Quantification of viral proteins of the avian H7 subtype of influenza virus: An isotope dilution mass spectrometry method applicable for producing more rapid vaccines in the case of an influenza pandemic

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 9, 2014, Pages 4088-4095

  Santana, Wanda I ^a   Williams, Tracie L ^a   Winne, Emily K ^a   Pirkle, James L ^a   Barr, John R ^a  

^a NATIONAL CENTER FOR ENVIRONMENTAL HEALTH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; ISOTOPES; MASS SPECTROMETRY; PEPTIDES; VIRUSES;

ENZYMATIC DIGESTIONS; INFLUENZA PANDEMICS; INFLUENZA VIRUS; ISOTOPE DILUTION MASS SPECTROMETRY; RAPID RESPONSE; SPECIFIC DETECTION; SURFACE PROTEINS; VIRAL PROTEINS;

VACCINES;

INFLUENZA VACCINE; VIRUS PROTEIN;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMAL; AVIAN INFLUENZA; BIRD; CHEMISTRY; IMMUNOLOGY; INFLUENZA VIRUS A; LIQUID CHROMATOGRAPHY; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS; PROCEDURES; SEQUENCE HOMOLOGY; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; BIRDS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; INFLUENZA A VIRUS; INFLUENZA IN BIRDS; INFLUENZA VACCINES; MOLECULAR SEQUENCE DATA; SEQUENCE HOMOLOGY, AMINO ACID; TANDEM MASS SPECTROMETRY; VIRAL PROTEINS;

EID: 84899825144     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac4040778     Document Type: Article

References (32)

1. Subbarao, K.; Joseph, T. Nat. Rev. Immunol. 2007, 7, 267-278
2. Gerdil, C. Vaccine 2003, 21, 1776-1779
3. Alexander, D. J. Vet. Microbiol. 2000, 74, 3-13
4. Liu, W.; Zhu, Y.; Qi, X.; Xu, K.; Ge, A.; Ji, H.; Ai, J.; Bao, C.; Tang, F.; Zhou, M. J. Biomed. Res. 2013, 27, 163-166
5. Bridges, C. B.; Lim, W.; Hu-Primmer, J.; Sims, L.; Fukuda, K.; Mak, K. H.; Rowe, T.; Thompson, W. W.; Conn, L.; Lu, X.; Cox, N. J.; Katz, J. M. J. Infect. Dis. 2002, 185, 1005-1010
6. Mounts, A. W.; Kwong, H.; Izurieta, H. S.; Ho, Y.; Au, T.; Lee, M.; Buxton Bridges, C.; Williams, S. W.; Mak, K. H.; Katz, J. M.; Thompson, W. W.; Cox, N. J.; Fukuda, K. J. Infect. Dis. 1999, 180, 505-508
7. Webster, R. G.; Peiris, M.; Chen, H.; Guan, Y. Emerging Infect. Dis. 2006, 12, 3-8
8. Areechokchai, D.; Jiraphongsa, C.; Laosiritaworn, Y.; Hanshaoworakul, W.; O'Reilly, M. MMWR: Morbidity and Mortality Weekly Report 2006, 55 (Suppl 1) 3-6
9. Salzberg, S. L.; Kingsford, C.; Cattoli, G.; Spiro, D. J.; Janies, D. A.; Aly, M. M.; Brown, I. H.; Couacy-Hymann, E.; De Mia, G. M.; Dung do, H.; Guercio, A.; Joannis, T.; Maken Ali, A. S.; Osmani, A.; Padalino, I.; Saad, M. D.; Savic, V.; Sengamalay, N. A.; Yingst, S.; Zaborsky, J.; Zorman-Rojs, O.; Ghedin, E.; Capua, I. Emerging Infect. Dis. 2007, 13, 713-718
10. Wood, J. M. Philos. Trans. R. Soc., B 2001, 356, 1953-1960
11. Webby, R. J.; Perez, D. R.; Coleman, J. S.; Guan, Y.; Knight, J. H.; Govorkova, E. A.; McClain-Moss, L. R.; Peiris, J. S.; Rehg, J. E.; Tuomanen, E. I.; Webster, R. G. Lancet 2004, 363, 1099-1103
12. Hayden, F. G.; Abdel-Ghafar, A. N.; Chotpitayasunondh, T.; Gao, Z. C.; Hien, N. D.; de Jong, M. D.; Naghdaliyev, A.; Peiris, J. S. M.; Shindo, N.; Soeroso, S.; Uyeki, T. M. N. Engl. J. Med. 2008, 358, 261-273
13. Ai, J.; Huang, Y.; Xu, K.; Ren, D.; Qi, X.; Ji, H.; Ge, A.; Dai, Q.; Li, J.; Bao, C.; Tang, F.; Shi, G.; Shen, T.; Zhu, Y.; Zhou, M.; Wang, H. Euro Surveillance: Bulletin Européen sur les Maladies Transmissibles 2013, 18, 20510
14. Min, J. Y.; Vogel, L.; Matsuoka, Y.; Lu, B.; Swayne, D.; Jin, H.; Kemble, G.; Subbarao, K. J. Virol. 2010, 84, 11950-11960
15. Du Ry van Beest Holle, M.; Meijer, A.; Koopmans, M.; de Jager, C. M. Euro Surveillance: Bulletin Européen sur les Maladies Transmissibles 2005, 10, 264-268
16. Fouchier, R. A.; Schneeberger, P. M.; Rozendaal, F. W.; Broekman, J. M.; Kemink, S. A.; Munster, V.; Kuiken, T.; Rimmelzwaan, G. F.; Schutten, M.; Van Doornum, G. J.; Koch, G.; Bosman, A.; Koopmans, M.; Osterhaus, A. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 1356-1361
17. Nicoll, A.; Danielsson, N. Euro Surveillance: Bulletin Européen sur les Maladies Transmissibles 2013, 18, 20452
18. Li, Q.; Zhou, L.; Zhou, M.; Chen, Z.; Li, F.; Wu, H.; Xiang, N.; Chen, E.; Tang, F.; Wang, D.; Meng, L.; Hong, Z.; Tu, W.; Cao, Y.; Li, L.; Ding, F.; Liu, B.; Wang, M.; Xie, R.; Gao, R.; Li, X.; Bai, T.; Zou, S.; He, J.; Hu, J.; Xu, Y.; Chai, C.; Wang, S.; Gao, Y.; Jin, L.; Zhang, Y.; Luo, H.; Yu, H.; Gao, L.; Pang, X.; Liu, G.; Shu, Y.; Yang, W.; Uyeki, T. M.; Wang, Y.; Wu, F.; Feng, Z. N. Engl. J. Med. 2014, 370, 520-532
19. Kageyama, T.; Fujisaki, S.; Takashita, E.; Xu, H.; Yamada, S.; Uchida, Y.; Neumann, G.; Saito, T.; Kawaoka, Y.; Tashiro, M. Euro Surveillance: Bulletin Européen sur les Maladies Transmissibles 2013, 18, 20453
20. Wood, J. M.; Schild, G. C.; Newman, R. W.; Seagroatt, V. Dev. Biol. Stand. 1977, 39, 193-200
21. Wood, J. M.; Schild, G. C.; Newman, R. W.; Seagroatt, V. J. Biol. Standard. 1977, 5, 237-247
22. Williams, T. L.; Luna, L.; Guo, Z.; Cox, N. J.; Pirkle, J. L.; Donis, R. O.; Barr, J. R. Vaccine 2008, 26, 2510-2520
23. Williams, T. L.; Pirkle, J. L.; Barr, J. R. Vaccine 2012, 30, 2475-2482
24. Woolfitt, A. R.; Solano, M. I.; Williams, T. L.; Pirkle, J. L.; Barr, J. R. Anal. Chem. 2009, 81, 3979-3985
25. Yu, Y. Q.; Gilar, M.; Lee, P. J.; Bouvier, E. S.; Gebler, J. C. Anal. Chem. 2003, 75, 6023-6028
26. Caudill, S. P.; Schleicher, R. L.; Pirkle, J. L. Statistics in Medicine 2008, 27, 4094-4106
27. Barr, J. R.; Maggio, V. L.; Patterson, D. G., Jr.; Cooper, G. R.; Henderson, L. O.; Turner, W. E.; Smith, S. J.; Hannon, W. H.; Needham, L. L.; Sampson, E. J. Clin. Chem. 1996, 42, 1676-1682
28. Norrgran, J.; Williams, T. L.; Woolfitt, A. R.; Solano, M. I.; Pirkle, J. L.; Barr, J. R. Anal. Biochem. 2009, 393, 48-55
29. Andrews, P.; Arnott, J.; Farmar, J.; Ivanov, A.; Kowalak, J.; Lane, W.; Mechtler, K.; Ogorzalek Loo, R.; Raida, M. In The Association of Biomolecular Resource Facilities: Salt Lake City, 2008.
30. Mo, W.; Ma, Y.; Takao, T.; Neubert, T. A. Rapid Commun. Mass Spectrom 2000, 14, 2080-2081
31. Blake, T. A.; Williams, T. L.; Pirkle, J. L.; Barr, J. R. Anal. Chem. 2009, 81, 3109-3118
32. Sayers, E. W.; Barrett,.; Benson, D. A.; Bryant, S. H.; Canese, K.; Chetvernin, V.; Church, D. M.; DiCuccio, M.; Edgar, R.; Federhen, S.; Feolo, M.; Geer, L. Y.; Helmberg, W.; Kapustin, Y.; Landsman, D.; Lipman, D. J.; Lu, Z.; Madden, T. L.; Madej, T.; Maglott, D. R.; Marchler-Bauer, A.; Miller, V.; Mizrachi, I.; Ostell, J.; Panchenko, A.; Pruitt, K. D.; Schuler, G. D.; Sequeira, E.; Sherry, S. T.; Shumway, M.; Sirotkin, K.; Slotta, D.; Souvorov, A.; Starchenko, G.; Tatusova, T. A.; Wagner, L.; Wang, Y.; John Wilbur, W.; Yaschenko, E.; Ye, J. Nucleic Acids Res. 2010, D5-D16