Reconstructing fungal natural product biosynthetic pathways

Natural Product Reports

Volumn 31, Issue 10, 2014, Pages 1339-1347

  Lazarus, C M ^a   Williams, K ^a   Bailey, A M ^a  

^a UNIVERSITY OF BRISTOL   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL PRODUCT;

BIOSYNTHESIS; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; FUNGAL GENOME; FUNGUS; METABOLISM; REVIEW;

BIOLOGICAL PRODUCTS; BIOSYNTHETIC PATHWAYS; FUNGI; GENOME, FUNGAL; MOLECULAR STRUCTURE;

EID: 84907144112     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4np00084f     Document Type: Article

References (58)

1. D. J. Newman G. M. Cragg J. Nat. Prod. 2012 75 311 335
2. G. Ozcengiz A. L. Demain Biotechnol. Adv. 2013 31 287 311
3. J. D. Walton Fungal Genet. Biol. 2000 30 167 171
4. S. Bergmann J. Schumann K. Scherlach C. Lange A. A. Brakhage C. Hertweck Nat. Chem. Biol. 2007 3 213 217
5. S. Jain N. Keller Fungal Biology Reviews 2013 27 51 59
6. A. A. Brakhage Nat. Rev. Microbiol. 2013 11 21 32
7. J. Antosch F. Schaefers T. A. M. Gulder Angew. Chem., Int. Ed. 2014 53 3011 3014
8. S. Agger F. Lopez-Gallego C. Schmidt-Dannert Mol. Microbiol. 2009 72 1307 1308
9. G. T. Wawrzyn M. B. Quin S. Choudhary F. Lopez-Gallego C. Schmidt-Dannert Chem. Biol. 2012 19 772 783
10. J. Davison A. al Fahad M. H. Cai Z. Song S. Y. Yehia C. M. Lazarus A. M. Bailey T. J. Simpson R. J. Cox Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 7642 7647
11. A. O. Zabala W. Xu Y.-H. Chooi Y. Tang Chem. Biol. 2012 19 1049 1059
12. C. J. Paddon P. J. Westfall D. J. Pitera K. Benjamin K. Fisher D. McPhee M. D. Leavell A. Tai A. Main D. Eng D. R. Polichuk K. H. Teoh D. W. Reed T. Treynor J. Lenihan M. Fleck S. Bajad G. Dang D. Dengrove D. Diola G. Dorin K. W. Ellens S. Fickes J. Galazzo S. P. Gaucher T. Geistlinger R. Henry M. Hepp T. Horning T. Iqbal H. Jiang L. Kizer B. Lieu D. Melis N. Moss R. Regentin S. Secrest H. Tsuruta R. Vazquez L. F. Westblade L. Xu M. Yu Y. Zhang L. Zhao J. Lievense P. S. Covello J. D. Keasling K. K. Reiling N. S. Renninger J. D. Newman Nature 2013 496 528 532
13. S. M. Ma J. W. H. Li J. W. Choi H. Zhou K. K. M. Lee V. A. Moorthie X. Xie J. T. Kealey N. A. Da Silva J. C. Vederas Y. Tang Science 2009 326 589 592
14. M. Wang M. Beissner H. Zhao Chem. Biol. 2014 21 257 263
15. S. Wattanachaisaereekul A. E. Lantz M. L. Nielsen Ó. S. Andrésson J. Nielsen Biotechnol. Bioeng. 2007 97 893 900
16. R. Lambalot A. M. Gehring R. S. Fluge P. Zuber M. LaCelle M. A. Marahiel R. Reid C. Khosia C. T. Walsh Chem. Biol. 1996 3 923 936
17. K. i. Ishiuchi T. Nakazawa T. Ookuma S. Sugimoto M. Sato Y. Tsunematsu N. Ishikawa H. Noguchi K. Hotta H. Moriya K. Watanabe ChemBioChem 2012 13 846 854
18. Y. Tsunematsu K. i. Ishiuchi K. Hotta K. Watanabe Nat. Prod. Rep. 2013 30 1139 1149
19. P. Rugbjerg M. Naesby U. H. Mortensen R. J. N. Frandsen Microb. Cell Fact. 2013 12 31
20. L. Gidijala J. A. K. W. Kiel R. D. Douma R. M. Seifar W. M. van Gulik R. A. L. Bovenberg M. Veenhuis I. J. van der Klei PLoS One 2009 4 e8317
21. W. H. Meijer L. Gidijala S. Fekken J. A. K. W. Kiel M. A. van den Berg R. Lascaris R. A. L. Bovenberg I. J. van der Klei Appl. Environ. Microbiol. 2010 76 5702 5709
22. S. E. Unkles V. Valiante D. J. Mattern A. A. Brakhage Chem. Biol. 2014 21 502 508
23. J. Yaegashi B. R. Oakley C. C. C. Wang J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2014 41 433 442
24. D. J. Smith M. K. R. Burnham J. Edwards A. J. Earl G. Turner Nat. Biotechnol. 1990 8 39 41
25. K. Sakai H. Kinoshita T. Shimizu T. Nihira J. Biosci. Bioeng. 2008 106 466 472
26. W.-B. Yin Y. H. Chooi A. R. Smith R. A. Cacho Y. Hu T. C. White Y. Tang ACS Synth. Biol. 2013 2 629 634
27. K. Sakai H. Kinoshita T. Nihira Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012 93 2011 2022
28. J. W. Bok N. P. Keller Eukaryotic Cell 2004 3 527 535
29. S. S. Lee J. H. Lee I. Lee J. Microbiol. Biotechnol. 2013 23 959 965
30. Y.-M. Chiang C. E. Oakley M. Ahuja R. Entwistle A. Schultz S.-L. Chang C. T. Sung C. C. C. Wang B. R. Oakley J. Am. Chem. Soc. 2013 135 7720 7731
31. P. Barbesgaard H. P. Heldthansen B. Diderichsen Appl. Microbiol. Biotechnol. 1992 36 569 572
32. A. Watanabe Y. Ono I. Fujii U. Sankawa M. E. Mayorga W. E. Timberlake Y. Ebizuka Tetrahedron Lett. 1998 39 7733 7736
33. A. Watanabe I. Fujii U. Sankawa M. E. Mayorga W. E. Timberlake Y. Ebizuka Tetrahedron Lett. 1999 40 91 94
34. K. Gomi Y. Iimura S. Hara Agric. Biol. Chem. 1987 51 2549 2555
35. T. Fujii H. Yamaoka K. Gomi K. Kitamoto C. Kumagai Biosci., Biotechnol., Biochem. 1995 59 1869 1874
36. F. H. Jin J.-I. Maruyama P. R. Juvvadi M. Arioka K. Kitamoto FEMS Microbiol. Lett. 2004 239 79 85
37. J. Beck S. Ripka A. Siegner E. Schiltz E. Schweizer Eur. J. Biochem. 1990 192 487 498
38. A. P. MacCabe H. Vanliempt H. Palissa S. E. Unkles M. B. R. Riach E. Pfeifer H. Vondohren J. R. Kinghorn J. Biol. Chem. 1991 266 12646 12654
39. Z. Song R. J. Cox C. M. Lazarus T. J. Simpson ChemBioChem 2004 5 1196 1203
40. J. W. Sims J. P. Fillmore D. D. Warner E. W. Schmidt Chem. Commun. 2005 186 188
41. B. G. Hansen B. Salomonsen M. T. Nielsen J. B. Nielsen N. B. Hansen K. F. Nielsen T. B. Regueira J. Nielsen K. R. Patil U. H. Mortensen Appl. Environ. Microbiol. 2011 77 3044 3051
42. Z. Shao H. Zhao H. Zhao Nucleic Acids Res. 2009 37 e16
43. Z. Shao Y. Luo H. Zhao Mol. BioSyst. 2011 7 1056 1059
44. A. Munawar J. W. Marshall R. J. Cox A. M. Bailey C. M. Lazarus ChemBioChem 2013 14 388 394
45. K. A. K. Pahirulzaman K. Williams C. M. Lazarus Methods Enzymol. 2012 517 241 260
46. Z. Wasil K. A. K. Pahirulzaman C. Butts T. J. Simpson C. M. Lazarus R. J. Cox Chem. Sci. 2013 4 3845 3856
47. M. N. Heneghan A. A. Yakasai K. Williams K. A. Kadir Z. Wasil W. Bakeer K. M. Fisch A. M. Bailey T. J. Simpson R. J. Cox C. M. Lazarus Chem. Sci. 2011 2 972 979
48. K. M. Fisch W. Bakeer A. A. Yakasai Z. Song J. Pedrick Z. Wasil A. M. Bailey C. M. Lazarus T. J. Simpson R. J. Cox J. Am. Chem. Soc. 2011 133 16635 16641
49. J. M. Palmer N. P. Keller Curr. Opin. Microbiol. 2010 13 431 436
50. R. J. Watson S. Burchat J. Bosley Fungal Genet. Biol. 2008 45 1348 1363
51. M. N. Heneghan A. A. Yakasai L. M. Halo Z. Song A. M. Bailey T. J. Simpson R. J. Cox C. M. Lazarus ChemBioChem 2010 11 1508 1512
52. R. Fujii A. Minami T. Tsukagoshi N. Sato T. Sahara S. Ohgiya K. Gomi H. Oikawa Biosci., Biotechnol., Biochem. 2011 75 1813 1817
53. K. Tagami C. Liu A. Minami M. Noike T. Isaka S. Fueki Y. Shichijo H. Toshima K. Gomi T. Dairi H. Oikawa J. Am. Chem. Soc. 2013 135 1260 1263
54. Y. Matsuda T. Awakawa I. Abe Tetrahedron 2013 69 8199 8204
55. T. Akao M. Sano O. Yamada T. Akeno K. Fujii K. Goto S. Ohasi-Kunihiro K. Takase M. Yasukawa-Watanabe K. Yamaguchi Y. Kurihara J. I. Maruyama P. R. Juvvadi A. Tanaka Y. Hata Y. Koyama S. Yamaguchi N. Kitamoto K. Gomi K. Abe M. Takeuchi T. Kobayashi H. Horiuchi K. Kitamoto Y. Kashiwagi M. Machida O. Akita DNA Res. 2007 14 47 57
56. H. U. Bohnert I. Fudal W. Dioh D. Tharreau J. L. Notteghem M. H. Lebrun Plant Cell 2004 16 2499 2513
57. W. Bakeer, Overexpression of secondary metabolism genes from Magnaporthe grisea and Beauveria bassiana, PhD thesis, University of Bristol, 2011
58. K. M. Fisch E. Skellam D. Ivison R. J. Cox A. M. Bailey C. M. Lazarus T. J. Simpson Chem. Commun. 2010 46 5331 5333