás, Z.; Bäsel, K.; Becher, D.; Antelmann, H.; Nagy, P.; Dick, T. P. Antioxid. Redox Signaling 2013, 19, 1749-1765
28. Sun, W.; Nesic, S.; Young, D.; Woollam, R. C. Ind. Eng. Chem. Res. 2008, 47, 1738-1742
29. Keilin, D. Proc. R. Soc. London, Ser. B 1933, 133, 393-404
30. Libardi, S.; Pindstrup, H.; Cardoso, D. R.; Skibsted, L. H. J. Agric. Food Chem. 2013, 61, 2883-2888
31. Ríos-González, B. B.; Román-Morales, E. M.; Pietri, R.; López-Garriga, J. J. Inorg. Biochem. 2014, 133, 78-86
32. Park, C. M.; Nagel, R. L. N. Engl. J. Med. 1984, 310, 1579-1584
33. Szábo, C. Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 917-935
34. English, D. R.; Hendrickson, D. N.; Süslick, K. S.; Eigenbrot, C. W., Jr.; Scheidt, W. R. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 7258-7259
35. Balch, A. L.; Cornman, C. R.; Safari, N. Organometallics 1990, 9, 2420-2421
36. Pavlik, J. W.; Noll, B. C.; Oliver, A. G.; Schulz, C. E.; Scheidt, W. R. Inorg. Chem. 2010, 49, 1017-1026
37. Hill, B. C.; Nicholls, P. Can. J. Biochem. 1980, 58, 499-503
38. Nicoletti, F. P.; Thompson, M. K.; Franzen, S.; Smulevich, G. J. Biol. Inorg. Chem. 2011, 16, 611-619
39. Kraus, D. W.; Wittenberg, J. B. JBIC, J. Biol. Chem. 1990, 265, 6043-6053
40. Pietri, R.; Lewis, A.; León, R.; Casabona, G.; Kiger, L.; Yeh, S. R.; Fernández-Alberti, S.; Marden, M. C.; Cadilla, C. L.; López-Garriga, J. Biochemistry 2009, 48, 4881-4894
41. Marques, H. M. Dalton Trans. 2007, 4371-4385
42. Munro, O. Q.; Marques, H. M. Inorg.Chem. 1996, 35, 3752-3767
43. Low, D. W.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 117-120
44. Laberge, M.; Vregdenhil, A. J.; Vanderkooi, J. M.; Butler, I.S. J. J. Biomol. Struct. Dyn. 1998, 15, 1039-1050
45. Carraway, A. D.; McCollum, M. G.; Peterson, J. Inorg. Chem. 1996, 35, 6885-6891
46. Baldwin, D. A.; Marques, H. M.; Pratt, J. M. J. Inorg. Biochem. 1987, 30, 203-217
47. Sharma, V. S.; Schmidt, M. R.; Ranney, H. M. J. Biol. Chem. 1976, 251, 4267-4272
48. Cheek, J.; Low, D. W.; Gray, H. B.; Dawson, J. H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998, 253, 195-198
49. Tezcan, F. A.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 13383-13388
50. Riposati, A.; Prieto, T.; Shida, C. S.; Nantes, I. L.; Nascimento, O. R. J. Inorg. Biochem. 2006, 100, 226-238
51. Hamelberg, D.; Mongan, J.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 2004, 120, 11919-11929
52. Sadeque, A. J. M.; Shimizu, T.; Hatano, M. Inorg. Chim. Acta 1987, 135, 109-113
53. Marques, H. M.; Rousseau, A. Inorg. Chim. Acta 1996, 248, 115-119
54. Kalampounias, A. G.; Andrikopoulos, K. S.; Yannopoulos, S. N. J. Chem. Phys. 2003, 118, 8460-8467
55. Kimura, Y.; Mikami, Y.; Osumi, K.; Tsugane, M.; Oka, J.-I.; Kimura, H. FASEB J. 2013, 27, 2451-2457
56. Khan, S. A. K.; Hughes, R. W.; Reynolds, P. A. Vib. Spectrosc. 2011, 56, 241-244
57. Nicoletti, F. P.; Comandini, A.; Bonamore, A.; Boechi, L.; Boubeta, F. M.; Feis, A.; Smulevich, G.; Boffi, A. Biochemistry 2010, 49, 2269-2278
58. Ramos-Alvarez, C.; Yoo, B. K.; Pietri, R.; Lamarre, I.; Martin, J. L.; Lopez-Garriga, J.; Negrerie, M. Biochemistry 2013, 52, 7007-7021
59. Bonamore, A.; Ilari, A.; Giangiacomo, L.; Bellelli, A.; Morea, V.; Boffi, A. FEBS J. 2005, 272, 4189-201
60. Smith, M. C.; McLendon, G. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 5666-5670
61. Marques, H. M.; Baldwin, D. A.; Pratt, J. M. J. Inorg. Biochem. 1987, 29, 77-91
62. Fernández-Alberti, S.; Bacelo, D. E.; Binning, R. C., Jr.; Echave, J.; Chergui, M.; López-Garriga, J. Biophys. J. 2006, 91, 1698-709
63. Battistuzzi, G.; Borsari, M.; Cowan, J. A.; Ranieri, A.; Sola, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5315-5324
64. Zhong, F.; Lisi, G. P.; Collins, D. P.; Dawson, J. H.; Pletneva, E. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014, 111, E309-E315