Mechanical stability of the antibody domain CH3 homodimer in different oxidation states

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 40, 2013, Pages 15085-15091

  Bertz, Morten ^a,c   Buchner, Johannes ^a,b   Rief, Matthias ^a,b  

^a TECHNICAL UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

^b Munich Center for Integrated Protein Science   (Germany)

^c WASEDA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIBODIES; COVALENT BONDS; DIMERS; DISSOCIATION; IONS; MONOMERS; SULFUR COMPOUNDS;

DISULFIDE BRIDGE; DOMAIN INTERFACES; HIGHLY STABLES; MECHANICAL FASTENER; NON-COVALENT INTERACTION; OXIDATION STATE; PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS; SINGLE MOLECULE FORCE SPECTROSCOPY;

MECHANICAL STABILITY;

ANTIBODY; DIMER; HOMODIMER; MONOMER;

ANTIBODY AFFINITY; ARTICLE; DIMERIZATION; DISSOCIATION; OXIDATION; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; SPECTROSCOPY;

BIOMECHANICAL PHENOMENA; DISULFIDES; IMMUNOGLOBULIN HEAVY CHAINS; MECHANICAL PROCESSES; MODELS, MOLECULAR; OXIDATIVE STRESS; PROTEIN MULTIMERIZATION; PROTEIN STABILITY; PROTEIN STRUCTURE, QUATERNARY;

EID: 84885662551     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja405076j     Document Type: Article

References (42)

1. Goto, Y.; Hamaguchi, K. J. Biochem. 1979, 86, 1433-1441
2. Harris, L. J.; Skaletsky, E.; McPherson, A. J. Mol. Biol. 1998, 275, 861-872
3. Saphire, E. O.; Stanfield, R. L.; Max Crispin, M. D.; Parren, P. W. H. I.; Rudd, P. M.; Dwek, R. A.; Burton, D. R.; Wilson, I. A. J. Mol. Biol. 2002, 319, 9-18
4. Sandin, S.; Öfverstedt, L.-G.; Wikström, A.-C.; Wrange, Ö.; Skoglund, U. Structure 2004, 12, 409-415
5. Lilyestrom, W. G.; Shire, S. J.; Scherer, T. M. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 9611-9618
6. Silverton, E. W. E.; Navia, M. A. M.; Davies, D. R. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1977, 74, 5140-5144
7. Feige, M. J.; Hendershot, L. M.; Buchner, J. Trends Biochem. Sci. 2010, 35, 10-10
8. Rispens, T.; Ooijevaar-de Heer, P.; Bende, O.; Aalberse, R. C. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 10302-10311
9. van der Neut Kolfschoten, M.; Schuurman, J.; Losen, M.; Bleeker, W. K.; Martínez-Martínez, P.; Vermeulen, E.; Bleker, den, T. H.; Wiegman, L.; Vink, T.; Aarden, L. A. Science 2007, 317, 1554-1557
10. Thies, M. J.; Talamo, F.; Mayer, M.; Bell, S.; Ruoppolo, M.; Marino, G.; Buchner, J. J. Mol. Biol. 2002, 319, 1267-1277
11. Thies, M. J.; Mayer, J.; Augustine, J. G.; Frederick, C. A.; Lilie, H.; Buchner, J. J. Mol. Biol. 1999, 293, 67-79
12. Schwaiger, I.; Kardinal, A.; Schleicher, M.; Noegel, A. A.; Rief, M. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 81-85
13. Bustamante, C.; Marko, J. F.; Siggia, E. D.; Smith, S. Science 1994, 265, 1599-1600
14. Dietz, H.; Rief, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 1244-1247
15. Rief, M.; Fernandez, J. M.; Gaub, H. E. Phys. Rev. Lett. 1998, 81, 4764-4767
16. Junker, J. P.; Rief, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 14361-14366
17. Junker, J. P.; Ziegler, F.; Rief, M. Science 2009, 323, 633-637
18. Berkemeier, F.; Bertz, M.; Xiao, S.; Pinotsis, N.; Wilmanns, M.; Grater, F.; Rief, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 14139-14144
19. Pernigo, S.; Fukuzawa, A.; Bertz, M.; Holt, M.; Rief, M.; Steiner, R. A.; Gautel, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 2908-2913
20. Kim, J.; Zhang, C.-Z.; Zhang, X.; Springer, T. A. Nature 2010, 466, 992-995
21. Bertz, M.; Chen, J.; Feige, M. J.; Franzmann, T. M.; Buchner, J.; Rief, M. J. Mol. Biol. 2010, 400, 1046-1056
22. McAuley, A.; Jacob, J.; Kolvenbach, C. G.; Westland, K.; Lee, H. J.; Brych, S. R.; Rehder, D.; Kleemann, G. R.; Brems, D. N.; Matsumura, M. Protein Sci. 2008, 17, 95-106
23. Bell, G. I. Science 1978, 200, 618-627
24. Wiita, A. P.; Perez-Jimenez, R.; Walther, K. A.; Grater, F.; Berne, B. J.; Holmgren, A.; Sanchez-Ruiz, J. M.; Fernandez, J. M. Nature 2007, 450, 124-127
25. Kosuri, P.; Alegre-Cebollada, J.; Feng, J.; Kaplan, A.; Inglés-Prieto, A.; Badilla, C. L.; Stockwell, B. R.; Sanchez-Ruiz, J. M.; Holmgren, A.; Fernández, J. M. Cell 2012, 151, 794-806
26. Morfill, J.; Blank, K.; Zahnd, C.; Luginbuhl, B.; Kuhner, F.; Gottschalk, K. E.; Pluckthun, A.; Gaub, H. E. Biophys. J. 2007, 93, 3583-3590
27. Stahl, S. W.; Nash, M. A.; Fried, D. B.; Slutzki, M.; Barak, Y.; Bayer, E. A.; Gaub, H. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 20431-20436
28. Bertz, M.; Wilmanns, M.; Rief, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 133307-133310
29. Pinotsis, N.; Abrusci, P.; Djinovic Carugo, K.; Wilmanns, M. Trends Biochem. Sci. 2009, 34, 33-39
30. Lu, Schulten Chem. Phys. 1999, 247, 13-13
31. Carrion-Vazquez, M.; Li, H.; Lu, H.; Marszalek, P. E.; Oberhauser, A. F.; Fernandez, J. M. Nat. Struct. Biol. 2003, 10, 738-743
32. Valbuena, A.; Oroz, J.; Hervas, R.; Vera, A. M.; Rodriguez, D.; Menendez, M.; Sulkowska, J. I.; Cieplak, M.; Carrion-Vazquez, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 13791-13796
33. Dall'Acqua, W.; Simon, A. L.; Mulkerrin, M. G.; Carter, P. Biochemistry 1998, 37, 9266-9273
34. Isenman, D. E.; Lancet, D.; Pecht, I. Biochemistry 1979, 18, 3327-3336
35. Pace, C. N.; Grimsley, G. R.; Thomson, J. A.; Barnett, B. J. J. Biol. Chem. 1988, 263, 11820-11825
36. Feige, M. J.; Hagn, F.; Esser, J.; Kessler, H.; Buchner, J. J. Mol. Biol. 2007, 365, 1232-1244
37. Dietz, H.; Berkemeier, F.; Bertz, M.; Rief, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 12724-12728
38. Carl, P.; Kwok, C. H.; Manderson, G.; Speicher, D. W.; Discher, D. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 1565-1570
39. Ainavarapu, S. R.; Brujic, J.; Huang, H. H.; Wiita, A. P.; Lu, H.; Li, L.; Walther, K. A.; Carrion-Vazquez, M.; Li, H.; Fernandez, J. M. Biophys. J. 2007, 92, 225-233
40. Engstler, M.; Pfohl, T.; Herminghaus, S.; Boshart, M.; Wiegertjes, G.; Heddergott, N.; Overath, P. Cell 2007, 131, 505-515
41. Rispens, T.; Heer, P. O.-D.; Vermeulen, E.; Schuurman, J.; van der Neut Kolfschoten, M.; Aalberse, R. C. J. Immunol. 2009, 182, 4275-4281
42. Xiang, T.; Chumsae, C.; Liu, H. Anal. Chem. 2009, 81, 8101-8108