World-to-digital-microfluidic interface enabling extraction and purification of RNA from human whole blood

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 8, 2014, Pages 3856-3862

  Jebrail, Mais J ^a   Sinha, Anupama ^a   Vellucci, Samantha ^a,b   Renzi, Ronald F ^a   Ambriz, Cesar ^a,c   Gondhalekar, Carmen ^a,d   Schoeniger, Joseph S ^a   Patel, Kamlesh D ^a   Branda, Steven S ^a  

^a SANDIA NATIONAL LABORATORIES   (United States)

^b Stratos Genomics   (United States)

^c STANFORD UNIVERSITY   (United States)

^d OREGON STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BLOOD; DIGITAL MICROFLUIDICS; DROP FORMATION; EXTRACTION; MEDICAL APPLICATIONS; POLYMERASE CHAIN REACTION; PURIFICATION; RNA;

COMPLEX PROTOCOLS; EXTRACTION AND PURIFICATIONS; LOW CONCENTRATIONS; PRECISE MANIPULATION; Q-RT-PCR; REAL-WORLD; SAMPLE PROCESSING; WHOLE BLOOD;

CHEMICAL ANALYSIS;

DYES, REAGENTS, INDICATORS, MARKERS AND BUFFERS; RNA;

BLOOD; EQUIPMENT DESIGN; HUMAN; ISOLATION AND PURIFICATION; MICROFLUIDIC ANALYSIS; MICROFLUIDICS; PROCEDURES; REPRODUCIBILITY;

EQUIPMENT DESIGN; HUMANS; INDICATORS AND REAGENTS; MICROFLUIDIC ANALYTICAL TECHNIQUES; MICROFLUIDICS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; RNA;

EID: 84898927415     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac404085p     Document Type: Article

References (48)

1. Wheeler, A. R. Science 2008, 322, 539-540
2. Pollack, M. G.; Fair, R. B.; Shenderov, A. D. Appl. Phys. Lett. 2000, 77, 1725-1726
3. Lee, J.; Moon, H.; Fowler, J.; Schoellhammer, T.; Kim, C. J. Sens. Actuators, A: Phys. 2002, 95, 259-268
4. Jebrail, M. J.; Bartsch, M. S.; Patel, K. D. Lab Chip 2012, 12, 2452-2463
5. Hua, Z.; Rouse, J. L.; Eckhardt, A. E.; Srinivasan, V.; Pamula, V. K.; Schell, W. A.; Benton, J. L.; Mitchell, T. G.; Pollack, M. G. Anal. Chem. 2010, 82, 2310-2316
6. Choi, K.; Ng, A. H. C.; Fobel, R.; Wheeler, A. R. Annu. Rev. Anal. Chem. 2012, 5, 413-440
7. Jebrail, M. J.; Ng, A. H. C.; Rai, V.; Hili, R.; Yudin, A. K.; Wheeler, A. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 8625-8629
8. Jebrail, M. J.; Yang, H.; Mudrik, J. M.; Lafreniere, N. M.; McRoberts, C.; Al-Dirbashi, O. Y.; Fisher, L.; Chakraborty, P.; Wheeler, A. R. Lab Chip 2011, 11, 3218-3224
9. Mousa, N. A.; Jebrail, M. J.; Yang, H.; Abdelgawad, M.; Metalnikov, P.; Chen, J.; Wheeler, A. R.; Casper, R. F. Sci. Transl. Med. 2009, 1, 1ra2
10. Yang, H.; Mudrik, J. M.; Jebrail, M. J.; Wheeler, A. R. Anal. Chem. 2011, 83, 3824-3830
11. Chatterjee, D.; Hetayothin, B.; Wheeler, A. R.; King, D. J.; Garrell, R. L. Lab Chip 2006, 6, 199-206
12. Jebrail, M. J.; Wheeler, A. R. Anal. Chem. 2009, 81, 330-335
13. Sinha, A.; Jebrail, M. J.; Kim, H.; Patel, K. D.; Branda, S. S. J. Visualized Exp. 2013, e50597
14. Kim, H.; Jebrail, M. J.; Sinha, A.; Bent, Z. W.; Solberg, O. D.; Williams, K. P.; Langevin, S. A.; Renzi, R. F.; Van De Vreugde, J. L.; Meagher, R. J.; Schoeniger, J. S.; Lane, T. W.; Branda, S. S.; Bartsch, M. S.; Patel, K. D. PLoS One 2013, 8 e68988
15. Kim, H.; Bartsch, M. S.; Renzi, R. F.; He, J.; Van de Vreugde, J. L.; Claudnic, M. R.; Patel, K. D. J. Lab. Autom. 2011, 16, 405-414
16. Shah, G. J.; Ding, H.; Sadeghi, S.; Chen, S.; Kim, C. J.; van Dam, R. M. Lab Chip 2013, 13, 2785-2795
17. Ding, H.; Sadeghi, S.; Shah, G. J.; Chen, S.; Keng, P. Y.; Kim, C. J.; van Dam, R. M. Lab Chip 2012, 12, 3331-3340
18. Ren, H.; Fair, R. B.; Pollack, M. G. Sens. Actuators, B: Chem. 2004, 98, 319-327
19. Yang, H.; Luk, V. N.; Abeigawad, M.; Barbulovic-Nad, I.; Wheeler, A. R. Anal. Chem. 2009, 81, 1061-1067
20. Luk, V. N.; Mo, G. C. H.; Wheeler, A. R. Langmuir 2008, 24, 6382-6389
21. Jebrail, M. J.; Luk, V. N.; Shih, S. C. C.; Fobel, R.; Ng, A. H. C.; Yang, H.; Freire, S. L. S.; Wheeler, A. R. J. Visualized Exp. 2009, e1603
22. Langevin, S. A.; Bent, Z. W.; Solberg, O. D.; Curtis, D. J.; Lane, P. D.; Williams, K. P.; Schoeniger, J. S.; Sinha, A.; Lane, T. W.; Branda, S. S. RNA Biol. 2013, 10, 502-515
23. Vandernoot, V. A.; Langevin, S. A.; Solberg, O. D.; Lane, P. D.; Curtis, D. J.; Bent, Z. W.; Williams, K. P.; Patel, K. D.; Schoeniger, J. S.; Branda, S. S.; Lane, T. W. BioTechniques 2012, 53, 373-380
24. Rodrigue, S.; Materna, A. C.; Timberlake, S. C.; Blackburn, M. C.; Malmstrom, R. R.; Alm, E. J.; Chisholm, S. W. PLoS One 2010, 5 e11840 10.1371/journal.pone.0011840
25. Trapnell, C.; Williams, B. A.; Pertea, G.; Mortazavi, A.; Kwan, G.; van Baren, M. J.; Salzberg, S. L.; Wold, B. J.; Pachter, L. Nat. Biotechnol. 2010, 28, 511-515
26. Kirby, A. E.; Wheeler, A. R. Lab Chip 2013, 13, 2533-2540
27. Dow, G. J. Method for wetting a powder containing benzoyl peroxide. United States of America patent, WO2011049547 A1 (Apr 28, 2011).
28. MagMAX-96 Blood RNA Isolation Kit (User Guide), September 2012, http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/cms-055422.pdf (accessed 20 August 2013).
29. Garty, G.; Karam, A.; Brenner, D. J. Int. J. Radiat. Biol. 2011, 87, 754-765
30. Hack, C. M.; Scarfi, C. A.; Sivitz, A. B.; Rosen, M. D. Pediatr. Emerg. Care 2013, 29, 319-323
31. Loewenstein, D.; Stake, C.; Cichon, M. Am. J. Emerg. Med. 2013, 31, 1236-1239
32. Belardinelli, A.; Benni, M.; Tazzari, P. L.; Pagliaro, P. Vox Sang. 2013, 105, 116-120 10.1111/vox.12033
33. Larrat, S.; Bourdon, C.; Baccard, M.; Garnaud, C.; Mathieu, S.; Quesada, J. L.; Signori-Schmuck, A.; Germi, R.; Blanc, M.; Leclercq, P.; Hilleret, M. N.; Leroy, V.; Zarski, J. P.; Morand, P. J. Clin. Virol. 2012, 55, 220-225
34. Robison, E. H.; Mondala, T. S.; Williams, A. R.; Head, S. R.; Salomon, D. R.; Kurian, S. M. BMC Genomics 2009, 10, 1471-2164
35. Abdelgawad, M.; Freire, S. L. S.; Yang, H.; Wheeler, A. R. Lab Chip 2008, 8, 672-677
36. Model, M. A.; Omann, G. M. Biophys. J. 1995, 69, 1712-1720
37. Menke, A.; Rex-Haffner, M.; Klengel, T.; Binder, E. B.; Mehta, D. BMC Res. Notes 2012, 5, 1756-0500
38. Kiewe, P.; Gueller, S.; Komor, M.; Stroux, A.; Thiel, E.; Hofmann, W. K. Ann. Hematol. 2009, 88, 1177-1183
39. Stamova, B. S.; Apperson, M.; Walker, W. L.; Tian, Y.; Xu, H.; Adamczy, P.; Zhan, X.; Liu, D. Z.; Ander, B. P.; Liao, I. H.; Gregg, J. P.; Turner, R. J.; Jickling, G.; Lit, L.; Sharp, F. R. BMC Med. Genomics 2009, 2, 1755-8794
40. Dheda, K.; Huggett, J. F.; Bustin, S. A.; Johnson, M. A.; Rook, G.; Zumla, A. BioTechniques 2004, 37, 112-114
41. Schrader, C.; Schielke, A.; Ellerbroek, L.; Johne, R. J. Appl. Microbiol. 2012, 113, 1014-1026
42. Wilson, I. G. Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, 3741-3751
43. Radstrom, P.; Knutsson, R.; Wolffs, P.; Lovenklev, M.; Lofstrom, C. Mol. Biotechnol. 2004, 26, 133-146
44. Malic, L.; Veres, T.; Tabrizian, M. Lab Chip 2009, 9, 473-475
45. Boles, D. J.; Benton, J. L.; Siew, G. J.; Levy, M. H.; Thwar, P. K.; Sandahl, M. A.; Rouse, J. L.; Perkins, L. C.; Sudarsan, A. P.; Jalili, R.; Pamula, V. K.; Srinivasan, V.; Fair, R. B.; Griffin, P. B.; Eckhardt, A. E.; Pollack, M. G. Anal. Chem. 2011, 83, 8439-8447
46. Thaitrong, N.; Kim, H.; Renzi, R. F.; Bartsch, M. S.; Meagher, R. J.; Patel, K. D. Electrophoresis 2012, 33, 3506-3513
47. Malic, L.; Veres, T.; Tabrizian, M. Biosens. Bioelectron. 2011, 26, 2053-2059
48. Watson, M. W. L.; Jebrail, M. J.; Wheeler, A. R. Anal. Chem. 2010, 82, 6680-6686