Protein microarray technology: How far off is routine diagnostics?

Analyst

Volumn 139, Issue 3, 2014, Pages 528-542

  Cretich, Marina ^a   Damin, Francesco ^a   Chiari, Marcella ^a  

^a CNR   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DYES, REAGENTS, INDICATORS, MARKERS AND BUFFERS;

DIAGNOSIS; HUMAN; METABOLISM; METHODOLOGY; PRINTING; PROTEIN MICROARRAY; QUALITY CONTROL; REVIEW; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; STANDARD;

DIAGNOSIS; HUMANS; INDICATORS AND REAGENTS; PRINTING; PROTEIN ARRAY ANALYSIS; QUALITY CONTROL; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

EID: 84891464368     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3an01619f     Document Type: Review

References (84)

1. G. MacBeath, S. L. Schreiber, Science, 2000, 289, 1760
2. H. Zhu, M. Bilgin, R. Bangham, D. Hall, A. Casamayor, P. Bertone, N. Lan, R. Jansen, S. Bidlingmaier, T. Houfek, T. Mitchell, P. Miller, R. A. Dean, M. Gerstein, M. Snyder, Science, 2001, 293, 2101
3. R. P. Ekins, J. Pharm. Biomed. Anal., 1989, 7, 155
4. B. H. Jun, H. Kang, Y. S. Lee, D. H. Jeong, Molecules, 2012, 17, 2474
5. H. Y. Hsu, T. O. Joos, H. Koga, Electrophoresis, 2009, 30, 4008
6. V. V. Krishhan, I. H. Khan, P. Luciw, Crit. Rev. Biotechnol., 2009, 29, 29
7. P. Jonkheijm, D. Weinrich, H. Schroder, C. M. Niemeyer, H. Waldmann, Angew. Chem., Int. Ed. Engl., 2008, 47, 9618
8. M. Chiari, M. Cretich, F. Damin, G. Di Carlo, C. Oldani, J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci., 2008, 866, 89
9. I. Balboni, C. Limb, J. D. Tenenbaum, P. J. Utz, Proteomics, 2008, 8, 3443
10. L. Berrade, A. E. Garcia, J. A. Camarero, Pharm. Res., 2011, 28, 1480
11. A. A. Ellington, I. J. Kullo, K. R. Bailey, G. G. Klee, Clin. Chem., 2010, 56, 186
12. M. T. Lee, F. C. Kuo, G. A. Whitmore, J. Sklar, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2000, 97, 9834
13. F. Diehl, S. Grahlmann, M. Beier, J. D. Hoheisel, Nucleic Acids Res., 2001, 29, e38
14. S. George, I. D. Block, S. I. Jones, P. C. Mathias, V. Chaudhery, P. Vuttipittayamongkol, H.-Y. Wu, L. O. Vodkin, B. T. Cunningham, Anal. Chem., 2010, 82, 8551
15. S. D'Angelo, F. Mignone, C. Deantonio, R. Di Niro, R. Bordoni, R. Marzari, G. De Bellis, T. Not, F. Ferrara, A. Bradbury, C. Santoro, D. Sblattero, Clin. Immunol., 2013, 148, 99
16. M. Cretich, A. Reddington, M. Monroe, M. Bagnati, F. Damin, L. Sola, M. S. Unlü, M. Chiari, Biosens. Bioelectron., 2011, 26, 3938
17. M. Cretich, G. Di Carlo, R. Longhi, C. Gotti, N. Spinella, S. Coffa, C. Galati, L. Renna, M. Chiari, Anal. Chem., 2009, 81, 5197
18. P. Gagni, L. Sola, M. Cretich, M. Chiari, Biosens. Bioelectron., 2013, 47, 490
19. W. G. Shreffler, J. Allergy Clin. Immunol., 2011, 127, 843
20. E. Ozkumur, A. Yalcin, M. Cretich, C. A. Lopez, D. A. Bergstein, B. B. Goldberg, M. Chiari, M. S. Unlü, Biosens. Bioelectron., 2009, 25, 167
21. M. Cretich, G. Pirri, F. Damin, I. Solinas, M. Chiari, Anal. Biochem., 2004, 332, 67
22. M. R. Monroe, A. P. Reddington, A. D. Collin, C. LaBoda, M. Cretich, M. Chiari, F. F. Little, M. S. Unlü, Anal. Chem., 2011, 83, 9485
23. S. R. Master, C. Bierl, L. J. Kricka, Drug Discovery Today, 2006, 11, 1007
24. A. A. Ellington, I. J. Kullo, K. R. Bailey, G. G. Klee, Clin. Chem., 2009, 55, 1092
25. L. J. Kricka, S. R. Master, Clin. Chem., 2009, 55, 1053
26. C. A. K. Borrebaeck, C. Wingren, J. Proteomics, 2009, 72, 928
27. S. Hober, M. Uhlen, Curr. Opin. Biotechnol., 2008, 19, 30
28. C. Wingen, C. A. K. Borrebaeck, Expert Rev. Proteomics, 2004, 1, 355
29. C. Peri, P. Gagni, F. Combi, A. Gori, M. Chiari, R. Longhi, M. Cretich, G. Colombo, ACS Chem. Biol., 2013, 8, 397
30. G. Scarabelli, G. Morra, G. Colombo, Biophys. J., 2010, 98, 1966
31. C. Steinhauer, C. Wingren, A. C. M. Hager, C. A. K. Borrebaeck, BioTechniques, 2002, S38
32. A. A. Neryl, C. Wrenger, H. Ulrich, J. Sep. Sci., 2009, 32, 1523
33. M. J. Taussig, U. Landgren, Targets, 2003, 4, 169
34. M. Pla-Roca, R. F. Leulmi, S. Tourekhanova, S. Bergeron, V. Laforte, E. Moreau, S. J. C. Gosline, N. Bertos, M. Hallett, M. Park, D. Juncker, Mol. Cell. Proteomics, 2012, 11, M111.011460
35. R. M. Gonzalez, S. L. Seurynck-Servoss, S. A. Crowley, M. Brown, G. S. Omenn, D. F. Hayes, R. C. Zangar, J. Proteome Res., 2008, 7, 2406
36. N. Schneiderhan-Marra, G. Sauer, C. Kazmaier, H. Y. Hsu, K. Koretz, H. Deissler, T. O. Joos, Anal. Bioanal. Chem., 2010, 397, 3329
37. H. Li, S. Bergeron, D. Junncker, Anal. Chem., 2012, 84, 4776
38. L. Sola, P. Gagni, M. Cretich, M. Chiari, J. Immunol. Methods, 2013, 391, 95
39. R. P. Ekins, Clin. Chem., 1998, 44, 2015
40. M. Zao, X. Wang, D. Nolte, Biomed. Opt. Express, 2010, 3, 983
41. W. Kusnezow, Y. V. Syagailo, S. Ruffer, N. Baudenstiel, C. Gauer, J. D. Hoheisel, D. Wild, I. Goychuk, Mol. Cell. Proteomics, 2006, 5, 1681
42. M. J. Hessner, V. K. Singh, X. Wang, S. Khan, M. R. Tschannen, T. C. Zahrt, BMC Genomics, 2004, 5, 12
43. P. Saviranta, R. Okon, A. Brinker, M. Warashina, J. Eppinger, B. H. Geierstanger, Clin. Chem., 2004, 50, 1907
44. M. Seidel, R. Niessner, Anal. Bioanal. Chem., 2008, 391, 1521
45. M. Cretich, M. Bagnati, F. Damin, L. Sola, M. Chiari, Anal. Biochem., 2011, 418, 164
46. A. Toegl, R. Kirchner, C. Gauer, A. Wixforth, J. Biomol. Tech., 2003, 14, 197
47. M. A. Bynum, G. B. Gordon, Anal. Chem., 2004, 76, 7039
48. H. Liu, R. Lenigk, R. L. Druyor-Sanchez, J. Yang, P. Grodzinski, Anal. Chem., 2003, 75, 1911
49. J. Vanderhoeven, K. Pappaert, B. Dutta, P. Van Hummelen, G. Desmet, Electrophoresis, 2005, 26, 3773
50. M. Cretich, G. Di Carlo, C. Giudici, S. Pokoj, I. Lauer, S. Scheurer, M. Chiari, Proteomics, 2009, 9, 2098
51. B. I. Fall, B. Eberlein-Konig, H. Behrendt, R. Niessner, J. Ring, M. G. Weller, Anal. Chem., 2003, 75, 556
52. A. Ardizzoni, B. Capuccini, M. C. Baschieri, C. F. Orsi, F. Rumpianesi, S. Peppoloni, C. Cermelli, M. Meacci, A. Crisanti, P. Steensgaard, E. Blasi, Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2009, 28, 1067
53. C. Harwanegg, R. Hiller, Eur. Ann. Allergy Clin. Immunol., 2006, 38, 232
54. T. Bacarese-Hamilton, L. Mezzasoma, C. Ingham, A. Ardizzoni, R. Rossi, F. Bistoni, A. Crisanti, Clin. Chem., 2002, 48, 1367
55. H. Hochwallner, U. Schulmeister, I. Swoboda, et al., Clin. Exp. Allergy, 2010, 40, 1809
56. S. Wiltshire, S. O'Malley, J. Lambert, K. Kukanskis, D. Edgar, S. F. Kingsmore, B. Schweitzer, Clin. Chem., 2000, 46, 1990
57. K. Deinhofer, H. Sevcik, N. Balic, C. Harwanegg, R. Hiller, H. Rumpold, M. W. Mueller, S. Spitzauer, Methods, 2004, 32, 249
58. G. Javaloyes, M. J. Goikoetxea, I. G. Nunez, M. L. Sanz, M. Blanca, S. Scheurer, S. Vieths, M. Ferrer, J. Invest. Allergol. Clin. Immunol., 2012, 22, 508
59. R. Gadisseur, J. P. Chapelle, E. Cavalier, Clin. Chem. Lab. Med., 2011, 49, 277
60. M. Cretich, D. Breda, F. Damin, M. Borghi, L. Sola, S. M. Unlü, S. E. Burastero, M. Chiari, Anal. Bioanal. Chem., 2010, 398, 1723
61. M. Cretich, M. R. Monroe, A. Reddington, X. Zhang, G. G. Daaboul, F. Damin, L. Sola, M. S. Unlü, M. Chiari, Proteomics, 2012, 12, 2963
62. G. Pirri, F. Damin, M. Chiari, E. Bontempi, L. E. Depero, Anal. Chem., 2004, 76, 1352
63. J. Sastre, Clin. Exp. Allergy, 2010, 40, 1442
64. Y. F. Lin, C. Y. Chen, M. H. Tsai, M. S. Wu, Y. C. Wang, E. Y. Chuang, J. T. Lin, P. C. Yang, L. P. Cho, Mol. Cell. Proteomics, 2007, 6, 1018
65. M. E. Hudson, I. Pozdnyakova, K. Haines, G. Mor, M. Snyder, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104, 17494
66. S. Horn, A. Lueking, D. Murphy, A. Staudt, C. Gutjahr, K. Schulte, A. König, M. Landsberger, H. Lehrach, S. B. Felix, D. J. Cahill, Proteomics, 2006, 6, 605
67. F. J. Quintana, M. F. Farez, V. Viglietta, A. H. Iglesias, Y. Merbi, G. Izquierdo, M. Lucas, A. S. Basso, S. J. Khoury, C. F. Lucchinetti, I. R. Cohen, H. L. Weiner, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2008, 45, 18889
68. J. Genius, H. Klafki, J. Benninghoff, H. Esselmann, J. Wiltfang, Eur. Arch. Psychiatry Clin. Neurosci., 2012, 262, 71
69. R. P. Huang, B. Burkholder, V. S. Jones, W. D. Jiang, Y. Q. Mao, Q. L. Chen, Z. Shi, Curr. Proteomics, 2012, 9, 55
70. E. C. Hirsh, S. Hunot, Lancet Neurol., 2009, 8, 382
71. D. L. Vargas, C. Nascimbene, C. Krishnan, A. W. Zimmermann, C. A. Pardo, Ann. Neurol., 2004, 57, 67
72. S. Ray, M. Britschgi, C. Herbert, Y. Takeda-Uchimura, A. Boxer, K. Blennow, L. F. Friedman, D. R. Galasko, M. Jutel, A. Karydas, J. A. Kaye, J. Leszek, B. L. Miller, L. Minthon, J. F. Quinn, G. D. Rabinovici, W. H. Robinson, M. N. Sabbagh, Y. T. So, D. L. Sparks, M. Tabaton, J. Tinklenberg, J. A. Yesavage, R. Tibshirani, T. Wyss-Coray, Nat. Med., 2007, 13, 1359
73. P. Mahlknecht, S. Stemberger, F. Sprenger, J. Rainer, E. Hametner, R. Kirchmair, C. Grabmer, C. Scherfler, G. K. Wenning, K. Seppi, W. Poewe, M. Reindl, Proteome Sci., 2012, 10, 71
74. C. Humpel, Trends Biotechnol., 2011, 29, 26
75. D. A. Giljohann, C. A. Mirkin, Nature, 2009, 462, 461
76. J. A. L. Coronell, P. Syed, K. Sergelen, I. Gyurjan, A. Weinhausel, J. Proteomics, 2012, 76, 102
77. A. Gallotta, E. Orzes, G. Fassina, Clin. Lab. Med., 2012, 32, 33
78. J. F. Rusling, C. V. Kumar, J. S. Gutkind, V. Patel, Analyst, 2010, 135, 2496
79. C. Wingren, A. Sandstrom, R. Segersvard, A. Carlsson, R. Andersson, M. Lohr, C. A. K. Borrebaeck, Cancer Res., 2012, 72, 2481
80. A. Jemal, R. Siegel, E. Ward, Y. Hao, J. Xu, M. J. Thun, Ca-Cancer J. Clin., 2009, 59, 225
81. A. Sandstrom, R. Andersson, R. Segersvard, M. Lohr, C. A. K. Borrebaeck, C. Wingren, Proteomics: Clin. Appl., 2012, 6, 486
82. H. S. Erickson, Stat. Med., 2012, 31, 2400
83. B. C. Liu, D. A. Dijohnson, D. J. O'Rourke, Expert Opin. Med. Diagn., 2012, 6, 187
84. R. F. Gordon, R. L. McDade, Clin. Chem., 1997, 43, 1799