Detecting kinase activities from single cell lysate using concentration-enhanced mobility shift assay

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 15, 2014, Pages 7455-7462

  Cheow, Lih Feng ^a   Sarkar, Aniruddh ^a   Kolitz, Sarah ^b   Lauffenburger, Douglas ^b   Han, Jongyoon ^a,b  

^a USA   (United States)

^b Massachusetts Institute of Technology Cambridge   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ASSAYS; CYTOLOGY; ENZYMES; PEPTIDES;

CONCENTRATION FACTORS; DETECTION SENSITIVITY; MICRO-FLUIDIC DEVICES; MOBILITY SHIFT ASSAYS; PRE-CONCENTRATION; SIGNALING PATHWAYS; SINGLE-CELL SENSITIVITIES; SUBSTRATE PEPTIDES;

CELLS;

PHOSPHOTRANSFERASE;

AMINO ACID SEQUENCE; HEPG2 CELL LINE; HUMAN; METABOLISM; SINGLE CELL ANALYSIS;

AMINO ACID SEQUENCE; HEP G2 CELLS; HUMANS; PHOSPHOTRANSFERASES; SINGLE-CELL ANALYSIS;

EID: 84905715773     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac502185v     Document Type: Article

References (47)

1. Spencer, S. L.; Gaudet, S.; Albeck, J. G.; Burke, J. M.; Sorger, P. K. Nature 2009, 459 (7245) 428-432
2. Berenbaum, M. C. Cancer Chemother. Rep., Part 1 1972, 56 (5) 563
3. Nelson, D. E.; Ihekwaba, A. E. C.; Elliott, M.; Johnson, J. R.; Gibney, C. A.; Foreman, B. E.; Nelson, G.; See, V.; Horton, C. A.; Spiller, D. G. Science 2004, 306 (5696) 704-708
4. Nair, V. D.; Yuen, T.; Olanow, C. W.; Sealfon, S. C. J. Biol. Chem. 2004, 279 (26) 27494-27501
5. Lahav, G.; Rosenfeld, N.; Sigal, A.; Geva-Zatorsky, N.; Levine, A. J.; Elowitz, M. B.; Alon, U. Nat. Genet. 2004, 36 (2) 147-150
6. Johnson, S. A.; Hunter, T. Nat. Methods 2005, 2 (1) 17-25
7. Shi, Q.; Qin, L.; Wei, W.; Geng, F.; Fan, R.; Shin, Y. S.; Guo, D.; Hood, L.; Mischel, P. S.; Heath, J. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109 (2) 419-424
8. Eyer, K.; Kuhn, P.; Hanke, C.; Dittrich, P. S. Lab Chip 2012, 12 (4) 765-772
9. Sato, M.; Ozawa, T.; Inukai, K.; Asano, T.; Umezawa, Y. Nat. Biotechnol. 2002, 20 (3) 287-294
10. Mehta, S.; Zhang, J. Annu. Rev. Biochem. 2011, 80, 375-401
11. Meredith, G. D.; Sims, C. E.; Soughayer, J. S.; Allbritton, N. L. Nat. Biotechnol. 2000, 18 (3) 309-312
12. Li, H.; Sims, C. E.; Kaluzova, M.; Stanbridge, E. J.; Allbritton, N. L. Biochemistry 2004, 43 (6) 1599-1608
13. Li, H.; Wu, H. Y.; Wang, Y.; Sims, C. E.; Allbritton, N. L. J. Chromatogr. B: Biomed. Sci. Appl. 2001, 757 (1) 79-88
14. Sarkar, A.; Kolitz, S.; Lauffenburger, D. A.; Han, J. Nat. Commun. 2014, 5, 3421
15. Cheow, L. F.; Han, J. Anal. Chem. 2011, 83 (18) 7086-7093
16. Wang, Y. C.; Stevens, A. L.; Han, J. Anal. Chem. 2005, 77 (14) 4293-4299
17. Wang, Y. C.; Han, J. Lab Chip 2008, 8 (3) 392-394
18. Lee, J. H.; Song, Y. A.; Tannenbaum, S. R.; Han, J. Anal. Chem. 2008, 80 (9) 3198-3204
19. Lee, J. H.; Cosgrove, B. D.; Lauffenburger, D. A.; Han, J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131 (30) 10340-10341
20. Cheow, L. F.; Ko, S. H.; Kim, S. J.; Kang, K. H.; Han, J. Anal. Chem. 2010, 82 (8) 3383-3388
21. Jung, B.; Bharadwaj, R.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2006, 78 (7) 2319-2327
22. Ross, D.; Locascio, L. E. Anal. Chem. 2002, 74 (11) 2556-2564
23. Remenyi, A.; Good, M. C.; Lim, W. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16 (6) 676-685
24. Shults, M. D.; Janes, K. A.; Lauffenburger, D. A.; Imperiali, B. Nat. Methods 2005, 2 (4) 277-284
25. Stains, C. I.; Luković, E.; Imperiali, B. ACS Chem. Biol. 2010, 6 (1) 101-105
26. Stains, C. I.; Tedford, N. C.; Walkup, T. C.; Luković, E.; Goguen, B. N.; Griffith, L. G.; Lauffenburger, D. A.; Imperiali, B. Chem. Biol. 2012, 19 (2) 210-217
27. Suresh Babu, C. V.; Cho, S. G.; Sook Yoo, Y. Electrophoresis 2005, 26 (19) 3765-3772
28. Schilling, E. A.; Kamholz, A. E.; Yager, P. Anal. Chem. 2002, 74 (8) 1798-1804
29. Waters, L. C.; Jacobson, S. C.; Kroutchinina, N.; Khandurina, J.; Foote, R. S.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 1998, 70 (1) 158-162
30. Gao, J.; Yin, X. F.; Fang, Z. L. Lab Chip 2004, 4 (1) 47-52
31. Lu, H.; Schmidt, M. A.; Jensen, K. F. Lab Chip 2005, 5 (1) 23-29
32. Ferrell, J. E., Jr. Trends Biochem. Sci. 1996, 21 (12) 460-466
33. Ottesen, E. A.; Hong, J. W.; Quake, S. R.; Leadbetter, J. R. Science 2006, 314 (5804) 1464-1467
34. Rissin, D. M.; Walt, D. R. Nano Lett. 2006, 6 (3) 520-523
35. Li, L.; Du, W.; Ismagilov, R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 132 (1) 106-111
36. Kumar, N.; Afeyan, R.; Kim, H. D.; Lauffenburger, D. A. Mol. Pharmacol. 2008, 73 (6) 1668-1678
37. Wynn, M. L.; Ventura, A. C.; Sepulchre, J. A.; García, H. J.; Merajver, S. D. BMC Syst. Biol. 2011, 5 (1) 156
38. Perez, O. D.; Nolan, G. P. Nat. Biotechnol. 2002, 20 (2) 155-162
39. Bodenmiller, B.; Zunder, E. R.; Finck, R.; Chen, T. J.; Savig, E. S.; Bruggner, R. V.; Simonds, E. F.; Bendall, S. C.; Sachs, K.; Krutzik, P. O. Nat. Biotechnol. 2012, 30 (9) 858-867
40. Quist, J.; Janssen, K. G.; Vulto, P.; Hankemeier, T.; van der Linden, H. J. Anal. Chem. 2011, 83 (20) 7910-7915
41. Khurana, T. K.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2008, 80 (16) 6300-6307
42. Bercovici, M.; Kaigala, G. V.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2010, 82 (5) 2134-2138
43. Jalali-Heravi, M.; Shen, Y.; Hassanisadi, M.; Khaledi, M. G. Electrophoresis 2005, 26 (10) 1874-1885
44. Janini, G. M.; Metral, C. J.; Issaq, H. J.; Muschik, G. M. J. Chromatogr. A 1999, 848 (1) 417-433
45. Ko, S. H.; Kim, S. J.; Cheow, L. F.; Li, L. D.; Kang, K. H.; Han, J. Lab Chip 2011, 11 (7) 1351-1358
46. Rau, K. R.; Quinto-Su, P. A.; Hellman, A. N.; Venugopalan, V. Biophys. J. 2006, 91 (1) 317-329
47. Miller, M. A.; Barkal, L.; Jeng, K.; Herrlich, A.; Moss, M.; Griffith, L. G.; Lauffenburger, D. A. Integr. Biol. 2011, 3 (4) 422-438