Far-red organic fluorophores contain a fluorescent impurity

ChemPhysChem

Volumn 15, Issue 11, 2014, Pages 2240-2246

  Stone, Matthew B ^a   Veatch, Sarah L ^a  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

fluorescence; fluorescent probes; live cells; quantitative imaging; super resolution imaging

Indexed keywords

COLORING AGENT; FLUORESCENT DYE;

ANIMAL; ARTIFACT; CHEMISTRY; FLUORESCENCE MICROSCOPY; IMAGE PROCESSING; MOUSE; PROCEDURES; TUMOR CELL LINE;

ANIMALS; ARTIFACTS; CELL LINE, TUMOR; COLORING AGENTS; FLUORESCENT DYES; IMAGE PROCESSING, COMPUTER-ASSISTED; MICE; MICROSCOPY, FLUORESCENCE;

EID: 84904966494     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.201402002     Document Type: Article

References (37)

1. M. Heilemann, E. Margeat, R. Kasper, M. Sauer, P. Tinnefeld, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3801-3806.
2. T. Ha, P. Tinnefeld, Annu. Rev. Phys. Chem. 2012, 63, 595-617.
3. G. T. Dempsey, J. C. Vaughan, K. H. Chen, M. Bates, X. Zhuang, Nat. Methods 2011, 8, 1027-1036.
4. G. T. Dempsey, M. Bates, W. E. Kowtoniuk, D. R. Liu, R. Y. Tsien, X. Zhuang, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 18192-18193.
5. H. Bock, C. Geisler, C. A. Wurm, C. von Middendorff, S. Jakobs, A. Schönle, A. Egner, S. W. Hell, C. Eggeling, Appl. Phys. B 2007, 88, 161-165.
6. L. S. Churchman, Z. Ökten, R. S. Rock, J. F. Dawson, J. A. Spudich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 1419-1423.
7. H. Shroff, C. G. Galbraith, J. A. Galbraith, H. White, J. Gillette, S. Olenych, M. W. Davidson, E. Betzig, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 20308-20313.
8. F. V. Subach, G. H. Patterson, S. Manley, J. M. Gillette, J. Lippincott-Schwartz, V. V. Verkhusha, Nat. Methods 2009, 6, 153-159.
9. G. Patterson, M. Davidson, S. Manley, J. Lippincott-Schwartz, Annu. Rev. Phys. Chem. 2010, 61, 345-367.
10. M. Bates, B. Huang, G. T. Dempsey, X. Zhuang, Science 2007, 317, 1749-1753.
11. S. Semrau, L. Holtzer, M. González-Gaitán, T. Schmidt, Biophys. J. 2011, 100, 1810-1818.
12. S. L. Veatch, B. B. Machta, S. A. Shelby, E. N. Chiang, D. A. Holowka, B. A. Baird, PloS One 2012, 7, e 31457.
13. T. Toplak, E. Pandzic, L. Chen, M. Vicente-Manzanares, A. R. Horwitz, P. W. Wiseman, Biophys. J. 2012, 103, 1672-1682.
14. A. Dupont, K. Stirnnagel, D. Lindemann, D. C. Lamb, Biophys. J. 2013, 104, 2373-2382.
15. S. A. McKinney, C. S. Murphy, K. L. Hazelwood, M. W. Davidson, L. L. Looger, Nat. Methods 2009, 6, 131-133.
16. M. Zhang, H. Chang, Y. Zhang, J. Yu, L. Wu, W. Ji, J. Chen, B. Liu, J. Lu, Y. Liu, et al., Nat. Methods 2012, 9, 727-729.
17. A. K. Chibisov, G. V. Zakharova, H. Görner, Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 44-49.
18. H. J. Gruber, C. D. Hahn, G. Kada, C. K. Riener, G. S. Harms, W. Ahrer, T. G. Dax, H. G. Knaus, Bioconjugate Chem. 2000, 11, 696-704.
19. J. E. Berlier, A. Rothe, G. Buller, J. Bradford, D. R. Gray, B. J. Filanoski, W. G. Telford, S. Yue, J. Liu, C.-Y. Cheung, et al., J. Histochem. Cytochem. 2003, 51, 1699-1712.
20. F. V. Subach, G. H. Patterson, M. Renz, J. Lippincott-Schwartz, V. V. Verkhusha, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6481-6491.
21. J. C. M. Gebhardt, D. M. Suter, R. Roy, Z. W. Zhao, A. R. Chapman, S. Basu, T. Maniatis, X. S. Xie, Nat. Methods 2013, 10, 421-426.
22. A. Gahlmann, J. L. Ptacin, G. Grover, S. Quirin, A. R. S. von Diezmann, M. K. Lee, M. P. Backlund, L. Shapiro, R. Piestun, W. E. Moerner, Nano Lett. 2013, 13, 987-993.
23. M. S. Gunewardene, F. V. Subach, T. J. Gould, G. P. Penoncello, M. V. Gudheti, V. V. Verkhusha, S. T. Hess, Biophys. J. 2011, 101, 1522-1528.
24. I. Izeddin, C. G. Specht, M. Lelek, X. Darzacq, A. Triller, C. Zimmer, M. Dahan, PloS One 2011, 6, e 15611.
25. S. Wilmes, M. Staufenbiel, D. Lisse, C. P. Richter, O. Beutel, K. B. Busch, S. T. Hess, J. Piehler, Angew. Chem. 2012, 124, 4952-4955
26. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 4868-4871.
27. U. Endesfelder, S. Malkusch, B. Flottmann, J. Mondry, P. Liguzinski, P. J. Verveer, M. Heilemann, Molecules 2011, 16, 3106-3118.
28. S.-H. Shim, C. Xia, G. Zhong, H. P. Babcock, J. C. Vaughan, B. Huang, X. Wang, C. Xu, G.-Q. Bi, X. Zhuang, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2012, ##DOI:.
29. V. Mennella, B. Keszthelyi, K. L. McDonald, B. Chhun, F. Kan, G. C. Rogers, B. Huang, D. A. Agard, Nat. Cell Biol. 2012, 14, 1159-1168.
30. S. A. Jones, S.-H. Shim, J. He, X. Zhuang, Nat. Methods 2011, 8, 499-505.
31. I. Nikic̈, T. Plass, O. Schraidt, J. Szymański, J. A. G. Briggs, C. Schultz, E. A. Lemke, Angew. Chem. 2014, 126, 2278-2282
32. Angew. Chem. Int. Ed. 2014, 53, 2245-2249.
33. J. R. Grover, G. N. Llewellyn, F. Soheilian, K. Nagashima, S. L. Veatch, A. Ono, J. Virol. 2013, JVI. 03526-12.
34. D. Kim, N. M. Curthoys, M. T. Parent, S. T. Hess, J. Opt. 2013, 15, 094011.
35. P. S. Pyenta, D. Holowka, B. Baird, Biophys. J. 2001, 80, 2120-2132.
36. J. Widengren, P. Schwille, J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6416-6428.
37. H. S. Muddana, T. T. Morgan, J. H. Adair, P. J. Butler, Nano Lett. 2009, 9, 1559-1566.