Quantitative analysis of prostate specific antigen isoforms using immunoprecipitation and stable isotope labeling mass spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 1, 2015, Pages 545-553

  Chen, Yi Ting ^b,c   Tuan, Li Ping ^a   Chen, Hsiao Wei ^c   Wei, I An ^a   Chou, Min Yuan ^d   Chen, Han Min ^e   Tyan, Yu Chang ^f   Chen, Sung Fang ^a  

^a NATIONAL TAIWAN NORMAL UNIVERSITY   (Taiwan)

^b CHANG GUNG UNIVERSITY COLLEGE OF MEDICINE   (Taiwan)

^c CHANG GUNG UNIVERSITY   (Taiwan)

^d INDUSTRIAL TECHNOLOGY RESEARCH INSTITUTE   (Taiwan)

^e FU JEN CATHOLIC UNIVERSITY   (Taiwan)

^f KAOHSIUNG MEDICAL UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIGEN-ANTIBODY REACTIONS; ANTIGENS; BIOMARKERS; DISEASES; ISOTOPES; MASS SPECTROMETRY; PROTEINS; SPECTROMETRY; UROLOGY;

ACCURATE QUANTIFICATIONS; BENIGN PROSTATIC HYPERPLASIA; IMMUNOPRECIPITATIONS; LIMIT OF QUANTITATIONS; MULTIPLE REACTION MONITORING; PROSTATE SPECIFIC ANTIGEN; SIMULTANEOUS MEASUREMENT; STABLE-ISOTOPE LABELING;

BODY FLUIDS;

ISOPROTEIN; PEPTIDE FRAGMENT; PLASMA PROTEIN; PROSTATE SPECIFIC ANTIGEN;

BIOASSAY; BLOOD; FEMALE; HUMAN; IMMUNOPRECIPITATION; ISOTOPE LABELING; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MALE; MASS SPECTROMETRY; NORMAL HUMAN; PROCEDURES; PROSTATIC NEOPLASMS; RADIOIMMUNOASSAY;

BIOLOGICAL ASSAY; BLOOD PROTEINS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; FEMALE; HEALTHY VOLUNTEERS; HUMANS; IMMUNOPRECIPITATION; ISOTOPE LABELING; MALE; MASS SPECTROMETRY; PEPTIDE FRAGMENTS; PROSTATE-SPECIFIC ANTIGEN; PROSTATIC NEOPLASMS; PROTEIN ISOFORMS; RADIOIMMUNOASSAY;

EID: 84920491197     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac5033066     Document Type: Article

References (65)

1. Baade, P. D.; Youlden, D. R.; Krnjacki, L. J. Mol. Nutr. Food Res. 2009, 53, 171-84
2. Ward, A. M.; Catto, J. W.; Hamdy, F. C. Ann. Clin. Biochem. 2001, 38, 633-51
3. Balk, S. P.; Ko, Y. J.; Bubley, G. J. J. Clin. Oncol. 2003, 21, 383-91
4. Velonas, V. M.; Woo, H. H.; Remedios, C. G.; Assinder, S. J. Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 11034-60
5. Armbruster, D. A. Clin Chem. 1993, 39, 181-195
6. Catalona, W. J.; Smith, D. S.; Ratliff, T. L.; Dodds, K. M.; Coplen, D. E.; Yuan, J. J.; Petros, J. A.; Andriole, G. L. N. Engl. J. Med. 1991, 324, 1156-61
7. Stephan, C.; Jung, K.; Lein, M.; Diamandis, E. P. Eur. J. Cancer 2007, 43, 1918-1926
8. Lilja, H.; Ulmert, D.; Vickers, A. J. Nat. Rev. Cancer 2008, 8, 268-278
9. Catalona, W. J.; Richie, J. P.; Ahmann, F. R.; Hudson, M. A.; Scardino, P. T.; Flanigan, R. C.; deKernion, J. B.; Ratliff, T. L.; Kavoussi, L. R.; Dalkin, B. L. J. Urol. 1994, 151, 1283-90
10. Tchetgen, M. B. N.; Oesterling, J. E. Urol. Clin. N. Am. 1997, 24, 283-&
11. Thompson, I. M.; Goodman, P. J.; Tangen, C. M.; Lucia, M. S.; Miller, G. J.; Ford, L. G.; Lieber, M. M.; Cespedes, R. D.; Atkins, J. N.; Lippman, S. M.; Carlin, S. M.; Ryan, A.; Szczepanek, C. M.; Crowley, J. J.; Coltman, C. A., Jr. N. Engl. J. Med. 2003, 349, 215-24
12. Becker, C.; Lilja, H. Clin. Chim. Acta 1997, 257, 117-132
13. Moore, R. A. Clin. Chem. 1997, 43, 1561-1562
14. Catalona, W. J.; Partin, A. W.; Slawin, K. M.; Brawer, M. K.; Flanigan, R. C.; Patel, A.; Richie, J. P.; deKernion, J. B.; Walsh, P. C.; Scardino, P. T.; Lange, P. H.; Subong, E. N. P.; Parson, R. E.; Gasior, G. H.; Loveland, K. G.; Southwick, P. C. J. Am. Med. Assoc. 1998, 279, 1542-1547
15. Woodrum, D. L.; Brawer, M. K.; Partin, A. W.; Catalona, W. J.; Southwick, P. C. J. Urol. 1998, 159, 5-12
16. Lilja, H.; Christensson, A.; Dahlen, U.; Matikainen, M. T.; Nilsson, O.; Pettersson, K.; Lovgren, T. Clin. Chem. 1991, 37, 1618-1625
17. Stenman, U. H.; Leinonen, J.; Alfthan, H.; Rannikko, S.; Tuhkanen, K.; Alfthan, O. Cancer Res. 1991, 51, 222-226
18. Zhang, W. M.; Leinonen, J.; Kalkkinen, N.; Dowell, B.; Stenman, U. H. Clin. Chem. 1995, 41, 1567-1573
19. Christensson, A.; Bjork, T.; Nilsson, O.; Dahlen, U.; Matikainen, M. T.; Cockett, A. T. K.; Abrahamsson, P. A.; Lilja, H. J. Urol. 1993, 150, 100-105
20. Zhang, W. M.; Finne, P.; Leinonen, J.; Vesalainen, S.; Nordling, S.; Rannikko, S.; Stenman, U. H. Clin. Chem. 1998, 44, 2471-2479
21. Zhang, W. M.; Finne, P.; Leinonen, J.; Vesalainen, S.; Nordling, S.; Stenman, U. H. Clin. Chem. 1999, 45, 814-821
22. Mikolajczyk, S. D.; Marks, L. S.; Partin, A. W.; Rittenhouse, H. G. Urology 2002, 59, 797-802
23. Mikolajczyk, S. D.; Millar, L. S.; Wang, T. J.; Rittenhouse, H. G.; Marks, L. S.; Song, W. T.; Wheeler, T. M.; Slawin, K. M. Cancer Res. 2000, 60, 756-759
24. Mikolajczyk, S. D.; Grauer, L. S.; Millar, L. S.; Hill, T. M.; Kumar, A.; Rittenhouse, H. G.; Wolfert, R. L.; Saedi, M. S. Urology 1997, 50, 710-714
25. Mikolajczyk, S. D.; Millar, L. S.; Wang, T. J.; Rittenhouse, H. G.; Wolfert, R. L.; Marks, L. S.; Song, W. T.; Wheeler, T. M.; Slawin, K. M. Urology 2000, 55, 41-45
26. Mikolajczyk, S. D.; Marker, K. M.; Millar, L. S.; Kumar, A.; Saedi, M. S.; Payne, J. K.; Evans, C. L.; Gasior, C. L.; Linton, H. J.; Carpenter, P.; Rittenhouse, H. G. Cancer Res. 2001, 61, 6958-6963
27. Peter, J.; Unverzagt, C.; Krogh, T. N.; Vorm, O.; Hoesel, W. Cancer Res. 2001, 61, 957-962
28. Bangma, C. H.; Wildhagen, M. F.; Yurdakul, G.; Schroder, F. H.; Blijenberg, B. G. BJU Int. 2004, 93, 720-4
29. Stephan, C.; Meyer, H. A.; Paul, E. M.; Kristiansen, G.; Loening, S. A.; Lein, M.; Jung, K. Anticancer Res. 2007, 27, 1833-6
30. Miyakubo, M.; Ito, K.; Yamamoto, T.; Takechi, H.; Ohi, M.; Suzuki, K. Int. J. Urol. 2009, 16, 561-5
31. Makarov, D. V.; Isharwal, S.; Sokoll, L. J.; Landis, P.; Marlow, C.; Epstein, J. I.; Partin, A. W.; Carter, H. B.; Veltri, R. W. Clin. Cancer Res. 2009, 15, 7316-21
32. Catalona, W. J.; Bartsch, G.; Rittenhouse, H. G.; Evans, C. L.; Linton, H. J.; Amirkhan, A.; Horninger, W.; Klocker, H.; Mikolajczyk, S. D. J. Urol. 2003, 170, 2181-5
33. Khan, M. A.; Partin, A. W.; Rittenhouse, H. G.; Mikolajczyk, S. D.; Sokoll, L. J.; Chan, D. W.; Veltri, R. W. J. Urol. 2003, 170, 723-6
34. Naya, Y.; Fritsche, H. A.; Bhadkamkar, V. A.; Mikolajczyk, S. D.; Rittenhouse, H. G.; Babaian, R. J. Urol. Oncol. 2005, 23, 16-21
35. Sokoll, L. J.; Chan, D. W.; Mikolajczyk, S. D.; Rittenhouse, H. G.; Evans, C. L.; Linton, H. J.; Mangold, L. A.; Mohr, P.; Bartsch, G.; Klocker, H.; Horninger, W.; Partin, A. W. Urology 2003, 61, 274-6
36. Anderson, N. L.; Anderson, N. G.; Pearson, T. W.; Borchers, C. H.; Paulovich, A. G.; Patterson, S. D.; Gillette, M.; Aebersold, R.; Carr, S. A. Mol. Cell. Proteomics 2009, 8, 883-6
37. Preissner, C. M.; O'Kane, D. J.; Singh, R. J.; Morris, J. C.; Grebe, S. K. J. Clin. Endocrinol. Metab. 2003, 88, 3069-74
38. Roehrborn, C. G.; Boyle, P.; Gould, A. L.; Waldstreicher, J. Urology 1999, 53, 581-9
39. Mikolajczyk, S. D.; Catalona, W. J.; Evans, C. L.; Linton, H. J.; Millar, L. S.; Marker, K. M.; Katir, D.; Amirkhan, A.; Rittenhouse, H. G. Clin. Chem. 2004, 50, 1017-1025
40. Makawita, S.; Diamandis, E. P. Clin. Chem. 2010, 56, 212-222
41. Chen, Y. T.; Chen, H. W.; Domanski, D.; Smith, D. S.; Liang, K. H.; Wu, C. C.; Chen, C. L.; Chung, T.; Chen, M. C.; Chang, Y. S.; Parker, C. E.; Borchers, C. H.; Yu, J. S. J. Proteomics 2012, 75, 3529-3545
42. Parker, C. E.; Domanski, D.; Percy, A. J.; Chambers, A. G.; Camenzind, A. G.; Smith, D. S.; Borchers, C. H. Top Curr. Chem. 2014, 336, 117-137
43. Anderson, L.; Hunter, C. L. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5, 573-588
44. Stahl-Zeng, J.; Lange, V.; Ossola, R.; Eckhardt, K.; Krek, W.; Aebersold, R.; Domon, B. Mol. Cell. Proteomics 2007, 6, 1809-1817
45. Barnidge, D. R.; Goodmanson, M. K.; Klee, G. G.; Muddiman, D. C. J. Proteome Res. 2004, 3, 644-652
46. Barr, J. R.; Maggio, V. L.; Patterson, D. G.; Cooper, G. R.; Henderson, L. O.; Turner, W. E.; Smith, S. J.; Hannon, W. H.; Needham, L. L.; Sampson, E. J. Clin. Chem. 1996, 42, 1676-1682
47. Gerber, S. A.; Rush, J.; Stemman, O.; Kirschner, M. W.; Gygi, S. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 6940-6945
48. Peter, J.; Unverzagt, C.; Lenz, H.; Hoesel, W. Anal. Biochem. 1999, 273, 98-104
49. Keshishian, H.; Addona, T.; Burgess, M.; Kuhn, E.; Carr, S. A. Mol. Cell. Proteomics 2007, 6, 2212-2229
50. Hoofnagle, A. N.; Becker, J. O.; Wener, M. H.; Heinecke, J. W. Clin. Chem. 2008, 54, 1796-1804
51. Whiteaker, J. R.; Zhao, L.; Zhang, H. Y.; Feng, L. C.; Piening, B. D.; Anderson, L.; Paulovich, A. G. Anal. Biochem. 2007, 362, 44-54
52. Fortin, T.; Salvador, A.; Charrier, J. P.; Lenz, C.; Lacoux, X.; Morla, A.; Choquet-Kastylevsky, G.; Lemoine, J. Mol. Cell. Proteomics 2009, 8, 1006-1015
53. Bjorhall, K.; Miliotis, T.; Davidsson, P. Proteomics 2005, 5, 307-317
54. Rifai, N.; Gillette, M. A.; Carr, S. A. Nat. Biotechnol. 2006, 24, 971-983
55. Anderson, N. L.; Anderson, N. G. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 845-867
56. Addona, T. A.; Abbatiello, S. E.; Schilling, B.; Skates, S. J.; Mani, D. R.; Bunk, D. M.; Spiegelman, C. H.; Zimmerman, L. J.; Ham, A. J. L.; Keshishian, H.; Hall, S. C.; Allen, S.; Blackman, R. K.; Borchers, C. H.; Buck, C.; Cardasis, H. L.; Cusack, M. P.; Dodder, N. G.; Gibson, B. W.; Held, J. M.; Hiltke, T.; Jackson, A.; Johansen, E. B.; Kinsinger, C. R.; Li, J.; Mesri, M.; Neubert, T. A.; Niles, R. K.; Pulsipher, T. C.; Ransohoff, D.; Rodriguez, H.; Rudnick, P. A.; Smith, D.; Tabb, D. L.; Tegeler, T. J.; Variyath, A. M.; Vega-Montoto, L. J.; Wahlander, A.; Waldemarson, S.; Wang, M.; Whiteaker, J. R.; Zhao, L.; Anderson, N. L.; Fisher, S. J.; Liebler, D. C.; Paulovich, A. G.; Regnier, F. E.; Tempst, P.; Carr, S. A. Nat. Biotechnol. 2009, 27, 864-864
57. Kuhn, E.; Whiteaker, J. R.; Mani, D. R.; Jackson, A. M.; Zhao, L.; Pope, M. E.; Smith, D.; Rivera, K. D.; Anderson, N. L.; Skates, S. J.; Pearson, T. W.; Paulovich, A. G.; Carr, S. A. Mol. Cell. Proteomics 2012, 11 M111 013854
58. Lin, D.; Alborn, W. E.; Slebos, R. J.; Liebler, D. C. J. Proteome Res. 2013, 12, 5996-6003
59. Liu, T.; Hossain, M.; Schepmoes, A. A.; Fillmore, T. L.; Sokoll, L. J.; Kronewitter, S. R.; Izmirlian, G.; Shi, T.; Qian, W. J.; Leach, R. J.; Thompson, I. M.; Chan, D. W.; Smith, R. D.; Kagan, J.; Srivastava, S.; Rodland, K. D.; Camp, D. G., 2nd. J. Proteomics 2012, 75, 4747-57
60. Choi, Y. S.; Hou, S.; Choe, L. H.; Lee, K. H. J. Chromatogr. B 2013, 930, 129-35
61. Klee, E. W.; Bondar, O. P.; Goodmanson, M. K.; Trushin, S. A.; Singh, R. J.; Anderson, N. L.; Klee, G. G. Am. J. Clin. Pathol. 2014, 141, 527-33
62. Vegvari, A.; Sjodin, K.; Rezeli, M.; Malm, J.; Lilja, H.; Laurell, T.; Marko-Varga, G. Mol. Cell. Proteomics 2013, 12, 2761-73
63. Anderson, N. L.; Anderson, N. G.; Haines, L. R.; Hardie, D. B.; Olafson, R. W.; Pearson, T. W. J. Proteome Res. 2004, 3, 235-244
64. Schoenherr, R. M.; Zhao, L.; Whiteaker, J. R.; Feng, L. C.; Li, L.; Liu, L. N.; Liu, X. W.; Paulovich, A. G. J. Immunol. Methods 2010, 353, 49-61
65. Whiteaker, J. R.; Zhao, L.; Abbatiello, S. E.; Burgess, M.; Kuhn, E.; Lin, C. W.; Pope, M. E.; Razavi, M.; Anderson, N. L.; Pearson, T. W.; Carr, S. A.; Paulovich, A. G. Mol. Cell. Proteomics 2011, 10 M110.005645