Label-free absolute quantitation of oligosaccharides using multiple reaction monitoring

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 5, 2014, Pages 2640-2647

  Hong, Qiuting ^a   Ruhaak, L Renee ^a   Totten, Sarah M ^a   Smilowitz, Jennifer T ^a   German, J Bruce ^a   Lebrilla, Carlito B ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALIBRATION CURVES; COLLISION-INDUCED DISSOCIATION; DETECTION LIMITS; HUMAN MILK OLIGOSACCHARIDES; MULTIPLE REACTION MONITORING; ORDERS OF MAGNITUDE; RESPONSE FACTOR; SINGLY CHARGED;

OLIGOSACCHARIDES; SACCHARIFICATION;

CALIBRATION;

OLIGOSACCHARIDE;

LIMIT OF DETECTION; MASS SPECTROMETRY;

LIMIT OF DETECTION; MASS SPECTROMETRY; OLIGOSACCHARIDES;

EID: 84900675178     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac404006z     Document Type: Article

References (45)

1. Bakhtiar, R.; Lohne, J.; Ramos, L.; Khemani, L.; Hayes, M.; Tse, F. J. Chromatogr., B 2002, 768, 325-340
2. Li, A. C.; Alton, D.; Bryant, M. S.; Shou, W. Z. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2005, 19, 1943-1950
3. Ross, A. R. S.; Ambrose, S. J.; Cutler, A. J.; Allan Feurtado, J.; Kermode, A. R.; Nelson, K.; Zhou, R.; Abrams, S. R. Anal. Biochem. 2004, 329, 324-333
4. Bennett, B. D.; Kimball, E. H.; Gao, M.; Osterhout, R.; Van Dien, S. J.; Rabinowitz, J. D. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 593-599
5. Barnidge, D. R.; Goodmanson, M. K.; Klee, G. G.; Muddiman, D. C. J. Proteome Res. 2004, 3, 644-652
6. Pan, S.; Aebersold, R.; Chen, R.; Rush, J.; Goodlett, D. R.; McIntosh, M. W.; Zhang, J.; Brentnall, T. A. J. Proteome Res. 2008, 8, 787-797
7. Anderson, L.; Hunter, C. L. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5, 573-588
8. Song, E.; Pyreddy, S.; Mechref, Y. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2012, 26, 1941-1954
9. Sanda, M.; Pompach, P.; Brnakova, Z.; Wu, J.; Makambi, K.; Goldman, R. Mol. Cell. Proteomics 2013, 12, 1294-1305
10. Hong, Q.; Lebrilla, C. B.; Miyamoto, S.; Ruhaak, L. R. Anal. Chem. 2013, 85, 8585-8593
11. Viverge, D.; Grimmonprez, L.; Cassanas, G.; Bardet, L.; Bonnet, H.; Solere, M. Ann. Nutr. Metab. 1985, 29, 1-11
12. Coppa, G. V.; Pierani, P.; Zampini, L.; Carloni, I.; Carlucci, A.; Gabrielli, O. Acta Paediatr. 1999, 88, 89-94
13. Kunz, C.; Rudloff, S.; Baier, W.; Klein, N.; Strobel, S. Annu. Rev. Nutr. 2000, 20, 699-722
14. Gnoth, M. J.; Kunz, C.; Kinne-Saffran, E.; Rudloff, S. J. Nutr. 2000, 130, 3014-3020
15. Coppa, G. V.; Zampini, L.; Galeazzi, T.; Facinelli, B.; Ferrante, L.; Capretti, R.; Orazio, G. Pediatr. Res. 2006, 59, 377-382
16. Jantscher-Krenn, E.; Zherebtsov, M.; Nissan, C.; Goth, K.; Guner, Y. S.; Naidu, N.; Choudhury, B.; Grishin, A. V.; Ford, H. R.; Bode, L. Gut 2012, 61, 1417-1425
17. Marcobal, A.; Sonnenburg, J. L. Clin. Microbiol. Infect. 2012, 18 (Suppl 4) 12-15
18. Ninonuevo, M. R.; Park, Y.; Yin, H. F.; Zhang, J. H.; Ward, R. E.; Clowers, B. H.; German, J. B.; Freeman, S. L.; Killeen, K.; Grimm, R.; Lebrilla, C. B. J. Agric. Food Chem. 2006, 54, 7471-7480
19. Wu, S.; Tao, N. N.; German, J. B.; Grimm, R.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2010, 9, 4138-4151
20. Wu, S.; Grimm, R.; German, J. B.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2011, 10, 856-868
21. Kobata, A. Proc. Jpn. Acad., Ser. B 2010, 86, 731-747
22. Bode, L.; Jantscher-Krenn, E. Adv. Nutr. 2012, 3, 383S-391S
23. LoCascio, R. G.; Ninonuevo, M. R.; Freeman, S. L.; Sela, D. A.; Grimm, R.; Lebrilla, C. B.; Mills, D. A.; German, J. B. J. Agric. Food Chem. 2007, 55, 8914-8919
24. Kunz, C.; Rudloff, S.; Hintelmann, A.; Pohlentz, G.; Egge, H. J. Chromatogr. B: Biomed. Sci. Appl. 1996, 685, 211-221
25. Hardy, M. R.; Townsend, R. R. Carbohydr. Res. 1989, 188, 1-7
26. Townsend, R. R.; Hardy, M. R.; Cumming, D. A.; Carver, J. P.; Bendiak, B. Anal. Biochem. 1989, 182, 1-8
27. Townsend, R. R.; Hardy, M. R.; Lee, Y. C. Methods Enzymol. 1989, 179, 65-76
28. Sumiyoshi, W.; Urashima, T.; Nakamura, T.; Arai, I.; Saito, T.; Tsumura, N.; Wang, B.; Brand-Miller, J.; Watanabe, Y.; Kimura, K. Br. J. Nutr. 2003, 89, 61-69
29. Asakuma, S.; Urashima, T.; Akahori, M.; Obayashi, H.; Nakamura, T.; Kimura, K.; Watanabe, Y.; Arai, I.; Sanai, Y. Eur. J. Clin. Nutr. 2008, 62, 488-494
30. Leo, F.; Asakuma, S.; Fukuda, K.; Senda, A.; Urashima, T. Biosci., Biotechnol., Biochem. 2010, 74, 298-303
31. Leo, F.; Asakuma, S.; Nakamura, T.; Fukuda, K.; Senda, A.; Urashima, T. J. Chromatogr., A 2009, 1216, 1520-1523
32. Fong, B.; Ma, K.; Mcjarrow, P. J. Agric. Food Chem. 2011, 59, 9788-9795
33. Santos-Fandila, A.; Zafra-Gómez, A.; Vazquez, E.; Navalón, A.; Rueda, R.; Ramírez, M. Talanta 2014, 118, 137-146
34. Tao, N.; DePeters, E. J.; German, J. B.; Grimm, R.; Lebrilla, C. B. J. Dairy Sci. 2009, 92, 2991-3001
35. Oriol, R.; Le Pendu, J.; Mollicone, R. Vox Sang. 1986, 51, 161-171
36. Totten, S. M.; Zivkovic, A. M.; Wu, S.; Ngyuen, U.; Freeman, S. L.; Ruhaak, L. R.; Darboe, M. K.; German, J. B.; Prentice, A. M.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2012, 11, 6124-6133
37. Xiao, J. F.; Zhou, B.; Ressom, H. W. TrAC, Trends Anal. Chem. 2012, 32, 1-14
38. Kitteringham, N. R.; Jenkins, R. E.; Lane, C. S.; Elliott, V. L.; Park, B. K. J. Chromatogr., B 2009, 877, 1229-1239
39. Gallien, S.; Duriez, E.; Domon, B. J. Mass Spectrom. 2011, 46, 298-312
40. Kelly, R. T.; Tolmachev, A. V.; Page, J. S.; Tang, K.; Smith, R. D. Mass Spectrom. Rev. 2010, 29, 294-312
41. Shaffer, S. A.; Tang, K.; Anderson, G. A.; Prior, D. C.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1997, 11, 1813-1817
42. Wheeler, S. F.; Harvey, D. J. Anal. Chem. 2000, 72, 5027-5039
43. Bao, Y.; Chen, C.; Newburg, D. S. Anal. Biochem. 2013, 433, 28-35
44. Thurl, S.; Munzert, M.; Henker, J.; Boehm, G.; Muller-Werner, B.; Jelinek, J.; Stahl, B. Br. J. Nutr. 2010, 104, 1261-1271
45. Thurl, S.; Henker, J.; Siegel, M.; Tovar, K.; Sawatzki, G. Glycoconjugate J. 1997, 14, 795-799