Strategy of Fc-recognizable peptide ligand design for oriented immobilization of antibody

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 6, 2014, Pages 2931-2938

  Tsai, Ching Wei ^a   Jheng, Siang Long ^a   Chen, Wen Yih ^a   Ruaan, Ruoh Chyu ^a  

^a NATIONAL CENTRAL UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; ANTIBODIES; BINDING ENERGY; DISSOCIATION; EFFICIENCY; ELECTROSTATICS; HYDROPHOBICITY; MOLECULAR DYNAMICS; PEPTIDES; PLASMONS; SITE SELECTION; SURFACE PLASMON RESONANCE; VAN DER WAALS FORCES;

ANTIBODY IMMOBILIZATION; BINDING AFFINITIES; DISSOCIATION CONSTANT; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; ORIENTATION FACTORS; ORIENTED IMMOBILIZATIONS; POSITIVELY CHARGED SURFACES; RECOGNITION EFFICIENCY;

LIGANDS;

ANTIBODY; IMMUNOGLOBULIN FC FRAGMENT; LIGAND; PEPTIDE;

CHEMISTRY; SURFACE PLASMON RESONANCE;

ANTIBODIES; IMMUNOGLOBULIN FC FRAGMENTS; LIGANDS; PEPTIDES; SURFACE PLASMON RESONANCE;

EID: 84896526181     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac4029467     Document Type: Article

References (34)

1. Kacar, T.; Zin, M. T.; So, C.; Wilson, B.; Ma, H.; Gul-Karaguler, N.; Jen, A. K.; Sarikaya, M.; Tamerler, C. Biotechnol. Bioeng. 2009, 103, 696-705
2. Fang, Y.; Lahiri, J.; Picard, L. Drug Discovery Today 2004, 9, S61-67
3. Godl, K.; Wissing, J.; Kurtenbach, A.; Habenberger, P.; Blencke, S.; Gutbrod, H.; Salassidis, K.; Stein-Gerlach, M.; Missio, A.; Cotten, M.; Daub, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 15434-15439
4. Spiker, J. O.; Kang, K. A. Biotechnol. Bioeng. 1999, 66, 158-163
5. Forrer, P.; Tamaskovic, R.; Jaussi, R. Biol. Chem. 1998, 379, 1101-1111
6. Baniukevic, J.; Hakki Boyaci, I.; Goktug Bozkurt, A.; Tamer, U.; Ramanavicius, A.; Ramanaviciene, A. Biosens. Bioelectron. 2013, 43, 281-288
7. Liu, L.; Zheng, J.; Fang, G.; Xie, W. Anal. Chim. Acta 2012, 726, 85-92
8. Cho, I. H.; Park, J. W.; Lee, T. G.; Lee, H.; Paek, S. H. Analyst 2011, 136, 1412-1419
9. del Mar Garcia-Suarez, M.; Villaverde, R.; Gonzalez-Rodriguez, I.; Vazquez, F.; Mendez, F. J. Curr. Microbiol. 2009, 59, 81-87
10. Steinhauer, C.; Wingren, C.; Khan, F.; He, M.; Taussig, M. J.; Borrebaeck, C. A. Proteomics 2006, 6, 4227-4234
11. Mukhopadhyay, R.; Lo, K. K.; Wong, L. L.; Hill, H. A. J. Microsc. 2004, 213, 6-10
12. Puertas, S.; de Gracia Villa, M.; Mendoza, E.; Jimenez-Jorquera, C.; de la Fuente, J. M.; Fernandez-Sanchez, C.; Grazu, V. Biosens. Bioelectron. 2013, 43, 274-280
13. Ciani, I.; Schulze, H.; Corrigan, D. K.; Henihan, G.; Giraud, G.; Terry, J. G.; Walton, A. J.; Pethig, R.; Ghazal, P.; Crain, J.; Campbell, C. J.; Bachmann, T. T.; Mount, A. R. Biosens. Bioelectron. 2012, 31, 413-418
14. Iijima, M.; Somiya, M.; Yoshimoto, N.; Niimi, T.; Kuroda, S. Sci. Rep. 2012, 2, 790
15. Karyakin, A. A.; Presnova, G. V.; Rubtsova, M. Y.; Egorov, A. M. Anal. Chem. 2000, 72, 3805-3811
16. Kausaite-Minkstimiene, A.; Ramanaviciene, A.; Kirlyte, J.; Ramanavicius, A. Anal. Chem. 2010, 82, 6401-6408
17. Boozer, C.; Ladd, J.; Chen, S.; Yu, Q.; Homola, J.; Jiang, S. Anal. Chem. 2004, 76, 6967-6972
18. Fan, R.; Vermesh, O.; Srivastava, A.; Yen, B. K.; Qin, L.; Ahmad, H.; Kwong, G. A.; Liu, C. C.; Gould, J.; Hood, L.; Heath, J. R. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 1373-1378
19. de Juan-Franco, E.; Caruz, A.; Pedrajas, J. R.; Lechuga, L. M. Analyst 2013, 138, 2023-2031
20. Jung, Y.; Lee, J. M.; Jung, H.; Chung, B. H. Anal. Chem. 2007, 79, 6534-6541
21. Kwon, Y.; Han, Z.; Karatan, E.; Mrksich, M.; Kay, B. K. Anal. Chem. 2004, 76, 5713-5720
22. Jiang, R.; Weingart, J.; Zhang, H.; Ma, Y.; Sun, X. L. Bioconjugate Chem. 2012, 23, 643-649
23. Popp, M. W.; Antos, J. M.; Grotenbreg, G. M.; Spooner, E.; Ploegh, H. L. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 707-708
24. Jung, Y.; Kang, H. J.; Lee, J. M.; Jung, S. O.; Yun, W. S.; Chung, S. J.; Chung, B. H. Anal. Biochem. 2008, 374, 99-105
25. Liu, C. I.; Hsu, K. Y.; Ruaan, R. C. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 9148-9154
26. Huang, H. M.; Chen, W. Y.; Ruaan, R. C. J. Colloid Interface Sci. 2003, 263, 23-28
27. Huang, H. M.; Lin, F. Y.; Chen, W. Y.; Ruaan, R. C. J. Colloid Interface Sci. 2000, 229, 600-606
28. Tsai, C. W.; Ruaan, R. C.; Liu, C. I. Langmuir 2012, 28, 10446-10452
29. Tsai, C. W.; Liu, C. I.; Chan, Y. C.; Tsai, H. H.; Ruaan, R. C. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 11620-11627
30. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graph. 1996, 14, 33-38; 27-38
31. Brooks, B. R.; Brooks, C. L., 3rd; Mackerell, A. D., Jr.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545-1614
32. Hu, W. P.; Huang, L. Y.; Kuo, T. C.; Hu, W. W.; Chang, Y.; Chen, C. S.; Chen, H. C.; Chen, W. Y. Anal. Biochem. 2012, 423, 26-35
33. Wang, H.; Chen, S.; Li, L.; Jiang, S. Langmuir 2005, 21, 2633-2636
34. Piliarik, M.; Bockova, M.; Homola, J. Biosens. Bioelectron. 2010, 26, 1656-1661