Accurate structure, thermodynamic and spectroscopic parameters from CC and CC/DFT schemes: The challenge of the conformational equilibrium in glycine

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 15, Issue 25, 2013, Pages 10094-10111

  Barone, Vincenzo ^a   Biczysko, Malgorzata ^b   Bloino, Julien ^a,c   Puzzarini, Cristina ^d  

^a SCUOLA NORMALE SUPERIORE   (Italy)

^b CENTER FOR NANOTECHNOLOGY INNOVATION NEST   (Italy)

^c CNR   (Italy)

^d UNIVERSITY OF BOLOGNA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GLYCINE;

ARTICLE; CHEMISTRY; CONFORMATION; INFRARED SPECTROPHOTOMETRY; TEMPERATURE; THERMODYNAMICS;

GLYCINE; MOLECULAR CONFORMATION; SPECTROPHOTOMETRY, INFRARED; TEMPERATURE; THERMODYNAMICS;

EID: 84881086957     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3cp50439e     Document Type: Article

References (111)

1. P. D. Godfrey R. D. Brown J. Am. Chem. Soc. 1995 117 2019 2023
2. A. Perczel J. G. Angyan M. Kajtar W. Viviani J. L. Rivail J. F. Marcoccia I. G. Csizmadia J. Am. Chem. Soc. 1991 113 6256 6265
3. A. Perczel I. G. Csizmadia Int. Rev. Phys. Chem. 1995 14 127 168
4. A. G. Császár A. Perczel Prog. Biophys. Mol. Biol. 1999 71 243 309
5. E. G. Robertson J. P. Simons Phys. Chem. Chem. Phys. 2001 3 1 18
6. R. Improta F. Mele O. Crescenzi C. Benzi V. Barone J. Am. Chem. Soc. 2002 124 7857 7865
7. W. Chin F. Piuzzi I. Dimicoli M. Mons Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 1033 1048
8. D. Toroz T. van Mourik Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 3463 3473
9. F. Albrieux F. Calvo F. Chirot A. Vorobyev Y. O. Tsybin V. Lepere R. Antoine J. Lemoine P. Dugourd J. Phys. Chem. A 2010 114 6888 6896
10. J. C. Dean E. G. Buchanan T. S. Zwier J. Am. Chem. Soc. 2012 134 17186 17201
11. R. D. Suenram F. J. Lovas J. Am. Chem. Soc. 1980 102 7180 7184
12. K. Iijima K. Tanaka S. Onuma J. Mol. Struct. 1991 246 257 266
13. S. McGlone P. Elmes R. Brown P. Godfrey J. Mol. Spectrosc. 1999 485-486 225 238
14. S. G. Stepanian I. D. Reva E. D. Radchenko M. T. S. Rosado M. L. T. S. Duarte R. Fausto L. Adamowicz J. Phys. Chem. A 1998 102 1041 1054
15. A. Ivanov G. Sheina Y. Blagoi Spectrochim. Acta, Part A 1998 55 219 228
16. F. Huisken O. Werhahn A. Y. Ivanov S. A. Krasnokutski J. Chem. Phys. 1999 111 2978 2984
17. J. Alonso E. Cocinero A. Lesarri M. Sanz J. Lopez Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 3471 3474
18. C. Espinoza J. Szczepanski M. Vala N. C. Polfer J. Phys. Chem. A 2010 114 5919 5927
19. R. Linder K. Seefeld A. Vavra K. Kleinermanns Chem. Phys. Lett. 2008 453 1 6
20. R. M. Balabin J. Phys. Chem. Lett. 2010 1 20 23
21. R. M. Balabin Phys. Chem. Chem. Phys. 2012 14 99 103
22. G. Bazso G. Magyarfalvi G. Tarczay J. Mol. Struct. 2012 1025 33 42
23. G. Bazso G. Magyarfalvi G. Tarczay J. Phys. Chem. A 2012 116 10539 10547
24. J. H. Jensen M. S. Gordon J. Am. Chem. Soc. 1991 113 7917 7924
25. A. G. Császár J. Am. Chem. Soc. 1992 114 9568 9575
26. V. Barone C. Adamo F. Lelj J. Chem. Phys. 1995 102 364 370
27. C. H. Hu M. Shen H. F. Schaefer III J. Am. Chem. Soc. 1993 115 2923 2929
28. D. Nguyen A. Scheiner J. Andzelm S. Sirois D. Salahub A. Hagler J. Comput. Chem. 1997 18 1609
29. N. Rega M. Cossi V. Barone J. Am. Chem. Soc. 1998 120 5723 5732
30. V. Kasalová W. D. Allen H. F. Schaefer III E. Czinki A. G. Császár J. Comput. Chem. 2007 28 1373 1383
31. P. Bandyopadhyay M. S. Gordon J. Chem. Phys. 2000 113 1104 1109
32. O. Bludsky J. Chocholousova J. Vacek F. Huisken P. Hobza J. Chem. Phys. 2000 113 4629 4635
33. T. F. Miller I. D. C. Clary A. J. H. M. Meijer J. Chem. Phys. 2005 122 244323
34. R. M. Balabin Chem. Phys. Lett. 2009 479 195 200
35. M. Shmilovits-Ofir Y. Miller R. B. Gerber Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 8715 8722
36. O. Rahaman A. C. T. van Duin W. A. Goddard D. J. Doren J. Phys. Chem. B 2011 115 249 261
37. K. Meng J. Wang Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 2001 2013
38. I. Carnimeo M. Biczysko J. Bloino V. Barone Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 16713 16727
39. M. Biczysko J. Bloino I. Carnimeo P. Panek V. Barone J. Mol. Spectrosc. 2012 1009 74 82
40. V. Barone M. Biczysko J. Bloino C. Puzzarini Phys. Chem. Chem. Phys. 2013 15 1358 1363
41. V. Barone M. Biczysko J. Bloino C. Puzzarini J. Chem. Theory Comput. 2013 9 1533 1547
42. M. J. Locke R. T. McIver J. Am. Chem. Soc. 1983 105 4226 4232
43. J. H. Jensen M. S. Gordon J. Am. Chem. Soc. 1995 117 8159 8170
44. N. Rega M. Cossi V. Barone J. Am. Chem. Soc. 1997 119 12962 12967
45. W. D. Allen, A. L. L. East and A. G. Csaśzaŕ, in Structures and Conformations of Non-Rigid Molecules, ed., J. Laane, M. Dakkouri, B. van der Veken, and, H. Oberhammer, Kluwer, Dordrecht, 1993, p. 343
46. A. L. L. East W. D. Allen J. Chem. Phys. 1993 99 4638
47. A. G. Császár W. D. Allen H. F. Schaefer III J. Chem. Phys 1998 108 9751
48. C. Møller M. S. Plesset Phys. Rev. 1934 46 618 622
49. C. Puzzarini V. Barone Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 7189 7197
50. C. Puzzarini V. Barone J. Chem. Phys. 2008 129 084306
51. C. Puzzarini V. Barone Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 6991 6997
52. P. Carbonniere T. Lucca C. Pouchan N. Rega V. Barone J. Comput. Chem. 2005 26 384 388
53. D. Begue P. Carbonniere C. Pouchan J. Phys. Chem. A 2005 109 4611 4616
54. D. Begue A. Benidar C. Pouchan Chem. Phys. Lett. 2006 430 215 220
55. C. Puzzarini M. Biczysko V. Barone J. Chem. Theory Comput. 2010 6 828 838
56. C. Puzzarini M. Biczysko V. Barone J. Chem. Theory Comput. 2011 7 3702 3710
57. M. Biczysko J. Bloino G. Brancato I. Cacelli C. Cappelli A. Ferretti A. Lami S. Monti A. Pedone G. Prampolini C. Puzzarini F. Santoro F. Trani G. Villani Theor. Chem. Acc. 2012 131 1201
58. J. Bloino M. Biczysko V. Barone J. Chem. Theory Comput. 2012 8 1015 1036
59. J. Bloino V. Barone J. Chem. Phys. 2012 136 124108
60. V. Barone A. Baiardi M. Biczysko J. Bloino C. Cappelli F. Lipparini Phys. Chem. Chem. Phys. 2012 14 12404 12422
61. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5652
62. M. J. Frisch, et al. Gaussian 09 Revision C.01. 2009, Gaussian Inc., Wallingford CT, 2009
63. K. Raghavachari G. W. Trucks J. A. Pople M. Head-Gordon Chem. Phys. Lett. 1989 157 479 483
64. T. H. Dunning Jr J. Chem. Phys. 1989 90 1007 1023
65. A. Kendall T. H. Dunning Jr R. J. Harrison J. Chem. Phys. 1992 96 6796 6806
66. D. E. Woon T. H. Dunning Jr J. Chem. Phys. 1995 103 4572 4585
67. J. F. Stanton, J. Gauss, M. E. Harding and P. G. Szalay, CFour A quantum chemical program package, 2011; with contributions from A. A. Auer, R. J. Bartlett, U. Benedikt, C. Berger, D. E. Bernholdt, Y. J. Bomble, O. Christiansen, M. Heckert, O. Heun, C. Huber, T.-C. Jagau, D. Jonsson, J. Jusélius, K. Klein, W. J. Lauderdale, D. Matthews, T. Metzroth, L. A. Mueck, D. P. O'Neill, D. R. Price, E. Prochnow, C. Puzzarini, K. Ruud, F. Schiffmann, W. Schwalbach, S. Stopkowicz, A. Tajti, J. Vázquez, F. Wang, J. D. Watts and the integral packages MOLECULE (J. Almloef and P. R. Taylor), PROPS (P. R. Taylor), ABACUS (T. Helgaker, H. J. Aa. Jensen, P. Jørgensen, and J. Olsen), and ECP routines by A. V. Mitin and C. van Wuellen. For the current version, see http://www.cfour.de (accessed September 13, 2012)
68. M. Heckert M. Kállay D. P. Tew W. Klopper J. Gauss J. Chem. Phys. 2006 125 044108
69. M. Heckert M. Kállay J. Gauss Mol. Phys. 2005 103 2109 2115
70. D. Feller J. Chem. Phys. 1993 98 7059 7071
71. T. Helgaker W. Klopper H. Koch J. Noga J. Chem. Phys. 1997 106 9639 9646
72. J. Gauss J. Stanton Chem. Phys. Lett. 1997 276 70 77
73. D. P. Tew W. Klopper M. Heckert J. Gauss J. Phys. Chem. A 2007 111 11242 11248
74. S. E. Stein B. S. Rabinovitch J. Chem. Phys. 1973 58 2438 2445
75. P. Y. Ayala H. B. Schlegel J. Phys. Chem. 1998 108 2314 2325
76. H. H. Nielsen Rev. Mod. Phys. 1951 23 90 136
77. I. M. Mills, in Molecular Spectroscopy: Modern Research, ed., K. N. Rao, and, C. W. Mathews, Academic, New York, 1972
78. A. D. Isaacson D. G. Truhlar K. Scanlon J. Overend J. Chem. Phys. 1981 75 3017 3024
79. R. D. Amos N. C. Handy W. H. Green D. Jayatilaka A. Willets P. Palmieri J. Chem. Phys. 1991 95 8323 8336
80. V. Barone J. Chem. Phys. 2005 122 014108
81. J. Vázquez J. F. Stanton Mol. Phys. 2006 104 377 388
82. J. M. L. Martin T. J. Lee P. R. Taylor J.-P. Francois J. Chem. Phys. 1995 103 2589 2602
83. C. Cappelli and M. Biczysko, in Computational Strategies for Spectroscopy, from Small Molecules to Nano Systems, ed., V. Barone, John Wiley & Sons, Inc., 2011, Chapter Time-Independent Approach to Vibrational Spectroscopies, pp. 309-360
84. K. M. Kuhler D. G. Truhlar A. D. Isaacson J. Chem. Phys. 1996 104 4664 4671
85. D. G. Truhlar A. D. Isaacson J. Chem. Phys. 1991 94 357 359
86. M. S. Schuurman W. D. Allen P. von Ragué Schleyer H. F. Schaefer III J. Chem. Phys. 2005 122 104302
87. J. Bloino C. Guido F. Lipparini V. Barone Chem. Phys. Lett. 2010 496 157 161
88. R. B. McClurg R. C. Flagan W. A. Goddard III J. Chem. Phys. 1997 106 6675 6680
89. R. B. McClurg J. Chem. Phys. 1999 111 7165
90. R. B. McClurg J. Chem. Phys. 1999 111 7163 7164
91. D. G. Truhlar J. Comput. Chem. 1991 12 266 270
92. Y.-Y. Chuang D. G. Truhlar J. Chem. Phys. 2000 112 1221 1228
93. M. Strekalov Chem. Phys. 2009 362 75 81
94. J. Zheng T. Yu E. Papajak I. M. Alecu S. L. Mielke D. G. Truhlar Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 10885 10907
95. B. G. Johnson M. J. Frisch J. Chem. Phys. 1994 100 7429 7442
96. N. C. Handy D. J. Tozer G. J. Laming C. W. Murray R. D. Amos Isr. J. Chem. 1993 33 331 344
97. T. Helgaker, P. Jørgensen and J. Olsen, Electronic-Structure Theory, Wiley, Chichester, 2000
98. T. Helgaker J. Gauss P. Jørgensen J. Olsen J. Chem. Phys. 1997 106 6430 6440
99. C. Puzzarini J. S. Stanton J. Gauss Int. Rev. Phys. Chem. 2010 29 273 367
100. P. Pulay W. Meyer J. E. Boggs J. Chem. Phys. 1978 68 5077 5085
101. F. Pawlowski P. Jørgensen J. Olsen F. Hegelund T. Helgaker J. Gauss K. L. Bak J. F. Stanton J. Chem. Phys. 2002 116 6482 6496
102. T. A. Ruden T. Helgaker P. Jørgensen J. Olsen J. Chem. Phys. 2004 121 5874 5884
103. M. H. Cortez N. R. Brinkmann W. F. Polik P. R. Taylor Y. J. Bomble J. F. Stanton J. Chem. Theory Comput. 2007 3 1267 1274
104. D. A. Feller J. A. Sordo J. Chem. Phys. 2000 112 5604 5610
105. J. M. L. Martin Chem. Phys. Lett. 1998 292 411 420
106. F. Pawlowski A. Halkier P. Jørgensen K. L. Bak T. Helgaker W. Klopper J. Chem. Phys. 2003 118 2539 2549
107. M. Biczysko Z. Latajka J. Phys. Chem. A 2002 106 3197 3201
108. J. R. Thomas B. J. DeLeeuw G. Vacek T. D. Crawford Y. Yamaguchi H. F. Schaefer III J. Chem. Phys. 1993 99 403 412
109. B. Galabov and T. Dudev, Vibrational Intensities, Elsevier Science, Amsterdam, 1996
110. M. D. Halls H. B. Schlegel J. Chem. Phys. 1998 109 10587 10593
111. B. Galabov Y. Yamaguchi R. B. Remington H. F. Schaefer III J. Phys. Chem. A 2002 106 819 832