Novel tripod amphiphiles for membrane protein analysis

Chemistry - A European Journal

Volumn 19, Issue 46, 2013, Pages 15645-15651

  Chae, Pil Seok ^a   Kruse, Andrew C ^d   Gotfryd, Kamil ^e   Rana, Rohini R ^c   Cho, Kyung Ho ^a   Rasmussen, Søren G F ^d   Bae, Hyoung Eun ^a   Chandra, Richa ^f   Gether, Ulrik ^e   Guan, Lan ^f   Kobilka, Brian K ^d   Loland, Claus J ^e   Byrne, Bernadette ^c   Gellman, Samuel H ^b  

^a Hanyang University   (South Korea)

^b UNIVERSITY OF WISCONSIN MADISON   (United States)

^c IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^d STANFORD UNIVERSITY   (United States)

^e UNIVERSITY OF COPENHAGEN   (Denmark)

^f TEXAS TECH UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

amphiphiles; membrane proteins; molecular design; protein structures; stabilization

Indexed keywords

INDISPENSABLE TOOLS; INTEGRAL MEMBRANE PROTEINS; MEMBRANE PROTEIN STRUCTURES; MEMBRANE PROTEINS; MEMBRANE-PROTEIN SYSTEMS; MOLECULAR DESIGN; POLAR SOLVENT MOLECULES; PROTEIN STRUCTURES;

AMPHIPHILES; BIOLOGICAL MEMBRANES; SOAPS (DETERGENTS); STABILIZATION;

PROTEINS;

DETERGENT; MEMBRANE PROTEIN; SOLVENT; SURFACTANT;

AMPHIPHILES; ARTICLE; CHEMICAL PHENOMENA; CHEMISTRY; MOLECULAR DESIGN; PROTEIN STRUCTURES; SOLUBILITY; STABILIZATION;

AMPHIPHILES; MEMBRANE PROTEINS; MOLECULAR DESIGN; PROTEIN STRUCTURES; STABILIZATION;

DETERGENTS; HYDROPHOBIC AND HYDROPHILIC INTERACTIONS; MEMBRANE PROTEINS; SOLUBILITY; SOLVENTS; SURFACE-ACTIVE AGENTS;

EID: 84887022427     PISSN: 09476539     EISSN: 15213765     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/chem.201301423     Document Type: Article

References (50)

1. J. P. Overington, B. Al-Lazikani, A. L. Hopkins, Nat. Rev. Drug Discovery 2006, 5, 993-996.
2. J. J. Lacapère, E. Pebay-Peyroula, J. M. Neumann, C. Etchebest, Trends Biochem. Sci. 2007, 32, 259-270.
3. S. H. White, W. C. Wimley, Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1999, 28, 319-365
4. J. V. Moller, J. leMaire, J. Biol. Chem. 1993, 268, 18659-18672.
5. R. M. Garavito, S. Ferguson-Miller, J. Biol. Chem. 2001, 276, 32403-32406
6. J. U. Bowie, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 397-402
7. M. J. Serrano-Vega, F. Magnani, Y. Shibata, C. G. Tate, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 877-882.
8. C. Tribet, R. Audebert, J.-L. Popot, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 15047-15050
9. J. L. Popot, T. Althoff, D. Bagnard, J. L. Banères, P. Bazzacco, E. Billon-Denis, L. J. Catoire, P. Champeil, D. Charvolin, M. J. Cocco, G. Crémel, T. Dahmane, L. M. delaMaza, C. Ebel, F. Gabel, F. Giusti, Y. Gohon, E. Goormaghtigh, E. Guittet, J. H. Kleinschmidt, W. Kühlbrandt, C. LeBon, K. L. Martinez, M. Picard, B. Pucci, F. Rappaport, J. N. Sachs, C. Tribet, C. vanHeijenoort, F. Wien, F. Zito, M. Zoonens, Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 2011, 40, 379-408
10. C.-L. McGregor, L. Chen, N. C. Pomroy, P. Hwang, S. Go, A. Chakrabartty, G. G. Privé, Nat. Biotechnol. 2003, 21, 171-176
11. C. Breyton, E. Chabaud, Y. Chaudier, B. Pucci, J.-L. Popot, FEBS Lett. 2004, 564, 312-318
12. K. H. Cho, B. Byrne, P. S. Chae, ChemBioChem 2013, 14, 452-455
13. A. Nath, W. M. Atkins, S. G. Sligar, Biochemistry 2007, 46, 2059-2069
14. X. Zhao, Y. Nagai, P. J. Reeves, P. Kiley, H. G. Khorana, S. Zhang, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 17707-17712
15. Q. Zhang, X. Ma, A. Ward, W.-X. Hong, V.-P. Jaakola, R. C. Stevens, M. G. Finn, G. Chang, Angew. Chem. 2007, 119, 7153-7155
16. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 7023-7025
17. P. S. Chae, K. Gotfryd, J. Pacyna, L. J. W. Miercke, S. G. F. Rasmussen, R. A. Robbins, R. R. Rana, C. J. Loland, B. Kobilka, R. Stroud, B. Byrne, U. Gether, S. H. Gellman, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 16750-16752
18. S. C. Howell, R. Mittal, L. Huang, B. Travis, R. M. Breyer, C. R. Sanders, Biochemistry 2010, 49, 9572-9583
19. P. S. Chae, S. G. F. Rasmussen, R. R. Rana, K. Gotfryd, A. C. Kruse, S. Nurva, U. Gether, L. Guan, C. J. Loland, B. Byrne, B. K. Kobilka, S. H. Gellman, Chem. Eur. J. 2012, 18, 9485-9490
20. D. T. McQuade, M. A. Quinn, S. M. Yu, A. S. Polans, M. P. Krebs, S. H. Gellman, Angew. Chem. 2000, 112, 774-777
21. Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 758-761
22. P. S. Chae, M. J. Wander, A. P. Bowling, P. D. Laible, S. H. Gellman, ChemBioChem 2008, 9, 1706-1709
23. P. S. Chae, P. D. Laible, S. H. Gellman, Mol. BioSyst. 2010, 6, 86-94
24. P. S. Chae, S. G. F. Rasmussen, R. R. Rana, K. Gotfryd, R. Chandra, M. A. Goren, A. C. Kruse, S. Nurva, C. J. Loland, Y. Pierre, D. Drew, J.-L. Popot, D. Picot, B. G. Fox, L. Guan, U. Gether, B. Byrne, B. Kobilka, S. H. Gellman, Nat. Methods 2010, 7, 1003-1008
25. T. T. Selao, R. Branca, P. S. Chae, J. Lehtiö, S. H. Gellman, S. G. F. Rasmussen, S. Nordlund, A. Norén, J. Proteome Res. 2011, 10, 2703-2714
26. P. S. Chae, R. R. Rana, K. Gotfryd, S. G. F. Rasmussen, A. C. Kruse, K. H. Cho, S. Capaldi, E. Carlsso, B. Kobilka, C. J. Loland, U. Gether, S. Banerjee, B. Byrne, J. K. Lee, S. H. Gellman, Chem. Commun. 2013, 49, 2287-2289.
27. S. G. F. Rasmussen, H.-J. Choi, J. J. Fung, E. Pardon, P. Casarosa, P. S. Chae, B. T. DeVree, D. M. Rosenbaum, F. S. Thian, T. S. Kobilka, A. Schnapp, I. Konetzki, R. K. Sunahara, S. H. Gellman, A. Pautsch, J. Steyaert, W. I. Weis, B. K. Kobilka, Nature 2011, 469, 175-180
28. D. M. Rosenbaum, C. Zhang, J. Lyons, R. Holl, D. Aragao, D. H. Arlow, S. G. F. Rasmussen, H.-J. Choi, B. T. DeVree, R. K. Sunahara, P. S. Chae, S. H. Gellman, R. O. Dror, D. E. Shaw, W. I. Weis, M. Caffrey, P. Gmeiner, B. K. Kobilka, Nature 2011, 469, 236-240
29. S. G. F. Rasmussen, B. T. DeVree, Y. Zou, A. C. Kruse, K. Y. Chung, T. S. Kobilka, F. S. Thian, P. S. Chae, E. Pardon, D. Calinski, J. M. Mathiesen, S. T. A. Shah, J. A. Lyons, M. Caffrey, S. H. Gellman, J. Steyaert, G. Skiniotis, W. I. Weis, R. K. Sunahara, B. K. Kobilka, Nature 2011, 477, 549-555
30. A. C. Kruse, J. Hu, A. C. Pan, D. H. Arlow, D. M. Rosenbaum, E. Rosemond, H. F. Green, T. Liu, P. S. Chae, R. O. Dror, D. E. Shaw, W. I. Weis, J. Wess, B. K. Kobilka, Nature 2012, 482, 552-556
31. K. Haga, A. C. Kruse, H. Asada, T. Y. Kobayashi, M. Shiroishi, C. Zhang, W. I. Weis, T. Okada, B. K. Kobilka, T. Haga, T. Kobayashi, Nature 2012, 482, 547-551
32. A. Manglik, A. C. Kruse, T. S. Kobilka, F. S. Thian, J. M. Mathiesen, R. K. Sunahara, L. Pardo, W. I. Weis, B. K. Kobilka, S. Granier, Nature 2012, 485, 321-326
33. S. Granier, A. Manglik, A. C. Kruse, T. S. Kobilka, F. S. Thian, W. I. Weis, B. K. Kobilka, Nature 2012, 485, 400-404
34. J. F. White, N. Noinaj, Y. Shibata, J. Love, B. Kloss, F. Xu, J. Gvozdenovic-Jeremic, P. Shah, J. Shiloach, C. G. Tate, R. Grisshammer, Nature 2012, 490, 508-513
35. J. Kellosalo, T. Kajander, K. Kogan, K. Pokharel, A. Goldman, Science 2012, 337, 473-476
36. S. E. Rollauer, M. J. Tarry, J. E. Graham, M. Jääskelä inen, F. Jäger, S. Johnson, M, Krehenbrink, S. M. Liu, M. J. Lukey, J. Marcoux, M. A. McDowell, F. Rodriguez, P. Roversi, P. J. Stansfeld, C. V. Robinson, M. S. Sansom, T. Palmer, M. Högbom, B. C. Berks, S. M. Lea, Nature 2012, 492, 210-214.
37. A. Chattopadhyay, E. London, Anal. Biochem. 1984, 139, 408-412.
38. B. Lorber, J. B. Bishop, L. Delucas, Biochim. Biophys. Acta 1990, 1023, 254-265.
39. R. Horsefield, S. Iwata, B. Byrne, Curr. Protein Pept. Sci. 2004, 5, 107-118.
40. A. Alexandrov, M. Mileni, E. Y. Chien, M. A. Hanson, R. C. Stevens, Structure 2008, 16, 351-359.
41. S. Urban, Biochem. J. 2010, 425, 501-521.
42. G. Deckert, P. V. Warren, T. Gaasterland, W. G. Young, A. L. Lenox, D. E. Graham, R. Overbeek, M. A. Snead, M. Keller, M. Aujay, R. Huber, R. A. Feldman, J. M. Short, G. J. Olsen, R. V. Swanson, Nature 1998, 392, 353-358.
43. M. Quick, J. A. Javitch, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 3603-3608.
44. P. Bazzacco, K. S. Sharma, G. Durand, F. Giusti, C. Ebel, J. L. Popot, B. Pucci, Biomacromolecules 2009, 10, 3317-3326.
45. P. D. Laible, C. Kirmaier, C. S. Udawatte, S. J. Hofman, D. Holten, D. K. Hanson, Biochemistry 2003, 42, 1718-1730.
46. D. M. Rosenbaum, V. Cherezov, M. A. Hanson, S. G. F. Rasmussen, F. S. Thian, T. S. Kobilka, H.-J. Choi, X.-J. Yao, W. I. Weis, R. C. Stevens, B. K. Kobilka, Science 2007, 318, 1266-1273.
47. B. K. Kobilka, Trends Pharmacol. Sci. 2011, 32, 213-218.
48. L. Guan, S. Nurva, S. P. Ankeshwarapu, J. Biol. Chem. 2011, 286, 6367-6374.
49. B. W. Berger, R. Y. Garcia, A. M. Lenhoff, E. W. Kaler, C. R. Robinson, Biophys. J. 2005, 89, 452-464.
50. P. S. Chae, M. J. Wander, K. H. Cho, P. D. Laible, S. H. Gellman, Mol. BioSyst. 2013, 9, 626-629.