Effects of hydrophobic interaction strength on the self-assembled structures of model peptides

Soft Matter

Volumn 10, Issue 27, 2014, Pages 4956-4965

  Mu, Yan ^a   Yu, Meng ^a  

^a SOUTH CHINA UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOINFORMATICS; CATIONIC SURFACTANTS; HYDROPHOBIC CHROMATOGRAPHY; HYDROPHOBICITY; MONTE CARLO METHODS; NANOSTRUCTURES; SELF ASSEMBLY;

COARSE GRAINED MODELS; FABRICATION STRATEGIES; HYDROPHOBIC INTERACTIONS; PEPTIDE SELF ASSEMBLIES; SELF ASSEMBLED STRUCTURES; SELF-ASSEMBLED PEPTIDES; SELF-ASSEMBLY BEHAVIORS; WEAK INTERMOLECULAR INTERACTIONS;

PEPTIDES;

PEPTIDE;

CHEMICAL PHENOMENA; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; MONTE CARLO METHOD; PROTEIN CONFORMATION; TEMPERATURE;

COMPUTER SIMULATION; HYDROPHOBIC AND HYDROPHILIC INTERACTIONS; MODELS, MOLECULAR; MONTE CARLO METHOD; PEPTIDES; PROTEIN CONFORMATION; TEMPERATURE;

EID: 84902687818     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4sm00378k     Document Type: Article

References (61)

1. C. M. Dobson Trends Biochem. Sci. 1999 24 329 332
2. J. W. Kelly Nat. Struct. Biol. 2002 9 323 325
3. E. Zerovnik Eur. J. Biochem. 2002 269 3362 3371
4. F. Chiti and C. M. Dobson, in Annual Review of Biochemistry, Annual Reviews, Palo Alto, 2006, vol. 75, pp. 333-366
5. P. T. Lansbury H. A. Lashuel Nature 2006 443 774 779
6. M. Reches E. Gazit Curr. Nanosci. 2006 2 105 111
7. J. D. Hartgerink E. Beniash S. I. Stupp Science 2001 294 1684 1688
8. A. Aggeli M. Bell N. Boden J. N. Keen P. F. Knowles T. C. B. McLeish M. Pitkeathly S. E. Radford Nature 1997 386 259 262
9. J. D. Hartgerink J. R. Granja R. A. Milligan M. R. Ghadiri J. Am. Chem. Soc. 1996 118 43 50
10. S. Vauthey S. Santoso H. Y. Gong N. Watson S. G. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 5355 5360
11. C. C. Cenker S. Bucak U. Olsson Soft Matter 2011 7 4868 4875
12. A. Mahler M. Reches M. Rechter S. Cohen E. Gazit Adv. Mater. 2006 18 1365 1370
13. C. Sinthuvanich L. A. Haines-Butterick K. J. Nagy J. P. Schneider Biomaterials 2012 33 7478 7488
14. T. C. Holmes S. de Lacalle X. Su G. S. Liu A. Rich S. G. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 6728 6733
15. G. A. Silva C. Czeisler K. L. Niece E. Beniash D. A. Harrington J. A. Kessler S. I. Stupp Science 2004 303 1352 1355
16. R. G. Ellis-Behnke Y. X. Liang S. W. You D. K. C. Tay S. G. Zhang K. F. So G. E. Schneider Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 5054 5059
17. Y. Nagai L. D. Unsworth S. Koutsopoulos S. G. Zhang J. Controlled Release 2006 115 18 25
18. F. Zhao M. L. Ma B. Xu Chem. Soc. Rev. 2009 38 883 891
19. S. Koutsopoulos L. D. Unsworth Y. Nagaia S. G. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 4623 4628
20. T. J. Measey R. Schweitzer-Stenner V. Sa K. Kornev Macromolecules 2010 43 7800 7806
21. J. F. Smith T. P. J. Knowles C. M. Dobson C. E. MacPhee M. E. Welland Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 15806 15811
22. R. Fairman K. S. Akerfeldt Curr. Opin. Struct. Biol. 2005 15 453 463
23. I. Cherny E. Gazit Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 4062 4069
24. K. Morris L. Serpell Chem. Soc. Rev. 2010 39 3445 3453
25. X. B. Zhao F. Pan H. Xu M. Yaseen H. H. Shan C. A. E. Hauser S. G. Zhang J. R. Lu Chem. Soc. Rev. 2010 39 3480 3498
26. P. Sikorski E. D. T. Atkins L. C. Serpell Structure 2003 11 915 926
27. T. Luhrs C. Ritter M. Adrian D. Riek-Loher B. Bohrmann H. Doeli D. Schubert R. Riek Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 17342 17347
28. P. Sikorski M. Wada L. Heux H. Shintani B. T. Stokke Macromolecules 2004 37 4547 4553
29. K. C. Holmes D. Popp W. Gebhard W. Kabsch Nature 1990 347 44 49
30. T. Oda M. Iwasa T. Aihara Y. Maeda A. Narita Nature 2009 457 441 445
31. D. Papapostolou A. M. Smith E. D. T. Atkins S. J. Oliver M. G. Ryadnov L. C. Serpell D. N. Woolfson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 10853 10858
32. M. R. Dreher A. J. Simnick K. Fischer R. J. Smith A. Patel M. Schmidt A. Chilkoti J. Am. Chem. Soc. 2008 130 687 694
33. Y. Qiao Y. Y. Lin Z. Y. Yang H. F. Chen S. F. Zhang Y. Yan J. B. Huang J. Phys. Chem. B 2010 114 11725 11730
34. R. Sabate A. Villar-Pique A. Espargaro S. Ventura Biomacromolecules 2012 13 474 483
35. J. Zurdo J. I. Guijarro J. L. Jimenez H. R. Saibil C. M. Dobson J. Mol. Biol. 2001 311 325 340
36. Y. S. Hong R. L. Legge S. Zhang P. Chen Biomacromolecules 2003 4 1433 1442
37. Y. Zimenkov S. N. Dublin R. Ni R. S. Tu V. Breedveld R. P. Apkarian V. P. Conticello J. Am. Chem. Soc. 2006 128 6770 6771
38. K. Giri N. P. Bhattacharyya S. Basak Biophys. J. 2007 92 293 302
39. B. Ozbas J. Kretsinger K. Rajagopal J. P. Schneider D. J. Pochan Macromolecules 2004 37 7331 7337
40. Y. Hong M. D. Pritzker R. L. Legge P. Chen Colloids Surf., B 2005 46 152 161
41. V. Castelletto I. W. Hamley C. Cenker U. Olsson J. Phys. Chem. B 2010 114 8002 8008
42. W. Hwang B. H. Kim R. Dandu J. Cappello H. Ghandehari J. Seog Langmuir 2009 25 12682 12686
43. G. Demirel F. Buyukserin Langmuir 2011 27 12533 12538
44. P. Kumaraswamy R. Lakshmanan S. Sethuraman U. M. Krishnan Soft Matter 2011 7 2744 2754
45. L. Zhang J. Zhong L. X. Huang L. J. Wang Y. K. Hong Y. L. Sha J. Phys. Chem. B 2008 112 8950 8954
46. J. T. Meijer M. Roeters V. Viola D. W. P. M. Lowik G. Vriend J. C. M. van Hest Langmuir 2007 23 2058 2063
47. S. Han S. Cao Y. Wang J. Wang D. Xia H. Xu X. Zhao J. R. Lu Chem.-Eur. J. 2011 17 13095 13102
48. W. M. Berhanu U. H. E. Hansmann Protein Sci. 2012 21 1837 1848
49. L. N. Zhao Y. Mu L. Y. Chew Phys. Chem. Chem. Phys. 2013 15 14098 14106
50. R. Ni S. Abeln M. Schor M. A. C. Stuart P. G. Bolhuis Phys. Rev. Lett. 2013 111 058101
51. S. Takada Z. Luthey-Schulten P. G. Wolynes J. Chem. Phys. 1999 110 11616 11629
52. A. V. Smith C. K. Hall Proteins: Struct., Funct., Genet. 2001 44 344 360
53. N. Y. Chen Z. Y. Su C. Y. Mou Phys. Rev. Lett. 2006 96 078103
54. Y. Mu Y. Q. Gao Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2009 80 041927
55. Y. Mu Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2011 84 031906
56. M. R. Betancourt J. Chem. Phys. 2005 123 174905
57. L. D. Landau and E. M. Lifshitz, Statistical Physics Butterworth- Heinemann, Oxford, 1980
58. H. D. Nguyen C. K. Hall J. Am. Chem. Soc. 2006 128 1890 1901
59. J. P. Bernacki R. M. Murphy Biochemistry 2011 50 9200 9211
60. S. E. Blondelle B. Forood R. A. Houghten E. PerezPaya Biochemistry 1997 36 8393 8400
61. T. D. Do N. J. Economou N. E. LaPointe W. M. Kincannon C. Bleiholder S. C. Feinstein D. B. Teplow S. K. Buratto M. T. Bowers J. Phys. Chem. B 2013 117 8436 8446