Erratum: Force Field and a Surface Model Database for Silica to Simulate Interfacial Properties in Atomic Resolution (Chemistry of Materials (2014) 26:8 (2647-2658) DOI: 10.1021/cm500365c);Force field and a surface model database for silica to simulate interfacial properties in atomic resolution

Chemistry of Materials

Volumn 26, Issue 8, 2014, Pages 2647-2658

  Emami, Fateme S ^a   Puddu, Valeria ^b   Berry, Rajiv J ^c   Varshney, Vikas ^c   Patwardhan, Siddharth V ^d   Perry, Carole C ^b   Heinz, Hendrik ^a  

^a University of Akron   (United States)

^b NOTTINGHAM TRENT UNIVERSITY   (United Kingdom)

^c AIR FORCE RESEARCH LABORATORY   (United States)

^d UNIVERSITY OF STRATHCLYDE   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADSORPTION; BIOMOLECULES; DRUG DELIVERY; PHASE INTERFACES; SELF ASSEMBLY; SURFACE CHEMISTRY;

ADSORPTION FREE ENERGY; BINDING CONFORMATIONS; COMPUTATIONAL PREDICTIONS; DEGREE OF IONIZATION; MOLECULAR ADSORPTION; POTENTIAL MEASUREMENTS; SILICA NANOSTRUCTURES; SILICA-WATER INTERFACE;

SILICA;

EID: 84899407001     PISSN: 08974756     EISSN: 15205002     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.chemmater.5b04760     Document Type: Erratum

References (133)

1. Hoffmann, F.; Cornelius, M.; Morell, J.; Froba, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 3216
2. Iler, R. K. The Chemistry of Silica: Solubility, Polymerization, Colloid and Surface Properties, and Biochemistry; John Wiley & Sons: New York, 1979.
3. Slowing, II; Trewyn, B. G.; Giri, S.; Lin, V. S. Y. Adv. Funct. Mater. 2007, 17, 1225
4. Chattopadhyay, D. K.; Webster, D. C. Prog. Polym. Sci. 2009, 34, 1068
5. Paul, D. R.; Robeson, L. M. Polymer 2008, 49, 3187
6. Jouault, N.; Vallat, P.; Dalmas, F.; Said, S.; Jestin, J.; Boue, F. Macromolecules 2009, 42, 2031
7. Li, J.-R.; Kuppler, R. J.; Zhou, H.-C. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 1477
8. Markovic, A.; Stoltenberg, D.; Enke, D.; Schlunder, E. U.; Seidel-Morgenstern, A. J. Membr. Sci. 2009, 336, 17
9. Deng, Y.; Cai, Y.; Sun, Z.; Liu, J.; Liu, C.; Wei, J.; Li, W.; Liu, C.; Wang, Y.; Zhao, D. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 8466
10. Joo, S. H.; Park, J. Y.; Tsung, C.-K.; Yamada, Y.; Yang, P.; Somorjai, G. A. Nat. Mater. 2009, 8, 126
11. Chaudhuri, R. G.; Paria, S. Chem. Rev. 2012, 112, 2373
12. Mackowiak, S. A.; Schmidt, A.; Weiss, V.; Argyo, C.; von Schirnding, C.; Bein, T.; Bräuchle, C. Nano Lett. 2013, 13, 2576
13. Sanchez, C.; Julian, B.; Belleville, P.; Popall, M. J. Mater. Chem. 2005, 15, 3559
14. Ariga, K.; Vinu, A.; Yamauchi, Y.; Ji, Q.; Hill, J. P. Bull. Chem. Soc. Jpn. 2012, 85, 1
15. Ambrogio, M. W.; Thomas, C. R.; Zhao, Y. L.; Zink, J. I.; Stoddartt, J. F. Acc. Chem. Res. 2011, 44, 903
16. Hildebrand, M. Chem. Rev. 2008, 108, 4855
17. Sarthou, G.; Timmermans, K. R.; Blain, S.; Treguer, P. J. Sea Res. 2005, 53, 25
18. Sumper, M.; Brunner, E. Adv. Funct. Mater. 2006, 16, 17
19. Patwardhan, S. V.; Emami, F. S.; Berry, R. J.; Jones, S. E.; Naik, R. R.; Deschaume, O.; Heinz, H.; Perry, C. C. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 6244
20. Puddu, V.; Perry, C. C. ACS Nano 2012, 6, 6356
21. Kröger, N.; Deutzmann, R.; Sumper, M. Science 1999, 286, 1129
22. Kröger, N.; Lorenz, S.; Brunner, E.; Sumper, M. Science 2002, 298, 584
23. Kaehr, B.; Townson, J. L.; Kalinich, R. M.; Awad, Y. H.; Swartzentruber, B. S.; Dunphy, D. R.; Brinker, C. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 17336
24. Patwardhan, S. V. Chem. Commun. 2011, 47, 7567
25. Rimola, A.; Costa, D.; Sodupe, M.; Lambert, J.-F.; Ugliengo, P. Chem. Rev. 2013, 113, 4216
26. Cha, J. N.; Stucky, G. D.; Morse, D. E.; Deming, T. J. Nature 2000, 403, 289
27. Muller, W. E. G.; Schroder, H. C.; Burghard, Z.; Pisignano, D.; Wang, X. H. Chem.-Eur. J. 2013, 19, 5790
28. Patwardhan, S. V.; Clarson, S. J.; Perry, C. C. Chem. Commun. 2005, 1113
29. Perry, C. C.; Patwardhan, S. V.; Deschaume, O. Biochem. Soc. Trans. 2009, 37, 687
30. Ogasawara, W.; Shenton, W.; Davis, S. A.; Mann, S. Chem. Mater. 2000, 12, 2835
31. Stober, W.; Fink, A.; Bohn, E. J. Colloid Interface Sci. 1968, 26, 62
32. Vigil, G.; Xu, Z. H.; Steinberg, S.; Israelachvili, J. J. Colloid Interface Sci. 1994, 165, 367
33. Sanders, M. J.; Leslie, M.; Catlow, C. R. A. J. Chem. Soc.-Chem. Commun. 1984, 1271
34. van Beest, B. W. H.; Kramer, G. J. Phys. Rev. Lett. 1990, 64, 1955
35. Hill, J. R.; Sauer, J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 1238
36. Cruz-Chu, E. R.; Aksimentiev, A.; Schulten, K. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 21497
37. Hassanali, A. A.; Singer, S. J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 11181
38. Hassanali, A. A.; Zhang, H.; Knight, C.; Shin, Y. K.; Singer, S. J. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3456
39. Lopes, P. E. M.; Murashov, V.; Tazi, M.; Demchuk, E.; MacKerell, A. D. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 2782
40. Butenuth, A.; Moras, G.; Schneider, J.; Koleini, M.; Köppen, S.; Meißner, R.; Wright, L. B.; Walsh, T. R.; Ciacchi, L. C. Phys. Status Solidi B 2012, 249, 292
41. Flikkema, E.; Bromley, S. T. Chem. Phys. Lett. 2003, 378, 622
42. Goumans, T. P.; Wander, A.; Brown, W. A.; Catlow, C. R. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 2146
43. Skelton, A. A.; Fenter, P.; Kubicki, J. D.; Wesolowski, D. J.; Cummings, P. T. J. Phys. Chem. C 2011, 115, 2076
44. Feuston, B. P.; Garofalini, S. H. J. Chem. Phys. 1988, 89, 5818
45. Lockwood, G. K.; Garofalini, S. H. J. Chem. Phys. 2009, 131, 074703
46. Hill, J. R.; Sauer, J. J. Phys. Chem. 1995, 99, 9536
47. Chenoweth, K.; van Duin, A. C. T.; Goddard, W. A., III J. Phys. Chem. A. 2008, 112, 1040
48. Heinz, H.; Suter, U. W. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 18341
49. Heinz, H.; Koerner, H.; Anderson, K. L.; Vaia, R. A.; Farmer, B. L. Chem. Mater. 2005, 17, 5658
50. Heinz, H.; Lin, T.-J.; Mishra, R. K.; Emami, F. S. Langmuir 2013, 29, 1754
51. Zhuravlev, L. T. Colloids Surf., A 2000, 173, 1
52. Bolt, G. H. J. Phys. Chem. 1957, 61, 1166
53. Sonnefeld, J. J. Colloid Interface Sci. 1996, 183, 597
54. Tadros, T. F.; Lyklema, J. J. Electroanal. Chem. Interfacial Electrochem. 1968, 17, 267
55. Zerrouk, R.; Foissy, A.; Mercier, R.; Chevallier, Y.; Morawski, J.-C. J. Colloid Interface Sci. 1990, 139, 20
56. Heinz, H.; Vaia, R. A.; Farmer, B. L. J. Chem. Phys. 2006, 124, 224713
57. Mishra, R. K.; Flatt, R. J.; Heinz, H. J. Phys. Chem. C 2013, 117, 10417
58. Emami, F. S.; Puddu, V.; Berry, R. J.; Varshney, V.; Patwardhan, S. V.; Perry, C. C.; Heinz, H. Submitted.
59. MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L., Jr.; Evanseck, J. D.; Fields, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E., III; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, D.; Wiórkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586
60. Dauber-Osguthorpe, P.; Roberts, V. A.; Osguthorpe, D. J.; Wolff, J.; Genest, M.; Hagler, A. T. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1988, 4, 31
61. Pearlman, D. A.; Case, D. A.; Caldwell, J. W.; Ross, W. S.; Cheatham, T. E.; DeBolt, S.; Ferguson, D.; Seibel, G.; Kollman, P. Comput. Phys. Commin. 1995, 91, 1
62. Maple, J. R.; Thacher, T. S.; Dinur, U.; Hagler, A. T. Chem. Des. Autom. News 1990, 5, 5
63. Sun, H. J. Comput. Chem. 1994, 15, 752
64. Sun, H. Macromolecules 1995, 28, 701
65. Sun, H. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 7338
66. Ngo, T.; Schwarzenbach, D. Acta Crystallogr., Sect. A: Cryst. Phys., Diffr., Theor., Gen. Crystallogr. 1979, A35, 658
67. Lewis, J.; Schwarzenbach, D. Acta Crystallogr., Sect. A: Cryst. Phys., Diffr., Theor., Gen. Crystallogr. 1982, A38, 733
68. Belokonewa, E. L.; Gubina, Y. K.; Forsyth, J. B.; Brown, P. J. J. Phys. Chem. Min. 2002, 29, 430
69. Abendroth, R. P. J. Colloid Interface Sci. 1970, 34, 591
70. Yates, D. E.; Healy, T. W. J. Colloid Interface Sci. 1976, 55, 9
71. Milonjić, S. K. Colloids Surf. 1987, 23, 301
72. House, W. A.; Orr, D. R. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1992, 88, 233
73. Méndez, A.; Bosch, E.; Rosés, M.; Neue, U. D. J. Chromatogr. A 2003, 986, 33
74. Taylor, J. A. G.; Hockey, J. A. J. Phys. Chem. 1966, 70, 2169
75. Oren, E. E.; Tamerler, C.; Sahin, D.; Hnilova, M.; Seker, U. O. S.; Sarikaya, M.; Samudrala, R. Bioinformatics 2007, 23, 2816
76. Oren, E. E.; Notman, R.; Kim, I. W.; Spencer, E. J.; Walsh, T. R.; Samudrala, R.; Tamerler, C.; Sarikaya, M. Langmuir 2010, 26, 11003
77. Eteshola, E.; Brillson, L. J.; Lee, S. C. Biomol. Eng. 2005, 22, 201
78. Naik, R. R.; Brott, L. L.; Clarson, S. J.; Stone, M. O. J. Nanosci. Nanotechnol. 2002, 2, 95
79. Naik, R. R.; Stringer, S. J.; Agarwal, G.; Jones, S. E.; Stone, M. O. Nat. Mater. 2002, 1, 169
80. Ruan, L.; Ramezani-Dakhel, H.; Chiu, C. Y.; Zhu, E.; Li, Y.; Heinz, H.; Huang, Y. Nano Lett. 2013, 13, 840
81. Heinz, H.; Farmer, B. L.; Pandey, R. B.; Slocik, J. M.; Patnaik, S. S.; Pachter, R.; Naik, R. R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 9704
82. Feng, J.; Pandey, R. B.; Berry, R. J.; Farmer, B. L.; Naik, R. R.; Heinz, H. Soft Matter 2011, 7, 2113
83. Feng, J.; Slocik, J. M.; Sarikaya, M.; Naik, R. R.; Farmer, B. L.; Heinz, H. Small 2012, 8, 1049
84. Fu, X.; Wang, Y.; Huang, L.; Sha, Y.; Gui, L.; Lai, L.; Tang, Y. Adv. Mater. 2003, 15, 902
85. Tamerler, C.; Sarikaya, M. Acta Biomater. 2007, 3, 289
86. Silica: Physical Behavior, Geochemistry, and Materials Applications. In Reviews in Mineralogy Heaney, P. J.; Prewitt, C. T.; Gibbs, G. V., Eds.; Mineralogical Society of America: New Jersey, 1994; Vol. 29.
87. Gommes, C. J.; Blacher, S.; Pirard, J.-P.; Scherer, G. W. J. Sol-Gel Sci. Technol. 2007, 44, 211
88. Zhang, H. Y.; Dunphy, D. R.; Jiang, X. M.; Meng, H.; Sun, B. B.; Tarn, D.; Xue, M.; Wang, X.; Lin, S. J.; Ji, Z. X.; Li, R. B.; Garcia, F. L.; Yang, J.; Kirk, M. L.; Xia, T.; Zink, J. I.; Nel, A.; Brinker, C. J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 15790
89. Zhuravlev, L. T. Langmuir 1987, 3, 316
90. Zhuravlev, L. T. Colloids Surf., A 1993, 74, 71
91. Lamb, R. N.; Furlong, D. N. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1982, 78, 61
92. Muster, T. H.; Prestidge, C. A.; Hayes, R. A. Colloids Surf., A 2001, 176, 253
93. Balard, H.; Donnet, J.-B.; Oulanti, H.; Gottschalk-Gaudig, T.; Barthel, H. Colloids Surf., A 2011, 378, 38
94. Douillard, J. M.; Elwafir, M.; Partyka, S. J. Colloid Interface Sci. 1994, 164, 238
95. Partyka, S.; Rouquerol, F.; Rouquerol, J. J. Colloid Interface Sci. 1979, 68, 21
96. Boyd, G. E.; Livingston, H. K. J. Am. Chem. Soc. 1942, 64, 2383
97. Baker, F. S.; Sing, K. S. W. J. Colloid Interface Sci. 1976, 55, 605
98. Dorémieux-Morin, C.; Heeribout, L.; Dumousseaux, C.; Fraissard, J.; Hommel, H.; Legrand, A. P. J. Am. Ceram. Soc. 1996, 118, 13040
99. Burneau, A.; Barrès, O.; Gallas, J. P.; Lavalley, J. C. Langmuir 1990, 6, 1364
100. Handke, M.; Mozgawa, W. Vib. Spectrosc. 1993, 5, 75
101. Liang, M.-K.; Deschaume, O.; Patwardhan, S. V.; Perry, C. C. J. Mater. Chem. 2011, 21, 80
102. Wallace, J. A.; Shen, J. K. J. Chem. Phys. 2012, 137, 184105
103. Heinz, H.; Castelijns, H. J.; Suter, U. W. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9500
104. Dera, P.; Lazarz, J. D.; Prakapenka, V. B.; Barkley, M.; Downs, R. T. Phys. Chem. Miner. 2011, 38, 517
105. Kihara, K. Eur. J. Mineral. 1990, 2, 63
106. Heinz, H.; Vaia, R. A.; Farmer, B. L.; Naik, R. R. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 17281
107. Holleman, A. F.; Wiberg, E. Inorganic Chemistry; Academic Press: New York, 1995.
108. Beglov, D.; Roux, B. J. Chem. Phys. 1994, 100, 9050
109. Joung, I. S.; Cheatham, T. E. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9020
110. Halgren, T. A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 7827
111. Heinz, H.; Vaia, R. A.; Farmer, B. L. J. Chem. Phys. 2006, 124, 224713
112. Batsanov, S. S. Inorg. Mater. 2001, 37, 871
113. CRC Handbook of Chemistry and Physics, 89 th ed.; Lide, D. R., Ed.; CRC Press: Boca Raton, FL, 2008.
114. Finnie, K. S.; Thompson, J. G.; Withers, R. L. J. Phys. Chem. Solids 1994, 55, 23
115. Kingma, K. J.; Hemley, R. J. Am. Mineral. 1994, 79, 269
116. Garofalini, S. H. J. Chem. Phys. 1982, 76, 3189
117. Zartman, G. D.; Liu, H.; Akdim, B.; Pachter, R.; Heinz, H. J. Phys. Chem. C 2010, 114, 1763
118. Heinz, H. J. Comput. Chem. 2010, 31, 1564
119. Oliver, W. C.; Pharr, G. M. J. Mater. Res. 1992, 7, 1564
120. Levien, L.; Prewitt, C. T.; Weidner, D. J. Am. Mineral. 1980, 65, 920
121. Kondo, S.; Fujiwara, H.; Ichii, T.; Tsuboi, I. J. Chem. Soc., Faraday Trans. I 1979, 75, 646
122. Donnet, J.-B.; Balard, H.; Nedjari, N.; Hamdi, B.; Barthel, H.; Gottschalk-Gaudig, T. J. Colloid Interface Sci. 2008, 328, 15
123. Knözinger, H. In The Hydrogen Bonds: III Dynamics, Thermodynamics and Special Systems; Schuster, P.; Zundel, G.; Sandorfy, C., Eds.; North Holland: Amsterdam, 1976; p 1329.
124. Hackerman, N.; Hall, A. C. J. Phys. Chem. 1958, 62, 1212
125. Staszczuk, P. Chromatographia 1985, 20, 724
126. Helmy, A. K.; de Bussetti, S. G.; Ferreiro, E. A. Appl. Surf. Sci. 2007, 253, 6878
127. Heinz, H. Clay Miner. 2012, 47, 205
128. Fu, Y. T.; Heinz, H. Philos. Mag. 2010, 90, 2415.
129. Schoonheydt, R. A.; Johnston, C. T. In The Surface Properties of Clay Minerals; Brigatti, M. F.; Mottana, A., Eds.; The European Mineralogical Union: Jena, Germany, 2011.
130. Gonzalez, L.; Lukamowicz-Rajska, M.; Thomassen, L. C. J.; Kirschhock, C. E. A.; Leyns, L.; Lison, D.; Martens, J. A.; Elhajouji, A.; Kirsch-Volders, M. Nanotoxicology 2014, 8, 876
131. Kishore, U.; Greenhough, T. J.; Waters, P.; Shrive, A. K.; Ghai, R.; Kamran, M. F.; Bernal, A. L.; Reid, K. B. M.; Madan, T.; Chakraborty, T. Mol. Immunol. 2006, 43, 1293
132. Scrivener, K. L.; Nonat, A. Cem. Concr. Res. 2011, 41, 651
133. Richardson, I. G. Cem. Concr. Res. 2008, 38, 137