Development of fluorogenic probes for quick No-Wash live-cell imaging of intracellular proteins

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 33, 2013, Pages 12360-12365

  Hori, Yuichiro ^a,b   Norinobu, Tomoya ^a   Sato, Motoki ^a   Arita, Kyohei ^c   Shirakawa, Masahiro ^d   Kikuchi, Kazuya ^a  

^a OSAKA UNIVERSITY   (Japan)

^b JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY   (Japan)

^c YOKOHAMA CITY UNIVERSITY   (Japan)

^d KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CELLULAR PROTEINS; FLUOROGENIC PROBES; FLUOROGENICS; INTRACELLULAR PROTEINS; LIVE-CELL IMAGING; METHYL-CPG-BINDING; NUCLEAR LOCALIZATION; SMALL PROTEINS;

CELL MEMBRANES; CYTOLOGY; PROBES;

PROTEINS;

CELL PROTEIN; PHOTOACTIVE YELLOW PROTEIN;

ARTICLE; CELL MEMBRANE; CONTROLLED STUDY; MOLECULAR IMAGING; MOLECULAR PROBE;

ANIMALS; BACTERIAL PROTEINS; CELL SURVIVAL; DNA METHYLATION; FLUORESCENT DYES; INTRACELLULAR SPACE; KINETICS; MICE; MOLECULAR IMAGING; NIH 3T3 CELLS; PHOTORECEPTORS, MICROBIAL; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; PROTEIN TRANSPORT; PROTEINS;

EID: 84883073819     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja405745v     Document Type: Article

References (45)

1. Jing, C.; Cornish, V. W. Acc. Chem. Res. 2011, 44, 784-792
2. Yano, Y.; Matsuzaki, K. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 2124-2131
3. Adams, S. R.; Campbell, R. E.; Gross, L. A.; Martin, B. R.; Walkup, G. K.; Yao, Y.; Llopis, J.; Tsien, R. Y. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6063-6076
4. Griffin, B. A.; Adams, S. R.; Tsien, R. Y. Science 1998, 281, 269-272
5. Gautier, A.; Juillerat, A.; Heinis, C.; Correa, I. R., Jr.; Kindermann, M.; Beaufils, F.; Johnsson, K. Chem. Biol. 2008, 15, 128-136
6. Keppler, A.; Gendreizig, S.; Gronemeyer, T.; Pick, H.; Vogel, H.; Johnsson, K. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 86-89
7. Los, G. V.; Wood, K. Methods Mol. Biol. 2007, 356, 195-208
8. Lee, H. L.; Lord, S. J.; Iwanaga, S.; Zhan, K.; Xie, H.; Williams, J. C.; Wang, H.; Bowman, G. R.; Goley, E. D.; Shapiro, L.; Twieg, R. J.; Rao, J.; Moerner, W. E. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 15099-15101
9. Chen, Z.; Jing, C.; Gallagher, S. S.; Sheetz, M. P.; Cornish, V. W. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 13692-13699
10. Miller, L. W.; Cai, Y.; Sheetz, M. P.; Cornish, V. W. Nat. Methods 2005, 2, 255-257
11. Yao, J. Z.; Uttamapinant, C.; Poloukhtine, A.; Baskin, J. M.; Codelli, J. A.; Sletten, E. M; Bertozzi, C. R.; Popik, V. V.; Ting, A. Y. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 3720-3728
12. Uttamapinant, C.; White, K. A.; Baruah, H.; Thompson, S.; Fernández-Suárez, M.; Puthenveetil, S.; Ting, A. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 10914-10919
13. Nonaka, H.; Fujishima, S. H.; Uchinomiya, S. H.; Ojida, A.; Hamachi, I. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 9301-9309
14. Ono, S.; Yano, Y.; Matsuzaki, K. Biopolymers 2012, 98, 234-238
15. Hori, Y.; Egashira, Y.; Kamiura, R.; Kikuchi, K. Chembiochem 2010, 11, 646-668
16. Tsutsumi, H.; Nomura, W.; Abe, S.; Mino, T.; Masuda, A.; Ohashi, N.; Tanaka, T.; Ohba, K.; Yamamoto, N.; Akiyoshi, K.; Tamamura, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 9164-9166
17. Mizukami, S.; Yamamoto, T.; Yoshimura, A.; Watanabe, S.; Kikuchi, K. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 8750-8752
18. Watanabe, S.; Mizukami, S.; Akimoto, Y.; Hori, Y.; Kikuchi, K. Chem.-Eur. J. 2011, 17, 8342-8349
19. Watanabe, S.; Mizukami, S.; Hori, Y.; Kikuchi, K. Bioconjugate Chem. 2010, 21, 2320-2326
20. Mizukami, S.; Watanabe, S.; Hori, Y.; Kikuchi, K. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 5016-5017
21. Komatsu, T.; Johnsson, K.; Okuno, H.; Bito, H.; Inoue, T.; Nagano, T.; Urano, Y. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 6745-6751
22. Zhang, C. J.; Li, L.; Chen, G. Y.; Xu, Q. H.; Yao, S. Q. Org. Lett. 2011, 13, 4160-4163
23. Sun, X.; Zhang, A.; Baker, B.; Sun, L.; Howard, A.; Buswell, J.; Maurel, D.; Masharina, A.; Johnsson, K.; Noren, C. J.; Xu, M. Q.; Corrêa, I. R., Jr. Chembiochem 2011, 12, 2217-2226
24. Lukinavičius, G.; Umezawa, K.; Olivier, N.; Honigmann, A.; Yang, G.; Plass, T.; Mueller, V.; Reymond, L.; Corrêa, I. R., Jr.; Luo, Z. G.; Schultz, C.; Lemke, E. A.; Heppenstall, P.; Eggeling, C.; Manley, S.; Johnsson, K. Nat. Chem. 2013, 5, 132-139
25. Mizukami, S.; Watanabe, S.; Akimoto, Y.; Kikuchi, K. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 1623-1629
26. Szent-Gyorgyi, C.; Schmidt, B. F.; Creeger, Y.; Fisher, G. W.; Zakel, K. L.; Adler, S.; Fitzpatrick, J. A.; Woolford, C. A.; Yan, Q.; Vasilev, K. V.; Berget, P. B.; Bruchez, M. P.; Jarvik, J. W.; Waggoner, A. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 235-240
27. Hori, Y.; Ueno, H.; Mizukami, S.; Kikuchi, K. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 16610-16611
28. Hori, Y.; Nakaki, K.; Sato, M.; Mizukami, S.; Kikuchi, K. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 5611-5614
29. Kumauchi, M.; Hara, M. T.; Stalcup, P.; Xie, A.; Hoff, W. D. Photochem. Photobiol. 2008, 84, 956-969
30. Meyer, T. E. Biochim. Biophys. Acta 1985, 806, 175-183
31. Cordfunke, R.; Kort, R.; Pierik, A.; Gobets, B.; Koomen, G. J.; Verhoeven, J. W.; Hellingwerf, K. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 7396-7401
32. Hoff, W. D.; Devreese, B.; Fokkens, R.; Nugteren-Roodzant, I. M.; Van Beeumen, J.; Nibbering, N.; Hellingwerf, K. J. Biochemistry 1996, 35, 1274-1281
33. Imamoto, Y.; Ito, T.; Kataoka, M.; Tokunaga, F. FEBS Lett. 1995, 374, 157-160
34. Clouaire, T.; Stancheva, I. Cell. Mol. Life Sci. 2008, 65, 1509-1522
35. Kroon, A. R.; Hoff, W. D.; Fennema, H. P.; Gijzen, J.; Koomen, G. J.; Verhoeven, J. W.; Crielaard, W.; Hellingwerf, K. J. J. Biol. Chem. 1996, 271, 31949-31956
36. Nad, S.; Kumbhakar, M.; Pal, H. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 4808-4816
37. Jones, G.; Jackson, W. R.; Kanoktanaporn, S.; Halpern, A. M. Opt. Commun. 1980, 33, 315-320
38. Wu, G.; Fang, Y. Z.; Yang, S.; Lupton, J. R.; Turner, N. D. J. Nutr. 2004, 134, 489-492
39. McRee, D. E.; Meyer, T. E.; Cusanovich, M. A.; Parge, H. E.; Getzoff, E. D. J. Biol. Chem. 1986, 261, 13850-13851
40. Cedar, H.; Bergman, Y. Nat. Rev. Genet. 2009, 10, 295-304
41. Delcuve, G. P.; Rastegar, M.; Davie, J. R. J. Cell. Physiol. 2009, 219, 243-250
42. Amirand, C.; Viari, A.; Ballini, J. P.; Rezaei, H.; Beaujean, N.; Jullien, D.; Käs, E.; Debey, P. J. Cell Sci. 1998, 111, 3551-3561
43. Zhang, W. H.; Srihari, R.; Day, R. N.; Schaufele, F. J. Biol. Chem. 2001, 276, 40373-40376
44. Kobayakawa, S.; Miike, K.; Nakao, M.; Abe, K. Genes Cells 2007, 12, 447-460
45. Juttermann, R.; Li, E.; Jaenisch, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 11797-11801